New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4845173 = | 50 (0.440) | 6 (0.060) | 5/212 | NT | 14.7% | intergenic (+14/‑123) | PP_4260/PP_4261 | hypothetical protein/cation‑transporting P‑type ATPase |
? | NC_002947 | 4845266 = | 26 (0.260) | intergenic (+107/‑30) | PP_4260/PP_4261 | hypothetical protein/cation‑transporting P‑type ATPase |
TTGGGTGACGAAGCCCTGCAAGGCGCCGAACACCAACAGTAGCAACACCGCAAATCCCTGTGGGAGCGGGCACGCCCGCGAATGCGATAGCTCAGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTGG > NC_002947/4845118‑4845413 | ttGGGTGACGAAGCCCTGCAAGGCGCCGAACACCAACAGTAGCAACACCGCAAATCCCTGTGGGAGCGGGCACGCCCGCGAATGCGATAGCTCAGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGtt > 1:2781375/1‑150 (MQ=255) gTGACGAAGCCCTGCAAGGCGCCGAACACCAACAGTAGCAACACCGCAAATCCCTGTGGGAGCGGGCACGCCCGCGAATGCGATAGCTCAGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTCCCt < 2:769463/150‑1 (MQ=255) cAAATCCCTGTGGGAGCGGGCACGCCCGCGAATGCGATAGCTCAGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGCGGGGCTGATCTGCCTGAGCAGTGTCTGTCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCt > 1:2491281/1‑150 (MQ=255) tgtgggagcgggcgcgcccgcgaatgcgtcagacctggaaatacctttgcctgagctatcgcattcgcgggcgtgcccgctcccacagggTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTgc > 2:115687‑M2/91‑150 (MQ=255) GCGGGCACGCCCGCGAATGCGATAGCTCAGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGAcccc > 2:1730064‑M1/1‑130 (MQ=255) GCGGGCACGCCCGCGAATGCGATAGCTCAGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGAcccc > 2:1730495‑M1/1‑130 (MQ=255) GCGGGCACGCCCGCGAATGCGATAGCTCAGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGAcccc < 1:1730064‑M1/130‑1 (MQ=255) GCGGGCACGCCCGCGAATGCGATAGCTCAGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGAcccc < 1:1730495‑M1/130‑1 (MQ=255) gggcgcgcccgcgaatgcgtcagacctggaaatacctttgcctgagctatcgcattcgcgggcgtgcccgctcccacagggGTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTACAGCTTATGACCCAACGGACCTCCTGCTAACACGGCGCCCTGccc > 1:1452109‑M2/82‑150 (MQ=255) GGCACGCCCGCGAATGCGATAGCTCAGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCg < 2:2346813‑M1/150‑1 (MQ=255) GGCACGCCCGCGAATGCGATAGCTCAGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCg < 1:476014‑M1/150‑1 (MQ=255) CACGCCCGCGAATGCGATAGCTCAGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTc < 1:2282271‑M1/150‑1 (MQ=255) ccgcgaatgcgtcagacctggaaatacctttgcctgagctatcgcattcgcgggcgtgcccgctcccacagggTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTc < 1:3005642‑M2/24‑1 (MQ=255) ccgcgaatgcgtcagacctggaaatacctttgcctgagctatcgcattcgcgggcgtgcccgctcccacagggTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTc > 2:3005642‑M2/74‑97 (MQ=255) ccgcgaatgcgtcagacctggaaatacctttgcctgagctatcgcattcgcgggcgtgcccgctcccacagggTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTa > 2:2519436‑M2/74‑104 (MQ=255) ccgcgaatgcgtcagacctggaaatacctttgcctgagctatcgcattcgcgggcgtgcccgctcccacagggTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTa < 1:2519436‑M2/31‑1 (MQ=255) ccGCGAATGCGATAGCTTAGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCAc > 1:2189881/1‑150 (MQ=255) ccGCGAATGCGATAGCTCAGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACACCCCTTTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCAc > 1:1541868/1‑150 (MQ=255) ccGCGAATGCGATAGATCAGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCAc > 1:891765/1‑150 (MQ=255) cgcgAATGCGATAGCTCAGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCAcc > 1:2899030/1‑150 (MQ=255) gCTCAGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTAc > 2:2996902/1‑113 (MQ=255) gCTCAGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTAc < 1:2996902/113‑1 (MQ=255) gCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCAccgccg > 1:309769/1‑150 (MQ=255) aaaGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTg < 2:252130/150‑1 (MQ=255) aaaGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTg > 1:252130/1‑150 (MQ=255) aaaGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTg > 2:420986/1‑150 (MQ=255) tCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGc > 1:1338443/1‑150 (MQ=255) gTCTGACGCATTCGCGGACGCGACCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGcc > 2:1573568/1‑150 (MQ=255) gACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTgg > 2:1215997/1‑133 (MQ=255) gACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTgg < 1:1215997/133‑1 (MQ=255) actcATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCt < 1:1147547/59‑1 (MQ=255) aCGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCt > 2:1147547/1‑62 (MQ=255) aCGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCt < 1:1718516/120‑1 (MQ=255) aCGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCt > 2:1718516/1‑120 (MQ=255) cATTCGCGGGCGCGCCCTCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGACCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGt > 2:419100/1‑150 (MQ=255) aTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGc > 2:1072478/1‑95 (MQ=255) aTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGc < 1:1072478/95‑1 (MQ=255) aTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGtt > 1:1786234/1‑150 (MQ=255) gagcgGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCACCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTct > 1:383972/3‑150 (MQ=255) cgcgGTCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTctg < 2:476014/150‑1 (MQ=255) gcgcgcCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGcc > 2:2484743/1‑150 (MQ=255) gcccgctcccacagggTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCgg > 1:1280296‑M2/17‑150 (MQ=255) ccgctcccacagggTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCt > 1:2420860‑M2/15‑150 (MQ=255) gctcccacagggTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGt < 2:891765‑M2/138‑1 (MQ=255) ccacagggTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGGCGCTTCAccgccg < 1:722013‑M2/97‑1 (MQ=255) ccacagggTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGGCGCTTCAccgccg > 2:722013‑M2/9‑105 (MQ=255) cacagggTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGc > 2:1389881‑M2/8‑150 (MQ=255) cacagggTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGc > 2:1340666‑M2/8‑150 (MQ=255) acagggTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTAc > 2:2028004‑M2/7‑60 (MQ=255) acagggTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTAc < 1:2028004‑M2/54‑1 (MQ=255) cagggTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCgg > 1:1354569‑M2/6‑150 (MQ=255) agggTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGt < 1:115687‑M2/146‑1 (MQ=255) gggTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTGTTCGCCCGTGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTg < 2:2282271‑M2/147‑1 (MQ=255) gggTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTg < 1:2484743‑M2/147‑1 (MQ=255) ggTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTgg < 1:1340666‑M2/148‑1 (MQ=255) | TTGGGTGACGAAGCCCTGCAAGGCGCCGAACACCAACAGTAGCAACACCGCAAATCCCTGTGGGAGCGGGCACGCCCGCGAATGCGATAGCTCAGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTGG > NC_002947/4845118‑4845413 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |