New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3952534 | 65 (1.090) | 4 (0.070) | 3/230 | NT | 6.4% | coding (60/657 nt) | PP_3488 | Sco1/SenC family protein |
? | NC_002947 | = 3952560 | 54 (0.940) | coding (34/657 nt) | PP_3488 | Sco1/SenC family protein |
ACCCACCAGGTCTTTCTCCAGGCGTACCGGCATGCCGTCCTGGTTCAGCAGCGACACATCGGCAAAACGCACACTGGTCTTTTCCTGGTGCGCCGCCGGGGGCTGCCCGGCATGGCCGTCATGCGCGTGACCGGCGTGGGCCATGGCCAGGTGGCTGGCGAATGCCAGGCTCAGGGCCAACAGTGTGCAAGCAGGCTTGGCGTTCATCGCACATTCCTCACGTCAGTCTGGGAAGCGTTGGTTGCAGCAGCCGGCAGAACGCGCAGGCTGGTGTAGTTTTCTTCGGCAAACTTGCGC > NC_002947/3952387‑3952683 | acccaccAGGTCTTTCTCCAGGCGTACCGGCATGCCGTCCTGGTTCAGCAGCGACACATCGGCAAAACGCACACTGGTCTTTTCCTGGTGCGCCGCCGGGGGCTGCCCGGCATGGCCGTCATGCGCGTGACCGGCGTGGGCCATGGCCAg > 2:1094431/1‑150 (MQ=255) ccaccaGGTCTTTCTCCAGGCGTACCGGCATGCCGTCCTGGTTCAGCAGCGACACATCGGCAAAACGCACACTGGTCTTTTCCTGGTGCGCCGCCGGGGGCTGCCCGGCATGGCCGTCATGCGCGTGACCGGCGTGGGCCATGGCCAGGt < 1:1579857/150‑1 (MQ=255) ccaccaGGTCTTTCTCCAGGCGTACCGGCATGCCGTCCTGGTTCAGCAGCGACACATCGGCAAAACGCACACTGGTCTTTTCCTGGTGCGCCGCCGGGGGCTGCCCGGCATGGCCGTCATGCGCGTGACCGGCGTGGGCCATGGCCAGGt > 2:292268/1‑150 (MQ=255) ccaccaGGTCTTTCTCCAGGCGTACCGGCATGCCGTCCTGGTTCAGCAGCGACACATCGGCAAAACGCACACTGGTCTTTTCCTGGTGCGCCGCCGGGGGCTGCCCGGCATGGCCGTCATGCGCGTGACCGGCGTGGCCCATGGCCAGGt > 1:546960/1‑150 (MQ=255) accaGGTCTTTCTCCAGGCGTACCGGCATGCCGTCCTGGTTCAGCAGCGACACATCGGCAAAACGCACACTGGTCTTTTCCTGGTGCGCCGCCGGGGGCTGCCCGGCATGGCCGTCATGCGCGTGACCGGCGTGGGCCATGGCCAGGtgg > 2:1194046/1‑150 (MQ=255) accaGGTCTTTCTCCAGGCGTACCGGCATGCCGTCCTGGTTCAGCAGCGACACATCGGCAAAACGCACACTGGTCTTTTCCTGGTGCGCCGCCGGGGGCTGCCCGGCATGGCCGTCATGCGCGTGACCGGCGTGGGCCATGGCCAGGtgg < 2:495523/150‑1 (MQ=255) accaGGTCTTTCTCCAGGCGTACCGGCATGCCGTCCTGGTTCAGCAGCGACACATCGGCAAAACGCACACTGGTCTTTTCCTGGTGCGCCGCCGGGGGCTGCCCGGCATGGCCGTCATGCGCGTGACCGGCGTGGGCCATGGCCAGGtgg > 1:17767/1‑150 (MQ=255) caGGTCTTTCTCCAGGCGTACCGGCATGCCGTCCTGGTTCAGCAGCGACACATCGGCAAAACGCACACTGGTCTTTTCCTGGTGCGCCGCCGGGGGCTGCCCGGCATGGCCGTCATGCGCGTGACCGGCGTGGGCCATGGCCAGGtggct > 1:618717/1‑150 (MQ=255) aGGTCTTTCTCCAGGCGTACCGGCATGCCGTCCTGGTTCAGCAGCGACACATCGGCAAAACGCACACTGGTCTTTTCCTGGTGCGCCGCCGGGGGCTGCCCGGCATGGCCGTCATGCGCGTGACCGGCGTGGGCCATGGCCAGGtggctg < 1:765470/150‑1 (MQ=255) ggTCTTTCTCCAGGCGTACCGGCATGCCGTCCTGGTTCAGCAGCGACACCTCGGCAAAACGCACACTGGTCTTTTCCTGGTGCGCCGCCGGGGGCTGCCCGGCATGGCCGTCATGCGCGTGACCGGCGTGGGCCATGGCCAGGtggctgg < 1:1440939/150‑1 (MQ=255) ggTCTTTCTCCAGGCGTACCGGCATGCCGTCCTGGTTCAGCAGCGACACATCGGCAAAACGCACACTGGTCTTTTCCTGGTGCGCCGCCGGGGGCTGCCCGGCATGGCCGTCATGCGCGTGACCGGCGTGGGCCATGGCCAGGtggctgg < 1:1595676/150‑1 (MQ=255) cTTTCTCCAGGCGTACCGGCATGCCGTCCTGGTTCAGCAGCGACACATCGGCAAAACGCACACTGGTCTTTTCCTGGTGCGCCGCCGGGGGCTGCCCGGCATGGCCGTCATGCGCGTGACCGGCGTGGGCCATGGTCAGGTGGCTGGCGa > 1:581066/1‑150 (MQ=255) ctcCAGGCGTACCGGCATGCCGTCCTGGTTCAGCAGCGACACATCGGCAAAACGCACACTGGTCTTTTCCTGGTGCGCCGCCGGGGGCTGCCCGGCATGGCCGTCATGCGCGTGACCGGCGTGGGCCATGGCCAGGTGGCTGGCGAATGc < 2:217169/150‑1 (MQ=255) cAGGCGTACCGGCATGCCGTCCTGGTTCAGCAGCGACACATCGGAAAAACGCACACTGGTCTTTTGCTGGTGTGACGCATTTGGCTGCACGGAATGGCCGTTATGCGCGTGACCGGCGTGGGGCATGGCAAGGTGGGTGGGGAATggaag > 2:631401/1‑146 (MQ=255) gTACCGGCATGCCGTCCTGGTTCAGCAGCGACACATCGGCAAAACGCACACTGGTCTTTTCCTGGTGCGCCGCCGGGGGCAGCCCGGCATGGCCGTCATGCGCGTGACCGGCGTGGGCCATGGCCAGGTGGCTGGCGAATGCCAGGCTCa > 1:27565/1‑150 (MQ=255) ccGGCAGGCCGTCCTGGTTCAGCAGCGACGCATCGGCAAAACGCACACTGGTCGTTTCCTGGTGCGCCGCCGGGGGCTGCCCGGCATGGCCGTCATGCGCGTGACCGGCGTGGGCCATGGCAAGGTGGCTGGCGAATGCCAGGCTCAGgg > 2:114446‑M2/1‑148 (MQ=255) aTGCCGTCCTGGTTCAGCAGCGACACATCGGCAAAACGCACACTGGTCTTTTCCTGGTGCGCCGCCGGGGGCTGCCCGGCATGGCCGTCATGCGCGTGACCGGCGTGGGCCATGGCCAGGTGGCTGGCGAATGCCAGGCTCAGGGCCAAc > 2:1095324/1‑150 (MQ=255) tGCCGTCCTGGTTCAGCAGCGACACATCGGCAAAACGCACACTGGTCTTTTCCTGGTGCGCCGCCGGGGGCTGCCCGGCATGGCCGTCATGCGCGTGACCGGCGTGGGCCATGGCCctgagcctggcattcgccagccacctggccatgg < 2:929310‑M1/150‑35 (MQ=255) ccGTCCTGGTTCAGCAGCGACACATCGGCAAAACGCACACTGGTCTTTTCCTGGTGCGCCGCCGGGGGCTGCCCGGCATGGCCGTCATGCGCGTGACCGGCGTGGGCCATGGCCctgagcctggcattcgccagccacctggccatggcc < 1:286049‑M1/150‑37 (MQ=255) gTCCTGGTTCAGCAGCGACACATCGGCAAAACGCACACTGGTCTTTTCCTGGTGCGCCGCCGGGGGCTGCCCGGCATGGCCGTCATGCGCGTGACCGGCGTGGGCCATGGCCAGGTGGCTGGCGAATGCCAGGCTCAGGGCCAACAgtgt < 2:546960/150‑1 (MQ=255) gTCCTGGTTCAGCAGCGACACATCGGCAAAACGCACACTGGTCTTTTCCTGGTGCGCCGCCGGGGGCTGCCCGGCATGGCCGTCATGCGCGTGACCGGCGTGGGCCATGGCCAGGTGGCTGGCGAATGCCAGGCTCAGGGCCAACAgtgt < 2:618717/150‑1 (MQ=255) tGGTTCAGCAGCGACACATCGGCAAAACGCACACTGGTCTTTTCCTGGTGCGCCGCCGGGGGCTGCCCGGCATGGCCGTCATGCGCGTGACCGGCGTGGGCCATGGCCAGGTGGCTGGCGAATGCCAGGCTCAGGGCCAACAGTGTGCaa < 1:1395211/150‑1 (MQ=255) gTTCAGCAGCGACACATCGGCAAAACGCACACTGGTCTTTTCCTGGTGCGCCGCCGGGGGCTGCCCGGCATGGCCGTCATGCGCGTGACCGGCGTGGGCCATGGCCAGGTGGCTGGCGAATGCCAGGCTCAGGGCCAACAGTGTGCAAGc > 1:203218/1‑150 (MQ=255) 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(MQ=255) acaTCGGCAAAACGCACACTGGTCTTTTCCTGGTGCGCCGCCGGGGGCTGCCCGGCATGGCCGTCATGCGCGTGACCGGCGTGGGCCATGGCCAGGTGGCTGGCGAATGCCAGGCTCAGGGCCAACAGTGTGc > 2:12562/1‑133 (MQ=255) acaTCGGCAAAACGCACACTGGTCTTTTCCTGGTGCGCCGCCGGGGGCTGCCCGGCATGGCCGTCATGCGCGTGACCGGCGTGGGCCATGGCCAGGTGGCTGGCGAATGCCAGGCTCAGGGCCAACAGTGTGc < 1:12562/133‑1 (MQ=255) acaTCGGCAAAACGCACACTGGTCTTTTCCTGGTGCGCCGCCGGGGGCTGCCCGGCATGGCCGTCATGCGCGTGACCGGCGTGGGCCATGGCCAGGTGGCTGGCGAATGCCAGGCTCAGGGCCAACAGTGTGCAAGCAGGCTTGGCGTTc < 2:1077801/150‑1 (MQ=255) acaTCGGCAAAACGCACACTGGTCTTTTCCTGGTGCGCCGCCGGGGGCTGCCCGGCATGGCCGTCATGCGCGTGACCGGCGTGGGCCATGGCCAGGTGGCTGGCGAATGCCAGGCTCAGGGCCAACAGTGTGCAAGCAGGCTTGGCGTTc > 2:1045457/1‑150 (MQ=255) caTCGGCAAAACGCACACTGGTCTTTTCCTGGTGCGCCGCCGGGGGCTGCCCGGCATGGCCGTCATGCGCGTGACCGGCGTGGGCCATGGCCAGGTGGCTGGCGAATGCCAGGCTCAGGGCCAACAGTGTGCAAGCAGGCTTGGCGTTCa < 1:164477/150‑1 (MQ=255) aTCGGCAAAACGCACACTGGTCTTTTCCTGGTGCGCCGCCGGGGGCTGCCCGGCATGGCCGTCATGCGCGTGACCGGCGTGGGCCATGGTCAGGTGGCTGGCGAATGCCAGGCTCAGGGCCAACAGTGTGCAAGCAGGCTTGGCGTTCAt < 2:581066/150‑1 (MQ=255) aTCGGCAAAACGCACACTGGTCTTTTCCTGGTGCGCCGCCGGGGGCTGCCCGGCATGGCCGTCATGCGCGTGACCGGCGTGGGCCATGGCCAGGTGGCTGGCGAATGCCAGGCTCAGGGCCAACAGTGTGCAAGCAGGCTTGGCGTTCa < 1:1160996/149‑1 (MQ=255) aTCGGCAAAACGCACACTGGTCTTTTCCTGGTGCGCCGCCGGGGGCTGCCCGGCATGGCCGTCATGCGCGTGACCGGCGTGGGCCATGGCCAGGTGGCTGGCGAATGCCAGGCTCAGGGCCAACAGTGTGCAAGCAGGCTTGGCGTTCa > 2:1160996/1‑149 (MQ=255) gCAAAACGCACACTGGTCTTTTCCTGGTGCGCCGCCGGGGGCTGCCCGGCATGGCCGTCATGCGCGTGACCGGCGTGGGCCATGGCCAGGTGGCTGGCGAATGCCAGGCTCAGGGCCAACAGTGTGCAAGCAGGCTTGGCGTTCATCGca > 1:488716/1‑150 (MQ=255) aaaaCGCACACTGGTCTTTTCCTGGTGCGCCGCCGGGGGCTGCCCGGCATGGCCGTCATGCGCGTGACCGGCGTGGGCCATGGCCAGGTGGCTGGCGAATGCCAgg < 2:1370836/106‑1 (MQ=255) aaaaCGCACACTGGTCTTTTCCTGGTGCGCCGCCGGGGGCTGCCCGGCATGGCCGTCATGCGCGTGACCGGCGTGGGCCATGGCCAGGTGGCTGGCGAATGCCAgg > 1:1370836/1‑106 (MQ=255) aaaaCGCACACTGGTCTTTTCCTGGTGCGCCGCCGGAGGCTTCCCGGCATCGCAGTCATGCGCGTGACCGGCGCAGGCCAAGTCCACGTGTCTAACTAATGCCAGGCTCAGGGCCAACATGGCGCAAGCAAGCATGGCGTTCATCCcaca > 2:128243/1‑150 (MQ=255) aCGCACACTGGTCTTTTCCTGGTGCGCCGCCGGGGGCTGCCCGGCATGGCCGTCATGCGCGTGACCGGCGTGGGCCATGGCCAGGTGGCTGGCGAATGCCAGGCTCAGGGCCAACAGTGTGCAAGCAGGCTTGGCGTTCATCGCACATTc > 2:38896/1‑150 (MQ=255) cacTGGTCTTTTCCTGGTGCGCCGCCGGGGGCTGCCCGGCATGGCCGTCATGCGCGTGACCGGCGTGGGCCATGGCCa > 1:573596/1‑78 (MQ=255) cacTGGTCTTTTCCTGGTGCGCCGCCGGGGGCTGCCCGGCATGGCCGTCATGCGCGTGACCGGCGTGGGCCATGGCCa < 2:573596/78‑1 (MQ=255) cacTGGTCTTTTCCTGGTGCGCCGCCGGGGGCTGCCCGGCATGGCCGTCATGCGCGTGACCGGCGTGGGCCATGGCCAGGTGGCTGGCGAATGCCAGGCTCAGGGCCAACAGTGTGCAAGCAGGCTTGGCGTTCATCGCACATTCCTCAc < 1:292268/150‑1 (MQ=255) cacTGGTCTTTTCCTGGTGCGCCGCCGGGGGCTGCCCGGCATGGCCATAAGTTGCGTGACCGGCGTGGGCCATGGCCAGGTGGCTGGCGAATGCCAGGCTCAGGGCCAACAGTGTGCAAGCAGGCTTGGCGTTCATCGCACATTCCTCAc < 1:514543/150‑1 (MQ=255) 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gccgccGGGGGCTGCCCGGCATGGCCGTCATGCGCGTGACCGGCGTGGGCCATGGCCAGGTGGCTGGCGAATGCCAGGCTCAGGGCCAACAGTGTGCAAGCAGGCTTGGCGTTCATCGCACATTCCTCACGTCAGTCTGGGAAGCgttgg < 1:38896/150‑1 (MQ=255) ccgccgGGGGCTGCCCGGCATGGCCGTCATGCGCGTGACCGGCGTGGGCCATGGCCAGGTGGCTGGCGAATGCCAGGCTCAGGGCCAACAGTGTGCAAGCAGGCTTGGCGTTCATCGCACATTCCTCACGTCAGTCTGGGAAGCgttggt > 2:479177/1‑150 (MQ=255) cgccgGGGGCTGCCCGGCATGGCCGTCATGCGCGTGACCGGCGTGGGCCATGGCCAGGTGGCTGGCGAATGCCAGGCTCAGGGCCAACAGTGTGCAAGCAGGCTTGGCGTTCATCGCACATTCCTCACGTCAGTCTGGGAAGCgttggtt < 2:1258246/150‑1 (MQ=255) gggCTGCCCGGCATGGCCATCATGCGCGTGACCGGCGTGGGCCATGGCCAGGTGGCTGGCGAATGCCAGGCTCAGGGCCAACAGTGTGCAAGCAGGCTTGGCGTTCATCGCACATTCCTCACGTCAGTCTGGGAAGCGTTGGTTgcagca > 1:1449700/1‑150 (MQ=255) gCTGCCCGGCATGGCCGTCATGCGCGTGACCGGCGTGGGCCATGGCCAGGTGGCTGGCGAATGCCAGGCTCAGGGCCAACAGTGTGCAAGCAGGCTTGGCGTTCATCGCACATTCCTCACGTCAGTCTGGGAAGCGTTGGTTGCagcagc < 1:1603835/150‑1 (MQ=255) gCCCGGCATGGCCGTCATGCGCGTGACCGGCGTGGGCCATGGCCAGGTGGCTGGCGAATGCCAGGCTCAGGGCCAACAGTGTGCAAGCAGGCTTGGCGTTCATCGCACATTCCTCACGTCAGTCTGGGAAGCGTTGGTTGCAGCAGCCgg < 1:1045457/150‑1 (MQ=255) cGGCATGGCCGTCATGCGCGTGACCGGCGTGGGCCATGGCCAGGTGGCTGGCGAATGCCAGGCTCAGGGCCAACAGTGTGCAAGCAGGCTTGGCGTTCATCGCACATTCCTCACGTCAGTCTGGGAAGCGTTGGTTGCAGCAGCCGGCAg > 2:583456/1‑150 (MQ=255) cATGGCCGTCATGCGCGTGACCGGCGTGGGCCATGGCCAGGTGGCTGGCGAATGCCAGGCTCAGgg > 2:1576822‑M2/1‑64 (MQ=255) cATGGCCGTCATGCGCGTGACCGGCGTGGGCCATGGCCAGGTGGCTGGCGAATGCCAGGCTCAGgg < 1:1576822‑M2/66‑3 (MQ=255) aTGCGCGTGACCGGCGTGGGCCATGGCCAGGTGGCTGGCGAATGCCAGGCTCAGGGCCAACAGTGTGCAAGCAGGCTTGGCGTTCATCGCACATTCCTCACGTCAGTCTGGGAAGCGTTGGTTGCAGCAGCCGGCAGAACGCGCAGGCTg < 1:1095324/150‑1 (MQ=255) aTGCGCGTGACCGGCGTGGGCCATGGCCAGGTGGCTGGCGAATGCCAGGCTCAGGGCCAACAGTGTGCAAGCAGGCTTGGCGTTCATCGCACATTCCTCACGTCAGTCTGGGAAGCGTTGGTTGCAGCAGCCGGCAGAACGCGCAGGCTg < 1:583456/150‑1 (MQ=255) 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cATCGCCAGGTGGGTCGCGAATGCCAGGCTCAGGGCCAACAGTGTGCAAGCCGGCTTGGCGTTCATCGCACATTCCCAACGCCTGTCTGGGAAGCGTTGGTTGGAGCGGCTGGCAGAACGCGCCGGCTGGTGTAGTTTTCTTCGGCAAAc < 1:115207/150‑1 (MQ=255) aTGGCCAGGTGGCTGGCGAATGCCAGGCTCAGGGCCAACAGTGTGCAAGCAGGCTTGGCGTTCATCGCACATTCCTCACGTCAGTCTGGGAAGCGTTGGTTGCAGCAGCCGGCa > 2:1052670/1‑114 (MQ=255) aTGGCCAGGTGGCTGGCGAATGCCAGGCTCAGGGCCAACAGTGTGCAAGCAGGCTTGGCGTTCATCGCACATTCCTCACGTCAGTCTGGGAAGCGTTGGTTGCAGCAGCCGGCa < 1:1052670/114‑1 (MQ=255) gCCAGGTGGCTGGCGAATGCCAGGCTCAGGGCCAACAGTGTGCAAGCAGGCTTGGCGTTCATCGCACATTCCTCACGTCAGTCTGGGAAGCGTTGGTTGCAGCAGCCGGCAGAACGCGCAGGCTGGTGTAGTTTTCTTCGGCAAACTTgc < 1:146460/150‑1 (MQ=255) ccctgagcctggcattcgccagccaccttgccatggcccacgccggtcacgcgcatgacggccatgccgggcagcccccggcggcgcaccaggaaacgaccagtgtgcgttttgccgatgcgtcgctgctgaaccaggacggcctgccgg > 2:114446‑M1/1‑2 (MQ=255) ccctgagcctggcattcgccagccacctggccatggcccacgccggtcacgcgcatgacggccatg < 1:1576822‑M1/66‑65 (MQ=255) ccctgagcctggcattcgccagccacctggccatggcccacgccggtcacgcgcatgacggccatg > 2:1576822‑M1/1‑2 (MQ=255) cAGGTGGCTGGCGAATGCCAGGCTCAGGGCCAACAGTGTGCAAGCAGGCTTGGCGTTCATCGCACATTCCTCACGTCAGTCTGGGAAGCGTTGGTTGCAGCAGCCGGCAGAACGCGCAGGCTGGTGTAGTTTTCTTTGGCAAACTTgcgc < 1:1406480/150‑1 (MQ=255) | ACCCACCAGGTCTTTCTCCAGGCGTACCGGCATGCCGTCCTGGTTCAGCAGCGACACATCGGCAAAACGCACACTGGTCTTTTCCTGGTGCGCCGCCGGGGGCTGCCCGGCATGGCCGTCATGCGCGTGACCGGCGTGGGCCATGGCCAGGTGGCTGGCGAATGCCAGGCTCAGGGCCAACAGTGTGCAAGCAGGCTTGGCGTTCATCGCACATTCCTCACGTCAGTCTGGGAAGCGTTGGTTGCAGCAGCCGGCAGAACGCGCAGGCTGGTGTAGTTTTCTTCGGCAAACTTGCGC > NC_002947/3952387‑3952683 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |