New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2832716 = | 59 (0.990) | 5 (0.090) | 5/226 | NT | 8.2% | intergenic (‑21/+46) | PP_2485/PP_2486 | hypothetical protein/Oye family NADH‑dependent flavin oxidoreductase |
? | NC_002947 | 2832764 = | 57 (1.010) | coding (1123/1125 nt) | PP_2486 | Oye family NADH‑dependent flavin oxidoreductase |
AGCATGCTCGGTGTATCACCTTCGAAAGCCTCTAGGGGAAAGAACAGCCCAAGGCTTAGATGACCCTGCCTGAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGG > NC_002947/2832568‑2832865 | gacctgatcgcttttggtcgccccttcattgcgaaccccgacctgcccgctcgtatcgccaacaactggccgcttaacccagttgatccaagcagcatgtacggcggtaccgataagggctacaccgactacccgacttacaaatcctaa > 1:1629765‑M1/149‑150 (MQ=255) aGCATGCTCGGTGTATCACCTTCGAAAGCCTCTAGGGGAAAGAACAGCCCAAGGCTTAGATGACCCTGCCTGAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCaa > 1:569350/1‑150 (MQ=255) gCTCGGTGTATCACCTTCGAAAGCCTCTAGGGGAAAGAACAGCCCAAGGCTTAGATGACCCTGCCTGAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCt < 2:1536002/150‑1 (MQ=255) tCGGTGTATCACCTTCGAAAGCCTCTAGGGGAAAGAACAGCCCAAGGCTTAGATGACCCTGCCTGAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGa > 2:66436/1‑150 (MQ=255) ccTTCGAAAGCCTCTAGGGGAAAGAACAGCCCAAGGCTTAGATGACCCTGCCTGAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCt < 1:1130765/150‑1 (MQ=255) cTTCGAAAGCCTCTAGGGGAAAGAACAGCCCAAGGCTTAGATGGCCCTGCCTGAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCGGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTg > 1:1581428/1‑150 (MQ=255) ttCGAAAGCCTCTAGGGCAAAGAACAGCCCAATGCTTAGATGACCCTGCCTGAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGa < 1:498025/150‑1 (MQ=255) aGCCTCTAGGGGAAAGAACAGCCCAAGGCTTAGATGACCCTGCCTGAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTCGGTACATCCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTTA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATg < 2:227945/150‑1 (MQ=255) gCCTCTAGGGGAAAGAACAGCCCAAGGCTTAGATGACCCTGCCTGAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATgg < 1:66436/150‑1 (MQ=255) tctAGGGGAAAGAACAGCCCAAGGCTTAGATGACCCTGCCTGAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGc > 2:1535014/1‑150 (MQ=255) gggAAAGAACAGCCCAAGGCTTAGATGACCCTGCCTGAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGc < 1:376175/150‑1 (MQ=255) gggAAAGAACAGCCCAAGGCTTAGATGACCCTGCCTGAAGGTTCGTTTGAATCCAATATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGc > 2:222778/1‑150 (MQ=255) cccgacctgcccgctcgtatcgccaacaactggccgcttaacccagttgatccaagcagcatgtacggcggtaccgataagggctacaccgactacccgacttacaaatcctAAACGCTCAATGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTgg < 1:697104‑M1/38‑1 (MQ=255) gAAAGAACAGCCCAAGGCTTAGATGACCCTGCCTGAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAAc < 1:1279686/115‑1 (MQ=255) gAAAGAACAGCCCAAGGCTTAGATGACCCTGCCTGAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAAc > 2:1279686/1‑115 (MQ=255) gAAAGAACAGCCCAAGGCTTAGATGACCCTGCCTGAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCAt > 1:102788/1‑150 (MQ=255) aaCAGCCCAAGGCTTAGATGACCCTGCCTGAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCCGTAATGAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCAtggcgc > 1:177636/1‑145 (MQ=255) aGCCCAAGGCTTAGATGACCCTGCCTGAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGtt < 2:569350/150‑1 (MQ=255) cccAAGGCTTAGATGACCCTGCCTGAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTCTGGGCCGCGGCTTTGAGCGTTTa > 2:1116434/1‑150 (MQ=255) ctcgtatcgccaacaactggccgcttaacccagttgatccaagcagcatgtacggcggtaccgataagggctacaccgactacccgacttacaaatcctAAACGCTCAATGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTa > 2:697104‑M1/100‑150 (MQ=255) atcgccaacaactggccgcttaacccagttgatccaagcagcatgtacggcggtaccgataagggctacaccgactacccgacttacaaatcctAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTg < 2:1044903‑M1/56‑1 (MQ=255) ttAGATGACCCTGCCTGAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGt < 2:102788/150‑1 (MQ=255) tcgccaacaactggccgcttaacccagttgatccaagcagcatgtacggcggtaccgataagggctacaccgactacccgacttacaaatcctAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGt > 1:1044903‑M1/94‑150 (MQ=255) cgccaacaactggccgcttaacccagttgatccaagcagcatgtacggcggtaccgataagggctacaccgactatccgacttacaaatcctATACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTa > 2:574421‑M1/93‑150 (MQ=255) gACCCTGCCTGAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCg < 1:493318/150‑1 (MQ=255) cccTGCCTGAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAg < 2:34315/135‑1 (MQ=255) cccTGCCTGAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAg > 1:34315/1‑135 (MQ=255) cctgAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTc > 1:903154/1‑142 (MQ=255) cctgAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTc < 2:903154/142‑1 (MQ=255) gTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAg < 1:1535014/150‑1 (MQ=255) cGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGccc < 1:1223599/150‑1 (MQ=255) gTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTg > 1:1015498/1‑90 (MQ=255) gTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTg < 2:1015498/90‑1 (MQ=255) tttGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCGtt > 1:1586715/1‑150 (MQ=255) tttGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCtt > 2:1079511/1‑150 (MQ=255) aaTCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCg > 2:1616291/1‑150 (MQ=255) ccTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTa < 2:1245007/126‑1 (MQ=255) ccTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTa > 1:1245007/1‑126 (MQ=255) ccTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTAcc > 1:1510461/1‑150 (MQ=255) ccTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTAcc > 2:284294/1‑150 (MQ=255) cTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTaa > 2:164454/1‑117 (MQ=255) cTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTaa < 1:164454/117‑1 (MQ=255) aTGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTAccgcc > 1:707489/1‑150 (MQ=255) tctTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCg < 2:1166600/123‑1 (MQ=255) tctTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCg > 1:1166600/1‑123 (MQ=255) ctTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACa < 2:468987/150‑1 (MQ=255) ggcggtaccgataagggctacaccgactacccgacttacaaatcctaaa > 1:32916‑M1/47‑49 (MQ=255) ggcggtaccgataagggctacaccgactacccgacttacaaatcctaaa < 2:32916‑M1/3‑1 (MQ=255) gggATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCgg > 1:1141639/1‑107 (MQ=255) gggATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCgg < 2:1141639/107‑1 (MQ=255) gggATAGTGCTCAGTTGGTAAATAAGTAACTTCCTCTGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCtt < 2:1586715/150‑1 (MQ=255) ggATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTg < 2:1510461/150‑1 (MQ=255) aTCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCGGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGa < 2:1581428/150‑1 (MQ=255) tCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGa < 1:575343/143‑1 (MQ=255) tCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGa > 2:575343/1‑143 (MQ=255) tCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTg > 1:1589136/1‑150 (MQ=255) tACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTgg > 2:644272/1‑143 (MQ=255) tACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTgg < 1:644272/143‑1 (MQ=255) tGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGcc > 2:163893/1‑150 (MQ=255) ttAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGa < 1:641759/128‑1 (MQ=255) ttAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGa > 2:641759/1‑128 (MQ=255) tCCTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCggg < 1:1015209/77‑1 (MQ=255) tCCTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCggg > 2:1015209/1‑77 (MQ=255) tCCTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTgg > 1:1099416/1‑150 (MQ=255) tCCTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTgg < 2:707489/150‑1 (MQ=255) ccTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGGTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTggt > 1:826950/1‑149 (MQ=255) tCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGGCATACTGGTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTCCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGACGa > 1:42657/1‑150 (MQ=255) tCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGa > 2:1463761/1‑150 (MQ=255) ggTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATa > 2:1290514/1‑150 (MQ=255) gTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGTGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATAc > 1:1328879/1‑150 (MQ=255) gCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTggg > 1:684039/1‑121 (MQ=255) gCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTggg < 2:684039/121‑1 (MQ=255) AAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCAtt < 1:1352387‑M1/40‑1 (MQ=255) AAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCAtt > 2:1352387‑M1/1‑40 (MQ=255) AAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCg > 1:1281132‑M1/1‑71 (MQ=255) AAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCg < 2:1281132‑M1/71‑1 (MQ=255) AAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCgg > 1:222778‑M1/1‑150 (MQ=255) | AGCATGCTCGGTGTATCACCTTCGAAAGCCTCTAGGGGAAAGAACAGCCCAAGGCTTAGATGACCCTGCCTGAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGG > NC_002947/2832568‑2832865 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |