New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5690116 | 54 (0.900) | 4 (0.070) | 4/228 | NT | 7.9% | coding (283/402 nt) | pilG | pilus biosynthesis/twitching motility protein PilG |
? | NC_002947 | = 5690136 | 42 (0.740) | coding (263/402 nt) | pilG | pilus biosynthesis/twitching motility protein PilG |
AAGTAGGACCGCGCCATGGCGGGGCTCGGTCAGGGTGCGTGTTGTTGAGGTGCGGCAAACCCGGGCACATGGGCGCGGATCGCGTCGAGCAGTTCTTCCTTGCTGAACGGCTTGGTCAGGAACTGATCGGAACCGACCACCCG‑CCCGCG‑‑GGCCTTGTCGAACAGGCCATCGCGGGACGACAGCAGGATAACCGGGGTGTCCTTGAAGGCACTGTTGTGCTTGATTACCGCGCAGGTCTGGTAGCCGTCCAGGCGTGGCATCAGCACATCGACGAAAATGATACTGGGCTGATGGTC > NC_002947/5689968‑5690263 | aaGTAGGACCGCGCCATGGCGGGGCTCGGTCAGGGTGCGTGTTGTTGAGGTGCGGCAAACCCGGGCACATGGGCGCGGATCGCGTCGAGCAGTTCTTCCTTGCTGAACGGCTTGGTCAGGAACTGATCGGAACCGACCACCCG‑CCCGCg‑‑g < 2:1120081/150‑1 (MQ=255) aaGTAGGACCGCGCCATGGCGGGGCTCGGTCAGGGTGCGTGTTGTTGAGGTGCGGCAAACCCGGGCACATGGGCGCGGATCGCGTCGAGCAGTTCTTCCTTGCTGAACGGCTTGGTCAGGAACTGATCGGAACCGACCACCCG‑CCCGCg‑‑g < 2:1267427/150‑1 (MQ=255) aaGTAGGACCGCGCCATGGCGGGGCTCGGTCAGGGTGCGTGTTGTTGAGGTGCGGCAAACCCGGGCACATGGGCGCGGATCGCGTCGAGCAGTTCTTCCTTGCTGAACGGCTTGGTCAGGAACTGATCGGAACCGACCACCCG‑CCCGCg‑‑g < 2:934124/150‑1 (MQ=255) ggACCGCGCCATGGCGGGGCTCGGTCAGGGTGCGTGTTGTTGAGGTGCGGCAAACCCGGGCACATGGGCGCGGATCGCGTCGAGCAGTTCTTCCTTGCTGAACGGCTTGGTCAGGAACTGATCGGAACCGACCACCCG‑CCCGCG‑‑GGCCtt > 2:820479/1‑150 (MQ=255) gACCGCGCCATGGCGGGGCTCGGTCAGGGTGCGTGTTGTTGAGGTGCGGCAAACCCGGGCACATGGGCGCGGATCGCGTCGAGCAGTTCTTCCTTGCTGAACGGCTTGGTCAGGAACTGATCGGAACCGACCACCCG‑CCCGCG‑‑GGCCTTg > 1:981358/1‑150 (MQ=255) gACCGCGCCATGGCGGGGCTCGGTCAGGGTGCGTGTTGTTGAGGTGCGGCAAACCCGGGCACATGGGCGCGGATCGCGTCGAGCAGTTCTTCCTTGCTGAACGGCTTGGTCAGGAACTGATCGGAACCGACCACCCG‑CCCGCG‑‑GGCCTTg > 1:623794/1‑150 (MQ=255) gACCGCGCCATGGCGGGGCTCGGTCAGGGTGCGCTATGTTGAGGTGCGGCAAACCCGGGCACATGGGCGCGGATCGCGTCGAGCAGTTCTTCCTTGCTGAACGGCTTGGTCAGGAACTGATCGGAACCGACCACCCG‑CCCGCG‑‑GGCCTTg > 1:387152/1‑150 (MQ=255) aCCGCGCCATGGCGGGGCTCGGTCAGGGTGCGTGTTGTTGAGGTGCGGCAAACCCGGGCACATGGGCGCGGATCGCGTCGAGCAGTTCTTCCTTGCTGAACGGCTTGGTCAGGAACTGATCGGAACCGACCACCCG‑CCCGCG‑‑GGCCTTGt < 1:45678/150‑1 (MQ=255) ccGCGCCATGGCGGGGCTCGGTCAGGGTGCGTGTTGTTGAGGTGCGGCAAACCCGGGCACATGGGCGCGGATCGCGTCGAGCAGTTCTTCCTTGCTGAACGGCTTGGTCAGGAACTGATCGGAACCGACCACCCG‑CCCGCG‑‑GGCCTTGTc < 1:1253646/150‑1 (MQ=255) ccGCGCCATGGCGGGGCTCGGTCAGGGTGCGTGTTGTTGAGGTGCGGCAAACCCGGGCACATGGGCGCGGATCGCGTCGAGCAGTTCTTCCTTGCTGAACGGCTTGGTCAGGAACTGATCGGAACCGACCACCCG‑CCCGCG‑‑GGCCTTGTc < 2:582484/150‑1 (MQ=255) ccGCGCCATGGCGGGGCTCGGTCAGGGTGCGTGTTGTTGAGGTGCGGCAAACCCGGGCACATGGGCGCGGATCGCGTCGAGCAGTTCTTCCTTGCTGAACGGCTTGGTCAGGAACTGATCGGAACCGACCACCCG‑CCCGCG‑‑GGCCTTGTc < 1:1558957/150‑1 (MQ=255) ccGCGCCATGGCGGGGCTCGGTCAGGGTGCGTGTTGTTGAGGTGCGGCAAACCCGGGCACATGAGCGCGGATCGCGTCGAGCACTTCTTCCTTGCTGAACGGCTTGGTCAGGAACTGATCGGAACCGACCACCCG‑CCCGCG‑‑GGCCTTGTc > 1:111008/1‑150 (MQ=255) cgcCATGGCGGGGCTCGGTCAGGGTGCGTGTTGTTGAGGTGCGGCAAACCCGGGCACATGGGCGCGGATCGCGTCGAGCAGTTCTTCCTTGCTGAACGGCTTGGTCAGGAACTGATCGGAACCGACCACCCG‑CCCGCG‑‑GGCCTTGTCGaa < 2:981358/150‑1 (MQ=255) cTCGGTCAGGGTGCGTGTTGTTGAGGTGCGGCAAACCCGGGCACATGGGCGCGGATCGCGTCGAGCAGTTCTTCCTTGCTGAACGGCTTGGTCAGGAACTGATCGGAACCGACCACCCG‑CCCGCG‑‑GGCCTTGTCGAACAGGCCATcgcgg > 1:1225986‑M2/1‑145 (MQ=255) cGGTCAGGGTGCGTGTTGTTGAGGTGCGGCAAACCCGGGCACATGGGCGCGGATCGAGTAGCACGAAAGTCGCGGGCTTAACGGCTTGGTCAGGAACTAACCGG‑CCCTATGCCAGGCCCCGCG‑‑TGCCTTGTCGAACAGGCCATCGCGGga < 1:1192274/150‑1 (MQ=255) cAGGGTGCGTGTTGTTGAGGTGCGGCAAACCCGGGCACATGGGCGCGGATCGCGTCGAGCAGTTCTTCCTTGCTGAACGGCTTGGTCAGGAACTGATCGGAACCGACCACCCG‑CCCGCGatggcctgttcgacaaggcccgcgggcgggt < 1:271371‑M1/150‑32 (MQ=255) aGGGTGCGTGTTGTTGAGGTGCGGCAAACCCGGGCACATGGGCGCGGATCGCGTCGAGCAGTTCTTCCTTGCTGAACGGCTTGGTCAGGAACTGATCGGAACCGACCACCCG‑CCCGCGatggcctgttcgacaaggcccgcgggcggg > 1:406560‑M1/1‑118 (MQ=255) aGGGTGCGTGTTGTTGAGGTGCGGCAAACCCGGGCACATGGGCGCGGATCGCGTCGAGCAGTTCTTCCTTGCTGAACGGCTTGGTCAGGAACTGATCGGAACCGACCACCCG‑CCCGCGatggcctgttcgacaaggcccgcgggcggg < 2:406560‑M1/148‑31 (MQ=255) gTGCGTGTTGTTGAGGTGCGGCAAACCCGGGCACATGGGCGCGGATCGCGTCGAGCAGTTCTTCCTTGCTGAACGGCTTGGTCAGGAACTGATCGGAACCGACCACCCG‑CCCGCG‑‑GGCCTTGTCGAACAGGCCATCGCGGGACGAcagca < 2:387152/150‑1 (MQ=255) cGTGTTGTTGAGGTGCGGCAAACCCGGGCACATGGGCGCGGATCGCGTCGAGCAGTTCTTCCTTGCTGAACGGCTTGGTCAGGAACTGATCGGAACCGACCACCCG‑CCCGCG‑‑GGCCTTGTCGAACAGGCCATCGCGGGACGACAGCAGGa < 2:623794/150‑1 (MQ=255) gtgtTGTTGAGGTGCGGCAAACCCGGGCACATGGGCGCGGATCGCGTCGAGCAGTTCTTCCTTGCTGAACGGCTTGGTCAGGAACTGATCGGAACCGACCACCCG‑CCCGCGATGGCCTGTTCGACAAGGCC‑gcgggcgggtggtcggtt > 2:1527792‑M2/1‑132 (MQ=255) gtgtTGTTGAGGTGCGGCAAACCCGGGCACATGGGCGCGGATCGCGTCGAGCAGTTCTTCCTTGCTGAACGGCTTGGTCAGGAACTGATCGGAACCGACCACCCG‑CCCGCG‑‑GGCCTTGTc < 2:687713/120‑1 (MQ=255) gtgtTGTTGAGGTGCGGCAAACCCGGGCACATGGGCGCGGATCGCGTCGAGCAGTTCTTCCTTGCTGAACGGCTTGGTCAGGAACTGATCGGAACCGACCACCCG‑CCCGCG‑‑GGCCTTGTc > 1:687713/1‑120 (MQ=255) ccgatctaGGTGCGGCAAACCCGGGCACATGGGCGCGGATCGCGTCGAGCAGTTCTTCCTTGCTGAACGGCTTGGTCAGGAACTGATCGGAACCGACCACCCG‑CCCGCG‑‑GGCAATTTTTAACAGGCCATCGCGGGACGACAGCAGGATaa < 1:1135335/143‑1 (MQ=255) tgAGGTGCGGCAAACCCGGGCACATGGGCGCGGATCGCGTCGAGCAGTTCTTCCTTGCTGACCGGGATTTTCAGGAACAGATCGGAACCGACCACCCG‑CCCGCG‑‑GGCCTTGTCCAACAGGCCATCGCGGGACGACAGCAGGATAACCggg < 1:115614/150‑1 (MQ=255) tgAGGTGCGGCAAACCCGGGCACATGGGCGCGGATCGCGTCGAGCAGTTCTTCCTTGCTGAACGGCTTGGTCAGGAACTGATCGGAACCGACCACCCG‑CCCGCG‑‑GGCCTTGTCGAACAGGCCATCGCGGGACGACAGCAGGATAACCggg < 2:1216955/150‑1 (MQ=255) tgAGGTGCGGCAAACCCGGGCACATGGGCGCGGATCGCGTCGAGCAGTTCTTCCTTGCTGAACGGCTTGGTCAGGAACTGATCGGAACCGACCACCCG‑CCCGCG‑‑GGCCTTGTCGAACAGGCCATCGCGGGACGACAGCAGGATAACCggg < 1:852962/150‑1 (MQ=255) tgAGGGGCGGCAAACCCCGGCACATGGGCGCGGATCGCGCCGAGCAGTTCTTCCTTGCTGAACGGCTTGGTCAGGAACTGATCGGAACCGACCACCCG‑CCCGCG‑‑GGCCTTGTCGAACAGGCCATCGCGGGACGACAGCAGGATAACCggg < 1:1502397/150‑1 (MQ=255) ggTGCGGCAAACCCGGGCACATGGGCGCGGATCGCGTCGAGCAGTTCTTCCTTGCTGAACGGCTTGGTAAAGAACTGAGCGGAACCGACCACCCG‑CCCGCG‑‑GGCCTTGTCGAACAGGCCATCGCGGGACGACAGCAGGATAAcagatcgg > 2:1135335/1‑143 (MQ=255) tGCGGCAAACCCGGGCACATGGGCGCGGATCGCGTCGAGCAGTTCTTCCTTGCTGAACGGCTTGGTCAGGAACTGATCGGACCCGACCACCCG‑CCCGCG‑‑GGCCTTTTCGAACAGGCCATCGCGGGACGACAGCAGGATAACCGGGGTGTc < 2:186205/150‑1 (MQ=255) gCGGCAAACCCGGGCACATGGGCGCGGATCGCGTCGAGCAGTTCTTCCTTGCTGAACGGCTTGGTCAGGAACTGATCGGAACCGACCACCCG‑CCCGCG‑‑GGCCTTGTCGAACa > 2:856119/1‑112 (MQ=255) gCGGCAAACCCGGGCACATGGGCGCGGATCGCGTCGAGCAGTTCTTCCTTGCTGAACGGCTTGGTCAGGAACTGATCGGAACCGACCACCCG‑CCCGCG‑‑GGCCTTGTCGAACa < 1:856119/112‑1 (MQ=255) aCCCGGGCACATGGGCGCGGATCGCGTCGAGCAGTTCTTCCTTGCTGAACGGCTTGGTCAGGAACTGATCGGAACCGACCACCCG‑CCCGCG‑‑GGCCTTGTCGAACAGGCCATCGCGGGACGACAGCAGGATAACCGGGGGGTCCTTGAAgg > 1:278740/1‑150 (MQ=255) ccGGGCACATGGGCGCGGATCGCGTCGAGCAGTTCTTCCTTGCTGAACGGCTTGGTCAGGAACTGATCGGAACCGACCACCCG‑CCCGCG‑‑GGCCTTGTCGAACAGGCCATCGCGGGACGACAGCAGGATAACCGGGGTGTCCTTGAAGGCa > 1:1506040/1‑150 (MQ=255) gggCACATGGGCGCGGATCGCGTCGAGCAGTTCTTCCTTGCTGAACGGCTTGGTCAGGAACTGATCGGAACCGACCACCCG‑CCCGCG‑‑GGCCTTGTCGAACAGGCCATCGCGGGACGACAGCAGGATAACCGGGGTGTCCTTGAAGGCACt > 2:1054430/1‑150 (MQ=255) ggCGCGGATCGCGTCGAGCAGTTCTTCCTTGCTGAACGGCTTGGTCAGGAACTGATCGGAACCGACCACCCG‑CCCGCG‑‑GGCCTTGTCGAACAGGCCATCGCGGGACGACAGCAGGATAACCGGGGTGTCCTTGAAGGCACTGTTGTGCtt < 2:1506040/150‑1 (MQ=255) gcgGGTCGCGTCGAGCAGTTCTTCCTTGCTGAACGAAGTAGCCAGGAACTGATGGGACCCGACACCCCG‑CCCGCG‑‑GGCCTTGTCGAACAGGCCATCACGGCACGACAGCAGGATAACCGGAGTGTCCTTGAAGGCACTGTTGTGCTTAAt > 2:521411/1‑150 (MQ=255) gATCGCGTCGAGCAGTTCTTCCTTGCTGAACGGCTTGGTCAGGAACTGATCGGAACCGACCACCCG‑CCCGCG‑‑GGCCTTGTCGAACAgg > 2:1511694/1‑88 (MQ=255) gATCGCGTCGAGCAGTTCTTCCTTGCTGAACGGCTTGGTCAGGAACTGATCGGAACCGACCACCCG‑CCCGCG‑‑GGCCTTGTCGAACAgg < 1:1511694/88‑1 (MQ=255) aGTTCTTCCTTGCTGAACGGCTTGGTCAGGAACTGATCGGAACCGACCACCCG‑CCCGCG‑‑GGCCTTGTCGAACAGGCCATCGCGGgacga < 2:246631/89‑1 (MQ=255) aGTTCTTCCTTGCTGAACGGCTTGGTCAGGAACTGATCGGAACCGACCACCCG‑CCCGCG‑‑GGCCTTGTCGAACAGGCCATCGCGGgacga > 1:246631/1‑89 (MQ=255) tcttcCTTGCTGAACGGCTTGGTCAGGAACTGATCGGAACCGACCACCCG‑CCCGCG‑‑GGCCTTGTCGAACAGGCCATCGCGGGACGACAGCAGGATAACCGGGGTGTCCTTGAAGGCACTGTTGTGCTTGATTACCGCGCAGGTCTGGTAg < 1:964490/150‑1 (MQ=255) ttcCTTGCTGAACGGCTTGGTCAGGAACTGATCGGAACCGACCACCCG‑CCCGCG‑‑GGGCTTGTCGAACAGGCCATCGCGGGACGACAGCAGGATAACCGGGGTGTCCTTGAAGGCACTGTTGTGCTTGATTACCGCGCAGGTCTGGTAGcc > 2:1422122/1‑150 (MQ=255) tcCTTGCTGAACGGCTTGGTCAGGAACTGATCGGAACCGACCACCCG‑CCCGCG‑‑GGCCTTGTCGAACAGGCCATCGCGGGACGACAGCAGGATAACCGGGGTGTCCTTGAAGGCACTGTTGTGCTTGATTACCGCGCAGGTCTGGTAGCCg > 1:990567/1‑150 (MQ=255) ccTTGCTGAACGGCTTGGTCAGGAACTGATCGGAACCGACCACCCG‑CCCGCG‑‑GGCCTTGTCGAACAGGCCATCGCGGGACGACAGCAGGATAACCGGGGTGTCCTTGAAgg < 1:265149/111‑1 (MQ=255) ccTTGCTGAACGGCTTGGTCAGGAACTGATCGGAACCGACCACCCG‑CCCGCG‑‑GGCCTTGTCGAACAGGCCATCGCGGGACGACAGCAGGATAACCGGGGTGTCCTTGAAgg > 2:265149/1‑111 (MQ=255) cTTGCTGAACGGCTTGGTCAGGAACTGATCGGAACCGACCACGCG‑CCNGCG‑‑GGCCTTGTCGAACAGGCCATCGCGGGACGACAGCAGGATAACCGGGGTGTCCTTGAAGGCACTGTTGTGCTTGGTTACCGCGCAGGGCTGGGAGCCGTc > 1:536118/1‑150 (MQ=255) cTTGCTGAACGGCTTGGTCAGGAACTGATCGGAACCGACCACCCG‑CCCGCG‑‑GGCCTTGTCGAACAGGCCATCGCGGGACGACAGCAGGATAACCGGGGTGTCCTTGAAGGCACTGTTGTGCTTGATTACCGCGCAGGTCTGGTAGCCGTc > 1:818732/1‑150 (MQ=255) gCTGAACGGCTTGGTCAGGAACTGATCGGAACCGACCACCCG‑CCCGCG‑‑GGCCTTGTCGAACAGGCCATCGCGGGACGACAGCAGGATAACCGGGGTGTCCTTGAAGGCACTGTTGTGCTTGATTACCGCGCAGGTCTGGTAGCCGTCCAg < 2:381673/150‑1 (MQ=255) aaCGGCTTGGTCAGGAACTGATCGGAACCGACCACCCG‑CCCGCG‑‑GGCCTTGTCGAACAGGCCATCGCGGGACGACAGCAGGATAACCGGGGTGTCCTTGAAGGCACTGTTGTGCTTGATTACCGCGCAGGTCTGGTAGCCGTCCAGGCGt > 1:912421/1‑150 (MQ=255) ggTCAGGAACTGATCGGAACCGACCACCCG‑CCCGCG‑‑CGCCTTGTCGAACAGGCCATCGCGGGACGACAGCAGGATAACCGGGGTGTCCTTGAAGGCACTGTTGTGCTTGATTACCGCGCAGGTCTGGTAGCCGTCCAGGCGTGGCATCAg < 1:1162992/150‑1 (MQ=255) aggcccTGATGGGAACCTACCACCCG‑CCCGCG‑‑GGCCTTGTCGAACAGGCCATCGCGGGACGACAGCAGGATAACCGGGGTGTCCTTGAAGGCACTGTTGTGCTTGATTACCGCGCAGGTCTGGTAGCCGTCCAGGCGTGGCATCAGcaca < 2:912421/145‑1 (MQ=255) aGGAACTGATCGGAACCGACCACCCG‑CCCGCG‑‑GGCCTTGTCGAACAGGCCATCGCGGGACGAcag < 1:1087772/65‑1 (MQ=255) aGGAACTGATCGGAACCGACCACCCG‑CCCGCG‑‑GGCCTTGTCGAACAGGCCATCGCGGGACGAcag > 2:1087772/1‑65 (MQ=255) cTGATCGGAACCGACCACCCG‑CCCGCG‑‑GGCCTTGTCGAACAGGCCATCGCGGGACGACAGCAGGATAACCGGGGTGTCCTTGAAGGCACTGTTGTGCTTGATTACCGCGCAGGTCTGGTAGCCGTCCAGGCGTGGCATCAGCACATcgac < 1:1054430/150‑1 (MQ=255) cTGATCGGAACCGACCACCCG‑CCCGCG‑‑GGCCTTGTCGAACAGGCCATAGCGGGACGACAGCAGGATAACCGGGGTGTCCTTGAAGGCACTGTTGTGCTTGATTACCGCGCAGGTCTGGTAGCCGTCCAGGCGTGGCATCAGCACATcgac < 2:278740/150‑1 (MQ=255) aaCCGACCACCCG‑CCCGCGggccttgtcgaacaggccatcgcgggcgggtggtcggttccgatcagttcctgaccaagccgttcagcaaggaagaactgctcgacgcgatccgcgcccatgtgcccgggtttgccgcacctcaacaacac > 2:1527792‑M1/1‑19 (MQ=255) gACCACCCG‑CCCGCG‑‑GGCCTTGTCGAACAGGCCATCGCGGGACGACAGCAGGATAACCGGGGTGTCCTTGAAGGCACTGTTGTGCTTGATTACCGCGCAGGTCTGGTAGCCGTCCAGGCGTGGCATCAGCACATCGACGAAAATGATACt > 1:508470/1‑150 (MQ=255) accaccCG‑CCCGCG‑‑GGCCTTGTCGAACAGGCCATCGCGGGACGACAGCAGGATAACCGGGGTGTCCTTGAAGGCACTGTTGTGCTTGATTACCGCGCAGGTCTGGTAGCCGTCCAGGCGTGGCATCAGCACATcgacga < 1:1302074/139‑1 (MQ=255) accaccCG‑CCCGCG‑‑GGCCTTGTCGAACAGGCCATCGCGGGACGACAGCAGGATAACCGGGGTGTCCTTGAAGGCACTGTTGTGCTTGATTACCGCGCAGGTCTGGTAGCCGTCCAGGCGTGGCATCAGCACATcgacga > 2:1302074/1‑139 (MQ=255) caccCG‑CCCGCG‑‑GGCCTTGTCGAACAGGCCATCGCGGGACGACAGCAGGATAACCGGGGTGTCCTTGAAGGCACTGTTGTGCTTGATTACCGCGCAGGTCTGGTAGCCGTCCAGGCGTGGCATCAGc < 1:908061/127‑1 (MQ=255) caccCG‑CCCGCG‑‑GGCCTTGTCGAACAGGCCATCGCGGGACGACAGCAGGATAACCGGGGTGTCCTTGAAGGCACTGTTGTGCTTGATTACCGCGCAGGTCTGGTAGCCGTCCAGGCGTGGCATCAGc > 2:908061/1‑127 (MQ=255) accCG‑CCCGCG‑‑GGCCTTGTCGAACAGGCCATcgcgggcgggtggtcggttccgatcagttcctgaccaagccgttcagcaaggaagaactgctcgacgcgatccgcgcccatgtgcccgggtttgccgcacctcaacaacacgcaccctg < 1:271371‑M2/150‑120 (MQ=255) cccg‑cccgCG‑‑GGCCTTGTCGAACAGGCCATcgcgggcgggtggtcggttccgatcagttcctgaccaagccgttcagcaaggaagaactgctcgacgcgatccgcgcccatgtgcccgggtttgccgcacctcaacaacacgcaccct < 2:406560‑M2/148‑119 (MQ=255) cccg‑cccgCG‑‑GGCCTTGTCGAACAGGCCATcgcgggcgggtggtcggttccgatcagttcctgaccaagccgttcagcaaggaagaactgctcgacgcgatccgcgcccatgtgcccgggtttgccgcacctcaacaacacgcaccct > 1:406560‑M2/1‑30 (MQ=255) cg‑cccgcG‑‑GGCCTTGTCGAACAGGCCATCGCGGGACGACAGCAGGATAACCGGGGTGTCCTTGAAGGCACTGTTGTGCTTGATTACCGCGCAGGTCTGGTAGCCGTCCAGGCGTGGCATCAGCACATCGACGAAAATGATACTGGGCTGa > 2:1505708/1‑150 (MQ=255) ccgcGatggcctgttcgacaaggcccgcgggcgggtggtcggttccgatcagttcctgaccaagccgttcagcaaggaagaactgctcgacgcgatccgcgcccatgtgcccgggtttgccgcacctcaacaacacgcaccctgaccgag > 1:1225986‑M1/1‑5 (MQ=255) gcg‑‑GGCCTTGTCGAACAGGCCATCGCGGGACGACAGCAGGATAACCGGGGTGTCCTTGAAGGCACTGTTGTGCTTGATTACCGCGCAGGTCTGGTAGCCGTCCAGGCGTGGCATCAGCACATCGACGAAAATGATACTGGGCTGATGGTc < 1:339299/150‑1 (MQ=255) gcg‑‑GGCCTTGTCGAACAGGCCATAGCGTGACGACAGCAGGATAACCGGGGTGTCCTTGAAGGCACTGTTGTGCTTGATTACCGCGCAGGTCTGGTAGCCGTCGAGGCGTGGCATCAGCACATCGACGAAAATGATACTGGGCTGATGGTc < 2:88376/150‑1 (MQ=255) | AAGTAGGACCGCGCCATGGCGGGGCTCGGTCAGGGTGCGTGTTGTTGAGGTGCGGCAAACCCGGGCACATGGGCGCGGATCGCGTCGAGCAGTTCTTCCTTGCTGAACGGCTTGGTCAGGAACTGATCGGAACCGACCACCCG‑CCCGCG‑‑GGCCTTGTCGAACAGGCCATCGCGGGACGACAGCAGGATAACCGGGGTGTCCTTGAAGGCACTGTTGTGCTTGATTACCGCGCAGGTCTGGTAGCCGTCCAGGCGTGGCATCAGCACATCGACGAAAATGATACTGGGCTGATGGTC > NC_002947/5689968‑5690263 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |