| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 6002402 = | 109 (1.820) | 8 (0.150) | 6/208 | NT | 9.4% | intergenic (‑46/+100) | amaA/amaB | L‑pipecolate oxidase/L‑piperidine‑6‑carboxylate dehydrogenase |
| ? | NC_002947 | 6002454 = | 60 (1.160) | intergenic (‑98/+48) | amaA/amaB | L‑pipecolate oxidase/L‑piperidine‑6‑carboxylate dehydrogenase | |||||
Only 100 of 129 total aligned reads displayed.
CATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAG‑GGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGCCATGCAGCATCAATACATCAGTCGAACACGATACCCTGCGCCAGCGGCAGCTCGCGCGAGTAGTTCA > NC_002947/6002254‑6002551 | cATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAG‑GGCGGCCCTTTCGCGGGTAAAc < 1:1317409/150‑1 (MQ=255) gtcgggctcggatgcctggaaaggctacatgcgtcgccagaccaacaccgtgaactactcgcgcgagctgccgctggcgcagggtatcgtgttcgactgatgtattgatgctgcatggccgggggcctggcccccggttcgcgggtagAc > 2:1474913‑M1/149‑150 (MQ=255) gtcgggctcggatgcctggaaaggctacatgcgtcgccagaccaacaccgtgaactactcgcgcgagctgccgctggcgcagggtatcgtgttcgactgatgtattgatgctgcatggccgggggcctggcccccggttcgcgggtagAc < 2:1553391‑M1/2‑1 (MQ=255) ggCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTT‑GGGCTGGAGCGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGc < 1:41872/150‑1 (MQ=255) tgcctggaaaggctacatgcgtcgccagaccaacaccgtgaactactcgcgcgagctgccgctggcgcagggtatcgtgttcgactgatgtattgatgctgcatggccgggggcctggcccccggttcgcgggtagACCCGCTCCTACAg > 2:1191394‑M1/137‑150 (MQ=255) tCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAG‑GGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAggg > 2:460197/1‑150 (MQ=255) aCCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAG‑GGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGt > 2:1238708/1‑150 (MQ=255) aCCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAG‑GGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGt < 1:247125/150‑1 (MQ=255) aCCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAG‑GGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGt > 1:1525409/1‑150 (MQ=255) cGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAG‑GGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAg < 2:187778/144‑1 (MQ=255) cGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAG‑GGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAg > 1:187778/1‑144 (MQ=255) cGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAG‑GGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCg > 1:1255733/1‑150 (MQ=255) gCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAG‑GGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGgt < 1:1630589/150‑1 (MQ=255) ccAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAG‑GGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGgtg < 2:1255733/150‑1 (MQ=255) ccAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAG‑GGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGgtg < 1:939511/150‑1 (MQ=255) aGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAG‑GGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTc < 2:190729/150‑1 (MQ=255) ggCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAG‑GGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGc > 2:1127358/1‑150 (MQ=255) gCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAG‑GGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCt < 2:261240/150‑1 (MQ=255) ccTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAG‑GGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCtt < 1:1493532/150‑1 (MQ=255) ccTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAG‑GGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCtt < 1:349588/150‑1 (MQ=255) cTGGGAGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAG‑GGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTg > 1:427000/1‑150 (MQ=255) ggcggcGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAG‑GGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGAc < 1:91967/150‑1 (MQ=255) aCGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAG‑GGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCt < 1:901090/150‑1 (MQ=255) cggtcggtTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAG‑GGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTg < 1:1238708/150‑1 (MQ=255) tcggtTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAG‑GGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAgg > 1:1080395/1‑121 (MQ=255) tcggtTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAG‑GGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAgg < 2:1080395/121‑1 (MQ=255) caacaccgtgaactactcgcgcgagctgccgctggcgcagggtatcgtgttcgactgatgtattgatgctgcatggccgggggcctggcccccggttcgcgggtaaACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAg > 2:520399‑M1/107‑150 (MQ=255) tGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAG‑GGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCgg < 2:774416/150‑1 (MQ=255) gCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAG‑GGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCggg < 1:733453/150‑1 (MQ=255) tgaactactcgcgcgagctgccgctggcgcagggtatcgtgttcgactgatgtattgatgctgcatggccgggggcctggcccccggttcgcgggtagACCCGCTCCTACAg > 2:509806‑M1/99‑112 (MQ=255) tgaactactcgcgcgagctgccgctggcgcagggtatcgtgttcgactgatgtattgatgctgcatggccgggggcctggcccccggttcgcgggtagACCCGCTCCTACAg < 1:509806‑M1/14‑1 (MQ=255) aCGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAG‑GGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTa > 1:1472910/1‑150 (MQ=255) gtgtTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAG‑GGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGc < 1:886054/120‑1 (MQ=255) gtgtTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAG‑GGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGc > 2:886054/1‑120 (MQ=255) tgtTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAG‑GGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTAccc > 1:813293/1‑150 (MQ=255) tcgcgcgagctgccgctggcgcagggtatcgtgttcgactgatgtattgatgctgcatggccgggggcctggcccccggttcgcgggtagACCCGCTCCTACAggg < 1:716141‑M1/16‑1 (MQ=255) tcgcgcgagctgccgctggcgcagggtatcgtgttcgactgatgtattgatgctgcatggccgggggcctggcccccggttcgcgggtagACCCGCTCCTACAggg > 2:716141‑M1/91‑106 (MQ=255) ccACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAG‑GGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTc < 1:1243611/112‑1 (MQ=255) ccACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAG‑GGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTc > 2:1243611/1‑112 (MQ=255) cacaAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAG‑GGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTg > 2:1639500/1‑127 (MQ=255) cacaAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAG‑GGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTg < 1:1639500/127‑1 (MQ=255) cacaAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAG‑GGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAAc > 1:569880/1‑150 (MQ=255) acaAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAG‑GGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAAcc > 2:1529592/1‑150 (MQ=255) acaAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTACAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAG‑GGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAAcc < 1:996547/150‑1 (MQ=255) aGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAG‑GGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCggg < 1:1529592/150‑1 (MQ=255) gCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAG‑GGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCgggg < 2:813293/150‑1 (MQ=255) tgccgctggcgcagggtatcgtgttcgactgatgtattgatgctgcatggccgggggcctggcccccggttcgcgggtagACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTa > 2:753335‑M1/81‑123 (MQ=255) aCGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAG‑GGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCg < 1:67270/92‑1 (MQ=255) aCGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAG‑GGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCg > 2:67270/1‑92 (MQ=255) aCGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAG‑GGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGAccc > 2:915503/1‑150 (MQ=255) ttCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAG‑GGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTg < 2:1308851/96‑1 (MQ=255) ttCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAG‑GGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTg > 1:1308851/1‑96 (MQ=255) ttCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAG‑GGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGcc > 1:993247/1‑150 (MQ=255) ggtatcgtgttcgactgatgtattgatgctgcatggccgggggcctggcccccggttcgcgggtagACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGATGAACCCTGTAg < 1:1270003‑M1/44‑1 (MQ=255) ggACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAG‑GGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGCCATg > 1:833036/1‑150 (MQ=255) gACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAG‑GGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCTGGCCCCCggttcgcg < 2:569880/150‑7 (MQ=255) gACATGGCCGGCTACATCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAG‑GGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCggttcgcg > 1:470659/1‑144 (MQ=255) aCATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAG‑GGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGCCATgca < 1:1009078/150‑1 (MQ=255) 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ttgttgGGGCCGCAG‑GGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGCCATGCAGCATCAATACATCAGTCGAACACGAt < 1:1127358/150‑1 (MQ=255) ttgttgGGGCCGCAG‑GGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGCCATGCAGCATCAATACATCAGTCGAACACGAt > 2:74282/1‑150 (MQ=255) ttgttgGGGCCGCAG‑GGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGCCATGCAGCATCAATACATCAGTCGAACACGAt > 1:1199120/1‑150 (MQ=255) ggggCCGCAG‑GGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGCCATGCAGCATCAATACATCAGTCGAACACGATACCCt < 1:1459934/150‑1 (MQ=255) ggCCGCAG‑GGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGCCATGCAGCATCAATACATCAGTCGAACACGATACCCTgc < 2:1525409/150‑1 (MQ=255) ggCCGCAG‑GGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGCCATGCAGCATCAATACATCAGTCGAACACGATACCCTgc < 2:1472910/150‑1 (MQ=255) gCCGCAG‑GGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGa < 1:717064/73‑1 (MQ=255) gCCGCAG‑GGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGCCATGCAGCATCAAt > 1:1122054/1‑124 (MQ=255) gCCGCAG‑GGCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGCCATGCAGCATCAAt < 2:1122054/124‑1 (MQ=255) gCAG‑GGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGCCATGCAGCATCAATACATCAGTCGAACACGATACCCTGCGCCa > 1:753020/1‑150 (MQ=255) cAG‑GGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGCCATGCAGCATCAATACATCAGTCGAACACGATACCCTGCGCCAg < 2:993247/150‑1 (MQ=255) cAG‑GGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGCCATGCAGCATCAATACATCAGTCGAACACGATACCCTGCGCCAg > 1:281317/1‑150 (MQ=255) gcCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCggggg < 2:1496946/86‑1 (MQ=255) gcCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCggggg > 1:1496946/1‑86 (MQ=255) gcCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGCCa > 2:317693/1‑101 (MQ=255) gcCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGCCa < 1:317693/101‑1 (MQ=255) gcCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGCCATGCAGCATCAATACATCAGTCGAACACGATACCCTGCGCCAGCGGCAGc < 2:753020/150‑1 (MQ=255) cccTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGCCATGCAGCATCAATACATCAGTCGAACACGATACCCTGCGCCAGCGGCAGCt > 1:381882/1‑150 (MQ=255) tttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGCCATGCAGCATCaa > 2:659781/1‑108 (MQ=255) tttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGCCATGCAGCATCaa < 1:659781/108‑1 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGCCATGCAGCATCAATACATCAGTCGAACACGATACCCTGCGCCAGCGGCAGCTCGCGCGagt < 1:460197/150‑1 (MQ=255) ACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGCCATGCAGCATCAATACATCAGTCGAACACGATACCCTGCGCCAGCGGCAGCTCGCGCGAGTAGTTCa < 2:1240548‑M1/150‑1 (MQ=255) ACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGCCATGCAGCATCAATACATCAGTCGAACACGATACCCTGCGCCAGCGGCAGCTCGCGCGAGTAGTTCa > 1:74282‑M1/1‑150 (MQ=255) | CATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAG‑GGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGCCATGCAGCATCAATACATCAGTCGAACACGATACCCTGCGCCAGCGGCAGCTCGCGCGAGTAGTTCA > NC_002947/6002254‑6002551 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |