New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2577167 | 104 (0.910) | 7 (0.070) | 7/222 | NT | 7.7% | coding (1271/1776 nt) | PP_2259 | sigma‑54 dependent transcriptional regulator |
? | NC_002947 | = 2577215 | 73 (0.700) | coding (1223/1776 nt) | PP_2259 | sigma‑54 dependent transcriptional regulator |
Only 100 of 127 total aligned reads displayed.
CAGGTCCTGGCGAAAGCGCCCGGCGCGCACTTCGTCGGCCAGGTTGCGATTGCTCGCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGTGAACGCGCCTTTGTCATAGCCGAACAGTTCCGACTCCACCAGTTCGGCCGG > NC_002947/2577067‑2577360 | cgcgttcaccggcgcccaccacaagggcaacccgggactgatccgcaaggccgaccacggcatcataccaaaggatgagattggcgacatGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCtgggt > 1:1725684‑M1/91‑150 (MQ=255) cAGGTCCTGGCGAAAGCGCCCGGCGCGCACTTCGTCGGCCAGGTTGCGATTGCTCGCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGt > 1:1172203‑M2/1‑149 (MQ=255) cAGGTCCTGGCGAAAGCGCCCGGCGCGCACTTCGTCGGCCAGGTTGCGATTGCTCGCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGt > 1:181297‑M2/1‑149 (MQ=255) cAGGTCCTGGCGAAAGCGCCCGGCGCGCACTTCGTCGGCCAGGTTGCGATTGCTCGCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGt > 2:1892733‑M2/1‑149 (MQ=255) aGGTCCTGGCGAAAGCGCCCGGCGCGCACTTCGTCGGCCAGGTTGCGATTGCTCGCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGtg > 1:759265‑M2/1‑148 (MQ=255) ggTCCTGGCGAAAGCGCCCGGCGCGCACTTCGTCGGCCAGGTTGCGATTGCTCGCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGtgg > 2:2033804‑M2/1‑147 (MQ=255) gTCCTGGCGAAAGCGCCCGGCGCGCACTTCGTCGGCCAGGTTGCGATTGCTCGCCGACACCACGCGCCTCAACACCTGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGtggg > 2:2256197‑M2/1‑146 (MQ=255) cTGGCTAAAGCGCCAGGCGAGCACTTGGACGGCCAGGTTGCGATTGCTCGCCGACACCACGCGGATACCCACCGGCCCCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGTGCG‑ACTGCAGTACACGCAGCAGGCGGGCCTGGGtgggcag > 2:630285‑M2/1‑143 (MQ=255) cTGGCGAAAGCGCCCGGCGCGCACTTCGTCGGCCAGGTTGCGATTGCTCGCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGtgggcag < 1:2125653‑M2/150‑8 (MQ=255) tGGCGAAAGCGCCCGGCGCGCACTTCGTCGGCCAGGTTGCGATTGCTCGCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGtgggcagt < 2:1554879‑M2/150‑9 (MQ=255) ggCGAAAGCGCCCGGCGCGCACTTCGTCGGCCAGGTTGCGATTGCTCGCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGtgggcagtg > 1:1917341‑M2/1‑141 (MQ=255) ggCGAAAGCGCCCGGCGCGCACTTCGTCGGCCAGGTTGCGATTGCTCGCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGtgggcagtg > 2:2934314‑M2/1‑141 (MQ=255) ggCGAAAGCGCCCGGCGCGCACTTCGTCGGCCAGGTTGCGATTGCTCGCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGtgggcagtg > 2:25956‑M2/1‑141 (MQ=255) gCGAACGCGCCCGGCGCGCACTTCGTCGGCCAGGTTGCGATTGCTCGCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGtgggcagtgg > 2:1856175‑M2/1‑140 (MQ=255) cggcgcccaccacaagggcaacccgggactgatccgcaaggccgaccacggcatcctgtttctggatgagattggcgacatGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTgg > 2:1373495‑M1/82‑150 (MQ=255) cGAAAGCGCCCGGCGCGCACTTCGTCGGCCAGGTTGCGATTGCTCGCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGtgggcagtggc > 1:2914935‑M2/1‑139 (MQ=255) gAAAGCGCCCGGCGCGCACTTCGTCGGCCAGGTTGCGATTGCTCGCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGtg > 1:1947368‑M2/1‑138 (MQ=255) gAAAGCGCCCGGCGCGCACTTCGTCGGCCAGGTTGCGATTGCTCGCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCa > 1:340292/1‑150 (MQ=255) gAAAGCGCCCGGCGCGCACTTCGTCGGCCAGGTTGCGATTGCTCGCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCa > 1:1033013/1‑150 (MQ=255) cgcccaccacaagggcaacccgggactgatccgcaaggccgaccacggcatcctgtttctggatgagattggcgacatGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCAt > 1:2302821‑M1/79‑150 (MQ=255) aGCGCCCGGCGCGCACTTCGTCGGCCAGGTTGCGATTGCTCGCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGt > 2:1844818/1‑150 (MQ=255) gcCCGGCGCGCACTTCGTCGGCCAGGTTGCGATTGCTCGCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTACAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGc > 1:2558649/1‑150 (MQ=255) cACTTCGTCGGCCAGGTTGCGATTGCTCGCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATc < 1:1682992/150‑1 (MQ=255) aCTTCGTCGGCCAGGTTGCGATTGCTCGCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATcc < 1:267218/150‑1 (MQ=255) tcgGCCAGGTTGCGATTGCTCGCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAAc < 2:229813/150‑1 (MQ=255) cgGCCAGGTTGCGATTGCTCGCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACa < 1:2443052/150‑1 (MQ=255) tGCGATTGCTCGCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGt > 1:2909179/1‑150 (MQ=255) gATTGCTCGCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGtggg > 1:70612‑M2/1‑102 (MQ=255) gATTGCTCGCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGtggg < 2:70612‑M2/106‑5 (MQ=255) gATTGCTAGCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGt > 1:2842016/1‑150 (MQ=255) aTTGCTCGCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTc < 2:2909179/150‑1 (MQ=255) ttGCTCGCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCg > 2:2415051/1‑150 (MQ=255) cTCGCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACGGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGAGGGCCTGGGCGGGCAAAGGCATGCCGGCAAGCTCATCCAGAAACAGGATGCCCTGGTCGGcc > 2:2199498/1‑150 (MQ=255) tCGCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCt > 2:124588/1‑150 (MQ=255) tCGCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCt > 1:1353988/1‑150 (MQ=255) gCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTg > 1:952485/1‑150 (MQ=255) ccGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGc > 1:912668/1‑150 (MQ=255) ccGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGc > 2:492061/1‑150 (MQ=255) acacCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGa < 2:2982702/150‑1 (MQ=255) caccacGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGAt < 2:1033013/150‑1 (MQ=255) caccacGCGGATACCCACCGGAACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCGCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCTGAt < 2:580682/150‑1 (MQ=255) cacGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATg < 1:527595/127‑1 (MQ=255) cacGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATg > 2:527595/1‑127 (MQ=255) acGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGt > 2:1626842/1‑150 (MQ=255) cgcgGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTc > 1:1498232/1‑150 (MQ=255) gATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCgg < 1:2429280/150‑1 (MQ=255) gATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGACTTGCGGATCAGTCCCgg < 2:1663548/150‑1 (MQ=255) atatCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCggg < 1:124588/150‑1 (MQ=255) atatCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTACAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCggg < 2:2558649/150‑1 (MQ=255) atCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGAATGTCGCCAATATCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGtt > 2:416589/1‑150 (MQ=255) accggcaccggTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGc > 1:1538100/1‑130 (MQ=255) accggcaccggTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGc < 2:1538100/130‑1 (MQ=255) accggcaccggTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGccc > 2:733738/1‑150 (MQ=255) accggTTCGCCACTGCTCAGCGGCTGGATGCTGCGGG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGCCGGGCCTGGTTTGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCCGATCAGGCCCGGGAGGCCCATgtgg > 2:2437885/1‑150 (MQ=255) cggTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTgtggtg > 2:2834181/1‑150 (MQ=255) cggTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTgtggtg < 1:184980/150‑1 (MQ=255) ggTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGtggtgg < 1:1432077/150‑1 (MQ=255) ggTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGtggtgg < 2:1353988/150‑1 (MQ=255) gTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGtgggcagtggcaaaccggtgccggtggatatccgcgtggtgtcggcgagcaatcgcaacctggccgacgaagtgcgcgccgggcgct < 1:2292235‑M2/150‑88 (MQ=255) ttCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGgc < 1:2834181/150‑1 (MQ=255) gCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGtgggcagtggcgaaccggtgccggtggatatccgcgtggtgtcggcgagcaatcgcaacctggccgacgaagtgc < 2:2395386‑M2/134‑76 (MQ=255) gCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGtgggcagtggcgaaccggtgccggtggatatccgcgtggtgtcggcgagcaatcgcaacctggccgacgaagtgc > 1:2395386‑M2/1‑59 (MQ=255) GCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGcc < 2:622694‑M1/150‑1 (MQ=255) ccACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGtgggcagtagcgaaccggtgccggtggatatccgcgtggtgtcggcgagcaatcgcaacctggc < 1:1592812‑M2/122‑65 (MQ=255) CCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCg > 1:622694‑M1/1‑150 (MQ=255) CACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCa > 2:2477029‑M1/1‑83 (MQ=255) CACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCa < 1:2477029‑M1/83‑1 (MQ=255) CACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCgg < 2:3063096‑M1/150‑1 (MQ=255) ACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCg < 2:1681866‑M1/148‑1 (MQ=255) ACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGt < 1:1342872‑M1/150‑1 (MQ=255) ACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGt < 1:588161‑M1/150‑1 (MQ=255) GCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGTGaa > 2:2134111‑M1/1‑150 (MQ=255) aGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGtgggcagtggcaaaccggtgccggtggatatccgcgtggtgtcggcgagcaatcgcaacctggccgacgaagtgcgcgccgggcgctttcgccaggacctg > 2:2292235‑M2/1‑49 (MQ=255) AGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGAt < 1:574557‑M1/110‑1 (MQ=255) gCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGTGAACgcgc < 2:1498232/150‑1 (MQ=255) cGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGTGAACGCGcc < 1:1966645/150‑1 (MQ=255) tGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGtgggcagtggcgaaccggtgccggtggatatccgcgtggtgtcggcgagcaatcgcaacctggccgacgaagtgcgcgccgggcgctttcgccaggacctgtactac < 1:1645348‑M2/150‑108 (MQ=255) tgctgcGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGTGAACGCGCCTTTGTCAt > 2:748573/1‑150 (MQ=255) tgcGCGTACTGCAGT‑CGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGcc < 2:2819432/89‑1 (MQ=39) tgcGCGTACTGCAGT‑CGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGTGAACGCGCCCTTGTCATAGc > 2:2701711/1‑150 (MQ=255) tgcGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGGGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGTGAACGCGCCTTTGTCATAGc > 2:1209656/1‑150 (MQ=255) cgcg‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGTGAACGCGCCTTTGTCATAGCCg < 1:108951/150‑1 (MQ=255) cg‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGTGAACGCGCCTTTGTCATAGCCGaa < 1:2199498/150‑1 (MQ=255) tGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGtggtgg < 2:89598/114‑1 (MQ=255) tGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGtggtgg > 1:89598/1‑114 (MQ=255) cAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGTGAACGCGCCTTTGTCATAGCCGAACAGTTc > 1:1293342/1‑150 (MQ=255) aGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCa > 1:1289259/1‑51 (MQ=255) aGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCa < 2:1289259/51‑1 (MQ=255) aGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGTGAACGCGCCTTTGTCATAGCCGAACAGTTcc < 2:2125653/150‑1 (MQ=255) aGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGTGAACGCGCCTTTGTCATAGCCGAACAGTTcc < 1:2752072/150‑1 (MQ=255) tACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGGCTGTGAACGCGCCTTTGTCATAGCCGAACAGTTCCgg > 1:1411975/1‑149 (MQ=255) gcgcAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGTGAACGCGCCTTTGTCATAGCCGaa < 2:1265410/138‑1 (MQ=255) gcagcaGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGTGAACGCGCCTTTGTCATAGCCGAACAGTTCCGACTcca > 2:2237580/1‑150 (MQ=255) gcagcaGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGTGAACGCGCCTTTGTCATAGCCGAACAGTTCCGACTcc > 1:222150/1‑149 (MQ=255) cagcagGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGTGAACGCGCCTTTGTCATAGCCGAACAGTTCCGACTccac < 1:1626842/150‑1 (MQ=255) cagGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGTGAACGCGCCTTTGTCATAGCCGAACAGTTCCGACTCCACCAg > 2:1397513/1‑150 (MQ=255) cTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGTGAACGCGCCTTTGTCATAGCCGAACAGtt < 1:522505/128‑1 (MQ=255) cTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGTGAACGCGCCTTTGTCATAGCCGAACAGtt > 2:522505/1‑128 (MQ=255) cTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGTGAACGCGCCTTTGTCATAGCCGAACAGTTCCGACTCCACCAGTTCGCCCgt < 2:3061201/150‑2 (MQ=255) ggtgggCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGTGAACGCGCCTTTGTCATAGCCGAACAGTTCCGACTCCACCAGTTCGGCCgg < 2:1877082/147‑1 (MQ=255) | CAGGTCCTGGCGAAAGCGCCCGGCGCGCACTTCGTCGGCCAGGTTGCGATTGCTCGCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGTGAACGCGCCTTTGTCATAGCCGAACAGTTCCGACTCCACCAGTTCGGCCGG > NC_002947/2577067‑2577360 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |