| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 4282655 = | 51 (0.850) | 4 (0.070) | 4/230 | NT | 7.4% | coding (619/1089 nt) | PP_3753 | AraC family transcriptional regulator |
| ? | NC_002947 | 4282678 = | 51 (0.890) | coding (596/1089 nt) | PP_3753 | AraC family transcriptional regulator | |||||
CGCCAGTGCGGCCAATGTCGGCCACTGTCCATAGCGCAATGCCCGCAGGTGCCGATACACCTCAGCCACCAGCCCGTTCTGATTGCGAAAGCGGATCACCAGCCCTTGAGGTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCA‑CCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCC > NC_002947/4282509‑4282801 | cgcCAGTGCGGCCAATGTCGGCCACTGTCCATAGCGCAATGCCCGCAGGTGCCGATACACCTCAGCCACCAGCCCGTTCTGATTGCGAAAGCGGATCACCAGCCCTTGAGGTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTg > 1:1509204/1‑150 (MQ=255) tgtgctggctggccgggcggcggattgccatcgaccgcacggagctcgcggtgtcgcgcccggcccaggaggacgacttgctgctgtgggggccggacctgcggctgggcagcggacgcaccgaggtggagttcgacagcgcctaCCTGc > 1:1006892‑M1/146‑150 (MQ=255) tgtgctggctggccgggcggcggattgccatcgaccgcacggagctcgcggtgtcgcgcccggcccaggaggacgacttgctgctgtgggggccggacctgaggctgggcagcggacgcaccgaggtggagttcgacagcgcctaCCTGc > 1:1270870‑M1/146‑150 (MQ=255) gCCAATGTCGGCCACTGTCCATAGCGCAATGCCCGCAGGTGCCGATACACCTCAGCCACCAGCCCGTTCTGATTGCGAAAGCGGATCACCAGCCCTTGAGGTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGca < 2:1226614/142‑1 (MQ=255) gCCAATGTCGGCCACTGTCCATAGCGCAATGCCCGCAGGTGCCGATACACCTCAGCCACCAGCCCGTTCTGATTGCGAAAGCGGATCACCAGCCCTTGAGGTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGca > 1:1226614/1‑142 (MQ=255) gCCAATGTCGGCCACTGTCCATAGCGCAATGCCCGCAGGTGCCGATACACCTCAGCCACCAGCCCGTTCTGATTGCGAAAGCGGATCACCAGCCCTTGAGGTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCA‑CCGGc > 1:1130156/1‑150 (MQ=255) ggCCACTGTCCATAGCGCAATGCCCGCAGGTGCCGATACACCTCAGCCACCAGCCCGTTCTGATTGCGAAAGCGGATCACCAGCCCTTGAGGTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCA‑CCGGCAGGCGCAgg < 1:1128019/150‑1 (MQ=255) gCCACTGTCCATAGCGCAATGCCCGCAGGTGCCGATACACCTCAGCCACCAGCCCGTTCTGATTGCGAAAGCGGATCACTGATGGTGGAGGTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATACTGCACCA‑CCGGCAGGCGCAGGt > 1:920579/1‑150 (MQ=255) cctAGCGCCATGCTCGCAGGTGCCGATACCCCTCAGCCCCCACACCGCTCTGATTCCGAAAGCGGAGCCAGCGCATTTTAGGTGCCCCGCGCAGAAAGGCCGTCGGTTCTGCCCGCTCCTGCAGCG‑CCGCCAGGCGCAGGTAGGCGCTGt < 2:1317862/148‑1 (MQ=255) cATAGCGCAATGCCCGCAGGTGCCGATACACCTCAGCCACCAGCCCGTTCTGATTGCGAAAGCGGATCACCAGCCCTTGAGGTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCA‑CCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGt > 1:367831/1‑150 (MQ=255) cAATGCCCGCAGGTGCCGATACACCTCAGCCACCAGCCCGTTCTGATTGCGAAAGCGGATCACCAGCCCTTGAGGTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCA‑CCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTc > 1:142941/1‑150 (MQ=255) gATACACCTCAGCCACCAGCCCGTTCTGATTGCGAAAGCGGATCACCAGCCCTTGAGGTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCA‑CCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTccac < 1:1530172/150‑3 (MQ=255) gATACACCTCAGCCACCAGCCCGTTCTGATTGCGAAAGCGGATCACCAGCCCTTGAGGTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCA‑CCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGc > 1:1578570/1‑150 (MQ=255) aTACACCTCAGCCACCAGCCCGTTCTGATTGCGAAAGCGGATCACCAGCCCTTGAGGTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCA‑CCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTc > 1:1400903/1‑126 (MQ=255) aTACACCTCAGCCACCAGCCCGTTCTGATTGCGAAAGCGGATCACCAGCCCTTGAGGTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCA‑CCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTc < 2:1400903/126‑1 (MQ=255) acCTCAGCCACCAGCCCGTTCTGATTGCGAAAGCGGATCACCAGCCCTTGAGGTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCA‑CCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCt < 2:1359777/146‑1 (MQ=255) acCTCAGCCACCAGCCCGTTCTGATTGCGAAAGCGGATCACCAGCCCTTGAGGTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCA‑CCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCt > 1:1359777/1‑146 (MQ=255) acCTCAGCCACCAGCCCGTTCTGATTGCGAAAGCGGATCACCAGCCCTTGAGGTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCA‑CCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGccc > 2:1523127/1‑150 (MQ=255) ccTCAGCCACCAGCCCGTTCTGATTGCGAAAGCGGATCACCAGCCCTTGAGGTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCA‑CCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCa > 1:1293444/1‑150 (MQ=255) cTCAGCCACCAGCCCGTTCTGATTGCGAAAGCGGATCACCAGCCCTTGAGGTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCA‑CCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAg > 1:500847/1‑150 (MQ=255) caccaGCCCGTTCTGATTGCGAAAGCGGATCACCAGCCCTTGAGGTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCA‑CCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAg < 2:500847/150‑1 (MQ=255) caGCCCGTTCTGATTGCGAAAGCGGATCACCAGCCCTTGAGGTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCA‑CCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTc > 1:58947/1‑150 (MQ=255) gCCCGTTCTGATTGCGAAAGCGGATCACCAGCCCTTGAGGTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCA‑CCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCg > 2:857973/1‑150 (MQ=255) cccGTTCTGATTGCGAAAGCGGATCACCAGCCCTTGAGGTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCA‑CCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCgg < 2:142941/150‑1 (MQ=255) ccGTTCTGATTGCGAAAGCGGATCACCAGCCCTTGAGGTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCA‑CCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGc < 2:1130156/150‑1 (MQ=255) gTTCTGATTGCGAAAGCGGATCACCAGCCCTTGAGGTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCA‑CCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAg > 2:853033/1‑141 (MQ=255) gTTCTGATTGCGAAAGCGGATCACCAGCCCTTGAGGTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCA‑CCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAg < 1:853033/141‑1 (MQ=255) ttCTGATTGCGAAAGCGGATCACCAGCCCTTGAGGTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCA‑CCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGcccc < 1:350607/150‑1 (MQ=255) ttCTGATTGCGAAAGCGGATCACCAGCCCTTGAGGTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCA‑CCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGcccc > 1:1614849/1‑150 (MQ=255) cTGATTGCGAAAGCGGATCACCAGCCCTTGAGGTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCATGGCTGCCCGAGCCTGCACCA‑CCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCca < 1:929443/150‑1 (MQ=255) aTTGCGAAAGCGGATCACCAGCCCTTGAGGTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCA‑CCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCAcag > 1:651975/1‑150 (MQ=255) aaaGCGGATCACCAGCCCTTGAGGTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCA‑CCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCaa < 2:1509204/150‑1 (MQ=255) aaGCGGATCACCAGCCCTTGAGGTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCA‑CCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAg > 1:576776/1‑150 (MQ=255) aaGCGGATCACCAGCCCTTGAGGTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCA‑CCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAg > 1:890792/1‑150 (MQ=255) ggggccggacctgcggctgggcagcggacgcaccgaggtggagttcgacagcgcctaCCTGCACCA‑CCGGCAGGCGCAGGTAg < 1:1204581‑M1/26‑1 (MQ=255) ggggccggacctgcggctgggcagcggacgcaccgaggtggagttcgacagcgcctaCCTGCACCA‑CCGGCAGGCGCAGGTAg > 2:1204581‑M1/58‑83 (MQ=255) ggATCACCAGCCCTTGAGGTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCA‑CCGGCAGGCGCAGGTAg > 2:1515177/1‑80 (MQ=255) ggATCACCAGCCCTTGAGGTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCA‑CCGGCAGGCGCAGGTAg < 1:1515177/80‑1 (MQ=255) cAGCCCTTGAGGTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCA‑CCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTg > 2:168823/1‑150 (MQ=255) cccTTGAGGTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCA‑CCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGt > 2:1301689/1‑77 (MQ=255) cccTTGAGGTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCA‑CCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGt < 1:1301689/77‑1 (MQ=255) ccTTGAGGTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCA‑CCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGcc < 2:1614849/150‑1 (MQ=255) aGGTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCA‑CCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGgcg > 1:1015610/1‑150 (MQ=255) ggTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCA‑CCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGt > 2:1161205/1‑86 (MQ=255) ggTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCA‑CCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGt < 1:1161205/86‑1 (MQ=255) ggTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCA‑CCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGgcgc < 2:367831/150‑1 (MQ=255) tGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCA‑CCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGa < 1:317626/150‑1 (MQ=255) gCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCA‑CCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGac > 1:1015161/1‑150 (MQ=255) cTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCA‑CCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTg < 2:403389/134‑1 (MQ=255) cTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCA‑CCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTg > 1:403389/1‑134 (MQ=255) gaGAAAGATCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCA‑CCGCCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAg < 2:4520/149‑1 (MQ=255) aGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCA‑CCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCg < 1:1523127/150‑1 (MQ=255) tCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCA‑CCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGt < 2:651975/150‑1 (MQ=255) gttcgacagcgcctaCCTGCGCCTGCCGGT‑GGTGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGt < 1:561113‑M1/135‑1 (MQ=255) gttcgacagcgcctaCCTGCGCCTGCCGGT‑GGTGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGt > 2:561113‑M1/16‑150 (MQ=255) ggCTGCCCGATCCTGCACCA‑CCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAgtcg < 1:819416/106‑1 (MQ=255) ggCTGCCCGATCCTGCACCA‑CCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAgtcg > 2:819416/1‑106 (MQ=255) gCTGCCCGATCCTGCACCA‑CCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCAATg < 2:583354/150‑1 (MQ=255) ccGATCCTGCACCA‑CCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATgg < 2:1111486/146‑1 (MQ=255) ccGATCCTGCACCA‑CCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATgg > 1:1111486/1‑146 (MQ=255) ccGATCCTGCACCA‑CCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGAAGGACGCCAAGGACCTTTGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAAt > 2:862414/1‑150 (MQ=255) gctCCTGCACCA‑CCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATcc > 2:1557656/3‑150 (MQ=255) | CGCCAGTGCGGCCAATGTCGGCCACTGTCCATAGCGCAATGCCCGCAGGTGCCGATACACCTCAGCCACCAGCCCGTTCTGATTGCGAAAGCGGATCACCAGCCCTTGAGGTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCA‑CCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCC > NC_002947/4282509‑4282801 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |