New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1285024 | 63 (1.050) | 7 (0.120) | 6/238 | NT | 10.0% | coding (249/795 nt) | PP_1122 | OmpA family protein |
? | NC_002947 | = 1285063 | 63 (1.060) | coding (288/795 nt) | PP_1122 | OmpA family protein |
TTGCCGCTGTTGGTGGCTGCCAGCCTGCTCACGGGCTGCGCTACGCACAGCGATGGCAGCGCGCCCCTCAATCAAAGGACCTGGCCCATCTGCAGCCTGCTGGGCGGCTTGGTCGGTGGTGGCCTTGGTGCCATCGAGAGTTCTTCCTGGGCCGCCGGTGGTGGCGCCTTGGGCGCCAT‑TGCCGGCGGGCTGATTTGTTACGCCCAGGACGGTGACGAAGATGGTGACGGCATTTTCGACCGGCGCGATCACTGCCCCGAGACCCCGGCCAACACGGCGGTTGACCACATGGGCTGCCC > NC_002947/1284875‑1285173 | ttGCCGCTGTTGGTGGCTGCCAGCCTGCTCACGGGCTGCTCTACGCACAGCGATGGCAGCGCGCCCCTCAATCAAAGGACCTGGCCCATCTGCAGCCTGCTGGGCGGCTTGGTCGGTGGTGGCCTTGGTGCCATCGAGAGTTCTTCCTGG < 1:473226‑M1/150‑1 (MQ=255) cGCTGTTGGTGGCTGCCAGCCTGCTCACGGGCTGCGCTACGCACAGCGATGGCAGCGCGCCCCTCAATCAAAGGACCTGGCCCATCTGCAGCCTGCTGGGCGGCTTGGTCGGTGGTGGCCTTGGTGCCATCGAGAGTTCTTCCTGGgccg > 1:347812/1‑150 (MQ=255) cGCTGTTGGTGGCTGCCAGCCTGCTCACGGCCTGCGCTACGCACAGCGATGGCGAATCGCCCCTCAATCAAAGCACCTGGCCCATCGGCAGCCTGCTGGGCGGCTTGGTCGGTGGTGGCCTTGGTGCCATCGAGAGTTCTTCCTGGggcg > 1:1021535‑M1/1‑146 (MQ=255) gtggCTGCCAGCCTGCTCACGGGCTGCGCTACGCACAGCGATGGCAGCGCGCCCCTCAATCAAAGGACCTGGCCCATCTGCAGCCTGCTGGGCGGCTTGGTCGGTGGTGGCCGTGGTGCCCTCGAGAGTTCTTCCTGGcccgccgggggt > 2:772256‑M1/1‑138 (MQ=255) ggCTGCCAGCCTGCTCACGGGCTGCGCTACGCACAGCGATGGCAGCGCGCCCCTCAATCAAAGGACCTGGCCCATCTGCAGCCTGCTGGGCGGCTTGGTCGGTGGTGGATTTTGTGCCATCGAGAGTTCTTCCTGGGCCGCCGGtggtgg > 1:1250814/1‑150 (MQ=255) gCCTGCTCACGGGCTGCGCTACGCACAGCGATGGCAGCGCGCCCCTCAATCAAAGGACCTGGCCCATCTGCAGCCTGCTGGGCGGCTTGGTCGGTGGTGGCCTTGGTGCCATCGAGAGTTCTTCCTGGGCCGCCGGTGGTGGCGCCTTgg < 2:347812/150‑1 (MQ=255) gCCTGCTCACGGGCTGCGCTACGCACAGCGATGGCAGCGCGCCCCTCAATCAAAGGACCTGGCCCATCTGCAGCCTGCTGGGCGGCTTGGTCGGTGGTGGCCTTGGTGCCATCGAGAGTTCTTCCTGGGCCGCCGGTGGTGGCGCCTTgg < 1:631566/150‑1 (MQ=255) tCACGGGCTGCGCTACGCACAGCGATGGCAGCGCGCCCCTCAATCAAAGGACCTGGCCCATCTGCAGCCTGCTGGGCGGCTTGGTCGGTGGTGGCCTTGGTGCCATCGAGAGTTCTTCCTGGGCCGCCGGTGGTGGCGCCTTGGGCGCCa > 2:687489/1‑150 (MQ=255) aCGGGCTGCGCTACGCACAGCGATGGCAGCGCGCCCCTCAATCAAAGGACCTGGCCCATCTGCAGCCTGCTGGGCGGCTTGGTCGGTGGTGGCCTTGGTGCCATCGCGAGTTCTTCCTGGACCGCCGGTGGTGGCGCCTTGGGCGCCAt‑t > 2:711914/1‑150 (MQ=255) aCGGGCTGCGCTACGCACAGCGATGGCAGCGCGCCCCTCAATCAAAGGACCTGGCCCATCTGCAGCCTGCTGGGCGGCTTGGTCGGTGGTGGCCTTGGTGCCATCGAGAGTTCTTCCTGGGCCGCCGGTGGTGGCGCCTTGGGCGCCAt‑t < 1:1189877/150‑1 (MQ=255) aCGGGCTGCGCTACGCACAGCGATGGCAGCGCGCCCCTCAATCAAAGGACCTGGCCCATCTGCAGCCTGCTGGGCGGCTTGGTCGGTGGTGGCCTTGGTGCCATCGAGAGTTCTTCCTGGGCCGCCGGTGGTGGCGCCTTGGGCGCCAt‑t > 1:1383877/1‑150 (MQ=255) gCTGCGCTACGCACAGCGATGGCAGCGCGCCCCTCAATCAAAGGACCTGGCCCATCTGCAGCCTGCTGGGCGGCTTGGTCGGTGGTGGCCTTGGTGCCATCGAGAGTTCTTCCTGGGCCGCCGGTGGTGGCGCCTTGGGCGCCAT‑TGCcg < 1:1261970/150‑1 (MQ=255) tGCGCTACGCACAGCGATGGCAGCGCGCCCCTCAATCAAAGGACCTGGCCCATCTGCAGCCTGCTGGGCGGCTTGGTCGGTGGTGGCCTTGGTGCCATCGAGAGTTCTTCCTGGcccgccggcaatggcgcccaaggcgccaccaccggc > 1:508634‑M1/1‑114 (MQ=255) gcgcTACGCACAGCGATGGCCGCGCGCCACTCAATCATAGGACCTGTCCCTTCTGCAGCCTGCTGGGCGGCTTGGTCGGTGGTGGCCTTGGTGCCATCGAGAGTTCTTCCTGGGCCGCCGGTGGTGGCGCCTTGGGCGCCAT‑TGCcggcg < 2:1250814/150‑1 (MQ=255) cTACGCACAGCGATGGCAGCGCGCCCCTCAATCAAAGGACCTGGCCCATCTGCAGCCTGCTGGGCGGCTTGGTCGGTGGTGGCCTTGGTGCCATCGAGAGTTCTTCCTGGcccgccggcaatggcgcccaaggcgccaccaccggcggcc < 2:508634‑M1/150‑41 (MQ=255) cTACGCACAGCGATGGCAGCGCGCCCCTCAATCAAAGGACCTGGCCCATCTGCAGCCTGCTGGGCGGCTTGGTCGGTGGTGGCCTTGGTGCCATCGAGAGTTCTTCCTGGGCCGCCGGTGGTGGCGCCTTGGGCGCCAT‑TGCCGGCGGGc < 2:1397712‑M2/150‑2 (MQ=255) cGCACAGCGATGGCAGCGCGCCCCTCAATCAAAGGACCTGGCCCATCTGCAGCCTGCTGGGCGGCTTGGTCGGTGGTGGCCTTGGTGCCATCGAGAGTTCTTCCTGGGCCGCCGGTGGTGGCGCCTTGGGCGCCAT‑TGCCGGCGGGCTGa > 1:792692/1‑150 (MQ=255) gCACAGCGATGGCAGCGCGCCCCTCAATCAAAGGACCTGGCCCATCTGCAGCCTGCTGGGCGGCTTGGTCGGTGGTGGCCTTGGTGCCATCGAGAGTTCTTCCTGGGCCGCCGGTGGTGGCGCCTTGGGCGCCAT‑TGCCGGCGGGCTGAt < 2:1489297/150‑1 (MQ=255) acaGCGATGGCAGCGCGCCCCTCAATCAAAGGACCTGGCCCATCTGCAGCCTGCTGGGCGGCTTGGTCGGTGGTGGCCTTGGTGCCATCGAGAGTTCTTCCTGGGCCGCCGGTGGTGGCGCCTTGGGCGCCAT‑TGCCGGCGGGCTGAttt < 2:148768/150‑1 (MQ=255) acaGCGATGGCAGCGCGCCCCTCAATCAAAGGACCTGGCCCATCTGCAGCCTGCTGGGCGGCTTGGTCGGTGGTGGCCTTGGTGCCATCGAGAATTCTTCCTTGGCCGCCGGTGGTGGCGCCTTGGGCGCCAT‑TGCAAGCAAGCTGAtgt < 1:530070/150‑3 (MQ=255) aTGGCAGCGCGCCCCTCAATCAAAGGACCTGGCCCATCTGCAGCCTGCTGGGCGGCTTGGTCGGTGGTGGCCTTGGTGCCATCGAGAGTTCTTCCTGGGCCGCCGGTGGTGGCGCCTTGGGCGCCAT‑TGCCGGCGGGCTGATTTGTTACg < 1:162196/150‑1 (MQ=255) aTGGCAGCGCGCCCCTCAATCAAAGGACCTGGCCCATCTGCAGCCTGCTGGGCGGCTTGGTCGGTGGTGGCCTTGGTGCCATCGAGAGTTCTTCCTGGGCCGCCGGTGGTGGCGCCTTGGGCGCCAT‑TGCCGGCGGGCTGATTTGTTACg > 2:1396655/1‑150 (MQ=255) ggCAGCGCGCCCCTCAATCAAAGGACCTGGCCCATCTGCAGCCTGCTGGGCGGCTTGGTCGGTGGTGGCCTTGGTGCCATCGAGAGTTCTTCCTGGGCCGCCGGTGGTGGCGCCTTGGGCGCCAT‑TGCCGGCGGGCTGATTTGTTACGcc < 1:977372/150‑1 (MQ=255) gcCCCTCAATCAAAGGACCTGGCCCATCTGCAGCCTGCTGGGCGGCTTGGTCGGTGGTGGCCTTGGTGCCATCGAGAGTTCTTCCTGGGCCGCCGGTGGTGGCGCCTTGGGCGCCAT‑TGCCGGCGGGCTGATTTGTTACGCCCAGGACgg < 2:1377256/150‑1 (MQ=255) cTCAATCAAAGGACCTGGCCCATCTGCAGCCTGCTGGGCGGCTTGGTCGGTGGTGGCCTTGGTGCCATCGAGAGTTCTTCCTGGGCCGCCGGTGGTGGCGCCTTGGGCGCCAT‑TGCCGGCGGGCTGATTTGTTACGCCCAGGACGGTGAc < 1:687489/150‑1 (MQ=255) aatcaaAGGACCTGGCCCATCTGCAGCCTGCTGGGCGGCTTGGTCGGTGGTGGCCTTGGTGCCATCGAGAGTTCTTCCTGGGCCGCCGGTGGTGGCGCCTTGGGCGCCAT‑TGCCGGCGGGCTGATTTGTTACGCCCAGGACGGTGACGaa > 1:1337600/1‑150 (MQ=255) aatcaaAGGACCTGGCCCATCTGCAGCCTGCTGGGCGGCTTGGTAGGTAGTTACATGTTTGCCATCGAGAGTTCTTCCTGGGCCGCCGGTGGTGGCGCCTTGGGCGCCAT‑TGCCGGCGGGCTGATTTGTTACGCCCAGGACGGTGACGaa > 1:1350517/1‑150 (MQ=255) atcaaAGGACCTGGCCCATCTGCAGCCTGCTGGGCGGCTTGGTCGGTGGGGGCCTTGGTGCCATCGAGAGTTCTTCCTGGGCCGCCGGTGGTGGCGCCTTGGGCGCCAT‑TGCCGGCGGGCTGGTTTGTTACGCCCAGGACGGTGACGAAg > 2:448913/1‑150 (MQ=255) tcaaAGGACCTGGCCCATCTGCAGCCTGCTGGGCGGCTTGGTCGGTGGTGGCCTTGGTGCCATCGAGAGTTCTTCCTGGGCCGCCGGTGGTGGCGCCTTGGGCGCCAt‑t > 2:698908/1‑109 (MQ=255) tcaaAGGACCTGGCCCATCTGCAGCCTGCTGGGCGGCTTGGTCGGTGGTGGCCTTGGTGCCATCGAGAGTTCTTCCTGGGCCGCCGGTGGTGGCGCCTTGGGCGCCAt‑t < 1:698908/109‑1 (MQ=255) aaGGACCTGGCCCATCTGCAGCCTGCTGGGCGGCTTGGTCGGTGGTGGCCTTGGTGCCATCGAGAGTTCTTCCTGGGCCGCCGGTGGTGGCGCCTTGGGCGCCAT‑TGCCGGCGGGCTGATTTGTTACGcc < 2:880418/130‑1 (MQ=255) aaGGACCTGGCCCATCTGCAGCCTGCTGGGCGGCTTGGTCGGTGGTGGCCTTGGTGCCATCGAGAGTTCTTCCTGGGCCGCCGGTGGTGGCGCCTTGGGCGCCAT‑TGCCGGCGGGCTGATTTGTTACGcc > 1:880418/1‑130 (MQ=255) tGGCCCATCTGCAGCCTGCTGGGCGGCTTGGTCGGTGGTGGCCTTGGTGCCATCGAGAGTTCTTCCTGGgccgccggcaatggcgcccaaggcgccaccaccggcggcccaggaa < 1:486867‑M1/115‑47 (MQ=255) tGGCCCATCTGCAGCCTGCTGGGCGGCTTGGTCGGTGGTGGCCTTGGTGCCATCGAGAGTTCTTCCTGGgccgccggcaatggcgcccaaggcgccaccaccggcggcccaggaa > 2:486867‑M1/1‑69 (MQ=255) ccATCTGCAGCCTGCTGGGCGGCTTGGTCGGTGGTGGCCTTGGTGCCATCGAGACTTACTCCTGGGCCGCCGGTGGTGGCGCCTTGGGCGCCAT‑TGCCGGCGGGCTGATTTGTTACGCCCAGGACGGTGACGAAGATGGTGACGGCAttt > 2:222063/1‑150 (MQ=255) ccATCTGCAGCCTGCTGGGCGGCTTGGTCGGGGGTGAGCTTGGTGCCATCGAGAGTGCTTCCTGGGCCGCCGGTGGTGGCGCCGTGGGCGCCAT‑TGCCGGCGGGCTGAATTGTTACGCCCAGGACGGTGACGAAGAGGGTGACGGCAttt > 1:642459/1‑150 (MQ=255) aTCTGCAGCCTGCTGGGCGGCTTGGTCGGTGGTGGCCTTGGTGCCATCGAGAGTTCTTCCTGGGCCGCCGGTGGTGGCGCCTTGGGCGCCAT‑TGCCGGCGGGCTGATTTGTTACGCCCAGGACGGTGACGAAGATGGTGACGGCATTTTc < 1:1107504/150‑1 (MQ=255) gCAGCCTGCTGGGCGGCTTGGTCGGTGGTGGCCTTGGTGCCATCGAGAGTTCTTCCTGGGCCGCCGGTGGTGGCGCCTTGGGCGCCAT‑TGCCGGCGGGCTGATTTGTTACGCCCAGGACGGTGACGAAGATGGTGACGGCATTTTCGAcc > 1:1152141/1‑150 (MQ=255) cAGCCTGCTGGGCGGCTTGGTCGGTGGTGGCCTTGGTGCCATCGAGAGTTCTTCCTGGGCCGCCGGTGGTGgc > 2:1243402/1‑73 (MQ=255) cAGCCTGCTGGGCGGCTTGGTCGGTGGTGGCCTTGGTGCCATCGAGAGTTCTTCCTGGGCCGCCGGTGGTGgc < 1:1243402/73‑1 (MQ=255) ccTGCTGGGCGGCTTGGTCGGTGGTGGCCTTGGTGCCATCGAGAGTTCTTCCTGGGCCGCCGGTGGTGGCGCCTTGGGCGCCAT‑TGCCGGCGGGCTGATTTGTTACGCCCAGGACGGTGACGAAGATGGTGACGGCATTTTCGACCGgcg > 1:1513813/1‑150 (MQ=255) tgctgGGCGGCTTGGTCGGTGGTGGCCTTGGTGCCATCGAGAGTTCTTCCTGGGCCGCCGGTGGTGGCGCCTTGGGCGCCAT‑TGCCGGCGGGCTGATTTGTTACGCCCAGGACGGTGACGAAGATGGTGACGGCATTTTCGACCGGcgcg > 1:1458345/1‑150 (MQ=255) tgGGCGGCTTGGTCGGTGGTGGCCTTGGTGCCATCGAGAGTTCTTCCTGGGCCGCCGGTGGTGGCGCCTTGGGCGCAATGTGAC‑GCGGAGTGATGTGTTACGCCCAGGAACGAGAAGAACATCAAGGCTACTGTTTCGACCGGCGCGATc > 1:1264362/1‑150 (MQ=255) ggcggcTTGGTCGGTGGTGGCCTTGGTGCCATCGAGAGTTCTTCCTGGGCCGCCGGTGGTGGCGCCTTGGGCGCCAT‑TGCCGGCGGGCTGATTTGTTACGCCCAGGACGGTGACGAAGATGGTGACGGCATTTTCGACCGGCGCGATCAc < 2:1513813/150‑1 (MQ=255) ttGGTCGGTGGTGGCCTTGGTGCCATCGAGAGTTCTTCCTGGGCCGCCGGTGGTGGCGCCTTGGGCGCCAT‑TGCCGGCGGGCTGATTTGTTACGCCCAGGACGGTGACGAAGATGGTGACGGCATTTTCGACCGGCGCGATCACTGcccc < 2:1490035/150‑1 (MQ=255) ttGGTCGGTGGTGGCCTTGGTGCCATCGAGAGTTCTTCCTGGGCCGCCGGTGGTGGCGCCTTGGGCGCCAT‑TGCCGGCGGGCTGATTTGTTACGCCCAGGACGGTGACGAAGATGGTGACGGCATTTTCGACCGGCGCGATCACTGcccc > 2:864396/1‑150 (MQ=255) gTCGGTGGTGGCCTTGGTGCCATCGAGAGTTCTTCCTGGGCCGCCGGTGGTGGCGCCTTGGGCGCCAT‑TGCCGGCGGGCTGATTTGTTACGCCCAGGACGGTGACGAAGATGGTGACGGCATTTTCGACCGgc < 2:948944/133‑1 (MQ=255) gTCGGTGGTGGCCTTGGTGCCATCGAGAGTTCTTCCTGGGCCGCCGGTGGTGGCGCCTTGGGCGCCAT‑TGCCGGCGGGCTGATTTGTTACGCCCAGGACGGTGACGAAGATGGTGACGGCATTTTCGACCGgc > 1:948944/1‑133 (MQ=255) gtggtgGCCTTGGTGCCATCGAGAGTTCTTCCTGGGCCGCCGGTGGTGGCGCCTTGGGCGCCAT‑TGCCGGCGGGCTGATTTGTTACGCCCAGGACGGTGACGAAGATGGTGACGGCATTTTCGACCGGCGCGATCACTGCCCCgaga > 1:1579315/1‑147 (MQ=255) gtggtgGCCTTGGTGCCATCGAGAGTTCTTCCTGGGCCGCCGGTGGTGGCGCCTTGGGCGCCAT‑TGCCGGCGGGCTGATTTGTTACGCCCAGGACGGTGACGAAGATGGTGACGGCATTTTCGACCGGCGCGATCACTGCCCCgaga < 2:1579315/147‑1 (MQ=255) gtggtgGCCTTGGTGCCATCGAGAGTTCTTCCTGGGCCGCCGGTGGTGGCGCCTTGGGCGCCAT‑TGCCGGCGGGCTGATTTGTTACGCCCAGGACGGTGACGAAGATGGTGACGGCATTTTCGACCGGCGCGATCACTGCCCCGAGAccc < 2:1337600/150‑1 (MQ=255) gtggtgGCCTTGGTGCCATCGAGAGTTCTTCCTGGGCCGCCGGTGGTGGCGCCTTGGGCGCCAT‑TGCCGGCGGGCTGATTTGTTACGCCCAGGACGGTGACGAAGATGGTGACGGCATTTTCGACCGGCGCGATCACTGCCCCGAGAccc < 2:1383877/150‑1 (MQ=255) tggtggCCTTGGTGCCATCGAGAGTTCTTCCTGGGCCGCCGGTGGTGGCGCCTTGGGCGCCAT‑TGCCGGCGGGCTGATTTGTTACGCCCAGGACGGTGACGAAGATGGTGACGGCATTTTCGACCGGCGCGATCACTGCCCCGAGGcccc > 1:21532/1‑150 (MQ=255) tggCCTTGGTGCCATCGAGAGTTCTTCCTGGGCCGCCGGTGGTGGCGCCTTGGGCGCCAT‑TGCCGGCGGGCTGATTTGTTACGCCCAGGACGGTGACGAAGATGGTGACGGCATTTTCGACCGGCGCGATCACTGCCCCGAGACCCCGGc < 2:1152141/150‑1 (MQ=255) ggCCTTGGTGCCATCGAGAGTTCTTCCTGGGCCGCCGGTGGTGGCGCCTTGGGCGCCAT‑TGCCGGCGGGCTGATTTGTTACGCCCAGGACGGTGACGAAGATGGTGACGGCATTTTCGACCGGCGCGATCACTGCCCCGAGACCCCGGcc > 1:1467567/1‑150 (MQ=255) ccTTGGTGCCATCGAGAGTTCTTCCTGGGCCGCCGGTGGTGGCGCCTTGGGCGCCAT‑TGCCGGCGGGCTGATTTGTTACGCCCAGGACGGTGACGAAGATGGTGACGGCATTTTCGACCGGCGCGATCACTGCCCCGAGAc > 1:1100018/1‑141 (MQ=255) ccTTGGTGCCATCGAGAGTTCTTCCTGGGCCGCCGGTGGCGGCGCCTTGGGCGCCAT‑TGCCGGCGGGCTGATTTGTTACGCCCAGGACGGTGACGAAGATGGTGACGGCATTTTCGACCGGCGCGATCACTGCCCCGAGAc < 2:1100018/141‑1 (MQ=255) gTGCCATCGAGAGTTCTTCCTGGcccgccgacaatggcgcccaaggcgccaccaccggcggcccaggaa < 2:1643540‑M1/69‑47 (MQ=255) gTGCCATCGAGAGTTCTTCCTGGcccgccgacaatggcgcccaaggcgccaccaccggcggcccaggaa > 1:1643540‑M1/1‑23 (MQ=255) tGCCATCGAGAGTTCTTCCTGGGCCGCCGGTGGTGGCGCCTTGGGCGCCAT‑TGCCGGCGGGCTGATTTGTTACGCCCAGGACGGTGACGAAGATGGTGACGGCATTTTCGACCGGCGCGATAAGTGCCGCGAGACCCCGGCCAACAcggc > 2:787324/1‑150 (MQ=255) gCCATCGAGAGTTCTTCCTGGGCCGCCGGTGGTGGCGCCTTGGGCGCCAT‑TGCCGGCGGGCTGATTTGTTACGCCCAGGACGGTGACGAAGATGGTGACGGCATTTTCGACCGGCGCGATCACTGCCCCGAGACCCCGGCCAACAcggcg < 2:1597814/150‑1 (MQ=255) gCCATCGAGAGTTCTTCCTGGGCCGCCGGTGGTGGCGCCTTGGGCGCCAT‑TGCCGGCGGGCTGATTTGTTACGCCCAGGACGGTGACGAAGATGGTGACGGCATTTTCGACCGGCGCGATCACTGCCCCGAGACCCCGGCCAACAcggcg < 2:1458345/150‑1 (MQ=255) aTCGAGAGTTCTTCCTGGGCCGCCGGTGGTGGCGCCTTGGGCGCCAT‑TGCCGGCGGGCTGATTTGTTACGCCCAGGACGGTGACGAAGATGGTGACGGCATTTTCGACCGGCGCGATCACTGCCCCGAGACCCCGGCCAACACGGCGGtt > 2:705973/1‑150 (MQ=255) aTCGAGAGTTCTTCCTGGGCCGCCGGTGGTGGCGCCTTGGGCGCCAT‑TGCCGGCGGGCTGATTTGTTACGCCCAGGACGGTGACGAAGATGGTGACGGCATTTTCGACCGGCGCGATCACTGCCCCGAGACCCCGGCCAACACGGCGGtt < 2:1264362/150‑1 (MQ=255) aTCGAGAGTTCTTCCTGGGCCGCCGGTGGTGGCGCCTTGGGCGCCAT‑TGCCGGCGGGCTGATTTGTTACGCCCAGGACGGTGACGAAGATGGTGACGGCATTTTCGACCGGCGCGATCACTGCCCCGAGACCCCGGCCAACACGGCGGtt < 2:371640/150‑1 (MQ=255) aTCGAGAGTTCTTCCTGGGCCGCCGGTGGTGGCGCCTTGGGCGCCAA‑TGCCGGCGCGCTGATTTGTTACACCCAGGACGGTGACCAAGATGGTGACGGCATTTTCGACCGGCGCGATCACTGCCCCGAAACCACGGCCAACACGGCGGtt < 2:1264443/150‑1 (MQ=255) gagaGTTCTTCCTGGGCCGCCGGTGGTGGCGCCTTGGGCGCCAT‑TGCCGGCGGGCTGATTTGTTACGCCCAGGACGGTGACGAAGATGGTGACGGCATTTTCGACCGGCGCGATCACTGCCCCGAGACCCCGGCCAACACGGCGGTTGAc < 1:1262411/150‑1 (MQ=255) gagaGTTCTTCCTGGGCCGCCGGTGGTGGCGCCTTGGGCGCCAT‑TGCCGGCGGGCTGATTTGTTACGCCCAGGACGGTGACGAAGATGGTGACGGCATTTTCGACCGACCGGATCACTGCCCCGAGACCCCGGCCAACACGGCGGTTGAc > 1:429457/1‑150 (MQ=255) agagTTCTTCCTGGGCCGCCGGTGGTGGCGCCTTGGGCGCCAT‑TGCCGGCGGGCTGATTTGTTACGCCCAGGACGGTGACGAAGATGGTGACGGCATTTTCGACCGGCGCGATCACTGCCCCGAGACCCCGGCCAACACGGCGGTTGAcc > 2:1643990/1‑150 (MQ=255) agagTTCTTCCTGGGCCGCCGGTGGTGGCGCCTTGGGCGCCAT‑TGCCGGCGGGCTGATTTGTTACGCCCAGGACGGTGACGAAGATGGTGACGGCATTTTCGACCGGCGCGATCACTGCCCCGAGACCCCGGCCAACACGGCGGTTGAcc > 2:1123498/1‑150 (MQ=255) agTTCTTCCTGGGCCGCCGGTGGTGGCGCCTTGGGCGCCAT‑TGCCGGCGGGCTGATTTGTTACGCCCAGGACGGTGACGAAGATGGTGACGGCATTTTCGACCGGCGCGATCACTGCCCCGAGACCCCGGCCAACACGGCGGTTGACcac < 1:1397712/150‑1 (MQ=255) gTTCTTCCTGGGCCGCCGGTGGTGGCGCCTTGGGCGCCAT‑TGCCGGCGGGCTGATTTGTTACGCCCAGGACGGTGACGAAGATGGTGACGGCATTTTCGACCGGCGCGATCACTGCCCCGAGACCCCGGCCAACACGGCGGTTGACcaca > 2:829586/1‑150 (MQ=255) gTTCTTCCTGGGCCGCCGGTGGTGGCGCCTTGGGCGCCAT‑TGCCGGCGGGCTGATTTGTTACGCCCAGGACGGTGACGAAGATGGTGACGGCATTTTCGACCGGCGCGATCACTGCCCCGAGACCCCGGCCAACACGGCGGTTGACcaca > 2:373765/1‑150 (MQ=255) ttcCTGGGCCGCCGGTGGTGGCGCCTTGGGCGCCAT‑TGTCGGCGGGccaggaagaactctcgatggcac > 1:1643540‑M2/1‑46 (MQ=255) ttcCTGGGCCGCCGGTGGTGGCGCCTTGGGCGCCAT‑TGTCGGCGGGccaggaagaactctcgatggcac < 2:1643540‑M2/69‑24 (MQ=255) ttcCTGGGCCGCCGGTGGTGGCGCCTTGGGCGCCAT‑TGCCGGCGGGCTGATTTGTTACGCCCAGGACGGTGACGAAGATGGTGACGGCATTTTCGACCGGCGCGATCACTGCCCCGAGACCCCGGCCAACACGGCGGTTGACCACATagg < 1:1643990/150‑1 (MQ=255) ttcCTGGGCCGCCGGTGGTGGCGCCTTGGGCGCCAT‑TGCCGGCGGCccaggaagaactctcgatggcaccaaggccaccaccgaccaagccgcccagcaggctgcagatgggcca > 2:486867‑M2/1‑46 (MQ=255) ttcCTGGGCCGCCGGTGGTGGCGCCTTGGGCGCCAT‑TGCCGGCGGCccaggaagaactctcgatggcaccaaggccaccaccgaccaagccgcccagcaggctgcagatgggcca < 1:486867‑M2/115‑70 (MQ=255) ccTGGGCCGCCGGTGGTGGCGCCTTGGGCGCCAT‑TGCCGGCGGGCTGATTTGTTACGCCCAGGACGGTGACGAAGATGGTGACGGCATTTTCGACCGGCGCGATCACTGCCCCGAGACCCCGGCCAACACGGCGGTTGACCACATGGGCt < 2:792692/150‑1 (MQ=255) tGGGCCGCCGGTGGTGGCGCCTTGGGCGCCAT‑TGCCGGCGGGCTGATTTGTTACGCCCAGGACGGTGACGAAGATGGTGACGGCATTTTCGACCGGCGCGATCACTGCCCCGAGACCCCGGCCAACACGGCGGTTGACCACATGGGCTGc < 2:1467567/150‑1 (MQ=255) ggCCGCCGGTGGTGGCGCCTTGGGCGCCAT‑TGCCGGCGGGccaggaagaactctcgatggcaccaaggccaccaccgaccaagccgcccagcaggctgcagatgggccaggtcctttgattgaggggcgcgctgccatcgctgtgcgtag < 2:508634‑M2/150‑111 (MQ=255) gcccgccggcaatggcgcccaaggcgccaccaccggcggcccaggaagaactctcgatggcaccaaggccaccaccgaccaagccgcccagcaggctgcagatgggccaggtcctttgattgaggggcgcgctgccatcgctgtgcgtag < 2:1397712‑M1/150‑150 (MQ=255) | TTGCCGCTGTTGGTGGCTGCCAGCCTGCTCACGGGCTGCGCTACGCACAGCGATGGCAGCGCGCCCCTCAATCAAAGGACCTGGCCCATCTGCAGCCTGCTGGGCGGCTTGGTCGGTGGTGGCCTTGGTGCCATCGAGAGTTCTTCCTGGGCCGCCGGTGGTGGCGCCTTGGGCGCCAT‑TGCCGGCGGGCTGATTTGTTACGCCCAGGACGGTGACGAAGATGGTGACGGCATTTTCGACCGGCGCGATCACTGCCCCGAGACCCCGGCCAACACGGCGGTTGACCACATGGGCTGCCC > NC_002947/1284875‑1285173 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |