New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3697416 = | 55 (0.920) | 6 (0.110) | 6/228 | NT | 10.1% | coding (116/417 nt) | PP_5595 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 3697451 = | 54 (0.950) | coding (81/417 nt) | PP_5595 | hypothetical protein |
GGGTCAGTGGAGCGATGCAGCTGCCGACACTCCCATCGGCGCACCGCGCTATTTTGCTCTTTTCGCTATTGAGCATGTCCTTGCTTTCGTTGCTGCATGACCAGTTGATCGCTTCGGCGGGTATGTTGCTGTAGCTGTAACAGGTGTGCCGCTCC‑‑‑ACCGGCGTCACGGCGTCGCTGGAGGAGCGAGTCAGCACATTGCAAGCTTCGGCCCAGACCTGGCCGCTGGCCAGGCTGGCAACCATCATCATCAAGGCAGGAACACGCATTTTCCACCTCCAGGGCACAAGGCCCTCGTC > NC_002947/3697267‑3697561 | caaagccatgcgccggcgcgacaagcctgctcagacctgacgagggccttgtgccctggaggtggaaaatgcgtgttcctgccttgatgatgatggttgccagcctggccagcggccaggtctgggccgaagcttgcaatgtgctgactc < 1:831145‑M1/1‑1 (MQ=255) caaagccatgcgccggcgcgacaagcctgctcagacctgacgagggccttgtgccctggaggtggaaaatgcgtgttcctgccttgatgatgatggttgccagcctggccagcggccaggtctgggccgaagcttgcaatgtgctgactc < 1:142443‑M1/1‑1 (MQ=255) ggTCAGTGGAGCGATGCAGCTGCCGACACTCCCATCGGCGCACCGCGCTATTTTGCTCTTTTCGCTATTGAGCATGTCCTTGCTTTCGTTGCTGCATGACCAGTTGATCGCTTCGGCGGGTATGTTGCTGTAGCTGTAACAGGTGTGCCg > 2:1166715/1‑150 (MQ=255) gATGCTGCTGCCGACACGCCCGTCGGCGGACAGCGCTATGTTGCGCGTTTCGCTATTGGGCGTGTCCGTGCTTTCGTTGCTGCCTGACCAGTTGATCACGTAAGCGTGCATGTTGCTGTATCTGTAACAGGTGTGCCGCTCC‑‑‑ACCAGCgc < 2:132628/150‑2 (MQ=255) aGCTGCCGACACTCCCATCGGCGCACCGCGCTATTTTGCTCTTTTCGCTATTGAGCATGTCCTTGCTTTCGTTGCTGCATGACCAGTTGATCGCTTCGGCGGGTATGTTGCTGTAGCTGTAACAGGTGTGCCGCTCC‑‑‑ACCGGCGTCACgg > 2:84070/1‑150 (MQ=255) tGCCGACACTCCCATCGGCGCACCGCGCTATTTTGCTCTTTTCGCTATTGAGCATGTCCTTGCTTTCGTTGCTGCATGGCCAGTTGATCGCTTCGGCGGGTAGGCAACTAGAGTTGGAACAGTTGTGCCGCTCC‑‑‑ACCGGCGTCACGGCGt > 1:1599940/1‑150 (MQ=255) cGACACTCCCATCGGCGCACCGCGCTATTTTGCTCTTTTCGCTATTGAGCATGTCCTTGCTTTCGTTGCTGCATGACCAGTTGATCGCTTCGGCGGGTATGTTGCTGTAGCTGTAACAGGTGTGCCGc > 1:1508570/1‑128 (MQ=255) cGACACTCCCATCGGCGCACCGCGCTATTTTGCTCTTTTCGCTATTGAGCATGTCCTTGCTTTCGTTGCTGCATGACCAGTTGATCGCTTCGGCGGGTATGTTGCTGTAGCTGTAACAGGTGTGCCGc < 2:1508570/128‑1 (MQ=255) gACACTCCCATCGGCGCACCGCGCTATTTTGCTCTTTTCGCTATTGAGCATGTCCTTGCTTTCGTTGCTGCATGACCAGTTGATCGCTTCGGCGGGTATGTTGCTGTAGCTGTAACAGGTGTGCCGCTCC‑‑‑ACCGGCGTCACGGCggcgat < 2:1219765/150‑6 (MQ=255) acacTCCCATCGGCGCACCGCGCTATTTTGCTCTTTTCGCTATTGAGCATGTCCTTGCTTTCGTTGCTGCATGACCAGTTGATCGCTTCGGCGGGTATGTTGCTGTAGCTGTAACAGGTGTGCCGCTCC‑‑‑ACCGGCGTCACGGCGTCGCTg < 1:123455/150‑1 (MQ=255) tcagacctgacgagggccttgtgccctggaggtggaaaatgcgtgttcctgccttgatgatgatggttgccagcctggccagcggccaggtctgggccgaagcttgcaatgtgctgactCGCTCC‑‑‑ACCGGCGTCACGGCGTCGCTggagg < 1:1311337‑M1/31‑1 (MQ=255) tCCCATCGGCGCACCGCGCTATTTTGCTCTTTTCGCTATTGAGCATGTCCTTGCTTTCGTTGCTGCATGACCAGTTGATCGCTTCGGCGGGTATGTTGCTGTAGCTGTAACAGGTGTGCCGCTCC‑‑‑ACCGGCGTCACGGCGTCGCTggagg > 1:287353/1‑150 (MQ=255) tCCCATCGGCGCACCGCGCTATTTTGCTCTTTTCGCTATTGAGCATGTCCTTGCTTTCGTTGCTGCATGACCAGTTGATCGCTTCGGCGGGTATGTTGCTGTAGCTGTAACAGGTGTGCCGCTCC‑‑‑ACCGGCGTCACGGCGTCGCTggagg > 1:990500/1‑150 (MQ=255) tCCCATCGGCGCACCGCGCTATTTTGCTCTTTTCGCTATTGAGCATGTCCTTGCTTTCGTTGCTGCATGACCAGTTGATCGCTTCGGCGGGTATGTTGCTGTAGCTGTAACAGGTGTGCCGCTCC‑‑‑ACCGGCGTCACGGCGTCGCTggagg < 1:1055119/150‑1 (MQ=255) ccATCGGCGCACCGCGCTATTTTGCTCTTTTCGCTATTGAGCATGTCCTTGCTTTCGTTGCTGCATGACCAGTTGATCGCTTCGGCGGGTATGTTGCTGTAGCTGTAACAGGTGTGCCGCTCC‑‑‑ACCGGc > 2:985046/1‑129 (MQ=255) ccATCGGCGCACCGCGCTATTTTGCTCTTTTCGCTATTGAGCATGTCCTTGCTTTCGTTGCTGCATGACCAGTTGATCGCTTCGGCGGGTATGTTGCTGTAGCTGTAACAGGTGTGCCGCTCC‑‑‑ACCGGc < 1:985046/129‑1 (MQ=255) aTCGGCGCACCGCGCTATTTTGCTCTTTTCGCTATTGAGCATGTCCTTGCTTTCGTTGCTGCATGACCAGTTGATCGCTTCGGCGGGTATGTTGCTGTAGCTGTAACAGGTGTGCCGCTCC‑‑‑ACCGGCGTCACGGCGTCGCTGGAGGAGCg > 2:1133307/1‑150 (MQ=255) ctgacgagggccttgtgccctggaggtggaaaatgcgtgttcctgccttgatgatgatggttgccagcctggccagcggccaggtctgggccgaagcttgcaatgtgctgactCGCTCC‑‑‑ACCGGCGTCACGGCGTCGCTGGAGGAGCGAg > 2:1311337‑M1/114‑150 (MQ=255) cgcTATTTTGCTCTTTTCGCTATTGAGCATGTCCTTGCTTTCGTTGCTGCATGACCAGTTGATCGCTTCGGCGGGTATGTTGCTGTAGCTGTAACAGGTGTGCCGCTCC‑‑‑ACCGGCGTCACGGCGTCGCTGGAGGAGCGAGTCAGCACAtt < 2:297313/150‑1 (MQ=255) ttttGCTCTTTTCGCTATTGAGCATGTCCTTGCTTTCGTTGCTGCATGACCAGTTGATCGCTTCGGCGGGTATGTTGCTGTAGCTGTAACAGGTGTGCCGCTCC‑‑‑ACCGGCGTCACGGCGTCGCTGGAGGAGCGAGTCAGCACATTGCAAg > 2:1495015/1‑150 (MQ=255) ttttCGCTATTGAGCATGTCCTTGCTTTCGTTGCTGCATGACCAGTTGATCGCTTCGGCGGGTATGTTGCTGTAGCTGTAACAGGTGTGCCGCTCC‑‑‑ACCGGCGTCACGGCGTCGCTGGAGGAGCGAGTCa < 2:674688/130‑1 (MQ=255) ttttCGCTATTGAGCATGTCCTTGCTTTCGTTGCTGCATGACCAGTTGATCGCTTCGGCGGGTATGTTGCTGTAGCTGTAACAGGTGTGCCGCTCC‑‑‑ACCGGCGTCACGGCGTCGCTGGAGGAGCGAGTCa > 1:674688/1‑130 (MQ=255) ttttCGCTATTGAGCATGTCCTTGCTTTCGTTGCTGCATGACCAGTTGATCGCTTCGGCGGGTATGTTGCTGTAGCTGTAACAGGTGTGCCGCTCC‑‑‑ACCGGCGTCACGGCGTCGCTGGAGGAGCGAGTCAGCACATTGCAAGCTTCGGcc > 1:105826/1‑150 (MQ=255) tATTGAGCATGTCCTTGCTTTCGTTGCTGCATGACCAGTTGATCGCTTCGGCGGGTATGTTGCTGTAGCTGTAACAGGTGTGCCGCTCC‑‑‑ACCGGCGTCACGGCGTCGCTGGAGGAGCGAGTCAGCACATTGCAAGCTTCGGCCCAGACCt > 1:728883/1‑150 (MQ=255) ttGAGCATGTCCTTGCTCTCGTTGCTGCATGACCAGTTGATCGCTTCGGCGGGTATGTTGCTGTAGCTGTAACAGGTGTGCCGCTCC‑‑‑ACCGGCGTCACGGCGTCGCTGGAGGAGCGAGTCAGCACATTGCAAGCTTCGGCCCAGACCTgg < 1:84070/150‑1 (MQ=255) aGCATGTCCTTGCTTTCGTTGCTGCATGACCAGTTGATCGCTTCGGCGGGTATGTTGCTGTAGCTGTAACAGGTGTGCCGCTCC‑‑‑ACCGGCGTCACGGCGTCGCTGGAGGAGCGAGTCAGCACATTGCAAGCTTCGGCCCAGACCTGGCCg > 2:142443/1‑150 (MQ=255) gCATGTCCTTGCTTTCGTTGCTGCATGACCAGTTGATCGCTTCGGCGGGTATGTTGCTGTAGCTGTAACAGGTGTGCCGCTCC‑‑‑ACCGGCGTCACGGCGTCGCTGGAGGAGCGAGTCAGCACATTGCAAGCTTCGGCCCAGACCTGGCCGc < 1:954597/150‑1 (MQ=255) aTGTCCTTGCTTTCGTTGCTGCATGACCAGTTGATCGCTTCGGCGGGTATGTTGCTGTAGCTGTAACAGGTGTGCCGCTCC‑‑‑ACCGGCGTCACGGCGTCGCTGGAGGAGCGAGTCAGCACATTGCAAGCTTCGGCCCAGACCTGGCCGCTg < 1:1133307/150‑1 (MQ=255) cTTGCTTTCGTTGCTGCATGACCAGTTGATCGCTTCGGCGGGTATGTTGCTGTAGCTGTAACAGGTGTGCCGCTCC‑‑‑ACCGGCGTCACGGCGTCGCTGGAGGAGCGAGTCAGCACATTGCAAGCTTCGGCCCAGACCTGGCCGCTGGCCAg > 1:501843/1‑150 (MQ=255) ttGCTTTCGTTGCTGCATGACCAGTTGATCGCTTCGGCGGGTATGTTGCTGTAGCTGTAACAGGTGTGCCGCTCC‑‑‑ACCGGCGTCACGGCGTCGCTGGAGGAGCGAGTCAGCACATTGCAAGCTTCGGCCCAGACCTGGCCGCTGGCCAgg < 1:240411/150‑1 (MQ=255) ccttgatgatgatggttgccagcctggccagcggccaggtctgggccgaagcttgcaatgtgctgactCGCTCC‑‑‑ACCGGCGTCACGGCGTCGCTg > 2:1385500‑M1/69‑95 (MQ=255) ccttgatgatgatggttgccagcctggccagcggccaggtctgggccgaagcttgcaatgtgctgactCGCTCC‑‑‑ACCGGCGTCACGGCGTCGCTg < 1:1385500‑M1/27‑1 (MQ=255) cTTTCGTTGCTGCATGACCAGTTGATCGCTTCGGCGGGTATGTTGCTGTAGCTGTAACAGGTGTGCCGc > 2:1028530/1‑69 (MQ=255) cTTTCGTTGCTGCATGACCAGTTGATCGCTTCGGCGGGTATGTTGCTGTAGCTGTAACAGGTGTGCCGc < 1:1028530/69‑1 (MQ=255) gTTGCTGCATGACCAGTTGATCGCTTCGGCGGGTATGTTGCTGTAGCTGTAACAGGTGTGCCGCTCC‑‑‑ACCGGCGTCACGGCGTCGCTGGAGGAGCGAGTCAGCACATTGCAAGCTTCGGCCCAGACCTGGTCGCTGGCCAg > 2:287060/1‑141 (MQ=255) gTTGCTGCATGACCAGTTGATCGCTTCGGCGGGTATGTTGCTGTAGCTGTAACAGGTGTGCCGCTCC‑‑‑ACCGGCGTCACGGCGTCGCTGGAGGAGCGAGTCAGCACATTGCAAGCTTCGGCCCAGACCTGGCCGCTGGCCAg < 1:287060/141‑1 (MQ=255) gTTGCTGCATGACCAGTTGATCGCTTCGGCGGGTATGTTGCTGTAGCTGTAACAGGTGTGCCGCTCC‑‑‑ACCGGCGTCACGGCGTCGCTGGAGGAGCGAGTCAGCACATTGCAAGCTTCGGCCCAGACCTGGCCGCTGGCCAGGCTGGCAAc > 2:574206/1‑150 (MQ=255) tgctgcATGACCAGTTGATCGCTTCGGCGGGTATGTTGCTGTAGCTGTAACAGGTGTGCCGCTCC‑‑‑ACCGGCGTCACGGCGTCGCTGGAGGAGCGAGTCAGCACATTGCAAGCTTCGGCCCAGACCTGGCCGCTGGCCAGGCTgggccgaa < 1:1166715/150‑7 (MQ=255) ctgcATGACCAGTTGATCGCTTCGGCGGGTATGTTGCTGTAGCTGTAACAGGTGTGCCGCTCC‑‑‑ACCGGCGTCACGGCGTCGCTGGAGGAGCGAGTCAGCACATTGCAAGCTTCGGCCCAGACCTGGCCGCTGGCCAGGCTGGCAACcatc < 2:990500/150‑1 (MQ=255) ttgccagcctggccagcggccaggtctgggccgaagcttgcaatgtgctgactCGCTCCTCCACCGGCGTCACGGCGTCGCTggag > 1:36000‑M1/54‑86 (MQ=255) ttgccagcctggccagcggccaggtctgggccgaagcttgcaatgtgctgactCGCTCCTCCACCGGCGTCACGGCGTCGCTggag < 2:36000‑M1/33‑1 (MQ=255) aTGACCAGTTGATCGCTTCGGCGGGTATGTTGCTGTAGCTGTAACAGGTGTGCCGCTCC‑‑‑ACCGGCGTCACGGCGTCGCTGGAGGAGCGAGTCAGCACATTGCAAGCTTCGGCCCAGACCTGGCCGCTGGCCAGGCTGGCAACcatcatca < 2:287353/150‑1 (MQ=255) cAGTTGATCGCTTCGGCGGGTATGTTGCTGTAGCTGTAACAGGTGTGCCGCTCC‑‑‑ACCGGCGTCACGGCGTCGCTGGAGGAGCGAGTCAGCACATTGCAAGCTTCGGCCCAGACCTGGcc < 1:916342/119‑1 (MQ=255) cAGTTGATCGCTTCGGCGGGTATGTTGCTGTAGCTGTAACAGGTGTGCCGCTCC‑‑‑ACCGGCGTCACGGCGTCGCTGGAGGAGCGAGTCAGCACATTGCAAGCTTCGGCCCAGACCTGGcc > 2:916342/1‑119 (MQ=255) ttGATCGCTTCGGCGGGTATGTTGCTGTAGCTGTAACAGGTGTGCCGCTCC‑‑‑ACCGGCGTCACGGCGTCGCTGGAGGAGCGAGTCAGCACATTGCAAGCTTCGGCCCAGACCTGGc < 2:992786/115‑1 (MQ=255) ttGATCGCTTCGGCGGGTATGTTGCTGTAGCTGTAACAGGTGTGCCGCTCC‑‑‑ACCGGCGTCACGGCGTCGCTGGAGGAGCGAGTCAGCACATTGCAAGCTTCGGCCCAGACCTGGc > 1:992786/1‑115 (MQ=255) tCGCTTCGGCGGGTATGTTGCTGTAGCTGTAACAGGTGTGCCGCTCC‑‑‑ACCGGCGTCACGGCGTCGCTGGAGGAGCGAGTCAGCACATTGCAAGCTTCGGCCCAGACCTGGCCGCTGGCCAGGCTGGCAACCATCATCATCAAGGCAGGaa > 2:1376145/1‑150 (MQ=255) tCGCTTCGGCGGGTATGTTGCTGTAGCTGTAACAGGTGTGCCGCTCC‑‑‑ACCGGCGTCACGGCGTCGCTGGAGGAGCGAGTCAGCACATTGCAAGCTTCGGCCCAGACCTGGCCGCTGGCCAGGCTGGCAACCATCATCATCAAGGCAGGaa > 2:831145/1‑150 (MQ=255) tCGCTTCGGCGGGTATGTTGCTGTAGCTGTAACAGGTGTGCCGCTCC‑‑‑ACCGGCGTCACGGCGTCGCTGGAGGAGCGAGTCAGCACATTGCAAGCTTCGGCCCAGACCTGGCCGCTGGCCAGGCTGGCAACCATCATCATCAAGGCAGCaa < 2:274704/150‑1 (MQ=255) gCTTCGGCGGGTATGTTGCTGTAGCTGTAACAGGTGTGCCGCTCC‑‑‑ACCGGCGTCACGGCGTCGCTGGAGGAGCGAGTCAGCACATTGCAAGCTTCGGCCCAGACCTGGCCGCTGGCCAGGCTGGCAACCATCATCATCAAGGCAGGAaca > 2:1562167/1‑150 (MQ=255) cTTCGGCGGGTATGTTGCTGTAGCTGTAACAGGTGTGCCGCTCC‑‑‑ACCGGCGTCACGGCGTCGCTGGAGGAGCGAGTCAGCACATTGCAAGCTTCGGCCCAGACCTGGCCGCTGGCCAGGCTGGCAACCATCATCATCAAGGCAGGAacac < 1:1495015/150‑1 (MQ=255) gTATGTTGCTGTAGCTGTAACAGGTGTGCCGCTCC‑‑‑ACCGGCGTCACGGCGTCGCTGGAGGAGCGAGTCAGCACATTGCAAGCTTCGGCCCAGACCTGGCCGCTGGCCAGGCTGGCAACCATCATCATCAAGGCAGGAACACGCATTTTcc > 1:1263192/1‑150 (MQ=255) tATGTTGCTGTAGCTGTAACAGGTGTGCCGCTCC‑‑‑ACCGGCGTCACGGCGTCGCTGGAGGAGCGAGTCAGCACATTGCAAGCTTCGGCCCAGa < 2:1490316/92‑1 (MQ=255) tATGTTGCTGTAGCTGTAACAGGTGTGCCGCTCC‑‑‑ACCGGCGTCACGGCGTCGCTGGAGGAGCGAGTCAGCACATTGCAAGCTTCGGCCCAGa > 1:1490316/1‑92 (MQ=255) aTGTTGCTGTAGCTGTAACAGGTGTGCCGCTCC‑‑‑ACCGGCGTCACGGCGTCGCTGGAGGAGCGAGTCAGCACATTGCAAGCTTCGGCCCAGACCTGGCCGCTGGCCAGGCTGGCAACCATCATCATCAAGGCAGGAACACGCATTTTCCAc < 1:1562167/150‑1 (MQ=255) ttGCTGTAGCTGTAACAGGTGTGCCGCTCC‑‑‑ACCGGCGTCACGGCGTCGCTGGAGGAGCGAGTCAGCACATTGCAAGCTTCGGCCCAGACCTGGCCGCTGGCCAGGCTGGCAACCATCATCATCAAGGCAGGAACACGCATTTTcc < 1:381929/145‑1 (MQ=255) ttGCTGTAGCTGTAACAGGTGTGCCGCTCC‑‑‑ACCGGCGTCACGGCGTCGCTGGAGGAGCGAGTCAGCACATTGCAAGCTTCGGCCCAGACCTGGCCGCTGGCCAGGCTGGCAACCATCATCATCAAGGCAGGAACACGCATTTTcc > 2:381929/1‑145 (MQ=255) gctgtagctgtaACAGGTGTGCCGCTCC‑‑‑ACCGGCGTCACGGCGTCGCTGGAGGAGCGAGTCAGCACATTGCAAGCTTCGGCCCAGACCTGGCCGCTGGCCAGGCTGGCAACCATCATCATCAAGGCAGGAACACGCATTTTCCACCTCCa < 2:501843/150‑1 (MQ=255) gctgtagctgtaACAGGTGTGCCGCTCC‑‑‑ACCGGCGTCACGGCGTCGCTGGAGGAGCGAGTCAGCACATTGCAAGCTTCGGCCCAGACCTGGCCGCTGGCCAGGCTGGCAACCATCATCATCAAGGCAGGAACACGCATTTTCCACCTCCa > 2:323453/1‑150 (MQ=255) ctgtagctgtgACAGGTGTGCCGCTCC‑‑‑ACCGGCGTCACGGCGTCGCTGGAGGAGCGAGTCAGCACATTGCAAGCTTCGGCCCAGACCTGGCCGCTGGCCAGGCTGGCAACCATCATCATCAAGGCAGGAACACGCATTTTCCACCTCCAg > 1:1033211/1‑150 (MQ=255) gctgtaACAGGTGTGCCGCTCC‑‑‑ACCGGCGTCGCGGCGTCGCTGGAGGAGCGAGTCAGCACATTGCAAGCTTCGGCCCAGACCTGGCCGCTGGCCAGGCTGGCAACCATCATCATCAAGGCAGGAACACGCATTTTCCACCTCCAGGGcac > 2:1198642/1‑150 (MQ=255) tgtaACAGGTGTGCCGCTCC‑‑‑ACCGGCGTCACGGCGTCGCTGGAGGAGCGAGTCAGCACATTGCAAGCTTCGGCCCAGACCTGGCCGCTGGCCAGGCTGGCAACCATCATCATCAAGGCAGGAACACGCATTTTCCACCTCCAGGGCACaa < 2:728883/150‑1 (MQ=255) tgtaACAGGTGTGCCGCTCC‑‑‑ACCGGCGTCACGGCGTCGCTGGAGGAGCGAGTCAGCACATTGCAAGCTTCGGCCCAGACCTGGCCGCTGGCCAGGCTGGCAACCATCATCATCAAGGCAGGAACACGCATTTTCCACCTCCAGGGCACaa > 1:1344204/1‑150 (MQ=255) aCAGGTGTGCCGCTCC‑‑‑ACCGGCGTCACGGCGTCGCTGGAGGAGCGAGTCAGCACATTGCAAGCTTCGGCCCAGACCTGGCCGCTGGCCAGGCTGGCAACcatcatca > 2:134763/1‑107 (MQ=255) aCAGGTGTGCCGCTCC‑‑‑ACCGGCGTCACGGCGTCGCTGGAGGAGCGAGTCAGCACATTGCAAGCTTCGGCCCAGACCTGGCCGCTGGCCAGGCTGGCAACcatcatca < 1:134763/107‑1 (MQ=255) aCAGGTGTGCCGCTCC‑‑‑ACCGGCGTCACGGCGTCGCTGGAGGAGCGAGTCAGCACATTGCAAGCTTCGGCCCAGACCTGGCCGCTGGCCAGGCTGGCAACCATCATCATCAAGGCAGGAACACGCATTTTCCACCTCCAGGGCACAAg > 1:789045/1‑147 (MQ=255) aCAGGTGTGCCGCTCC‑‑‑ACCGGCGTCACGGCGTCGCTGGAGGAGCGAGTCAGCACATTGCAAGCTTCGGCCCAGACCTGGCCGCTGGCCAGGCTGGCAACCATCATCATCAAGGCAGGAACACGCATTTTCCACCTCCAGGGCACAAg < 2:789045/147‑1 (MQ=255) ggTGTGCCGCTCC‑‑‑ACCGGCGTCACGGCGTCGCTGGAGGAGCGAGTCAGCACATTGCAAGCTTCGGCCCAGACCTGGCCGCTGGCCAGGCTGGCAACCATCATCATCAAGGCAGGAACACGCATTTTCCACCTCCAGGGCACAAGGCCCTc < 2:105826/150‑1 (MQ=255) gtgCCGCTCC‑‑‑ACCGGCGTCACGGCGTCGCTGGAGGAGCGAGTCAGCACATTGCAAGCTTCGGCCCAGACCTGGCCGCTGGCCAGGCTGGCAACCATCATCATCAAGGCAGGAACACGCATTTTCCACCTCCAGGGCACAAGGCCCTCGTc > 2:568999/1‑150 (MQ=255) tgCCGCTCC‑‑‑ACCGGCGTCACGGCGTCGCTGGAGGAGCGAGTCAGCACATTGCAAGCTTCGGCCCAGACCTGGCCGCTGGCCAGGCTGGCAACCATCATCATCAAGGCAGGAACACGCATTTTCCACCTCCAg > 1:1376874/1‑132 (MQ=255) tgCCGCTCC‑‑‑ACCGGCGTCACGGCGTCGCTGGAGGAGCGAGTCAGCACATTGCAAGCTTCGGCCCAGACCTGGCCGCTGGCCAGGCTGGCAACCATCATCATCAAGGCAGGAACACGCATTTTCCACCTCCAg < 2:1376874/132‑1 (MQ=255) CGCTCC‑‑‑ACCGGCGTCACGGCGTCGCTGGAGGAGCGAGTCAGCACATTGCAAGCTTCGGCCCAGACCTGGCCGCTGGCCAGGCTGGCaa < 2:1340520‑M1/88‑1 (MQ=255) CGCTCC‑‑‑ACCGGCGTCACGGCGTCGCTGGAGGAGCGAGTCAGCACATTGCAAGCTTCGGCCCAGACCTGGCCGCTGGCCAGGCTGGCaa > 1:1340520‑M1/1‑88 (MQ=255) | GGGTCAGTGGAGCGATGCAGCTGCCGACACTCCCATCGGCGCACCGCGCTATTTTGCTCTTTTCGCTATTGAGCATGTCCTTGCTTTCGTTGCTGCATGACCAGTTGATCGCTTCGGCGGGTATGTTGCTGTAGCTGTAACAGGTGTGCCGCTCC‑‑‑ACCGGCGTCACGGCGTCGCTGGAGGAGCGAGTCAGCACATTGCAAGCTTCGGCCCAGACCTGGCCGCTGGCCAGGCTGGCAACCATCATCATCAAGGCAGGAACACGCATTTTCCACCTCCAGGGCACAAGGCCCTCGTC > NC_002947/3697267‑3697561 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |