| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 1925745 = | 88 (1.470) | 6 (0.130) | 5/192 | NT | 8.7% | intergenic (‑2/+98) | PP_1725/PP_1726 | hypothetical protein/ABC transporter substrate‑binding protein |
| ? | NC_002947 | 1925810 = | 56 (1.170) | intergenic (‑67/+33) | PP_1725/PP_1726 | hypothetical protein/ABC transporter substrate‑binding protein | |||||
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
CACGCGGTACAGCGCGGCGCGGTCGGCCTCGACGTAGGCGTGCAGGTGGCCCATCGCATGGTGGGCGACCTGATAGTTGAGGCCGTCGAGCAGGACCAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGATCAGGCACTACAAAGCCCAGCCCCTTACTCCATCTCGATGATCACCTGCTCCTGCCACATCTGCGGCAGTTTCTT > NC_002947/1925597‑1925893 | cACGCGGTACAGCGCGGCGCGGTCGGCCTCGACGTAGGCGTGCAGGTGGCCCATCGCATGGTGGGCGACCTGATAGTTGAGGCCGTCGAGCAGGACCAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCtt > 1:1137466/1‑150 (MQ=255) ggTACAGCGCGGCGCGGTCGGCCTCGACGTAGGCGTGCAGGTGGCCCATCGCATGGTGGGCGACCTGATAGTTGAGGCCGTCGAGCAGGACCAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCgg < 1:52983/150‑1 (MQ=255) cagtacgctgccgcccagccgatcaagaatgccgaagcctgggaagccacctcgaagaaactgccgcagatgtggcaggagcaggtgatcatcgagatggagtaaggggctgggctttgtagtgcctgatccggccctTTCGCGGGTaaa < 2:1362261‑M1/12‑1 (MQ=255) agtacgctgccgcccagccgatcaagaatgccgaagcctgggaagccacctcgaagaaactgccgcagatgtggcaggagcaggtgatcatcgagatggagtaaggggctgggctttgtagtgcctgatccggccctTTCGCGGGTAAAc > 1:1362261‑M1/138‑150 (MQ=255) gtacgctgccgcccagccgatcaagaatgccgaagcctgggaagccacctcgaagaaactgccgcagatgtggcaggagcaggtgatcatcgagatggagtaaggggctgggctttgtagtgcctgatccggccctTTCGCGGGTAAAcc > 1:1452851‑M1/137‑150 (MQ=255) ggcgcggTCGGCCTCGACGTAGGCGTGCAGGTGGCCCATCGCATGGTGGGCGACCTGATAGTTGAGGCCGTCGAGCAGGACCAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGc > 1:218306/1‑150 (MQ=255) cgcggTCGGCCTCGACGTAGGCGTGCAGGTGGCCCATCGCATGGTGGGCGACCTGATAGTTGAGGCCGTCGAGCAGGACCAGGATTACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTc < 1:436611/150‑1 (MQ=255) tgccgcccagccgatcaagaatgccgaagcctgggaagccacctcgaagaaactgccgcagatgtggcaggagcaggtgatcatcgagatggagtaaggggctgggctttgtagtgcctgatccggccctTTCGCGGGTAAACCCGCTcc < 1:1187437‑M1/20‑1 (MQ=255) tgccgcccagccgatcaagaatgccgaagcctgggaagccacctcgaacaaacttccgcagatgtggcaggagcaggtgatcatcgagatggagtaaggggctgggctttgtagtgcctgatccggccctTTCGCGGGTAAACCCGCTcc > 2:1118981‑M1/131‑150 (MQ=255) gcggTCGGCCTCGACGTAGGCGTGCAGGTGGCCCATCGCATGGTGGGCGACCTGATAGTTGAGGCCGTCGAGCAGGACCAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTcc > 2:497385/1‑150 (MQ=255) cGGCCTCGACGTAGGCGTGCAGGTGGCCCATCGCATGGTGGGCGACCTGATAGTTGAGGCCGTCGAGCAGGACCAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAt < 2:220414/150‑1 (MQ=255) tCGACGTAGGCGTGCAGGTGGCCCATCGCATGGTGGGCGACCTGATAGTTGAGGCCGTCGAGCAGGACCAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACacaggga > 1:604759/1‑144 (MQ=255) tCGACGTAGGCGTGCAGGTGGCCCATCGCATGGTGGGCGACCTGATAGTTGAGGCCGTCGAGCAGGACCAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATc > 2:447620/1‑150 (MQ=255) gACGTAGGCGTGCAGGTGGCCCATCGCATGGTGGGCGACCTGATAGTTGAGGCCGTCGAGCAGGACCAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATcgc > 1:384946/1‑150 (MQ=255) aCGTAGGCGTGCAGGTGGCCCATCGCATGGTGGGCGACCTGATAGTTGAGGCCGTCGAGCAGGACCAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAc < 1:348230/140‑1 (MQ=255) aCGTAGGCGTGCAGGTGGCCCATCGCATGGTGGGCGACCTGATAGTTGAGGCCGTCGAGCAGGACCAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAc > 2:348230/1‑140 (MQ=255) aGGCGTGCAGGTGGCCCATCGCATGGTGGGCGACCTGATAGTTGAGGCCGTCGAGCAGGACCAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATc < 2:1061793/150‑1 (MQ=255) cGTGCAGGTGGCCCATCGCATGGTGGGCGACCTGATAGTTGAGGCCGTCGAGCAGGACCAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTACCCCt < 2:1473536/150‑1 (MQ=255) ggTGGCCCATCGCATGGTGGGCGACCTGATAGTTGAGGCCGTCGAGCAGGACCAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGTGTAg < 1:1316512/150‑1 (MQ=255) ggTGGCCCATCGCATGGTGGGCGACCTGATAGTTGAGGCCGTCGAGCAGGACCAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGTGTAg < 1:463041/150‑1 (MQ=255) tGGCCCATCGCATGGTGGGCGACCTTATAGTTGAGGCCGTCGAGCAGGACCAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGa > 2:299959/1‑150 (MQ=255) ccATCGCATGGTGGGCGACCTGATAGTTGAGGCCGTCGAGCAGGACCAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGCgg > 2:1111356/1‑150 (MQ=255) ccATCGCATGGTGGGCGACCTGATAGTTGAGGCCGTCGAGCAGGACCAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGCgg < 2:1137466/150‑1 (MQ=255) cATCGCATGGTGGGCGACCTGATAGTTGAGGCCGTCGAGCAGGACCAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGCggg > 2:859051/1‑150 (MQ=255) tCGCATGGTGGGCGACCTGATAGTTGAGGCCGTCGAGCAGGACCAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGCGGGtt < 1:1579699/150‑1 (MQ=255) cATGGTGGGCGACCTGATAGTTGAGGCCGTCGAGCAGGACCAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGCGGGTTTAc < 1:663211/150‑1 (MQ=255) cATGGTGGGCGACCTGATAGTTGAGGCCGTCGAGCAGGACCAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGCGGGTTTAc > 2:611138/1‑150 (MQ=255) tggtggGCGACCTGATAGTTGAGGCCGTCGAGCAGGACCAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTCCATGTATCGCGCATCCCTGTGTAGTAGCGGGTTTAccc < 1:1111356/150‑1 (MQ=255) tggtggGCGACCTGATAGTTGAGGCCGTCGAGCAGGACCAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGCGGGTTTAccc < 2:384946/150‑1 (MQ=255) ggtggGCGACCTGATAGTTGAGGCCGTCGAGCAGGACCAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTa > 1:348873/1‑111 (MQ=255) ggtggGCGACCTGATAGTTGAGGCCGTCGAGCAGGACCAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTa < 2:348873/111‑1 (MQ=255) ccTGATAGTTGAGGCCGTCGAGCAGGACCAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGc < 2:1476612/150‑1 (MQ=255) cTGATAGTTGAGGCCGTCGAGCAGGACCAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGcc < 1:497385/150‑1 (MQ=255) tgccgcagatgtggcaggagcaggtgatcatcgagatggagtaaggggctgggctttgtagtgcctgatcctgccctTTCGCgg > 1:577282‑M1/78‑84 (MQ=255) tgccgcagatgtggcaggagcaggtgatcatcgagatggagtaaggggctgggctttgtagtgcctgatcctgccctTTCGCgg < 2:577282‑M1/7‑1 (MQ=255) gTTGAGGCCGTCGAGCAGGACCAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGATCa > 2:849380/1‑150 (MQ=255) ggCCGTCGAGCAGGACCAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCtgt > 1:1205148/1‑110 (MQ=255) ggCCGTCGAGCAGGACCAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCtgt < 2:1205148/110‑1 (MQ=255) tCGAGCAGGACCAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGATCAGGCACTACaa > 2:1144249/1‑150 (MQ=255) gCAGGACCAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGc < 2:1007509/76‑1 (MQ=255) gCAGGACCAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGc > 1:1007509/1‑76 (MQ=255) aggtgatcatcgagatggagtaaggggctgggctttgtagtgcctgatccggccctTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGCgg > 1:239414‑M1/57‑108 (MQ=255) gtgatcatcgagatggagtaaggggctgggctttgtagtgcctgatccggccctTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGCgg > 1:417378‑M1/55‑106 (MQ=255) gtgatcatcgagatggagtaaggggctgggctttgtagtgcctgatccggccctTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGCgg < 2:417378‑M1/52‑1 (MQ=255) aCCAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCGTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGATCAGGCACTACAAagcccagcc < 2:266663/150‑1 (MQ=255) ccAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGATCAGGCACTACAAagcccagccc > 2:601813/1‑150 (MQ=255) gATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGATCAGGCACTACAAAGCCCAGCCCCTTa > 1:173184/1‑150 (MQ=255) tcgagatggagtaaggggctgggctttgtagtgcctgatccggccccTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGc > 1:656674‑M1/48‑117 (MQ=255) tcgagatggagtaaggggctgggctttgtagtgcctgatccggccccTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGc < 2:656674‑M1/70‑1 (MQ=255) gACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAAc > 1:1342498/1‑59 (MQ=255) gACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAAc < 2:1342498/59‑1 (MQ=255) aCGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCAACTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTAAAACGGATCCCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGATCAGGCACTACAAAGCCCAGCCCCTTACTcc < 1:524401/150‑1 (MQ=39) ttGTATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCTTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGATCAGGCACTACAAAGCCCAGCCCCTTACTCCATCTCgat < 1:231742/150‑1 (MQ=255) ttGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGCGGGTTTAcc < 1:413770/96‑1 (MQ=255) ttGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGCGGGTTTAcc > 2:413770/1‑96 (MQ=255) ttGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGATCAGGCACTACAAAGCCCAGCCCCt < 1:118558/136‑1 (MQ=255) gCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGTGTa < 1:85693/80‑1 (MQ=255) gCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGTGTa > 2:85693/1‑80 (MQ=255) cATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGCGGGTTTAccc > 1:1300732/1‑94 (MQ=255) cATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGCGGGTTTAccc < 2:1300732/94‑1 (MQ=255) aTGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGATc > 2:1514970/1‑109 (MQ=255) aTGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGATc < 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aTGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGATCAGGCACTACaaa > 1:877627/1‑106 (MQ=255) aTGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGATCAGGCACTACAAAGCCCAGCCCCt > 1:672818/1‑117 (MQ=255) aTGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGATCAGGCACTACAAAGCCCAGCCCCt < 2:326073/117‑1 (MQ=255) aTGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGATCAGGCACTACAAAGCCCAGCCCCt > 1:326073/1‑117 (MQ=255) aTGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGATCAGGCACTACAAAGCCCAGCCCCt < 2:672818/117‑1 (MQ=255) aTGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGATCAGGCACTACAAAGCCCAGCCCCTTACTCCAtc > 2:325611/1‑126 (MQ=255) aTGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGATCAGGCACTACAAAGCCCAGCCCCTTACTCCAtc < 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ttGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGATCAGGCACTACAAAGCCCAGCCCCTTACTCCATCTCGATGATCACCTGCTCCTGCCACATCTGCGGCa < 1:601813/150‑1 (MQ=255) tGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGATCAGGCACTACAAAGCCCAGCCCCTTACTCCATCTCGATGATCACCTGCTCCTGCCACATCTGCgg > 2:1257761/1‑147 (MQ=255) tGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGATCAGGCACTACAAAGCCCAGCCCCTTACTCCATCTCGATGATCACCTGCTCCTGCCACATCTGCgg < 1:1257761/147‑1 (MQ=255) gCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGATCAGGCACTACAAAGCCCAGCCCCTTACTCCATCTCGATGATCAc < 1:204731/124‑1 (MQ=255) gCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGATCAGGCACTACAAAGCCCAGCCCCTTACTCCATCTCGATGATCAc > 2:204731/1‑124 (MQ=255) gCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGATCAGGCACTACAAAGCCCAGCCCCTTACTCCATCTCGATGATCACCTGCTCCt < 2:620134/132‑1 (MQ=255) gCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGATCAGGCACTACAAAGCCCAGCCCCTTACTCCATCTCGATGATCACCTGCTCCt > 1:620134/1‑132 (MQ=255) cACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGATCAGGCACTACAAAGCCCAGCCCCTTACTCCATCTCGATGATCACCTGCTCCTGCCACATCTGCGGCAGttt > 1:1377039/1‑150 (MQ=255) aCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGaaa < 2:566286/69‑1 (MQ=255) aCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGaaa > 1:566286/1‑69 (MQ=255) cTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGATCAGGCACTACAAAGCCCAGCCCCTTACTCCATCTCGATGATCACCTGCTCCTGCCACATCTGCGGCATTttctt > 2:1474056/1‑150 (MQ=255) | CACGCGGTACAGCGCGGCGCGGTCGGCCTCGACGTAGGCGTGCAGGTGGCCCATCGCATGGTGGGCGACCTGATAGTTGAGGCCGTCGAGCAGGACCAGGATGACGTTGTGTTGCATGTTTTCTCCAGTCATGAACCGCGTTGGCACCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGTATCGCGTATCCCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGATCAGGCACTACAAAGCCCAGCCCCTTACTCCATCTCGATGATCACCTGCTCCTGCCACATCTGCGGCAGTTTCTT > NC_002947/1925597‑1925893 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |