New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1192305 = | 74 (1.240) | 4 (0.070) | 4/228 | NT | 5.4% | coding (1351/2076 nt) | upxB | phosphatase |
? | NC_002947 | 1192344 = | 70 (1.230) | coding (1312/2076 nt) | upxB | phosphatase |
TTGTTGGTCAGGGTCAGGTATACGTCGCCGTTCAGCGGGTTGACCGTGGTCCACTCCGGGCGGTCCATCGGCGTTGCGCCCACGGCATCGCCGGCACCACGGGTGTTGAGGATGATGCCCGGCAGGTCACCATACAGCGCACCCAGGGTGCTGCCGGCGGTGGTGGCGGTGGCCACGTCCAGCAGCAGCCATACA‑CCGGTGCCGTCGGCATTGAAGCGGGCCACGTAGAGCTTGCCTTGGTCGAGGTACTTGGCGCCGGTGGCCAGGCGGTCGGCCGGGGTGGCGTCGGCGGGGTCCC > NC_002947/1192157‑1192454 | ttgttgGTCAGGGTCAGGTATACGTCGCCGTTCAGCGGGTTGACCGTGGTCCACTCCGGGCGGTCCATCGGCGTTGCGCCCACGGCATCGCCGGCACCACGGGTGTTGAGGATGATGCCCGGCAGGTCACCATACAGCGCACCCAGGGtg > 1:266758/1‑150 (MQ=255) aacgagtacctgtacaagtgggtgtccaccgccgtgtgggaccccgccgacgccaccccggccgaccgcctggccaccggcgccaagtacctcgaccaaggcaagctctacgtggcccgcttcaatgccgacggcaccggtgtatggctg < 1:104532‑M1/2‑1 (MQ=255) gagtacctgtacaagtgggtgtccaccgccgtgtgggaccccgccgacgccaccccggccgaccgcctggccaccggcgccaagtacctcgaccaaggcaagctctacgtggcccgcttcaatgccgacggcaccggtgtatggctgctg < 1:1510086‑M1/5‑1 (MQ=255) gtcagggtcaggTATACGTCGCCGTTCAGCGGGTTGACCGTGGTCCACTCCGGGCGGTCCATCGGCGTTGCGCCCACGGCATCGCCGGCACCACGGGTGTTGAGGATGATGCCCGGCAGGTCACCATACAGCGCACCCAGGGTGCTGCcg > 2:1010258/1‑150 (MQ=255) gtcagggtcaggTATACGTCGCCGTTCAGCGGGTTGACCGTGGTCCACTCCGGGCGGGCCATCGGCGTGGCGCCCACGGCATCGCCGGCACCACGGGTGTTGAGGATGATGCCCGGCAGGTCACCATACAGCGCACCCAGGGTGCTGCcg > 2:1295168/1‑150 (MQ=255) tcagggtcaggTATACGTCGCCGTTCAGCGGGTTGACGGTGGTTATTTCCCGGTGGTCCATCGGCGTTGCGCCCACGGCATCGCCGGCACGACGAGGGTTGATGATGATGCCCGGCAGGTCACCATACAGCGCACCCAGGGTGCTGCcgg > 1:1265611/1‑150 (MQ=255) tcagggtcaggTATACGTCGCCGTTCAGCGGGTTGACCGTGGTCCACTCCGGGCGGTCCATCGGCGTTGCGCCCACGGCATCGCCGGCACCACGGGTGTTGAGGATGATGCCCGGCAGGTCACCATACAGCGCACCCAGGGTGCTGCcgg > 1:1484010/1‑150 (MQ=255) ggtcaggTATACGTCGCCGTTCAGCGGGTTGACCGTGGTCCACTCCGGGCGGTCCATCGGCGTTGCGCCCACGGCATCGCCGGCACCACGGGTGTTGAGGATGATGCCCGGCAGGTCACCATACAGCGCACCCAGGGTGCTGCCGGCggt < 2:1604381/150‑1 (MQ=255) gtcaggTATACGTCGCCGTTCAGCGGGTTGACCGTGGTCCACTCCGGGCGGTCCATCGGCGTTGCGCCCACGGCATCGCCGGCACCACGGGTGTTGAGGATGATGCCCGGCAGGTCACCATACAGCGCACCCAGGGTGCTGCCGGCggtg < 2:266758/150‑1 (MQ=255) tcaggTATACGTCGCCGTTCAGCGGGTTGACCGTGGTCCACTCCGGGCGGTCCATCGGCGTTGCGCCCACGGCATCGCCGGCACCACGGGTGTTGAGGATGATGCCCGGCAGGTCACCATACAGCGCACCCAGGGTGCTGCCGGCggtg < 2:1550013/149‑1 (MQ=255) caaggTATACGTCGCCGTTCAGCGGGTTGACCGTGGTCCACTCCGGGCGGTCCATCGGCGTTGCGCCCACGGCATCGCCGGCACCACGGGTGTTGAGGATGATGCCCGGCAGGTCACCATACAGCGCACCCAGGGTGCTGCCGGCggtg > 1:1550013/3‑149 (MQ=255) taCGTCGCAGTTCAGCGGGTTGACCGTGCTTCCCTCCGGGCGGTCCATCGGCGTTGCGCCCACGGCATCGCCGGCACCACGGGTGTTGAGGATGATGCCCGGCAGGTCACCATACAGCGCACCCAGGGTGCTGCCGGCGGTggtggcggt < 1:1162131/150‑1 (MQ=255) aCGTCGCCGTTCAGCGGGTTGACCGTGGTCCACTCCGGGCGGTCCATCGGCGTTGCGCCCACGGCATCGCCGGCACCACGGGTGTTGAGGATGATGCCCGGCAGGTCACCATACAGCGCACCCAGGGTGCTGCCGGCGGTggtggcggtg < 2:1408058/150‑1 (MQ=255) gTCGCCGTTCAGCGGGTTGACCGTGGTCCACTCCGGGCGGTCCATCGGCGTTGCGCCCACGGCATCGCCGGCACCACGGGTGTTGAGGATGATGCCCGGCAGGTCACCATACAGCGCACCCAGGGTGCTGCCGGCggt < 1:68937/138‑1 (MQ=255) gTCGCCGTTCAGCGGGTTGACCGTGGTCCACTCCGGGCGGTCCATCGGCGTTGCGCCCACGGCATCGCCGGCACCACGGGTGTTGAGGATGATGCCCGGCAGGTCACCATACAGCGCACCCAGGGTGCTGCCGGCggt > 2:68937/1‑138 (MQ=255) gTCGCCGTTCAGCGGGTTGACCGTGGTCCACTCCGGGCGGTCCATCGGCGTTGCGCCCACGGCATCGCCGGCACCACGGGTGTTGAGGATGATGCCCGGCAGGTCACCATACAGCGCACCCAGGGTGCTGCCGGCGGTggtggcggtggc > 1:717386/1‑150 (MQ=255) gCCGTTCAGCGGGTTGACCGTGGTCCACTCCGGGCGGTCCATCGGCGTTGCGCCCACGGCATCGCCGGCACCACGGGTGTTGAGGATGATGCCCGGCAGGTCACCATACAGCGCACCCAGGGTGCTGCCGGCGGTGGTGGCGGTGGCCAc < 2:460074/150‑1 (MQ=255) gCCGTTCAGCGGGTTGACCGTGGTCCACTCCGGGCGGTCCATCGGCGTTGCGCCCACGGCATCGCCGGCACCACGGGTGTTGAGGATGATGCCCGGCAGGTCACCATACAGCGCACCCAGGGTGCTGCCGGCGGTGGGGGCGGTGGCCAc > 1:987253/1‑150 (MQ=255) 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cACTCCGGGCGGTCCATCGGCGTTGCGCCCACGGCATCGCCGGCACCACGGGTGTTGAGGATGATGCCCGGCAGGTCACCATACAGCGCACCCAGGGTGCTGCCGGCGGTGGTGGCGGTGGCCACGTCCAGCAGCAGCCATACA‑CCGGTg > 2:467000/1‑150 (MQ=255) aCTCCGGGCGGTCCATCGGCGTTGCGCCCACGGCATCGCCGGCACCACGGGTGTTGAGGATGATGCCCGGCAGGTCACCATACAGCGCACCCAGGGTGCTGCCGGCGGTGGTGTCGGTGGCCACGTCCAGCAGCAGCCATACA‑CCGGTGc > 1:787760/1‑150 (MQ=255) tCCGGGCGGGCCATCGGCGTTGCGCCCACGGCATCGCCGGCCCCACGGGTGTTGAGGATGGTGCCCGGCAGGTCACCATACAGCGCACCCAGGGCGCTGCCGGCGGTGGTGGGGGTGGCAACGTCGAGGAGCGGCCCTTCT‑CGGGTGCCg > 2:199112/1‑150 (MQ=255) gggCGGTCCATCGGCGTTGCGCCCACGGCATCGCCGGCACCACGGGTGTTGAGGATGATGCCCGGCAGGTCACCATACAGCGCACCCAGGGTGCTGCCGGCGGTGGTGGCGGTGGCCACGTCCAGCAGCAGCCATACA‑CCGGTGCCGTCg > 1:824474/1‑150 (MQ=255) ggCGGGCCGTCGGCGTTGCGGCCACGGCATCGCCGGCACCACGGGTGTTCAGGATGCCGCCCGGCAGGTGACCATACAGCGCACCCAGGGTGCTGCCGGCGGTGGTGCCGGTGGCCACGTCCAGCAGCAGCCATACA‑CCGGTGCCGTccg < 2:649927/150‑3 (MQ=255) cGGTCCATCGGCGTTGCGCCCACGGCATCGCCGGCACCACGGGTGTTGAGGATGATGCCCGGCAGGTCACCATACAGCGCACCCAGGGTGCTGCCGGCGGTGGTGGCGGTGGCCACGTCCAGCAGCAGCCATACA‑CCGGTGCCGTCGGCa < 1:288207/150‑1 (MQ=255) ggTCCATCGGCGTTGCGCCCACGGCATCGCCGGCACCACGGGTGTTGAGGATGATGCCCGGCAGGTCACCATACAGCGCACCCAGGGTGCTGCCGGCGGTGGTGGCGGTGGCCACGTCCAGCAGCAGCCATACA‑CCGGTGCCGTCGGCAt < 1:467000/150‑1 (MQ=255) ggTCCATCGGCGTTGCGCCCACGGCATCGCCGGCACCACGGGTGTTGAGGATGATGCCCGGCAGGTCACCATACAGCGCACCAAGGGTGCTGCCGGCGGTGGTGGCGGTGGCCACGTCCAGCAGCAGCCATACA‑CCGGTGCCGTCGGCAt < 1:519217/150‑1 (MQ=255) gTCCATCGGCGTTGCGCCCACGGCATCGCCGGCACCACGGGTGTTGAGGATGATGCCCGGCAGGTCACCATACAGCGCACCCAGGGTGCTGCCGGCGGTGGTGGCGGTGACCACGTCCAGCAGCAGCCATACA‑CCGGTGCCGTCGGCAtt > 2:1287646/1‑150 (MQ=255) gcctggccaccggcgccaagtacctcgaccaaggcaagctctacgtggcccgcttcaatgccgacggcaccggtgtatggcTGCTGCCGGCGGTGGTGGCGGTGGCCACGTCcagca > 2:747973‑M1/82‑117 (MQ=255) gcctggccaccggcgccaagtacctcgaccaaggcaagctctacgtggcccgcttcaatgccgacggcaccggtgtatggcTGCTGCCGGCGGTGGTGGCGGTGGCCACGTCcagca < 1:747973‑M1/36‑1 (MQ=255) cGGCGTTGCGCCCACGGCATCGCCGGCACCACGGGTGTTGAGGATGATGCCCGGCAGGTCACCATACAGCGCACCCAGGGTGCTGCCGGCGGTGGTGGCGGTGGCCACGTCCAGCAGCAGCCATACA‑CCGGTGCCGTCGGCATTGAAGCg < 1:1331687/150‑1 (MQ=255) ggCGTTGCGCCCACGGCATCGCCGGCACCACGGGTGTTGAGGATGATGCCCGGCAGGTCACCATACAGCGCACCCAGGGTGCTGCCGGCGGTGGTGTCGGTGGCCACGTCCAGCAGCAGCCATACA‑CCGGTGCCGTCGGCATTGAAGCgg < 2:787760/150‑1 (MQ=255) gcgcACGGCAGCGCCGGCACCACGGGTGTTGAGGATGATGACTGGCAGAACACCATACAGCGCACCAAGGTTGCTAGCGACGGTGGGCGCGGTTGCGACCTCCAGCAGCAGCCATAAA‑CCGGTGCCGTCGGCATTGAAGCGGGCCAcaga > 2:597263/4‑147 (MQ=255) gcCCACGGCATCGCCGGCACCACGGGTGTTGAGGATGATGCCCGGCATGTCACCATACAGCGCACCCAGGTTGGTGCCGGCGGTGGTGGCGGTGGCCACGTCCAGCAGCAGCCATACA‑CCGGTGCCGTCGGCATTGAAGCGGGCCACGTa > 1:1350117/1‑150 (MQ=255) cACGGCATCGCCGGCACCACGGGTGTTGAGGATGATGCCCGGCAGGTCACCATACAGCGCACCCAGGGTGCTGCCGGCGGTGGTGGCGGTGGCCACGTCCAGCAGCAGCCATACA‑CCGGTGCCGTCGGCATTGAAGCGGGCCACGTagag < 1:143073/150‑1 (MQ=255) aCGGCATCGCCGGCACCACGGGTGTTGAGGATGATGCCCGGCAGGTCACCATACAGCGCACCCAGGGTGCTGCCGGCGGTGGTGGCGGTGGCCACGTCCAGCAGCAGCCATACA‑CCGGTGCCGTCGGCATTGAAGCGGGCCACGTAGAGc > 1:575679/1‑150 (MQ=255) ccGGCACCACGGGTGTTGAGGATGATGCCCGGCAGGTCACCATACAGCGCACCCAGGGTGCTGCCGGCGGTGGTGGCGGTGGCCACGTCCAGCAGCAGCCATACA‑CCGGTGCCGTCGGCATTGAAGCGGGCCACGTAGAGCTTGCCTTgg < 1:1129550/150‑1 (MQ=255) cGGCACCACGGGTGTTGAGGATGATGCCCGGCAGGTCACCATACAGCGCACCCAGGGTGCTGCCGGCGGTGGTGGCGGTGGCCACGTCCAGCAGCAGCCATACA‑CCGGTGCCGTCGGCATTGAAGCGGGCCACGTAGAGCTTGCCTTGGt < 2:1273126/150‑1 (MQ=255) ggCACCACGGGTGTTGAGGATGATGCCCGGCAGGTCACCATACAGCGCACCCAGGGTGCTGCCGGCGGTGGTGGCGGTGGCCACGTCCAGCAGCAGCCATACA‑CCGGTGCCGTCGGCATTGAAGCGGGCCACGTAGAGCTTGCCTTGGTc > 2:1626549/1‑150 (MQ=255) ggCACCACGGGTGTTGAGGATGATGCCCGGCAGGTCACCATACAGCGCACCCAGGGTGCTGCCGGCGGTGGTGGCGGTGGCCACGTCCAGCAGCAGCCATACA‑CCGGTGCCGTCGGCATTGAAGCGGGCCACGTAGAGCTTGCCTTGGTc < 2:1484010/150‑1 (MQ=255) caccacGGGTGTTGAGGATGATGCCCGGCAGGTCACCATACAGCGCACCCAGGGTGCTGCCGGCGGTGGTGGCGGTGGCCACGTCCAGCAGCAGCCATACA‑CCGGTGCCGTCGGCATTGAAGCGGGCCACGTAGAGCTTGCCTTGGTCGa < 2:575679/150‑1 (MQ=255) ccaaggcaagctctacgtggcccgcttcaatgccgacggcaccggtgtatggcTGCTGCCGGCGGTggtggcggtg < 2:1029099‑M1/23‑1 (MQ=255) ccaaggcaagctctacgtggcccgcttcaatgccgacggcaccggtgtatggcTGCTGCCGGCGGTggtggcggtg > 1:1029099‑M1/54‑76 (MQ=255) cacGGGTGTTGAGGATGATGCCCGGCAGGTCACCATACAGCGCACCCAGGGTGCTGCCGGCGGTGGTGGCGGTGGCCACGTCCAGCAGCAGCCATACA‑CCGGTGCCGTCGGCATTGAAGCGGGCCACGTAGAGCTTGCCTTGGTCGAGGt > 1:690051/1‑150 (MQ=255) cacGGGTGTTGAGGATGATGCCCGGCAGGTCACCATACAGCGCACCCAGGGTGCTGCCGGCGGTGGTGGCGGTGGCCACGTCCAGCAGCAGCCATACA‑CCGGTGCCGTCGGCATTGAAGCGGGCCACGTAGAGCTTGCCTTGGTCGAGGt > 2:74822/1‑150 (MQ=255) acGGGTGTTGAGGATGATGCCCGGCAGGTCACCATACAGCGCACCCAGGGTGCTGCCGGCGGTGGTGGCGGTGGCCACGTCCAGCAGCAGcc > 2:1238547/1‑92 (MQ=255) acGGGTGTTGAGGATGATGCCCGGCAGGTCACCATACAGCGCACCCAGGGTGCTGCCGGCGGTGGTGGCGGTGGCCACGTCCAGCAGCAGcc < 1:1238547/92‑1 (MQ=255) ggTGTTGAGGATGATGCCCGGCAGGTCACCATACAGCGCACCCAGGGTGCTGCCGGCGGTGGTGGCGGTGGCCACGTCCAGCAGCAGCCATACA‑CCGGTGCCGTCGGCATTGAAGCgg > 1:1080767/1‑118 (MQ=255) ggTGTTGAGGATGATGCCCGGCAGGTCACCATACAGCGCACCCAGGGTGCTGCCGGCGGTGGTGGCGGTGGCCACGTCCAGCAGCAGCCATACA‑CCGGTGCCGTCGGCATTGAAGCgg < 2:1080767/118‑1 (MQ=255) gtgtTGAGGATGATGCCCGGCAGGTCACCATACAGCGCACCCAGGGTGCTGCCGGCGGTGGTGGCGGTGGCCACGTCCAGCAGCAGCCATACA‑CCGGTGCCGTCGGCATTGAAGc < 2:198446/115‑1 (MQ=255) gtgtTGAGGATGATGCCCGGCAGGTCACCATACAGCGCACCCAGGGTGCTGCCGGCGGTGGTGGCGGTGGCCACGTCCAGCAGCAGCCATACA‑CCGGTGCCGTCGGCATTGAAGc > 1:198446/1‑115 (MQ=255) tgtTGAGGATGATGCCCGGCAGGTCACCATACAGCGCACCCAGGGTGCTGCCGGCGGTGGTGGCGGTGGCCACGTCCAGCAGCAGCCATACA‑CCTGTGCCGTCGGCATTGAAGCGGGCCACGTAGAGCTTGCCTTGGTCGAGGTACTTgg < 2:724656/150‑1 (MQ=255) aGGATGATGCCCGGCAGGTCACCATACAGCGCACCCAGGGTGCTGCCGGCGGTGGTGGCGGTGGCCACGTCCAGCAGCAGTAGCCCAGGACGGGGCG‑CAACGCTGTATCGGGCCACGTAGAGCTTGCCTTGGTCGAGGTACTTGGCGCCg > 1:603347/1‑150 (MQ=255) gatgCCCGGCAGGTCACCATACAGCGCACCCAGGGTGCTGCCGGCGGTGGTGGCGGTGGCCACGTCCAGCAGCAGCCATACA‑CCGGTGCCGTCGGCATTGAAGCGGGCCACGTAGAGCTTGCCTTGGTCGAGGTACTTGGCGCCGGTGGc > 2:1036979/1‑150 (MQ=255) tgCCCGGCAGGTCACCATACAGCGCACCCAGGGTGCTGCCGGCGGTGGTGGCGGTGGCCACGTCCAGCAGCAGCCATACA‑CCGGTGCCGTCGGCATTGAAGCGGGCCACGTAGAGCTTGCCTTGGTCGAg < 2:315630/130‑1 (MQ=255) tgCCCGGCAGGTCACCATACAGCGCACCCAGGGTGCTGCCGGCGGTGGTGGCGGTGGCCACGTCCAGCAGCAGCCATACA‑CCGGTGCCGTCGGCATTGAAGCGGGCCACGTAGAGCTTGCCTTGGTCGAg > 1:315630/1‑130 (MQ=255) gCCCGGCAGGTCACCATACAGCGCACCCAGGGTGCTGCCGGCGGTGGTGGCGGTGGCCACGTCCAGCAGCAGCCATACA‑CCGGTGCCGTCTGCATTGAAGCGGGCCACGTAGAGCTTGCCTTGGTCGAGGTACTTGGCGCCGGTGGCCAg < 1:199112/150‑1 (MQ=255) gCCCGGCAGGTCACCATACAGCGCACCCAGGGTGCTGCCGGCGGTGGTGGCGGTGGCCACGTCCAGCAGCAGCCATACA‑CCGGTGCCGTCGGCATTGAAGCGGGCCACGTAGAGCTTGCCTTGGTCGAGGTACTTGGCGCCGGTGGCCAg < 2:1265611/150‑1 (MQ=255) cccGGCAGGTCACCATACAGCGCACCCAGGGTGCTGCCGGCGGTGGTGGCGGTGGCCACGTCCAGCAGCAGCCATACA‑CCGGTGCCGTCGGCATTGAAGCGGGCCACGTAGAGCTTGCCTTGGTCGAGGTACTTGGCGCCGGTGGCCAgg < 1:1482566/150‑1 (MQ=255) ccGGCAGGTCACCATACAGCGCACCCAGGGTGCTGCCGGCGGTGGTGGCGGTGGCCACGTCCAGCAGCAGCCATACA‑CCGGTGCCGTCGGCATTGAAGCGGGCCACGTAGAGCTTGCCTTGGTCGAGGTACTTGGCGCCGGTGGCCAGGc > 2:1307766/1‑150 (MQ=255) gTCACCATACAGCGCACCCCGGGTGCTGCCGGCGGTGGTGGCGGTGGCCACGTCCAGCAGCAGCCATACA‑CCGGTGCCGTCGGCATTGAAGCGGGCCACGTAGAGCTTGCCTTGGTCGAGGTACTTGGCGCCGGTGGCCAGGCGGTCgta < 2:1080718/150‑3 (MQ=255) tCACCATACAGCGCACCCAGGGTGCTGCCGGCGGTGGTGGCGGTGGCCACGTCCAGCAGCAGCCATACA‑CCGGTGCCGTCGGCATTGAAGCGGGCCACGTAGCGCTTGCCTTGGTCGAGGTACTTGGCGCCGGTGGCCAGGCGGTCGGcc < 1:377124/150‑1 (MQ=255) tCACCATACAGCGCACCCAGGGTGCTGCCGGCGGTGGTGGCGGTGGCCACGTCCAGCAGCAGCCATACA‑CCGGTGCCGTCGGCATTGAAGCGGGCCACGTAGAGCTTGCCTTGGTCGAGGTACTTGGCGCCGGTGGCCAg < 1:50887/140‑1 (MQ=255) tCACCATACAGCGCACCCAGGGTGCTGCCGGCGGTGGTGGCGGTGGCCACGTCCAGCAGCAGCCATACA‑CCGGTGCCGTCGGCATTGAAGCGGGCCACGTAGAGCTTGCCTTGGTCGAGGTACTTGGCGCCGGTGGCCAg > 2:50887/1‑140 (MQ=255) tCACCATACAGCGCACCCAGGGTGCTGCCGGCGGTGGTGGCGGTGGCCACGTCCAGCAGCAGCCATACA‑CCGGTGCCGTCGGCATTGAAGCGGGCCACGTAGAGCTTGCCTTGGTCGAGGTACTTGGCGCCGGTGGCCAGGCGGTCGGcc > 1:396310/1‑150 (MQ=255) aCCATACAGCGCACCCAGGGTGCTGCCGGCGGTGGTGGCGGTGGCCACGTCCAGCAGCAGCCATACA‑CCGGTGCCGTCGGCATTTAAGCGGGCCACGTAGAGCTTGCCTTGGTCGAg > 1:516116/1‑117 (MQ=255) aCCATACAGCGCACCCAGGGTGCTGCCGGCGGTGGTGGCGGTGGCCACGTCCAGCAGCAGCCATACA‑CCGGTGCCGTCGGCATTGAAGCGGGCCACGTAGAGCTTGCCTTGGTCGa < 2:597687/116‑1 (MQ=255) aCCATACAGCGCACCCAGGGTGCTGCCGGCGGTGGTGGCGGTGGCCACGTCCAGCAGCAGCCATACA‑CCGGTGCCGTCGGCATTGAAGCGGGCCACGTAGAGCTTGCCTTGGTCGa > 1:597687/1‑116 (MQ=255) aCCATACAGCGCACCCAGGGTGCTGCCGGCGGTGGTGGCGGTGGCCACGTCCAGCAGCAGCCATACA‑CCGGTGCCGTCGGCATTGAAGCGGGCCACGTAGAGCTTGCCTTGGTCGAg < 2:516116/117‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) ccAGGGTGCTGCCGGCGGTGGTGGCGGTGGCCACGTCCAGCAGCAGCCATACA‑CCGGTGCCGTCGGCATTGAAGCGGGCCACGTAGAGCTTGCCTTGGTCGAGGTACTTGGCGCCGGTGGCCAGGCGGTCGGCCGGGGTGGCGTcggcgg < 1:565534/150‑1 (MQ=255) ccAGGGTGCTGCCGGCGGTGGTGGCGGTGGCCACGTCCAGCAGCAGCCATACA‑CCGGTGCCGTCGGCATTGAAGCGGGCCACGTAGAGCTTGCCTTGGTCGAGGTACTTGGCGCCGGTGGCCAGGCGGTCGGCCGGGGTGGCGTcggcgg > 1:497463/1‑150 (MQ=255) aGGGTGCTGCCGGCGGTGGTGGCGGTGGCCACGTCCAGCAGCAGCCATACA‑CCGGTGCCGTCGGCATTGAAGCGGGCCACGTAGAGCTTGCCTTGGTCGAGGTACTTGGCGCCGGTGGCCAGGCGGTCGGCCGGGGTGGCGTCGGCgggg > 1:1636359/1‑150 (MQ=255) TGCTGCCGGCGGTGGTGGCGGTGGCCACGTCCAGCAGCAGCCATACA‑CCGGTGCCGTCGGCATTGAAGCGGGCCACGTAGAGCTTGCCTTGGTCGAGGTACTGGGCGCCGGTGGCCAGGCGGTCGGCCGGGGTGGCGTCGGCGGGGTccc > 2:1636359‑M1/1‑150 (MQ=255) | TTGTTGGTCAGGGTCAGGTATACGTCGCCGTTCAGCGGGTTGACCGTGGTCCACTCCGGGCGGTCCATCGGCGTTGCGCCCACGGCATCGCCGGCACCACGGGTGTTGAGGATGATGCCCGGCAGGTCACCATACAGCGCACCCAGGGTGCTGCCGGCGGTGGTGGCGGTGGCCACGTCCAGCAGCAGCCATACA‑CCGGTGCCGTCGGCATTGAAGCGGGCCACGTAGAGCTTGCCTTGGTCGAGGTACTTGGCGCCGGTGGCCAGGCGGTCGGCCGGGGTGGCGTCGGCGGGGTCCC > NC_002947/1192157‑1192454 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |