New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3003037 = | 54 (0.900) | 6 (0.110) | 6/228 | NT | 10.7% | coding (1035/1464 nt) | PP_2626 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 3003077 = | 49 (0.860) | coding (1075/1464 nt) | PP_2626 | hypothetical protein |
CCGCCTTGCTGCAGCGTATTGAAAAGAGCCTGACGGCTTGCCCCTTCTGGATTCGTGGCAGCTTTCTGGCTGCGACCGTCGCCACACAGCTGGCGATGTGCGAGGTGGCCGAAGCCATCCGTTGTGCCACCGCCCGGTTTGTACAGCGCATGCCCTCGCTGCAGCAGCTGTGCTTCAGCGACGGCATGGTATTTGTCGACGACCAGTGCCTGGCCTGGCTCAAGGGCACCCAAGGGCCGTCTGGCCAAGGTGCAACCCCCCAGGAGTTCAGCGGCCTGCGCGAGGAGCTTG > NC_002947/3002889‑3003179 | gccgaaggagcagcggctctatgccaccggtttccagctggctgacaagctcctcgcgcaggccgctgaactcctggggggttgcaccttggccagacggcccttgggtgcccttgagccaggccaggcactggtcgtcgacaaatacCa > 2:1248190‑M1/149‑150 (MQ=255) cTTGCTGCAGCGTATTGAAAAGAGCCTGACGGCTTGCCCCTTCTGGATTCGTGGCAGCTTTCTGGCTGCGACCGTCGCCACACAGCTGGCGATGTGCGAGGTGGCCGAAGCCATCCGTTGTGCCACCGCCCGGTTTGTACAGCGCATGcc < 2:599834/150‑1 (MQ=255) tgcAGCGTATTGAAAAGAGCCTGACGGCTTGCCCCTTCTGGATTCGTGGCAGCTTTCTGGCTGCGACCGTCGCCACACAGCTGGCGATGTGCGAGGTGGCCGAAGCCATCCGTTGTGCCACCGCCCGGTTTGTACAGCGCATGCCCTCGc > 2:902/1‑150 (MQ=255) ttGAAAAGAGCCTGACGGCTTGCCCCTTCTGGATTCGTGGCAGCTTTCTGGCTGCGACCGTCGCCACACAGCTGGCGATGTGCGAGGTGGCCGAAGCCATCCGTTGTGCCACCGCCCGGTTTGTACAGCGCATGCCCTCGCTGCagcagc < 2:640558/150‑1 (MQ=255) gAAAAGAGCCTGACGGCTTGCCCCTTCTGGATTCGTGGCAGCTTTCTGGCTGCGACCGTCGCCACACAGCTGGCGATGTGCGAGGTGGCCGAAGCCATCCGTTGTGCCACCGCCCGGTTTGTACAGCGCATGCCCTCGCTGCAGCAGCtg > 2:906262/1‑150 (MQ=255) aaaaGAGCCTGACGGCTTGCCCCTTCTGGATTCGTGGCAGCTTTCTGGCTGCGACCGTCGCCACACAGCTGGCGATGTGCGAGGTGGCCGAAGCCATCCGTTGTGCCACCGCCCGGTTTGTACAGCGCATGCCCTCGCTGCAGCAGCtgt > 2:686601/1‑150 (MQ=255) gagCCTGACGGCTTGCCCCTTCTGGATTCGTGGCAGCTTTCTGGCTGCGACCGTCGCCACACAGCTGGCGATGTGCGAGGTGGCCGAAGCCATCCGTTGTGCCACCGCCCGGTTTGTACAGCGCATGCCCTCGCTGCAGCAGCTGTGCtt < 1:906262/150‑1 (MQ=255) ttGCCCCTTCTGGATTCGTGGCAGCTTTCTGGCTGCGACCGTCGCCACACAGCTGGCGATGTGCGAGGTGGCCGAAGCCATCCGTTGTGCCACCGCCCGGTTTGTACAGCGCATGCCCTCGCTGCAGCAGCTGTGCTTCAGCGACGGCAt > 1:189574/1‑150 (MQ=255) cccTTCTGGATTCGTGGCAGCTTTCTGGCTGCGACCGTCGCCACACAGCTGGCGATGTGCGAGGTGGCCGAAGCCATCCGTTGTGCCACCGCCCGGTTTGTACATCGCATGCCCTCGCTGCAGCAGCTGTGCTTCAGCGACGGCATGGTa > 1:768984/1‑150 (MQ=255) ccTTCTGGATTCGTGGCAGCTTTCTGGCTGCGACCGTCGCCACACAGCTGGCGATGTGCGAGGTGGCCGAAGCCATCCGTTGTGCCACCGCCCGGTTTGTACATCGCATGCCCTCGCTGCAGCAGCTGTGCTTCAGCGACGGCATGGTAt < 2:768984/150‑1 (MQ=255) ccTTCTGGATTCGTGGCAGCTTTCTGGCTGCGACCGTCGCCACACAGCTGGCGATGTGCGAGGTGGCCGAAGCCATCCGTTGTGCCACCGCCCGGTTTGTACAGCGCATGCCCTCGCTGCAGCAGCTGTGCTTCAGCGACGGCATGGTAt > 1:383740/1‑150 (MQ=255) tGGATTCGTGGCAGCTTTCTGGCTGCGATCGTCGCCACACAGCTGGCGATGTGCGAGGTGGCCGAAGCCATCCGTTGTGCCACCGCCCGGTTTGTACAGCGCATGCCCTCGCTGCAGCAGCTGTGCTTCAGCGACGGCATGGTATTTGTc > 2:1525703/1‑150 (MQ=255) tGGATTCGTGGCAGCTTTCTGGCTGCGACCGTCGCCACACAGCTGGCGATGTGCGAGGTGGCCGAAGCCATCCGTTGTGCCACCGCCCGGTTTGTACAGCGCATGCCCTCGCTGCAGCAGCTGTGCTTCAGCGACGGCATGGTATTTGTc > 2:599121/1‑150 (MQ=255) ttCGTGGCAGCTTTCTGGCTGCGACCGTCGCCACACAGCTGGCGATGTGCGAGGTGGCCGAAGCCATCCGTTGTGCCACCGCCCGGTTTGTACAGCGCATGCCCTCGCTGCAGCAGCTGTGCTTCAGCGACGGCATGGTATTTGTcgacg > 1:403837/1‑150 (MQ=255) tGGCAGCTTTCTGGCTGCGACCGTCGCCACACAGCTGGCGATGTGCGAGGTGGCCGAAGCCATCCGTTGTGCCACCGCCCGGTTTGTACAGCGCATGCCCTCGCTGCAGCAGCTGTGCTTCAGCGACGGCATGGTATTTGTCGACGACCa > 2:1630213/1‑150 (MQ=255) gCAGCTTTCTGGCTGCGACCGTCGCCACACAGCTGGCGATGTGCGAGGTGGCCGAAGCCATCCGTTGTGCCACCGCCCGGTTTGTACAGCGCATGCCCTCGCTGCAGCAGCTGTGCTTCAGCGACGGCATGGTATTTGTCGACGACCAGt > 2:1071024/1‑150 (MQ=255) cgctgaactcctggggggttgcaccttggccagacggcccttgggtgcccttgagccaggccaggcactggtcgtcgacaaatacCATGCCGTCGCTGCAGCAGCTGTGCTTCAg > 1:291575‑M1/86‑115 (MQ=255) cgctgaactcctggggggttgcaccttggccagacggcccttgggtgcccttgagccaggccaggcactggtcgtcgacaaatacCATGCCGTCGCTGCAGCAGCTGTGCTTCAg < 2:291575‑M1/30‑1 (MQ=255) tGGCTGCGATCGTCGCCACACAGCTGGCGATGTGCGAGGTGGCCGAAGCCATCCGTTGTGCCACCGCCCGGTTTGTACAGCGCATGCCCTCGCTGCAGCAGCTGTGCTTCAGCGACGGCATGGTATTTGTCGACGACCAGTgcctggcct < 1:1525703/150‑1 (MQ=255) ggCTGCGACCGTCGCCACACAGCTGGCGATGTGCGAGGTGGCCGAAGCCATCCGTTGTGCCACCGCCCGGTTTGTACAGCGCATGTCCTCGCTGCAGCAGCTGTGCTTCAGCGACGGCATg > 1:1638251/1‑121 (MQ=255) ggCTGCGACCGTCGCCACACAGCTGGCGATGTGCGAGGTGGCCGAAGCCATCCGTTGTGCCACCGCCCGGTTTGTACAGCGCATGTCCTCGCTGCAGCAGCTGTGCTTCAGCGACGGCATg < 2:1638251/121‑1 (MQ=255) gCTGCGACCGTCGCCACACAGCTGGCGATGTGCGAGGTGGCCGAAGCCATCCGTTGTGCCACCGCCCGGTTTGTACAGCGCATGCCCTCGCTGCAGCAGCTGTGCTTCAGCGACGGCATGGTATTTGTCTACGACCAGTGcctcggctgg > 2:264251/1‑150 (MQ=255) cTGCGACCGTCGCCACACAGCTGGCGATGTGCGAGGTGGCCGAAGCCATCCGTTGTGCCACCGCCCGGTTTGTACAGCGCATGCCCTCGCTGCAGCAGCTGTGCTTCAGCGACGGCATGGTATTTGTCGACGACCAGTGCctggcctggc < 1:686601/150‑1 (MQ=255) cacacaGCTGGCGATGTGCGAGGTGGCCGAAGCCATCCGTTGTGCCACCGCCCGGTTTGTACAGCGCATGCCCTCGCTGCAGCAGCTGTGc > 2:768876/1‑91 (MQ=255) cacacaGCTGGCGATGTGCGAGGTGGCCGAAGCCATCCGTTGTGCCACCGCCCGGTTTGTACAGCGCATGCCCTCGCTGCAGCAGCTGTGc < 1:768876/91‑1 (MQ=255) cacacaGCTGGCGATGTGCGAGGTGGCCGAAGCCATCCGTTGTGCCACCGCCCGGTTTGTACAGCGCATGCCCTCGCTGCAGCAGCTGTGCTTCAGCGACGGCATGGTAttt > 1:1533842/1‑112 (MQ=255) cacacaGCTGGCGATGTGCGAGGTGGCCGAAGCCATCCGTTGTGCCACCGCCCGGTTTGTACAGCGCATGCCCTCGCTGCAGCAGCTGTGCTTCAGCGACGGCATGGTAttt < 2:1533842/112‑1 (MQ=255) acacaGCTGGCGATGTGCGAGGTGGCCGAAGCCATCCGTTGTGCCACCGCCCGGTTTGTACAGCGCATGCCCTCGCTGCAGCAGCTGTGCTTCAGCGACGGCATGGTATTTGTCGACGACCAGTGCCTGGCCTGGCTCAAGGGCACCCaa < 2:383740/150‑1 (MQ=255) caGCTGGCGATGTGCGAGGTGGCCGAAGCCATCCGTTGTGCCACCGCCCGGTTTGTACAGCGCATGCCCTCGCTGCAGCAGCTGTGCTTCAGCGACGGCATGGTATTTGTCGACGACCAGTGCCTGGCCTGGCTCAAGGGCACCCAAggg < 1:599121/150‑1 (MQ=255) tgCGAGGTGGCCGAAGCCATCCGTTGTGCCACCGCCCGGTTTGTACAGCGCATGCCCTCGCTGCAGCAGCTGTGCTTCAGCGACGGCATGGTATTTGTCGACGACCAGTGCCTGGCCTGGCTCAAGGGCACCCAAGGGCCGTCTGGCCaa < 2:697879/150‑1 (MQ=255) ggcccttgggtgcccttgagccaggccaggcactggtcgtcgacaaatacCATGCCCTCGCTGCAGCAGCTGTGCTTCAGCGACg > 2:113449‑M1/51‑85 (MQ=255) ggcccttgggtgcccttgagccaggccaggcactggtcgtcgacaaatacCATGCCCTCGCTGCAGCAGCTGTGCTTCAGCGACg < 1:113449‑M1/35‑1 (MQ=255) gAGGTGGCCGAAGCCATCCGTTGTGCCACCGCCCGGTTTGTACAGCGCATGCCCTCGCTGCAGCAGCTGTGCTTCAGCGACGGCATGGTATTTGTCGACGACCAGTGCCTGGCCTGGCTCAAGGGCACCCAAGGGCCGTCTGGCCAAGGt < 1:1630213/150‑1 (MQ=255) gAGGTGGCCGAAGCCATCCGTTGTGCCACCGCCCGGTTTGTACAGCGCATGCCCTCGCTGCAGCAGCTGTGCTTCAGCGACGGCATGGTATTTGTCGACGACCAGTGCCTGGCCTGGCTCAAGGGCACCCAAGGGCCGTCTGGCCAAGGt < 2:189574/150‑1 (MQ=255) ggTGGCCGAAGCCATCCGTTGTGCCACCGCCCGGTTTGTACAGCGCATGCCCTCGCTGCAGCAGCTGTGCTTCAGCGACGGCATGGTATTTGTCGACGACCAGTGCCTGGCCTGGCTCAAGGGCACCCAAGGGCCGTCTGGCCAAGGTGc < 1:1234585/150‑1 (MQ=255) tGGCCGAAGCCATCCGTTGTGCCACCGCCCGGTTTGTACAGCGCATGCCCTCGCTGCAGCAGCTGTGCTTCAGCGACGGCATGGTATTTGTCGACGACCAGTGCCTGGCCTGGCTCAAGGGCACCCAAGGGCCGTCTGGCCAAGGTGCaa < 2:403837/150‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCCATCCGTTGTGCCACCGCCCGGTTTGTACAGCGCATGCCCTCGCTGCAGCAGCTGTGCTTCAGCGACGGCATGGTATTTGTCGACGACCAGTGCCTGGCCTGGCTCAAGGGCAACCAAGGGCCGTCTGGCCAAGGTGCAAc > 1:415464/1‑150 (MQ=255) gCCGAAGCCATCCGTTGTGCCACCGCCCGGTTTGTACAGCGCATGCCCTCGCTGCAGCAGCTGTGCTTCAGCGACGGCATGGTATTTGTcgac > 2:1580130/1‑93 (MQ=255) gCCGAAGCCATCCGTTGTGCCACCGCCCGGTTTGTACAGCGCATGCCCTCGCTGCAGCAGCTGTGCTTCAGCGACGGCATGGTATTTGTcgac < 1:1580130/93‑1 (MQ=255) gCCGAAGCCATCCGTTGTGCCACCGCCCGGTTTGTACAGCGCATGCCCTCGCTGCAGCAGCTGTGCTTCAGCGACGGCATGGTATTTGTCGACGACCAGTGCCTGGCCTGGCTCAAg < 2:556984/117‑1 (MQ=255) gCCGAAGCCATCCGTTGTGCCACCGCCCGGTTTGTACAGCGCATGCCCTCGCTGCAGCAGCTGTGCTTCAGCGACGGCATGGTATTTGTCGACGACCAGTGCCTGGCCTGGCTCAAg > 1:556984/1‑117 (MQ=255) tgcccttgagccaggccaggcactggtcgtcgacaaatacCATGCCCTCGCTGCAGCAGCTGTGCTTCAGCGACGGCATg < 2:1284329‑M1/40‑1 (MQ=255) tgcccttgagccaggccaggcactggtcgtcgacaaatacCATGCCCTCGCTGCAGCAGCTGTGCTTCAGCGACGGCATg > 1:1284329‑M1/41‑80 (MQ=255) cGAAGCCATCCGTTGTGCCACCGCCCGGTTTGTACAGCGCATGCCCTCGCTGCAGCAGCTGTGCTTCAGCGACGGCTTGGTATTTGTCGACGACCAGTGCCTGGCCTGGCTCAAGGGCACCCAAGGGCCGTCTGGCCAAGGTGCAAcccc > 2:411379/1‑150 (MQ=255) aTCCGTTGTGCCACCGCCCGGTTTGTACAGCGCATGCCCTCGCTGCAGCAGCTGTGCTTCAGCGACGGCATGGTATTTGTCGACGACCAGTGCCTGGCCTGGCTCAAGGGCACCCAAGGGCCGTCTGGCCAAGGTGCAACCCCCCAGGAg > 1:829891/1‑150 (MQ=255) cGTTGTGCCACCGCCCGGTTTGTACAGCGCATGCCCTCGCTGCAGCAGCTGTGCTTCAGCGACGGCATGGTATTTGTCGACGACCAGTGCCTGGCCTGGCTCAAGGGCACCCAAGGGCCGTCTGGc < 2:726847/126‑1 (MQ=255) cGTTGTGCCACCGCCCGGTTTGTACAGCGCATGCCCTCGCTGCAGCAGCTGTGCTTCAGCGACGGCATGGTATTTGTCGACGACCAGTGCCTGGCCTGGCTCAAGGGCACCCAAGGGCCGTCTGGc > 1:726847/1‑126 (MQ=255) ttGTGCCACCGCCCGGTTTGTACAGCGCATGCCCTCGCTGCAGCAGCTGTGCTTCAGCGACGGCATGGTATTTGTCGACGACCAGTGCCTGGCCTGGCTCAAGGGCACCCAAGGGCCGTCTGGCCAAg > 2:304412/1‑128 (MQ=255) ttGTGCCACCGCCCGGTTTGTACAGCGCATGCCCTCGCTGCAGCAGCTGTGCTTCAGCGACGGCATGGTATTTGTCGACGACCAGTGCCTGGCCTGGCTCAAGGGCACCCAAGGGCCGTCTGGCCAAg < 1:304412/128‑1 (MQ=255) gCCACCGCCCGGTTTGTACAGCGCATGCCCTCGCTGCAGCAGCTGTGCTTCAGCGACGGCATGGTATTTGTCGACGACCAGTGCCTGGCCTGGCTCAAGGGCACCCAAGGGCCGTCTGGCCAAGGTGCaa < 2:401357/130‑1 (MQ=255) gCCACCGCCCGGTTTGTACAGCGCATGCCCTCGCTGCAGCAGCTGTGCTTCAGCGACGGCATGGTATTTGTCGACGACCAGTGCCTGGCCTGGCTCAAGGGCACCCAAGGGCCGTCTGGCCAAGGTGCaa > 1:401357/1‑130 (MQ=255) ccACCGCCCGGTTTGTACAGCGCATGCCCTCGCTGCAGCAGCTGTGCTTCAGCGACGGCATGGTATTTGTCGACGACCAGTGCCTGGCCTGGCTCACGCACGCCCAAGGGCCGTCTGGCCAAGGTGCAACCCCCCAGGAGTTCAGCGGcc > 1:1334134/1‑150 (MQ=255) aCCGCCCGGTTTGTACAGCGCATGCCCTCGCTGCAGCAGCTGTGCTTCAGCGACGGCATGGTATTTGTCGACGACCAGTGcctggcctgg > 2:628297/1‑90 (MQ=255) aCCGCCCGGTTTGTACAGCGCATGCCCTCGCTGCAGCAGCTGTGCTTCAGCGACGGCATGGTATTTGTCGACGACCAGTGcctggcctgg < 1:628297/90‑1 (MQ=255) gTTTGTACAGCGCATGCCCTCGCTGCAGCAGCTGTGCTTCAGCGACGGCATGGTATTTGTCGACGACCAGTGCCTGGCCTGGCTCAAGGGCACCCAAGGGCCGTCTGGCCAAGGTGCAACCCCCCAGGAGTTCAGCGGCCTGCGCgagga < 2:829891/150‑1 (MQ=255) gTTTGTACAGCGCATGCCCTCGCTGCAGCAGCTGTGCTTCAGCGACGGCATGGTATTTGTCGACGACCAGTGCCTGGCCTGGCTCAAGGGCACCCAAGGGCCGTCTGGCCAAGGTGCAACCCCCCAGGAGTTCAGCAGCCTGCGCgag < 2:1099943/148‑1 (MQ=255) gTTTGTACAGCGCATGCCCTCGCTGCAGCAGCTGTGCTTCAGCGACGGCATGGTATTTGTCGACGACCAGTGCCTGGCCTGGCTCAAGGGCACCCAAGGGCCGTCTGGCCAAGGTGCAACCCCCCAGGAGTTCAGCAGCCTGCGCgag > 1:1099943/1‑148 (MQ=255) gTACAGCGCATGCCCTCGCTGCAGCAGTCTTGTTTCAGCGACGGCATGGTATTTGTCGACGACCAGTGCCTGGCCTGGCTCAAGGGCACCCAAGGGCCGTCTGGCCAAGGTGCAACCCCCCAGGAGTTCAGCGGCCTGCGCGAGGAGCtt < 1:902/150‑1 (MQ=255) tACAGCGCATGCCCTCGCTGCAGCAGCTGTGCTTCAGCGACGGCATGGTATTTGTCGACGACCAGTGCCTGGCCTGGCTCAAGGGCACCCAAGGGCCGTCTGGCCAAGGTGCAACCCCCCAGGAGTTCAGCGGCCTGCGCGAGGAGCTTg > 2:342172/1‑150 (MQ=255) aCAGCGCATGCCCTCGCTGCAGCAGCTGTGCTTCAGCGACGGCATGGTATTTGTCGACGACCAGTGCCTGGCCTGGCTCAAGGGCACCCAAGGGCCGTCTGGCCAAg < 1:882532/107‑1 (MQ=255) aCAGCGCATGCCCGCGCTGCAGCAGCTGTGCTTCAGCGACGGCATGGTATTTGTCGACGACCAGTGCCTGGCCTGGCTCAAGGGCACCCAAGGGCCGTCTGGCCAAg > 2:882532/1‑107 (MQ=255) | CCGCCTTGCTGCAGCGTATTGAAAAGAGCCTGACGGCTTGCCCCTTCTGGATTCGTGGCAGCTTTCTGGCTGCGACCGTCGCCACACAGCTGGCGATGTGCGAGGTGGCCGAAGCCATCCGTTGTGCCACCGCCCGGTTTGTACAGCGCATGCCCTCGCTGCAGCAGCTGTGCTTCAGCGACGGCATGGTATTTGTCGACGACCAGTGCCTGGCCTGGCTCAAGGGCACCCAAGGGCCGTCTGGCCAAGGTGCAACCCCCCAGGAGTTCAGCGGCCTGCGCGAGGAGCTTG > NC_002947/3002889‑3003179 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |