New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1556514 | 44 (0.730) | 5 (0.090) | 5/230 | NT | 10.5% | coding (376/852 nt) | purU‑II | formyltetrahydrofolate hydrolase |
? | NC_002947 | = 1556524 | 43 (0.750) | coding (386/852 nt) | purU‑II | formyltetrahydrofolate hydrolase |
GACCTGGCGCATTACCGACTCGGCTCAGAAAAAACGCGTGGTATTGATGGCCAGCCGTGAGTCGCACTGCCTGGCAGACTTGCTGCACCGCTGGCACACCGATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACC‑TGC‑GCAGCATGGTCGAGTGGCACGGTATTCCGTTCTTCCATGTACCGGTCGACCCCAAAGACAAGGCCCCGGCCTTTGCCGAAGTGTCGCGCCTGGTGCAGGAGCATGCCGCCGACGTCGTGGTGCTGGCCCGCTACATGCAGATCCTG > NC_002947/1556366‑1556663 | gACCTGGCGCATTACCGACTCGGCTCAGAAAAAACGCGTGGTATTGATGGCCAGCCGTGAGTCGCACTGCCTGGCAGACTTGCTGCACCGCTGGCACACCGATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACC‑t > 2:1535763/1‑150 (MQ=255) tGGCGCATTACCGACTCGGCTCAGAAAAAACGCGTGGTATTGATGGCCAGCCGTGAGTCGCACTGCCTGGCAGCCTTTCTGCACCGCGGGCACACCGATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACC‑Tgc‑gc > 1:1434211/1‑150 (MQ=255) aTTACCGACTCGGCTCAGAAAAAACGCGTGGTATTGATGGCCAGCCGTGAGTCGCACTGCCTGGCAGACTTGCTGCACCGCTGGCACACCGATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACC‑TGC‑GCAGCATg < 1:249778‑M2/150‑2 (MQ=255) aTTACCGACTCGGCTCAGAAAAAACGCGTGGTATTGATGGCCAGCCGTGAGTCGCACTGCCTGGCAGACTTGCTGCACCGCTGGCACACCGATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACC‑TGC‑GCAGCATg > 2:635519‑M2/1‑149 (MQ=255) aCCGACTCGGCTCAGAAAAAACGCGTGGTATGGATGGCCAGCCGTGAGTCGCACTGCCTGGCAGACTTGCTGCACCGCTGGCACACCGATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACC‑TGC‑GCAGCATgttc > 2:416745‑M2/1‑146 (MQ=255) cTCGGCTCAGAAAAAACGCGTGGTATTGATGGCCAGCCGTGAGTCGCACTGCCTGGCAGACTTGCTGCACCGCTGGCACACCGATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACC‑TGC‑GCAGCATGGTCGAGTg < 2:1540061/150‑1 (MQ=255) cTCAGAAAAAACGCGTGGTATTGATGGCCAGCCGTGAGTCGCACTGCCTGGCAGACTTGCTGCACCGCTGGCACACCGATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACT‑CGACCATGCTGC‑GCAgtcgttgtggttgg > 1:1423506‑M2/1‑136 (MQ=255) tCAGAAAAAACGCGTGGTATTGATGGCCAGCCGTGAGTCGCACTGCCTGGCAGACTTGCTGCACCGCTGGCACACCGATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACC‑TGC‑GCAGCATGGTCGAGTGGCACgg < 1:1535763/150‑1 (MQ=255) aaaaCGCGTGGTATTGATGGCCAGCCGTGAGTCGCACTGCCTGGCAGACTTGCTGCACCGCTGGCACACCGATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACC‑TGC‑GCAGCATGGTCGAGTGGCACGGTATTcc < 1:612381/150‑1 (MQ=255) tGGTATTGATGGCCAGCCGTGAGTCGCACTGCCTGGCAGACTTGCTGCACCGCTGGCACACCGATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACC‑TGC‑GCAGCATGGTCGAGTGGCACGGTATTCCGTTCTTcc < 1:332192/150‑1 (MQ=255) gTATTGATGGCCAGCCGTGAGTCGCACTGCCTGGCAGACTTGCTGCACCGCTGGCACACCGATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACC‑TGC‑GCAGCATGGTCGAGTGGCACGGTATTCCGTTCTTCCAt < 2:411996/150‑1 (MQ=255) tATTGATGGCCAGCCGTGAGTCGCACTGCCTGGCAGACTTGCTGCACCGCTGGCACACCGATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACC‑TGC‑GCAGCATGGTCGAGTGGCACGGTATTCCGTTCTTCCATg > 2:962294/1‑150 (MQ=255) tGATGGCCAGCCGTGAGTCGCACTGCCTGGCAGACTTGCTGCACCGCTGGCACACCGATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACC‑TGC‑GCAGCATGGTCGAGTGGCACGGTATTCCGTTCTTCCATGTAc < 2:1434108/150‑1 (MQ=255) cAGCCGTGAGTCGCACTGCCTGGCAGACTTGCTGCACCGCTGGCACACCGATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACC‑TGC‑GCAGCATGGTCGa > 1:340084/1‑114 (MQ=255) cAGCCGTGAGTCGCACTGCCTGGCAGACTTGCTGCACCGCTGGCACACCGATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACC‑TGC‑GCAGCATGGTCGa < 2:340084/114‑1 (MQ=255) gCCGTGAGTCGCACTGCCTGGCAGACTTGCTGCACCGCTGGCACACCGATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACC‑TGC‑GCAGCATGGTCGAGTGGCACGGTATTCCGTTCTTCCATGTACCGGTCGAcc < 2:249778/150‑1 (MQ=255) gAGTCGCACTGCCTGGCAGACTTGCTGCACCGCTGGCACACCGATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACC‑TGC‑GCAGCATGGTCGAGTGGCACGGTATTCCGTTCTTCCATGTACCGGTCGACCCCaaa < 2:1434211/150‑1 (MQ=255) gAGTCGCACTGCCTGGCAGACTTGCTGCACCGCTGGCACACCGATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACC‑TGC‑GCAGCATGGTCGAGTGGCACGGTATTCCGTTCTTCCATGTACCGGTCGACCCCaaa < 1:578586/150‑1 (MQ=255) cACTGCCTGGCAGACTTGCTGCACCGCTGGCACACCGATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACC‑TGC‑GCAGCATGGTCGAGTGGCACGGTATTCCGTTCTTcc < 2:1293705/124‑1 (MQ=255) cACTGCCTGGCAGACTTGCTGCACCGCTGGCACACCGATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACC‑TGC‑GCAGCATGGTCGAGTGGCACGGTATTCCGTTCTTcc > 1:1293705/1‑124 (MQ=255) aCTGCCTGGCAGACTTGCTGCACCGCTGGCACACCGATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACC‑TGC‑GCAGCATgg < 2:468104‑M2/96‑3 (MQ=255) aCTGCCTGGCAGACTTGCTGCACCGCTGGCACACCGATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACC‑TGC‑GCAGCATgg > 1:468104‑M2/1‑94 (MQ=255) cTGCCTGGCAGACTTGCTGCACCGCTGGCACACCGATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACC‑TGC‑GCAGCATGGTCGAGTGGCACGGTATTCCGTTCTTCCATGTACCGGTCGACCCCAAAGACAAGGc < 2:1352550/150‑1 (MQ=255) gCCTGGCAGACTTGCTGCACCGCTGGCACACCGATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACC‑TGC‑GCAGCATGGTCGAg > 2:914338/1‑98 (MQ=255) gCCTGGCAGACTTGCTGCACCGCTGGCACACCGATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACC‑TGC‑GCAGCATGGTCGAg < 1:914338/98‑1 (MQ=255) aCTTGCTGCACCGCTGGCACACCGATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACC‑TGC‑GCAGCATGGTCGAGTGGCACGGTATTCCGTTCTTCCATGTACCGGTCGACCCCAAAGa < 2:1483660/133‑1 (MQ=255) aCTTGCTGCACCGCTGGCACACCGATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACC‑TGC‑GCAGCATGGTCGAGTGGCACGGTATTCCGTTCTTCCATGTACCGGTCGACCCCAAAGa > 1:1483660/1‑133 (MQ=255) gctgcACCGCTGGCACACCGATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACCatgctgcgcaggtcgttgtgg < 2:197324‑M1/89‑22 (MQ=255) gctgcACCGCTGGCACACCGATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACCatgctgcgcaggtcgttgtgg > 1:197324‑M1/1‑68 (MQ=255) ctgcACCGCTGGCACACCGACGACCTGGACTCCGCGATCCCAGGCGTGCTTTCCACCCCCAACCACC‑CTC‑GCAGCCGGGTCGAGTGCCACCGCACTCCGCTCTTCCATGTAGCGGGCGACCCCAAAGCCAAGGCCCCGGCCCTTCCCCaa > 2:1031490/1‑150 (MQ=255) tgcACCGCTGGCACACCGATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACCatgctgcgcaggtcgttgtg > 1:216382‑M1/1‑66 (MQ=255) tgcACCGCTGGCACACCGATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACCatgctgcgcaggtcgttgtg < 2:216382‑M1/86‑21 (MQ=255) cACCGCTGGCACACCGATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACC‑TGC‑GCAGCATGGTCGAGTGGCACGGTATTCCGTTCTTCCATGTACCGGTCGACCCCAAAGACAAGGCCCCGGCCTTTGCCGAAgtg > 2:1600888/1‑150 (MQ=255) cGCTGGCACACCGATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACC‑TGC‑GCAGCATGGTCGAGTGGCACGGTATTCCGTTCTTCCATGTACCGGTCGACCCCAAAGACAAGGCCCCGGCCTTTGCCGAAGTGTcg > 1:1243659/1‑150 (MQ=255) tGGCACACCGATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACC‑TGC‑GCAGCATGGTCGAGTGGCACGGTATTCCGTTCTTCCATGTACCGGTCGACCCCAAAGACAAGGCCCCGGCCTTTGCCGAAGTGTCgcgc > 1:64283/1‑150 (MQ=255) cgatctaTGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACC‑TGC‑GCAGCATGGTCGAGTGGCACGGTATTCCGTTCTTCCATGTACCGGTCGACCCCAAAGACAAGGCCCCGGCCTTTGCCGAAGTGTCGCGCCTgg < 2:445996/144‑1 (MQ=255) acacCGATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACC‑TGC‑GCAGCATGGTCGAGTGGCACGGTATTCCGTTCTTCCATGTACCGGTCGACCCCAAAGACAAGGCCCCGGCCTTTGCCGAAGTGTCGCGCCTgg < 1:962294/150‑1 (MQ=255) acCGATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACC‑TGC‑GCAGCATGGTCGAGTGGCACGGTATTCCGTTCTTCCATGTACCGGTCGACCCCAAAGACAAGGCCCCGGCCTTTGCCGAAGTGTCGCGCCTGGTg > 2:1084513/1‑150 (MQ=255) gATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACC‑TGC‑GCAGCATGGTCGAGTGGCACGGTATTCCGTTCTTCCATGTACCGGTCGACCCCAAAGACAAGGCCCCGGCCTTTGCCGaa > 1:991252/1‑132 (MQ=255) gATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACC‑TGC‑GCAGCATGGTCGAGTGGCACGGTATTCCGTTCTTCCATGTACCGGTCGACCCCAAAGACAAGGCCCCGGCCTTTGCCGaa < 2:991252/132‑1 (MQ=255) tGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAGTTTTC‑TGC‑GCATCCTGGTCGAGTGGCACTGGTTTCCGTTCTTCCATGTACCGGTCGACCCCAAAGACAAGGCCCCGGCCTTTGCCGAAGTGTCGCGCCTGGtagatcg > 1:445996/1‑144 (MQ=255) cTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACC‑TGC‑GCAGCATGGTCGAGTGGCACGGTATTCCGTTCTTcc < 2:828361/82‑1 (MQ=255) cTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACC‑TGC‑GCAGCATGGTCGAGTGGCACGGTATTCCGTTCTTcc > 1:828361/1‑82 (MQ=255) tGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACC‑TGC‑GCAGCATGGTCGAGTGGCACGGTATTCCGTTCTTCCATGTACCGGTCGACCCCAAAGACAAGGCCCCGGCCTTTGCCGaa < 1:426144/120‑1 (MQ=255) tGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACC‑TGC‑GCAGCATGGTCGAGTGGCACGGTATTCCGTTCTTCCATGTACCGGTCGACCCCAAAGACAAGGCCCCGGCCTTTGCCGaa > 2:426144/1‑120 (MQ=255) cccTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACC‑TGC‑GCAGCATGGTCGAGTGGCACGGTATTCCGTTCTTCCATGTACCGGTCGACCCCAAAGACAAGGCCCCGGCCTTTGCCGAAGTGTCGCGCCTGGTGCAGGAGCATGCCGCCGAcgtcgt > 2:169757/1‑150 (MQ=255) ccTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACC‑TGC‑GCAGCATGGTCGAGTGGCACGGTATTCCGTTCTTCCATGTACCGGTCGACCCCAAAGAc < 2:1273934/90‑1 (MQ=255) ccTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACC‑TGC‑GCAGCATGGTCGAGTGGCACGGTATTCCGTTCTTCCATGTACCGGTCGACCCCAAAGAc > 1:1273934/1‑90 (MQ=255) gCGTGATTTCCAACCACAACGACC‑TGC‑GCAGCATGGTCGAGTGGCACGGTATTCCGTTCTTCCATGTACCGGTCGACCCCAAAGACAAGGCCCCGGCCTTTGCCGAAGTGTCGCGCCTGGTGCAGGAGCATGCCGCCGACGTCGTGGTGc > 2:1157815/1‑150 (MQ=255) gATTTCCAACCACAACGACC‑TGC‑GCAGCATGGTCGAGTGGCACGGTATTCCGTTCTTCCATGTACCGGTCGACCCCAAAGACAAGGCCCCGGCCTTTGCCGAAGTGTCGCGCCTGGTGCAg > 1:1259410/1‑121 (MQ=255) gATTTCCAACCACAACGACC‑TGC‑GCAGCATGGTCGAGTGGCACGGTATTCCGTTCTTCCATGTACCGGTCGACCCCAAAGACAAGGCCCCGGCCTTTGCCGAAGTGTCGCGCCTGGTGCAg < 2:1259410/121‑1 (MQ=255) gATTTCCAACCACAACGACC‑TGC‑GCAGCATGGTCGAGTGGCACGGTATTCCGTTCTTCCATGTACCGGTCGACCCCAAAGACAAGGCCCCGGCCTTTGCCGAAGTGTCGCGCCTGGTGCAGGAGCATGCCGCCGACGTCGTGGTGCTGGc < 1:1600888/150‑1 (MQ=255) ccAACCACAACGACCtgcgcagcatggtcgagtggttggaaatcacgcaagggatctcgcagtccagctcatcggtgtgccagcggtgcagcaagtctgccaggcagtgcgactcacggctggccatcaataccacgcgttttttctgag > 1:1423506‑M1/1‑15 (MQ=255) aaCCACAACGACC‑TGC‑GCAGCATGGTCGAGTGGCACGGTATTCCGTTCTTCCATGTACCGGTCGACCCCAAAGACAAGGCCCCGGCCTTTGCCGAAGTGTCGCGCCTGGTGCAGGAGCATGCCGCCGACGTCGTGGTGCTGGCCCGCTAc > 1:159357/1‑150 (MQ=255) ccACAACGACC‑TGC‑GCAGCATggtcgttgtggttggaaatcacgcaagggatctcgcagtccagctcatcggtgtgccagcggtgcagc > 1:197324‑M2/1‑21 (MQ=255) ccACAACGACC‑TGC‑GCAGCATggtcgttgtggttggaaatcacgcaagggatctcgcagtccagctcatcggtgtgccagcggtgcagc < 2:197324‑M2/89‑69 (MQ=255) ccACAACGACC‑TGC‑GCAGCATGGTCGAGTGGCACGGTATTCCGTTCTTCCATGTACCGGTCGACCCCAAAGACAAGGCCCCGGCCTTTGCCGAAGTGTCGCGCCTGGTGCAGGAGCATGCCGCCGACGTCGTGGTGCTGGCCCGCTACAt < 2:1243659/150‑1 (MQ=255) cacaACGACC‑TGC‑GCAGCATggtcgttgtggttggaaatcacgcaagggatctcgcagtccagctcatcggtgtgccagcggtgca > 1:216382‑M2/1‑20 (MQ=255) cacaACGACC‑TGC‑GCAGCATggtcgttgtggttggaaatcacgcaagggatctcgcagtccagctcatcggtgtgccagcggtgca < 2:216382‑M2/86‑67 (MQ=255) acaACGACC‑TGC‑GCAGCATGGTCGAGTGGCACGGTATTCCGTTCTTCCATGTACCGGTCGACCCCAAAGACAAGGCCCCGGCCTTTGCCGAAGTGTCGCGCCTg > 1:1285054/1‑104 (MQ=255) acaACGACC‑TGC‑GCAGCATGGTCGAGTGGCACGGTATTCCGTTCTTCCATGTACCGGTCGACCCCAAAGACAAGGCCCCGGCCTTTGCCGAAGTGTCGCGCCTg < 2:1285054/104‑1 (MQ=255) gaacatgctgcgcaggtcgttgtggttggaaatcacgcaagggatctcgcagtccagctcatcggtgtgccagcggtgcagcaagtctgccaggcagtgcgactcacggctggccatccataccacgcgttttttctgagccgagtcggt > 2:416745‑M1/4‑4 (MQ=255) ccatgctgcgcaggtcgttgtggttggaaatcacgcaagggatctcgcagtccagctcatcggtgtgccagcggtgcagcaagtctgccaggcagt < 2:468104‑M1/96‑95 (MQ=255) ccatgctgcgcaggtcgttgtggttggaaatcacgcaagggatctcgcagtccagctcatcggtgtgccagcggtgcagcaagtctgccaggcagt > 1:468104‑M1/1‑2 (MQ=255) catgctgcgcaggtcgttgtggttggaaatcacgcaagggatctcgcagtccagctcatcggtgtgccagcggtgcagcaagtctgccaggcagtgcgactcacggctggccatcaataccacgcgttttttctgagccgagtcggtaat < 1:249778‑M1/150‑150 (MQ=255) catgctgcgcaggtcgttgtggttggaaatcacgcaagggatctcgcagtccagctcatcggtgtgccagcggtgcagcaagtctgccaggcagtgcgactcacggctggccatcaataccacgcgttttttctgagccgagtcggtaat > 2:635519‑M1/1‑1 (MQ=255) c‑TGC‑GCAGCATGGTCGAGTGGCACGGTATTCCGTTCTTCCATGTACCGGTCGACCCCAAAGACAAGGCCCCGGCCTTTGCCGAAGTGTCGCGCCTGGTGCAGGAGCATGCCGCCGACGTCGTGGTGCTGGCCCGCTACATGCAGATCCTg > 2:57417/1‑150 (MQ=255) c‑TGC‑GCAGCATGGTCGAGTGGCACGGTATTCCGTTCTTCCATGTACCGGTCGACCCCAAAGACAAGGCCCCGGCCTTTGCCGAAGTGTCGCGCCTGGTGCAGGAGCATGCCGCAGACGACCTCGTTCTGGCCCGCTACATGCAGATCCTg > 1:1599319/1‑150 (MQ=255) | GACCTGGCGCATTACCGACTCGGCTCAGAAAAAACGCGTGGTATTGATGGCCAGCCGTGAGTCGCACTGCCTGGCAGACTTGCTGCACCGCTGGCACACCGATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACC‑TGC‑GCAGCATGGTCGAGTGGCACGGTATTCCGTTCTTCCATGTACCGGTCGACCCCAAAGACAAGGCCCCGGCCTTTGCCGAAGTGTCGCGCCTGGTGCAGGAGCATGCCGCCGACGTCGTGGTGCTGGCCCGCTACATGCAGATCCTG > NC_002947/1556366‑1556663 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |