New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4450528 | 139 (1.210) | 8 (0.070) | 6/232 | NT | 5.6% | coding (88/3564 nt) | nicB | nicotinate dehydrogenase subunit B |
? | NC_002947 | = 4450543 | 136 (1.250) | coding (103/3564 nt) | nicB | nicotinate dehydrogenase subunit B |
Only 100 of 167 total aligned reads displayed.
GAAATCCTGCGCGCCGTGCGCCGCGCTGCCGAGACCCGGAGAAAGCCATGAACCACTCACAACAGGTGCCCAGCCGCGACCAACTGCTGGCCAAGACCGGCGTGTTGCTGATCGTCGACCAGATCACCCCGCCCTCAGGCC‑CTGTGGCCA‑AGGGCGTGACACCTACAGTCAAGGAACGTGAGCTGGCGCTGTTCATCGCGGTCAGCGACGACGGCATGGTCTACGCCTTCAATGGTCATGTCGACCTGGGCACTGGCATCCGTACCTCGCTGGCGCAAATCGTCGCCGAAGAGCTGGAC > NC_002947/4450394‑4450692 | gAAATCCTGCGCGCCGTGCGCCGCGCTGCCGAGACCCGGAGAAAGCCATGAACCACTCACAACAGGTGCCCAGCCGCGACCAACTGCTGGCCAAGACCGGCGTGTTGCTGATCGTCGACCAGATCACCCCGCCCTCAGGCC‑CTGTGGCCa > 2:499010/1‑150 (MQ=255) tCCTGCGCGCCGTGCGCCGCGCTGCCGAGACCCGGAGAAAGCCATGAACCACTCACAACAGGTGCCCAGCCGCGACCAACTGCTGGCCAAGACCGGCGTGTTGCTGATCGTCGACCAGATCACCCCGCCCTCAGGCC‑CTGTGGCCAaggg < 2:2860893‑M2/150‑5 (MQ=255) cTGCGCGCCGTGCGCCGCGCTGCCGAGACCCGGAGAAAGCCATGAACCACTCACAACAGGTGCCCAGCCGCGACCAACTGCTGGCCAAGACCGGCGTGTTGCTGATCGTCGACCAGATCACCCCGCCCTCAGGCC‑CTGTGGCCAagggcg < 2:2976495‑M2/150‑7 (MQ=255) tGCGCGCCGTGCGCCGCGCTGCCGAGACCCGGAGAAAGCCATGAACCACTCACAACAGGTGCCCAGCCGCGACCAACTGCTGGCCAAGACCGGCGTGTTGCTGATCGTCGACCAGATCACCCCGCCCTCAGGCC‑CTGTGGCCA‑AGGGCGt > 2:1873477/1‑150 (MQ=255) tGCGCGCCGTGCGCCGCGCTGCCGAGACCCGGAGAAAGCCATGAACCACTCACAACAGGTGCCCAGCCGCGACCAACTGCTGGCCAAGACCGGCGTGTTGCTGATCGTCGAACAGATCACCCCGCCCTCAGGCC‑CTGTGGCCA‑AGGGCGt < 2:116201/150‑1 (MQ=255) cgcCGTGCGCCGCGCTGCCGAGACCCGGAGAAAGCCATGAACCACTCACAACAGGTGCCCAGCCGCGACCAACTGCTGGCCAAGACCGGCGTGTTGCTGATCGTCGACCAGATCACCCCGCCCTCACGCC‑CT‑TGGCCACAGGGCCTGagg < 1:1852952/150‑3 (MQ=255) gTGCGCCGCGCTGCCGAGACCCGGAGAAAGCCATGAACCACTCACAACAGGTGCCCAGCCGCGACCAACTGCTGGCCAAGACCGGCGTGTTGCTGATCGTCGACCAGATCACCCCGCCCTCAGGCC‑CTGTGGCCA‑AGGGCGTGACACCTa > 1:1044291/1‑150 (MQ=255) ccgcGCTGCCGAGACCCGGAGAAAGCCATGAACCACTCACAACAGGTGCCCAGCCGCGACCAACTGCTGGCCAAGACCGGCGTGTTGCTGATCGTCGACCAGATCACCCCGCCCTCAGGCC‑CTGTGGCCA‑AGGGCGTGACACCTACAGTc > 1:1250307/1‑150 (MQ=255) cgcgCTGCCGAGACCCGGAGAAAGCCATGAACCACTCACAACAGGTGCCCAGCCGCGACCAACTGTTGCCCTAGACCGGCGTGTTGCTGATCGTCGACCAGATCACCCCGCCCTT‑GGCCACAG‑GGCCTgagggcggggtgatctggtcga > 1:833702‑M2/1‑128 (MQ=255) gcgcTGCCGAGACCCGGAGAAAGCCATGAACCACTCACAACAGGTGCCCAGCCGCGACCAACTGCTGGCCCAGCTGAGCTGTTTTCTGATCGTCGACCAGATCACCCCGCCCTCAGGCC‑CTGTGGCCA‑AGGGCGTGACACCTACAGTCaa < 2:885126/150‑1 (MQ=255) gcgcTGCCGAGACCCGGAGAAAGCCATGAACCACTCACAACAGGTGCCCAGCCGCGACCAACTGCTGGCCAAGACCGGCGTGTTGCTGATCGTCGACCAGATCACCCCGCCCTCAGGCC‑CTGTGGCCA‑AGGGCGTGACACCTACAGTCaa < 2:2277938/150‑1 (MQ=255) cgcTGCCGAGACCCGGAGAAAGCCATGAACCACTCACAACAGGTGCCCAGCCGCGACCAACTGCTGGCCAAGACCGGCGTGTTGCTGATCGTCGACCAGATCACCCCGCCCTCAGGCC‑CTGTGGCCA‑AGGGCGTGACACCTACAGTCAAg < 1:2262687/150‑1 (MQ=255) cgcTGCCGAGACCCGGAGAAAGCCATGAACCACTCACAACAGGTGCCCAGCCGCGACCAACTGCTGGCCAAGACCGGCGTGTTGCTGATCGTCGACCAGATCACCCCGCCCTCAGGCC‑CTGTGGCCA‑AGGGCGTGACACCTACAGTCAAg < 1:1873477/150‑1 (MQ=255) tGCCGAGACCCGGAGAAAGCCATGAACCACTCACAACAGGTGCCCAGCCGCGACCAACTGCTGGCCAAGACCGGCGTGTTGCTGATCGTCGACCAGATCACCCCGCCCTCAGGCC‑CTGTGGCCA‑AGGGCGTGACACCTACAGTCAAGGaa > 1:1626060/1‑150 (MQ=255) gCCGAGACCCGGAGAAAGCCATGAACCACTCACAACAGGTGCCCAGCCGCGACCAACTGCTGGCCAAGACCGGCGTGTTGCTGATCGTCGACCAGATCACCCCGCCCTCAGGCC‑CTGTGGCCA‑AGGGCGTGACACCTACAGTCAAGGAAc < 1:1915769/150‑1 (MQ=255) cGAGACCCGGAGAAAGCCATGAACCACTCACAACAGGTGCCCAGCCGCGACCAACTGCTGGCCAAGACCGGCGTGTTGCTGATCGTCGACCAGATCACCCCGCCCTCAGGCC‑CTGTGGCCA‑AGGGCGTGACACCTACAGTCAAGGAACGt < 1:316111/150‑1 (MQ=255) aCCCGGAGAAAGCCATGAACCACTCACAACAGGTGCCCAGCCGCGACCAACTGCTGGCCAAGACCGGCGTGTTGCTGATCGTCGACCAGATCACCCCGCCCTCAGGCC‑CTGTGGCCA‑AGGGCGTGACACCTACAGTCAAGGAACGTGAGc > 1:2075921/1‑150 (MQ=255) aCCCGGAGAAAGCCATGAACCACTCACAACAGGTGCCCAGCCACGACCAACTGCTGGCCAAGACCGGCGTGTTGCTGATCGTCGACCAGATCACCCCGCCCTCAGGCC‑CTGTGGCCA‑AGGGCGTGACACCTACAGTCAAGGAACGTGAGc < 2:52817/150‑1 (MQ=255) 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acaagAACCACTCACAACAGGTGCCCAGCCGCGACCAACTGCTGGCCAAGACCGGCGTGTTGCTGATCGTCGACCAGATCACCCCGCCCTCAGGCC‑CTGTGGCCA‑AGGGCGTGACACCTACAGTCAAGGAACGTGAGCTGGCGCTGTTCa > 2:2492505/5‑150 (MQ=255) cATGAACCACTCACAACAGGTGCCCAGCCGCGACCAACTGCTGGCCAAGACCGGCGTGTTGCTGATCGTCGACCAGATCACCCCGCCCTCAGGCC‑CTGTGGCCA‑AGGGCGTGACACCTACAGTCAAGGAACGTGAGCTGGCGCTGTTCAt > 2:698866/1‑150 (MQ=255) aTGAACCACTCACAACAGGTGCCCAGCCGCGACCAACTGCTGGCCAAGACCGGCGTGTTGCTGATCGTCGACCAGATCACCCCGCCCTT‑GGCCACAG‑GGCCTgagggcggggtgatctggtcgac < 1:2597255‑M2/125‑24 (MQ=255) aTGAACCACTCACAACAGGTGCCCAGCCGCGACCAACTGCTGGCCAAGACCGGCGTGTTGCTGATCGTCGACCAGATCACCCCGCCCTCAGGCC‑CTGTGGCCA‑AGGGCGTGACACCTACAGTCAAGGAACGTGAGCTg < 2:2531921/138‑1 (MQ=255) aTGAACCACTCACAACAGGTGCCCAGCCGCGACCAACTGCTGGCCAAGACCGGCGTGTTGCTGATCGTCGACCAGATCACCCCGCCCTCAGGCC‑CTGTGGCCA‑AGGGCGTGACACCTACAGTCAAGGAACGTGAGCTg > 1:2531921/1‑138 (MQ=255) tGAACCACTCACAACAGGTGCCCAGCCGCGACCAACTGCTGGCCAAGACCGGCGTGTTGCTGATCGTCGACCAGATCACCCCGCCCTCAGGCC‑CTGTGGCCA‑AGGGCGTGACACCTACAGTCAAGGAACGTGAGCTGGCGCTGTTCATcg > 2:596731/1‑150 (MQ=255) tGAACCACTCACAACAGGTGCCCAGCCGCGACCAACTGCTGGCCAAGACCGGCGTGTTGCTGATCGTCGACCAGATCACCCCGCCCTCAGGCC‑CTGTGGCCA‑AGGGCGTGACACCTACAGTCAAGGAACGTGAGCTGGCGCTGTTCAGcg > 1:899422/1‑150 (MQ=255) gAACCACTCACAACAGGTGCCCAGCCGCGACCAACTGCTGGCCAAGACCGGCGTGTTGCTGATCGTCGACCAGATCACCCCGCCCTCAGGCC‑CTGTGGCCA‑AGGGCGTGACACCTACAGTCAAGGAACGTGAGCTg > 2:1759431/1‑136 (MQ=255) gAACCACTCACAACAGGTGCCCAGCCGCGACCAACTGCTGGCCAAGACCGGCGTGTTGCTGATCGTCGACCAGATCACCCCGCCCTCAGGCC‑CTGTGGCCA‑AGGGCGTGACACCTACAGTCAAGGAACGTGAGCTg < 1:1759431/136‑1 (MQ=255) aCCACTCACAACAGGTGCCCAGCCGCGACCAACTGCTGGCCAAGACCGGCGTGTTGCTGATCGTCGACCAGATCACCCCGCCCTCAGGCC‑CTGTGGCCA‑AGGGCGTGACACCTACAGTCAAGGAACGt > 2:2029582/1‑128 (MQ=255) ccACTCACAACAGGTGCCCAGCCGCGACCAACTGCTGGCCAAGACCGGCGTGTTGCTGATCGTCGACCAGATCACCCCGCCCTCAGGCC‑CTGTGGCCA‑AGGGTGTGACACCTACAGTCAAGGAACGTGAGCTGGCGCTGTTCATCGCGGt < 2:935477/150‑1 (MQ=255) tCACAACAGGTGCCCAGCCGCGACCAACTGCTGGCCAAGACCGGCGTGTTGCTGATCGTCGACCAGATCACCCCGCCCTCAGGCC‑CTGTGGCCA‑AGGGCGTGACACCTACAGTCAAGGAACGTGAGCTGGCGCTGTTCATCGCGGTCAGc > 2:1018462/1‑150 (MQ=255) tCACAACAGGTGCCCACCCGCGACCAACTGCTGTCCAAGACCGGCGTGTGGCTGAGCGTCGACCAGATCACCCCGCCCTCAGGCC‑CTGTGGCCA‑AGGGCGTGACACCTACAGTCAAGGAACGTGAGCTGGCGCTGTTCATCGCGGTCAGc < 1:1678004/150‑1 (MQ=255) caacaGGTGCGCAGCCGCGACCAACTGCTGGCCAAGACCGGCGTGTTGCTGATCGTCGACCAGATCACCGCGCCCTCAGGCC‑CTGTGGTCA‑AGGGCGTGAAACCTACAGTCAAGGAACTGGAGCTGGCGCTGTTCATCGCGGTCAGagac > 2:1696996/1‑150 (MQ=255) aacaGGTGCCCAGCCGCGACCAACTGCTGGCCAAGACCGGCGTGTTGCTGATCGTCGACCAGATCACCCCGCCCTCAGGCC‑CTGTGGCCA‑AGGGCGTGACACCTACAGTCAAGGAAc > 1:2846526/1‑117 (MQ=255) acaGGTGCCCAGCCGCGACCAACTGCTGGCCAAGACCGGCGTGTTGCTGATCGTCGACCAGATCACCCCGCCCTCAGGCC‑CTGTGGCCA‑AGGGCGTGACACCTACAGTCAAGGAACGTGTGATTGCGCTGTTCATCGCGGTCAGcgacga < 1:2860893/150‑1 (MQ=255) 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cccGCCCTCAGGCC‑CTGTGGCCA‑AGGGCGTGACACCTACAGTCAAGGAACGTGAGCTGGCGCTGTTCATCGCGGTCAGCGACGACGGCATGGTCTACGCCTTCAATGGTCAt > 2:847944/1‑112 (MQ=255) cccGCCCTCAGGCC‑CTGTGGCCA‑AGGGCGTGACACCTACAGTCAAGGAACGTGAGCTGGCGCTGTTCATCGCGGTCAGCGACGACGGCATGGTCTACGCCTTCAATGGTCAt < 1:847944/112‑1 (MQ=255) cccGCCCTCAGGCC‑CTGTGGCCA‑AGGGCGTGACACCTACAGTCAAGGAACGTGAGCTGGCGCTGTTCATCGCGGTCAGCGACGACGGCATGGTCTACGCCTTCAATGGTCATGTCGACCTGGGCACTGGCATCCGTACCTCGCTGGCGCa > 2:824650/1‑150 (MQ=255) cccGCCCTCAGGCC‑CTGTGGCCA‑AGGGCGTGACACCTACAGTCAAGGAACGTGAGCTGGCGCTGTTCATCGCGGTCAGCGACGACGGCATGGTCTACGCCTTCAATGGTCATGTCGACCTGGGCACTGGCATCCGTACCTCGCTGGCGCa > 1:3067776/1‑150 (MQ=255) cccGCCCTCAGGCC‑CTGTGGCCA‑AGGGCGTGACACCTACAGTCAAGGAACGTGAGCTGGCGCTGTTCATCGCGGTCAGCGACGACGGCATGGTCTACGCCTTCAATGGTCATGTCGACCTGGGCACTGGCATCCGTACCTCGCTGGCGCa > 2:2427192/1‑150 (MQ=255) ccGCCCTCAGGCC‑CTGTGGCCA‑AGGGCGTGACACCTACAGTCAAGGAACGTGAGCTGGCGCTGTTCATCGCGGTCAGCGACGACGGCa > 1:1494070/1‑88 (MQ=255) ccGCCCTCAGGCC‑CTGTGGCCA‑AGGGCGTGACACCTACAGTCAAGGAACGTGAGCTGGCGCTGTTCATCGCGGTCAGCGACGACGGCa < 2:1494070/88‑1 (MQ=255) cGCCCTCAGGCC‑CTGTGGCCA‑AGGGCGTGACACCTACAGTCAAGTAACGTGAGCTGGCGCTGTTCATCGCGGTCAGCGACGACGGCATGGGCTACGCCTTCAATGGTCATGTCGAACTGGGCAGTGGCGTCCGGAACTCGCGGGCGCaaa > 2:802152/1‑150 (MQ=255) cGCCCTCAGGCC‑CTGTGGCCA‑AGGGCGTGACACCTACAGTCAAGGAACGTGAGCTGGCGCTGTTCATCGCGGTCAGCGACGACGGCATg > 1:435726/1‑89 (MQ=255) cGCCCTCAGGCC‑CTGTGGCCA‑AGGGCGTGACACCTACAGTCAAGGAACGTGAGCTGGCGCTGTTCATCGCGGTCAGCGACGACGGCATg < 2:435726/89‑1 (MQ=255) tCAGGCC‑CTGTGGCCA‑AGGGCGTGACACCTACAGTCAAGGAACGTGAGCTGGCGCTGTTCATCGCGGTCAGCGACGACGGCATGGTCTACGCCTTCAATGGTCATGTCGACCTGGGCACTGGCATCCGTACCTCGCTGGCGCAAAtcgtc < 2:1462661/150‑1 (MQ=255) tCAGGCC‑CTGCGGCCA‑AGGGCGTGACACCTACAGTCAAGGAACGTGAGCTGGCGCTGTTCATCGCGGTCAGCGACGACGGCATGGTCTACGCCTTCAATGGTCATGTCGACCTGGGCACTGGCATCCGTACCTCGCTGGCGCAAAtcgtc < 2:2511756/150‑1 (MQ=255) gCC‑CTGTGGCCA‑AGGGCGTGACACCTACAGTCAAGGAACGTGAGCTGGCGCTGTTCATCGCGGTCAGCGACGACGGCATGGTCTACGCCTTCAATGGTCATGTCGACCTggg < 2:1938513/112‑1 (MQ=255) gCC‑CTGTGGCCA‑AGGGCGTGACACCTACAGTCAAGGAACGTGAGCTGGCGCTGTTCATCGCGGTCAGCGACGACGGCATGGTCTACGCCTTCAATGGTCATGTCGACCTGGGCACTgg > 1:1985477/1‑118 (MQ=255) gCC‑CTGTGGCCA‑AGGGCGTGACACCTACAGTCAAGGAACGTGAGCTGGCGCTGTTCATCGCGGTCAGCGACGACGGCATGGTCTACGCCTTCAATGGTCATGTCGACCTGGGCACTgg < 2:1985477/118‑1 (MQ=255) cTGTGGCCA‑AGGGCGTGACACCTACAGTCAAGGAACGTGAGCTGGCGCTGTTCATCGCGGTCAGCGACGACGGCATGGTCTACGCCTTCAATGGTCATGTCGACCTGGGCACTGGCATCCGTACCTCGCTGGCGCAAATCGTCGCCGAag < 2:2833425/150‑1 (MQ=255) cTGTGGCCA‑AGGGCGTGACACCTACAGTCAAGGAACGTGAGCTGGCGCTGTTCATCGCGGTCAGCGACGACGGCATGGTCTACGCCTTCAATGGTCATGTCGACCTGGGCACTGGCATCCGTACCTCGCTGGCGCAAATCGTCGCCGAag > 1:749496/1‑150 (MQ=255) tgtgGCCA‑AGGGCGTGACACCTACAGTCAAGGCACGCCAGCCACCCTTGTCNACCGCGGTCAGCGACGACGGCAGGGTCTACGCCTTCAATGGTCATGTCGACCTGGGCACTGGCATCCGTACCTCGCTTGCGCAAATCGTCGCCGAagg > 1:2833425/1‑149 (MQ=255) tgGCCA‑AGGGCGTGACACCTACAGTCAAGGAACGTGAGCTGGCGCTGTTCATCGCGGTCAGCGACGACGGCATGGTCTACGCCTTCAATg > 2:644281/1‑90 (MQ=255) tgGCCA‑AGGGCGTGACACCTACAGTCAAGGAACGTGAGCTGGCGCTGTTCATCGCGGTCAGCGACGACGGCATGGTCTACGCCTTCAATg < 1:644281/90‑1 (MQ=255) tgGCCA‑AGGGCGTGACACCTACAGTCAAGGAACGTGAGCTGGCGCTGTTCATCGCGGTCAGCGACGACGGCATGGTCTACGCCTTCAATg > 1:681574/1‑90 (MQ=255) cA‑AGGGCGTGACACCTACAGTCAAGGAACGTGAGCTGGCGCTGTTCATCGCGGTCAGCGACGACGGCATGGTCTACGCCTTCAATGGTCATGTCGACCTGGGCACTGGCATCCGTACCTCGCTGGCGCAAATCGTCGCCGAAGAGCTGGa < 1:318196/150‑1 (MQ=255) a‑aGGGCGTGACACCTACAGTCAAGGAACGTGAGCTGGCGCTGTTCATCGCGGTCAGCGACGACGGCATGGTCTACGCCTTCAATGGTCATGTCGACCTGGGCACTGGCATCCGTACCTCGCTGGCGCAAATCGTCGCCGAAGAGCTGGAc > 2:2599199/1‑150 (MQ=255) a‑aGGGCGTGACACCTACAGTCAAGGAACGTGAGCTGGCGCTGTTCATCGCGGTCAGCGACGACGGCATGGTCTACGCCTTCAATGGTCATGTCGACCTGGGCACTGGCATCCGTACCTCGCTGGCGCAAATCGTCGCCGAAGAGCTGGAc > 2:2587909/1‑150 (MQ=255) | GAAATCCTGCGCGCCGTGCGCCGCGCTGCCGAGACCCGGAGAAAGCCATGAACCACTCACAACAGGTGCCCAGCCGCGACCAACTGCTGGCCAAGACCGGCGTGTTGCTGATCGTCGACCAGATCACCCCGCCCTCAGGCC‑CTGTGGCCA‑AGGGCGTGACACCTACAGTCAAGGAACGTGAGCTGGCGCTGTTCATCGCGGTCAGCGACGACGGCATGGTCTACGCCTTCAATGGTCATGTCGACCTGGGCACTGGCATCCGTACCTCGCTGGCGCAAATCGTCGCCGAAGAGCTGGAC > NC_002947/4450394‑4450692 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |