New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | = 3622266 | 61 (1.020) | 10 (0.190) | 7/216 | NT | 15.5% | intergenic (‑186/+40) | PP_3192/PP_3193 | hypothetical protein/hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 3622288 | 54 (1.000) | intergenic (‑208/+18) | PP_3192/PP_3193 | hypothetical protein/hypothetical protein |
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
TGGAGAATACTGGGCACAAGACGGATCTTTGCCGGGTCGGGATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGC‑TGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGAGGTATCGCCACTGACGCCGATGGCGCCC > NC_002947/3622122‑3622414 | tGGAGAATACTGGGCACAAGACGGATCTTTGCCGGGTCGGGATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTcc > 2:613449/1‑150 (MQ=255) tACTGGGCACAAGACGGATCTTTGCCGGGTCGGGATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAAtt > 2:314315/1‑150 (MQ=255) gCACAAGACGGATCTTTGCCGGGTCGGGATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTtggt < 2:462905/150‑1 (MQ=255) cacaAGACGGATCTTTGCCGGGTCGGGATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTtggtg < 1:314315/150‑1 (MQ=255) acaAGACGGATCTTTGCCGGGTCGGGATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTtggtgg > 1:655509/1‑150 (MQ=255) acaAGACGGATCTTTGCCGGGTCGGGATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTtggtg < 1:1029460/149‑1 (MQ=255) acaAGACGGATCTTTGCCGGGTCGGGATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTtggtg > 2:1029460/1‑149 (MQ=255) acaAGACGGATCTTTGCCGGGTCGGGATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTG > 2:299550‑M1/1‑130 (MQ=255) acaAGACGGATCTTTGCCGGGTCGGGATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCCCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTG < 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cGGGTCGGGATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTg > 2:19638/1‑150 (MQ=255) ctgaaTCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCACGACTAGGGCATTAATGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCa < 2:677013/146‑1 (MQ=255) gggATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAg > 1:770437/1‑150 (MQ=255) ggATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGGAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAAca < 1:1518182‑M2/130‑3 (MQ=255) ggATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAAca > 2:1518182‑M2/1‑128 (MQ=255) 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tGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTG < 1:179959‑M1/91‑1 (MQ=255) gCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGC‑t < 2:840219/150‑1 (MQ=255) gAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGttccaccaacaattggcggagccag > 2:1404458‑M1/1‑88 (MQ=255) gAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGttccaccaacaattggcggagccag < 1:1404458‑M1/113‑26 (MQ=255) cTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGC‑TGTCGCCGa > 1:258173/1‑150 (MQ=255) gCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGa < 2:923377/131‑1 (MQ=255) gCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGa > 1:923377/1‑131 (MQ=255) gCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGC‑TGTCGCCGATCa < 2:1309406/150‑1 (MQ=255) tCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGC‑TGTCGCCGATCAGcc < 1:741992/150‑1 (MQ=255) gCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTtgg < 2:1403982/90‑1 (MQ=255) gCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTtgg > 1:1403982/1‑90 (MQ=255) ccATTACTGCGTCAGTAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAAcaggccaag < 1:962946‑M2/103‑10 (MQ=255) aTTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGC‑TGTCGCCGATCAGCCCGAgcg > 1:867942/1‑150 (MQ=255) aTTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGC‑TGTCGCCGATCAGCCCGAgcg > 2:899170/1‑150 (MQ=255) catcgaagcgctcgggctgatcggcgacagcggcgatcttcagccctgagccaaCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTgg < 1:1009096‑M1/50‑1 (MQ=255) catcgaagcgctcgggctgatcggcgacagcggcgatcttcagccctgagccaaCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTgg > 2:1009096‑M1/55‑104 (MQ=255) cTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGttccaccaacaattggcggagccag > 2:788059‑M1/1‑66 (MQ=255) cTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGttccaccaacaattggcggagccag < 1:788059‑M1/91‑26 (MQ=255) gCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGC‑TGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGa < 1:899170/150‑1 (MQ=255) cGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGC‑TGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGAt < 2:411615/150‑1 (MQ=255) tCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGC‑TGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATgg > 2:195078/1‑150 (MQ=255) gcgctcgggctgatcggcgacagcggcgatcttcagccctgagccaaCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCaa < 2:553291‑M1/42‑1 (MQ=255) gcgctcgggctgatcggcgacagcggcgatcttcagccctgagccaaCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCaa > 1:553291‑M1/48‑89 (MQ=255) agcagcATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGC‑TGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGcc > 2:410302/1‑150 (MQ=255) 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CCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGC‑TGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGAGGTATCGCCACTGACGCCGa > 2:640194‑M1/1‑150 (MQ=255) cTTGGCCTGttccaccaacaattggcggagccaggccaaggcgaggtcgccccatgctgcggatgcctctggaggacctgggatgctactgacgcagtaatgg > 2:962946‑M1/1‑9 (MQ=255) cTTGGCCTGttccaccaacaattggcggagccaggccaaggcgaggtcgccccatgctgcggatgcctctggaggacctgggatgctactgacgcagtaatgg < 1:962946‑M1/103‑95 (MQ=255) CTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGC‑TGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGAGGTATCGCCACTGACGCCGAt > 1:349323‑M1/1‑150 (MQ=255) CTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGC‑TGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGAGGTATCGCCACTGACGCCGAt < 2:1293768‑M1/150‑1 (MQ=255) TTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGC‑TGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGAGGTATCGCCACTGACGCCGATg > 2:301833‑M1/1‑150 (MQ=255) gCCTGttccaccaacaattggcggagccaggccaaggcgaggtcgccccatgctgcggatgcctctggaggacctgggatgctgctgacgcagtaatggccgaggcgagcggctcgcagccaggccttgatcccgacccggcaaagatcc < 1:677013‑M1/150‑146 (MQ=255) gCCTGttccaccaacaattggcggagccaggccaaggcgaggtcgccccatgctgcggatgcctctggaggacctgggatgctgctgacgcagtaatggccgaggcgagcggctcgcagccaggccttgatcccgacccggcaaagatcc < 1:840219‑M1/150‑146 (MQ=255) gCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAAcaggccaaggcgaggtcgccccatgctgcggatgcctctggaggacc < 2:637136‑M2/74‑48 (MQ=255) gCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAAcaggccaaggcgaggtcgccccatgctgcggatgcctctggaggacc > 1:637136‑M2/1‑27 (MQ=255) ccTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAAcaggccaaggcgaggtcgccccatgctgcggatgcctctggaggacctgggatgctgctgacgcagtaatggccgaggcgagcggctcgcagccaggccttgatcccgacccggcaaagatccg < 1:1085073‑M2/150‑125 (MQ=255) ccTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAAcaggccaaggcgaggtcgccccatgctgcggatgcctctggaggacctgggatgctgctgacgcagtaatggccgaggcgagcggctcgcagccaggccttgatcccgacccggcaaagatccg < 1:1084871‑M2/150‑125 (MQ=255) ccTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAAcaggccaaggcgaggtcgccccatgctgcggatgcctctggaggacctggga > 2:1176673‑M2/1‑26 (MQ=255) ccTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAAcaggccaaggcgaggtcgccccatgctgcggatgcctctggaggacctggga < 1:1176673‑M2/78‑53 (MQ=255) cTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAAcaggccaaggcgaggtcgccccatgctgcggatgcctctggaggacctgggatgctgctgacgcagtaatggccgaggcgagcggctc < 1:1404458‑M2/113‑89 (MQ=255) cTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAAcaggccaaggcgaggtcgccccatgctgcggatgcctctggaggacctgggatgctgctgacgcagtaatggccgaggcgagcggctc > 2:1404458‑M2/1‑25 (MQ=255) cTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAAcaggccaaggcgaggtcgccccatgctgcggatgcctctggaggacctgggatgctgctgacgcag > 2:788059‑M2/1‑25 (MQ=255) tGttccaccaacaattggcggagccaggccaaggcgaggtcgccccatgctccggatgcctctggaggacctgggatgctgctgacgcagtaatggccgaggcgagcggctcgcagccaggccttgatcc < 1:1518182‑M1/130‑129 (MQ=255) TGGCTCCGCCAATTGATGGTGGAACAGGCCAAGGAGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGC‑TGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAACAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGAGGTATCGCCACTGACGCCGAGGGCGccc < 2:805849‑M1/150‑1 (MQ=255) | TGGAGAATACTGGGCACAAGACGGATCTTTGCCGGGTCGGGATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGC‑TGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGAGGTATCGCCACTGACGCCGATGGCGCCC > NC_002947/3622122‑3622414 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |