New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3928414 | 66 (1.100) | 14 (0.260) | 10/212 | NT | 19.1% | intergenic (+46/‑94) | peaE/PP_3464 | phenylacetaldehyde dehydrogenase/hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 3928431 | 60 (1.130) | intergenic (+63/‑77) | peaE/PP_3464 | phenylacetaldehyde dehydrogenase/hypothetical protein |
Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
CGCTGCCGTTTGGTGGCTACAAGATGTCTGGCGTTGGTCGTGAGATGGGTTCAGCGGCCATCGAGCATTACACGGAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAGGTATCACATGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACAAAAAAACAACAATAAAAACCATGGAGCAACCCCATGAGGCACACACTCGCCTGCACATTGGCCCTGCTGTTAACCGCCCCCGCCAGCC > NC_002947/3928265‑3928562 | cgcTGCCGTTTGGTGGCTACAAGATGTCTGGCGTTGGTCGTGAGATGGGTTCAGCGGCCATCGAGCATTACACGGAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA < 2:1192240‑M1/150‑1 (MQ=255) ccGTTTGGTGGCTACAAGATGTCTGGCGTTGGTCGTGAGATGGGTTCAGCGGCCATCGAGCATTACACGGAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAgg > 2:629525/1‑150 (MQ=255) tggtggCTACAAGATGTCTGGCGTTGGTCGTGAGATGGGTTCAGCGGCCATCGAGCATTACACGGAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAGGTATca < 2:737039/150‑1 (MQ=255) gtggCTACAAGATGTCTGGCGTTGGTCGTGAGATGGGTTCAGCGGCCATCGAGCATTACACGGAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAGGTATcaca > 1:1226094/1‑150 (MQ=255) tggCTACAAGATGTCTGGCGTTGGTCGTGAGATGGGTTCAGCGGCCATCGAGCATTACACGGAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAGGTATCACAt > 2:1229368/1‑150 (MQ=255) tACAAGATGTCTGGCGTTGGTCGTGAGATGGGTTCAGCGGCCATCGAGCATTACACGGAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAgggcatgtgatacctgg > 2:465912‑M1/1‑133 (MQ=255) aaGATGTCTGGCGTTGGTCGTGAGATGGGTTCAGCGGCCATCGAGCATTACACGGAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAGGTATCACATGcc > 2:648854/1‑146 (MQ=255) aaGATGTCTGGCGTTGGTCGTGAGATGGGTTCAGCGGCCATCGAGCATTACACGGAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAGGTATCACATGcc < 1:648854/146‑1 (MQ=255) tCTGGCGTTGGTCGTGAGATGGGTTCAGCGGCCATCGAGCATTACACGGAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAGGTATc < 1:1010180/133‑1 (MQ=255) tCTGGCGTTGGTCGTGAGATGGGTTCAGCGGCCATCGAGCATTACACGGAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAGGTATc > 2:1010180/1‑133 (MQ=255) ggCGTTGGTCGTGAGATGGGTTCAGCGGCCATCGAGCATTACACGGAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAGGTATCACATGCCCtgtaggagcggg > 1:1229368‑M2/1‑138 (MQ=255) ggCGTTGGTCGTGAGATGGGTTCAGCGGCCATCGAGCATTACACGGAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAGGTATCACATGCCCtgtaggagcggg > 2:1226094‑M2/1‑138 (MQ=255) ggCGTTGGTCGTGAGATGGGTTCAGCGGCCATCGAGCATTACACGGAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAGGTATCACATGCCCtgtaggagc > 2:62131‑M2/1‑138 (MQ=255) tGGTCGTGAGATGGGTTCAGCGGACCTAGAGCATTACACGGAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAGGTATCACATGCCCTGTAGGAGCGGGTTCAc < 2:1440847/150‑1 (MQ=255) aTGGGTTCAGCGGCCATCGAGCATTACACGGAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAgggcatgtgatacctggtgtaggagcgg > 2:182249‑M1/1‑106 (MQ=255) aTGGGTTCAGCGGCCATCGAGCATTACACGGAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAgggcatgtgatacctggtgtaggagcgg < 1:182249‑M1/134‑29 (MQ=255) gTTCAGCGGCCATCGAGCATTACACGGAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAgggcatgtgatacctggtgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccg < 1:465912‑M1/150‑49 (MQ=255) aGCGGCCATCGAGCATTACACGGAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAGGTATCACATGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGcac < 1:561052/150‑1 (MQ=255) ggCCATCGAGCATTACACGGAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAGGTATCACATGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAgg < 1:1536956/150‑1 (MQ=255) ggCCATCGAGCATTACACGGAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAGGTATCACATGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAgg > 2:1536956/1‑150 (MQ=255) cATCGAGCATTACACGGAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCTTCTTCGCGGGTTACCCCGTTCCTAACCCAGGTATCACATTCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGcaa < 1:650336/150‑1 (MQ=38) aTCGAGCATTACACGGAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAGGCAACACAAGCCCTGTAGGAGCGGGGTCACCCCCGAAGAGGCCGGCACAgcaaac > 1:767067/1‑145 (MQ=38) cATTACACGGAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAGGTATCACATGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACaaaaaa < 1:9578/150‑1 (MQ=255) aTTACACGGAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAAGAATAACATGCCATGTAGGAGCAGGTCGACCCGCGAAGAGGCCGTCACAGGCAACaaaaaaa > 1:1625857/1‑150 (MQ=38) ttACACGGAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAGGTATCACATGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACAAAAAaac < 1:629525/150‑1 (MQ=255) cacGGAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAgggcatgtgatacctggtgtaggagcggg > 1:937771‑M1/1‑80 (MQ=255) cacGGAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAgggcatgtgatacctggtgtaggagcggg < 2:937771‑M1/109‑30 (MQ=255) ggAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAGGTAt < 2:1155508/85‑1 (MQ=255) ggAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAGGTAt > 1:1155508/1‑85 (MQ=255) ggAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAGGTATCACATGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACAAAAAAACAACAAt > 1:1535966/1‑150 (MQ=255) tGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAGGTATca > 2:819332/1‑82 (MQ=255) tGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAGGTATca < 1:819332/82‑1 (MQ=255) gAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCTGCCTCTTCGCCGGTAAAGCCGCTCATACACCAGGTATCACATGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCCCGAAAAGGCCAGCACAGGCAACAAAAAAACAACAATAAAAAc < 2:1499636/150‑1 (MQ=39) aaTCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAgggcatgtgatacctgg > 1:1043682‑M1/1‑69 (MQ=255) gtgtTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAGGTATCACATGCCCTGTAGGAGCGGGTTCAccc < 1:47233/100‑1 (MQ=255) gtgtTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAGGTATCACATGCCCTGTAGGAGCGGGTTCAccc > 2:47233/1‑100 (MQ=255) tgtTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAGGTATCACATGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACAAAAAAACAACAATAAAAACCATGGAGc < 1:1168473/150‑1 (MQ=255) ttGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAGGTATCACATGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACAAAAAAACAACAATAAAAACCATGGAGCaa > 1:867911/1‑150 (MQ=255) tCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAGGTATCACATGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACAAAAAAACAACAATAAAAACCATGGAGCAAcccc > 1:1099476/1‑150 (MQ=255) cAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAGGTATCACAt > 1:1497278/1‑69 (MQ=255) cAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAGGTATCACAt < 2:1497278/69‑1 (MQ=255) ctctGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAGGTATCACATGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGcc > 1:1427713/1‑99 (MQ=255) ctctGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAGGTATCACATGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGcc < 2:1427713/99‑1 (MQ=255) tctGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAGGTATCACATGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACAAAAAAACAACAATAAAAACCATGGAGCAACCCCATGAgg > 1:952856/1‑150 (MQ=255) gATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAGGTATCACATGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGcaacaa > 2:1344515/1‑109 (MQ=255) gATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAGGTATCACATGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGcaacaa < 1:1344515/109‑1 (MQ=255) aTCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAGGTATCACATGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACAAAAAaacaa < 2:324253/116‑1 (MQ=255) ccTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAGGTATCACATGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACAAAAAAACAACAATAAAACCCATGGAGCAACCCCATGAGGCACACACTCGCCt < 1:68263/150‑1 (MQ=255) cTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAgggcatgtgatacctggtgtaggagcg > 2:620667‑M1/1‑37 (MQ=255) cTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAgggcatgtgatacctggtgtaggagcg < 1:620667‑M1/64‑28 (MQ=255) 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cccGCTCCTACAgggcatgtgatacctggtgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggtacaggaaaaaggatcagagcttgatcaacaccgatttcagctccgtgtaatgctcgatggccgctgaacccatctcacgaccaacgcc > 1:1229368‑M1/1‑12 (MQ=255) cccGCTCCTACAgggcatgggatacctggtgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggtacaggaaaaaggatcagagcttgatcaacaccgatttcagctccgtgtaatgctcgatggccgctgaacccatctcacgaccaacgcc > 1:1526559‑M1/1‑12 (MQ=255) cccGCTCCTACACCAGGTATCACATGCCCtgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggtacaggaaaaaggatcagagcttgatcaacaccgatttcagctccgtg < 2:937771‑M2/109‑81 (MQ=255) cccGCTCCTACACCAGGTATCACATGCCCtgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggtacaggaaaaaggatcagagcttgatcaacaccgatttcagctccgtg > 1:937771‑M2/1‑29 (MQ=255) cccGCTCCTACACCAGGTATCACATGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACAAAAAAACAACAATAAAAACCATGGAGCAACCCCATGAGGca < 2:517190/113‑1 (MQ=255) cccGCTCCTACACCAGGTATCACATGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACAAAAAAACAACAATAAAAACCATGGAGCAACCCCATGAGGca > 1:517190/1‑113 (MQ=255) 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gCTCCTACAgggcatgtgatacctggtgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggtacaggaaaaaggatcagagcttgatcaacaccgatttcagctccgtgtaatgctcgatggccgctgaacccatctcacgaccaacgcc > 2:62131‑M1/1‑9 (MQ=255) gCTCCTACAgggcatgtgatacctggtgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggtacaggaaaaaggatcagagcttgatcaacaccgatttcagctccgtgtaatgctcgatggccgctgaacccatctcacgaccaacgcc < 1:62131‑M1/147‑139 (MQ=255) gCTCCTACACCAGGTATCACATGCCCtgtaggagcgggttcacccgcgaagaggccggtaca < 1:1363185‑M2/62‑37 (MQ=255) gCTCCTACACCAGGTATCACATGCCCtgtaggagcgggttcacccgcgaagaggccggtaca > 2:1363185‑M2/1‑26 (MQ=255) cTACAgggcatgtgatacctggtgtaggagcgggtttacccgcgaagagg < 1:761191‑M1/50‑46 (MQ=255) cTACAgggcatgtgatacctggtgtaggagcgggtttacccgcgaagagg > 2:761191‑M1/1‑5 (MQ=255) cTACACCAGGTATCACATGCCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACAAAAAAACAACAATAAAAACCATGGAGCAACCCCATGAGGCACACACTCGCCTGCACATTGGCCCTGCTGTTAACCGCCCCCgcca > 1:1118772/1‑150 (MQ=255) cTACACCAGGTATCACATGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACAAAAAAACAACAATAAAAACCATGGAGCAACCCCATGAGGCACACACTCGCCTGCACATTGGCCCTGCTGTTAACCGCCCCCgcca < 2:1332511/150‑1 (MQ=255) cTACACCAGGTATCACATGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACAAAAAAACAACAATAAAAACCATGGAGCAACCCCATGAGGCACACACTCGCCTGCACATTGGCCCTGCTGTTAACCGCCCCCgcca < 1:1513430/150‑1 (MQ=255) cacCAGGTATCACATGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACAAAAAAACAACAATAAAAACCATGGAGCAACCCCATGAGGCACACACTCGCCTGCACATTGGCCCTGCTGTTAACCGCCCCCgccagcc < 2:1535966/150‑1 (MQ=255) | CGCTGCCGTTTGGTGGCTACAAGATGTCTGGCGTTGGTCGTGAGATGGGTTCAGCGGCCATCGAGCATTACACGGAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAGGTATCACATGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACAAAAAAACAACAATAAAAACCATGGAGCAACCCCATGAGGCACACACTCGCCTGCACATTGGCCCTGCTGTTAACCGCCCCCGCCAGCC > NC_002947/3928265‑3928562 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |