| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 1899282 | 79 (1.320) | 4 (0.090) +AAACGTTACTGATTGCACTGTCCCTGTG |
3/184 | NT | 7.4% | intergenic (+310/‑210) | PP_t18/PP_1703 | tRNA‑Asp/assimilatory nitrate reductase/sulfite reductase |
| ? | NC_002947 | 2749651 = | 51 (0.850) | intergenic (+81/+33) | PP_2405/PP_2406 | hypothetical protein/quinate/shikimate dehydrogenase | |||||
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
GATCACCGGCATCTCCTGGGACATGGGAGGGCAGTGCTCATGCTGGAAATTGCCCCAGCAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCAACGTCGACAGCCCTCACCACTTCACGACAAAGGCGCCGTGTTGCCC > NC_002947/1899134‑1899430 | gATCACCGGCATCTCCTGGGACATGGGAGGGCAGTGCTCATGCTGGAAATTGCCCCAGCAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGcgcc < 2:162789/150‑1 (MQ=255) cACCGGCATCTCCTGGGACATGGGAGGGCAGTGCTCATGCTGGAAATTGCCCCAGCAAAGCGCCTCGGAGCATGAGGTTGCCACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCgccgcc > 2:1182669/1‑150 (MQ=255) ggCATCTCCTGGGACATGGGAGGGCAGTGCTCATGCTGGAAATTGCCCCAGCAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCATCGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCa < 2:12047/150‑1 (MQ=255) tGGGACATGGGAGGGCAGTGCTCATGCTGGAAATTGCCCCAGCAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCg > 1:882280/1‑150 (MQ=255) ggACATGGGAGGGCAGTGCTCATGCTGGAAATTGCCCCAGCAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTg > 2:1261206/1‑146 (MQ=255) ggACATGGGAGGGCAGTGCTCATGCTGGAAATTGCCCCAGCAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTg < 1:1261206/146‑1 (MQ=255) ggcgcctttgtcgtgaagtggtgagggctgtcgacgttgacagcccgggatgaggtagatcagcaatttatgggccagctataccggccctttcgcgggcacGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCt > 1:1558275‑M1/103‑150 (MQ=255) ggAGGGCAGTGCTCATGCTGGAAATTGCCCCAGCAAATCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCtg > 2:1620494/1‑150 (MQ=255) ggAGGGCAGTGCTCATGCTGGAAATTGCCCCAGCAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGTCACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCtg > 2:452675/1‑150 (MQ=255) aGGGCAGTGCTCATGCTGGAAATTGCCCCAGCAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCtgtg < 2:538934/150‑1 (MQ=255) gggCAGTGCTCATGCTGGAAATTGCCCCAGCAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTgg < 2:1388173/150‑1 (MQ=255) gggCAGTGCTCATGCTGGAAATTGCCCCAGCAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTgg < 2:648445/150‑1 (MQ=255) ggCAGTGCTCATGCTGGAAATTGCCCCAGCAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGa > 2:234105/1‑138 (MQ=255) ggCAGTGCTCATGCTGGAAATTGCCCCAGCAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGa < 1:234105/138‑1 (MQ=255) ggCAGTGCTCATGCTGGAAATTGCCCCAGCAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTggg > 2:236936/1‑150 (MQ=255) cATGCTGGAAATTGCCCCAGCAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCAt < 1:845354/150‑1 (MQ=255) tGCTGGAAATTGCCCCAGCAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGc > 1:1541295/1‑150 (MQ=255) tGGAAATTGCCCCAGCAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCcg > 2:93586/1‑150 (MQ=255) ggAAATTGCCCCAGCAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCcgc < 1:1213747/150‑1 (MQ=255) tgagggctgtcgacgttgacagcccgggatgaggtagatcagcaatttatgggccagctataccggccctttcgcgggcatGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCgg > 1:131807‑M1/82‑139 (MQ=255) tgagggctgtcgacgttgacagcccgggatgaggtagatcagcaatttatgggccagctataccggccctttcgcgggcatGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCgg < 2:131807‑M1/58‑1 (MQ=255) gAAATTGCCCCAGCAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCcgcg > 2:67594/1‑150 (MQ=255) aTTGCCCCAGCAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGTCACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGaaa < 1:452675/150‑1 (MQ=255) aTTGCCCCAGCAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGaaa < 1:1122145/150‑1 (MQ=255) ttGCCCCAGCAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAg < 1:882237/150‑1 (MQ=255) tGCCCCAGCAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAgg < 1:614314/150‑1 (MQ=255) cccAGCAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCCTGCCCGCGACAGGGcc > 2:182066/1‑150 (MQ=255) cAGCAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCgg > 1:1152751/1‑150 (MQ=255) cAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCa < 2:813841/99‑1 (MQ=255) cAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCa > 1:813841/1‑99 (MQ=255) tccgatcTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAg < 1:669163/144‑1 (MQ=255) aaGCGCCTGGGCGCATGAGGTTGCCACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTACCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAg < 1:1155806/150‑1 (MQ=255) aaGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAg < 1:236936/150‑1 (MQ=255) gcCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTgg < 1:224324/150‑1 (MQ=255) tGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGccc > 2:154070/1‑150 (MQ=255) tGGGAGAATGAGGTTGCCACCGCATGGTGCGAAACCGGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCAAACCCACAGGTAGTGCGCCGCGCTCAGGTATTAAGATATCACTGTGGTAGAGGGCGTACACGCGAAAGGGGCGGTAtggctggcaa > 2:970709/1‑148 (MQ=255) gCATGAGGTTGCCACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATaaa > 2:594096/1‑150 (MQ=255) gCATGAGGTTGCCACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATaaa < 2:1541295/150‑1 (MQ=255) cATGAGGTTGCCACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAAt > 1:834080/1‑150 (MQ=255) tGAGGTTGCCACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTg > 1:571409/1‑150 (MQ=255) gAGGTTGCCACAGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGc > 1:268766/1‑150 (MQ=255) cACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCTGATCTAc < 1:813638/150‑1 (MQ=255) cACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCTGATCTAc < 2:1028044/150‑1 (MQ=255) aCCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCTGATCTAcc > 1:709448/1‑150 (MQ=255) 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aaCCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGTAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGt < 1:496361/150‑1 (MQ=255) aaCCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGt > 1:258293/1‑150 (MQ=255) aCCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTAGCCCCTCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTc > 1:1532313/1‑150 (MQ=38) ccTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCa > 2:1009165/1‑150 (MQ=255) ccTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCa > 1:171402/1‑150 (MQ=255) ctataccggccctttcgcgggcacGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCtgt > 2:466151‑M1/25‑74 (MQ=255) ctataccggccctttcgcgggcacGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCtgt < 1:466151‑M1/50‑1 (MQ=255) cTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCGTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATTCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCCTCCCGGGCTGCCac > 1:118156/1‑149 (MQ=255) cTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCaa < 1:67594/150‑1 (MQ=255) cTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCCGGCTGTCaa > 2:288911/1‑150 (MQ=255) tgtgCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTGGGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCAAc > 1:1276203/1‑150 (MQ=255) tgCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCAACGt < 1:594096/150‑1 (MQ=255) 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CGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCAACGTCGACAGCCCTCACCACTTCACGAc < 1:4493‑M1/150‑1 (MQ=255) CCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCAACGTCGACAGCCCTCACCACTTCACGACAAAg > 2:1014474‑M1/1‑150 (MQ=255) CCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGTAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGccc > 2:945036‑M1/1‑83 (MQ=255) CCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCg < 1:889106‑M1/49‑1 (MQ=255) CCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCg > 2:889106‑M1/1‑49 (MQ=255) CCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCAt > 2:366125‑M1/1‑54 (MQ=255) CCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCAt < 1:366125‑M1/54‑1 (MQ=255) CCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGccc < 1:945036‑M1/83‑1 (MQ=255) CCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCAACGTCGACAGCCCTCACCACTTCACGACAAAgg < 2:1236479‑M1/150‑1 (MQ=255) CCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCAACGTCGACAGCCCTCACCACTTCACGACAAAgg < 2:121666‑M1/150‑1 (MQ=255) CCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGAAGCGGGAATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGACCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTAAACGTCGACAGCACTCACCACTTAACGACAAAgg < 2:505885‑M1/150‑1 (MQ=255) CCACAGGTACTGCGCCACCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCgaag < 2:412429‑M1/64‑2 (MQ=255) CACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCAACGTCGACAGCCCTCACCACTTCACGACAAAGgc > 1:1419557‑M1/1‑150 (MQ=255) GGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGGGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCTGATCTACCGCATCCCGGGCTGTCAACGTCGACAGCCCTCACCACTTCACGACAAAGGCGCCg < 1:1571319‑M1/150‑1 (MQ=255) GTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCAt > 2:1121254‑M1/1‑79 (MQ=255) GTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCAt < 1:1121254‑M1/79‑1 (MQ=255) aCTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCAACGTCGACAGCCCTCACCACTTCACGACAAAGGCGCCgt < 2:524512/148‑1 (MQ=255) aCTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCAACGTCGACAGCCCTCACCACTTCACGACAAAGGCGCCgt > 1:524512/1‑148 (MQ=255) cTGCGCCGTCGTCAGGCCTTGCGATCTCCCTGTGGGAGCGGGGATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCAACGTCGACAGCCCTCACCACTTCACGACAAAGGCGCCGTGtt < 2:118156/150‑1 (MQ=255) cTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCAACGTCGACAGCCCTCACCACTTCACGACAAAGGCGCCGTGtt > 2:1229201/1‑150 (MQ=255) cccgccCTCATGTGCTGCGACATCCCTGTGGGCGTGCGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCAACGTCGACAGCCCTCACCACTTCACGACAAAGGCGCCGTGTTGccc < 1:1223163/149‑1 (MQ=255) | GATCACCGGCATCTCCTGGGACATGGGAGGGCAGTGCTCATGCTGGAAATTGCCCCAGCAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGCTGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCAACGTCGACAGCCCTCACCACTTCACGACAAAGGCGCCGTGTTGCCC > NC_002947/1899134‑1899430 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |