New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 830700 | 60 (1.000) | 5 (0.090) | 5/224 | NT | 8.1% | coding (1072/1098 nt) | PP_0714 | PerM family transporter |
? | NC_002947 | = 830705 | 57 (1.020) | coding (1077/1098 nt) | PP_0714 | PerM family transporter |
TGATGTACCGATGCCGGTGGTACTGATCGGGGCATTAGGTGGCATGGTGGTCAAAGGCATCATCGGCTTGTTTATCGGCCCGGTAATCCTCGGCGTGACGTACGTGCTGTTCTGGCAATGGGTTGCGCTGCAGGTGCCGGA‑GCAACCGGCACCCCCTGCCGCCTGAGCCATGCCCAACCGCTG‑‑CTATGGCCTGGGGCTGCTGATGGTGCTGGCCGGTTGCACTCAGGTTGGTCCGGATTTCGAGAAGCCCCAAGCGCCGTGGCTGGACGGTTGGAGCACGCCCATGATCGAGCA > NC_002947/830561‑830854 | tGATGTACCGATGCCGGTGGTACTGATCGGGGCATTAGGTGGCATGGTGGTCAAAGGCATCATCGGCTTGTTTATCGGCCCGGTAATCCTCGGCGTGACGTACGTGCTGTTCTGGCAATGGGTTGCGCTGCAGGTGCCGGA‑GCAAccggc > 1:1079782‑M2/1‑145 (MQ=255) tGTACCGATGCCGGTGGTACTGATCGGGGCATTAGGTGGCATGGTGGTCAAAGGCATCATCGGCTTGTTTATCGGCCCGGTAATCCTCGGCGTGACGTACCTGGTGTTCTGCCAGTGCCAGGCTTTGCAGGTTCCGGG‑GCAAccggcacc < 2:429188‑M2/150‑9 (MQ=255) tACCGATGCCGGTGGTACTGATCGGGGCATTAGGTGGCATGGTGGTCAAAGGCATCATCGGCTTGTTTATCGGCCCGGTAATCCTCGGCGTGACGTACGTGCTGTTCTGGCAATGGGTTGCGCTGCAGGTGCCGGA‑GCAACCGGCAcccc > 2:849239/1‑150 (MQ=255) aCCGATGCCGGTGGTACTGATCGGGGCATTAGGTGGCATGGTGGTCAAAGGCATCATCGGCTTGTTTATCGGCCCGGTAATCCTCGGCGTGACGTACGTGCTGTTCTGGCAATGGGTTGCGCTGCAGGTGCCGGA‑GCAACCGGCAccccc > 2:542696/1‑150 (MQ=255) ccGATGCCGGTGGTACTGATCGGGGCATTAGGTGGCATGGTGGTCAAAGGCATCATCGGCTTGTTTATCGGCCCGGTAATCCTCGGCGTGACGTACGTGCTGTTCTGGCAATGGGTTGCGCTGCAGGTGCCGGA‑GCAACCGGCACCCCCt > 1:478464/1‑150 (MQ=255) cGGTGGTACTGATCGGGGCATTAGGTGGCATGGTGGTCAAAGGCATCATCGGCTTGTTTATCGGCCCGGTAATCCTCGGCGTGACGTACGTGCTGTTCTGGCAATGGGTTGCGCTGCAGGTGCCGGA‑GCAAccgg < 2:1474962‑M2/135‑5 (MQ=255) cGGTGGTACTGATCGGGGCATTAGGTGGCATGGTGGTCAAAGGCATCATCGGCTTGTTTATCGGCCCGGTAATCCTCGGCGTGACGTACGTGCTGTTCTGGCAATGGGTTGCGCTGCAGGTGCCGGA‑GCAAccgg > 1:1474962‑M2/1‑131 (MQ=255) tggtACTGATCGGGGCATTAGGTGGCATGGTGGTCAAAGGCATCATCGGCTTGTTTATCGGCCCGGTAATCCTCGGCGTGACGTACGTGCTGTTCTGGCAATGGGTTGCGCTGCAGGTGCCGGA‑GCAACCGGCACCCCCTGCCGCCTGAg < 2:989912/150‑1 (MQ=255) aCTGATCGGGGCATTAGGTGGCATGGTGGTCAAAGGCATCATCGGCTTGTTTATCGGCCCGGTAATCCTCGGCGTGACGTACGTGCTGTTCTGGCAATGGGTTGCGCTGCAGGTGCCGGA‑GCAACCGGCACCCCCTGCCGCCTGAGCCAt > 1:80247/1‑150 (MQ=255) tGATCGGGGCATTAGGTGGCATGGTGGTCAAAGGCATCATCGGCTTGTTTATCGGCCCGGTAATCCTCGGCGTGACGTACGTGCTGTTCTGGCAATGGGTTGCGCTGCAGGTGCCGGA‑GCAACCGGCACCCCCTGCCGCCTGAGCCATGc < 1:127678/150‑1 (MQ=255) tGATCGGGGCATTAGGTGGCATGGTGGTCAAAGGCATCATCGGCTTGTTTATCGGCCCGGTAATCCTCGGCGTGACGTACGTGCTGTTCTGGCAATGGGTTGCGCTGCAGGTGCCGGA‑GCAACCGGCACCCCCTGCCGCCTGAGCCATGc < 2:804050/150‑1 (MQ=255) ggggCATTAGGTGGCATGGTGGTCAAAGGCATCATCGGCTTGTTTATCGGCCCGGTAATCCTCGGCGTGACGTACGTGCTGTTCTGGCAATGGGTTGCGCTGCAGGTGCCGGA‑GCAACCGGCACCCCCTGCCGCCTGAGCCATGCCCAAc < 2:1474440/150‑1 (MQ=255) gggCATTAGGTGACATGGTGGTCAAAACATTCATCGGCTTGTTTATCGGCCCGGTAATCCTCGGCGTGACGTACGTGCTGTTCTGGCAATGGGTTGCGCTGCAGGTGCCGGA‑GCAACCGGCACCCCCTGCCGCCTGAGCCATGCCCAAcc > 1:863147/1‑150 (MQ=255) ggCATTAGGTGGCATGGTGGTCAAAGGCATCATCGGCTTGTTTATCGGCCCGGTAAGCCTCGGCGTGACGTACGTGCTGTTCTGGCAATGGGTTGCGCTGCAGGTGCCGGA‑GCAACCGGCACCCCCTGCCGCCTGAGCCATGCCCAACCg > 2:1061284/1‑150 (MQ=255) gCATTAGGTGGCATGGTGGTCAAAGGCATCATCGGCTTGTTTATCGGCCCGGTAATCCTCGGCGTGACGTACGTGCTGTTCTGGCAATGGGTTGCGCTGCAGGTGCCGGA‑GCAACCGGCACCCCCTGCCGCCTGAGCCATGCCCAACCgc > 2:822414/1‑150 (MQ=255) cATTAGGTGGCATGGTGGTCAAAGGCATCATCGGCTTGTTTATCGGCCCGGTAATCCTCGGCGTGACGTACGTGCTGTTCTGGCAATGGGTTGCGCTGCAGGTGCCGGA‑GCAACCGGCACCCCCTGCCGCCTGAGCCATGCCCAACCgct > 1:777594/1‑150 (MQ=255) aTTAGGTGGCATGGTGGTCAAAGGCATCATCGGCTTGTTTATCGGCCCGGTAATCCTCGGCGTGACGTACGTGCTGTTCTGGCAATGGGTTGCGCTGCAGGTGCCGGA‑GCAACCGGCACCCCCTGCCGCCTGAGCCATGCCCAACCgctg > 1:1302392/1‑150 (MQ=255) aTGGTGGTCAAAGGCATCATCGGCTTGTTTATCGGCCCGGTAATCCTCGGCGTGACGTACGTGCTGTTCTGGCAATGGGTTGCGCTGCAGGTGCCGGA‑GCAACCGGCACCCCCTGCCGCCTGAGCCATGCCCAACCgct > 2:871607/1‑139 (MQ=255) aTGGTGGTCAAAGGCATCATCGGCTTGTTTATCGGCCCGGTAATCCTCGGCGTGACGTACGTGCTGTTCTGGCAATGGGTTGCGCTGCAGGTGCCGGA‑GCAACCGGCACCCCCTGCCGCCTGAGCCATGCCCAACCgct < 1:871607/139‑1 (MQ=255) aTGGTGGTCAAAGGCATCATCGGCTTGTTTATCGGCCCGGTAATCCTCGGCGTGACGGACGTGCTGTTCTGGCAATGGGTTGCGCTGCAGGTGCCGGA‑GCAACCGGCACCCCCTGCCGCCTGAGCCATGCCCAACCGCTG‑‑CTATGGCCTg < 2:863147/150‑1 (MQ=255) ggtggtCAAAGGCATCATCGGCTTGTTTATCGGCCCGGTAATCCTCGGCGTGACGTACGTGCTGTTCTGGCAATGGGTTGCGCTGCAGGTGCCGGA‑GCAACCGGCACCCCCTGCCGCCTGAGCCATGCCCAACCGCTG‑‑CTATGGCCTggg < 1:1061284/150‑1 (MQ=255) tCAAAGGCATCATCGGCTTGTTTATCGGCCCGGTAATCCTCGGCGTGACGTACGTGCTGTTCTGGCAATGGGTTGCGCTGCAGGTGCCGGA‑GCAACCGGCACCCCCTGCCGCCTGAGCCATGCCCAACCGCTG‑‑CTATg < 2:1535160/138‑1 (MQ=255) tCAAAGGCATCATCGGCTTGTTTATCGGCCCGGTAATCCTCGGCGTGACGTACGTGCTGTTCTGGCAATGGGTTGCGCTGCAGGTGCCGGA‑GCAACCGGCACCCCCTGCCGCCTGAGCCATGCCCAACCGCTG‑‑CTATg > 1:1535160/1‑138 (MQ=255) ggCATCATCGGCTTGTTTATCGGCCCGGTAATCCTCGGCGGGACGTACGTGCTGTTCTGGCAATGGGTTGCGCTGCAGGTGCCGGA‑GCAACCGGCACCCCCTGCCGCCTGAGCCATGCCCAACCGCTG‑‑CTATGGCCTGGGGCTGCTGATg < 1:429188/150‑1 (MQ=255) atcatcGGCTTGTTTATCGGCCCGGTAATCCTCGGCGTGACGTACGTGCTGTTCTGGCAATGGGTTGCGCTGCAGGTGCCGGA‑GCAACCGGCACCCCCTGCCGCCTGAGCCATGCCCAACCGCTG‑‑CTATGGCCTGGGGCTGCTGCTGGTg > 2:621715/1‑150 (MQ=255) catcGGCTTGTTTATCGGCCCGGTAATCCTCGGCGTGACGTACGTGCTGTTCTGGCAATTGGGTGCGCTGCAGGTGCCGGA‑GCAACCGGCACCCCCTGCCGCCTGAGCCATGCCCAACCGCTG‑‑CTATGGCCTGGGGCTGCTGATGGTGCt < 1:1187143/150‑1 (MQ=255) catcGGCTTGTTTATCGGCCCGGTAATCCTCGGCGTGACGTACGTGCTGTTCTGGCAATGGGTTGCGCTGCAGGTGCCGGA‑GCAACCGGCACCCCCTGCCGCCTGAGCCATGCCCAACCGCTG‑‑CTATGGCCTGGGGCTGCTGATGGTGCt < 1:822414/150‑1 (MQ=255) cGGCTTGTTTATCGGCCCGGTAATCCTCGGCGTGACGTACGTGCTGTTCTGGCAATGGGTTGCGCTGCAGGTGCCGGA‑GCAACCGGCCCAACCTGCCGCCTGAGCCATGCCCAACCGCTG‑‑CTATGGCCTGGGGCTGCTGATGGTGCTGGc < 2:1378928/150‑1 (MQ=255) gCTTGTTTATCGGCCCGGTAATCCTCGGCGTGACGTACGTGCTGTTCTGGCAATGGGTTGCGCTGCAGGTGCCGGTTGCTcggcacctgcagc > 1:1527230‑M2/1‑81 (MQ=255) gCTTGTTTATCGGCCCGGTAATCCTCGGCGTGACGTACGTGCTGTTCTGGCAATGGGTTGCGCTGCAGGTGCCGGA‑GCAACCGGCACCCCCTGCCGCCTGAGCCATGCCCAACCGCTG‑‑CTATGGCCTGGGGCTGCTGATGGTGCTGGCCg > 1:1351907/1‑150 (MQ=255) gCTTGTTTATCGGCCCGGTAATCCTCGGCGTGACGTACGTGCTGTTCTGGCAATGGGTTGCGCTGCAGGTGCCGGA‑GCAACCGGCACCCCCTGCCGCCTGAGCCATGCCCAACCGCTG‑‑CTATGGCCTGGGGCTGCTGATGGTGCTGGCCg < 2:777594/150‑1 (MQ=255) tttATCGGCCCGGTAATCCTCGGCGTGACGTACGTGCTGTTCTGGCAATGGGTTGCGCTGCAGGTGCCGGA‑GCAACCGGCACCCCCTGCCGCCTGAGCCATGCCCAACCGCTG‑‑CTATGGCCTGGGGCTGCTGATGGTGCTGGCCGGTTGc > 1:838563/1‑150 (MQ=255) tCGGCCCGGTAATCCTCGGCGTGACGTACGTGCTGTTCTGGCAATGGGTTGCGCTGCAGGTGCCGGA‑GCAACCGGCACCCCCTGCCGCCTGAGCCATGCCCAACCGCTG‑‑CTATGGCCTGGGGCTGCTGATGGTGCTGGCCGGTTGCACTc < 2:478464/150‑1 (MQ=255) ggCCCGGTAATCCTCGGCGTGACGTACGTGCTGTTCTGGCAATGGGTTGCGCTGCAGGTGCCGGA‑GCAACCGGCACCCCCTGCCGCCTGAGCCATGCCCAACCGCTG‑‑CTATGGCCTGGGGTTGGTGATGGTGCTGGCCGGTTGCACTCAg < 1:863071/150‑1 (MQ=255) ggCCCGGTAATCCTCGGCGTGACGTACGTGCTGTTCTGGCAATGGGTTGCGCTGCAGGTGCCGGA‑GCAACCGGCACCCCCTGCCGCCTGAGCCATAAGAGACCGGGT‑‑CTATGGCCTGGGGCTGCTGATGGTGCTGGCCGGTTGCACTCAg > 2:863071/1‑150 (MQ=255) gCCCGGTAATCCTCGGCGTGACGTACGTGCTGTTCTGGCAATGGGTTGCGCTGCAGGTGCCGGA‑GCAACCGGCACCCCCTGCCGCCTGAGCCATGCCCAACCGCTG‑‑CTATGGCCTGGGGCTGCTGATGGTGCTGGCCGGTTGCACTCAgg > 1:1629364/1‑150 (MQ=255) cGGTAATCCTCGGCGTGACGTACGTGCTGTTCTGGCAATGGGTTGCGCTGCAGGTGCCGGA‑GCAACCGGCACCCCCTGCCGCCTGAGCCATGCCCAACCGCTG‑‑CTATGGCCTGGGGCTGCTGATGGTGCTGGCCGGTTGCACTCAGGTTg < 2:838563/150‑1 (MQ=255) tAATCCTCGGCGTGACGTACGTGCTGTTCTGGCAATGGGTTGCGCTGCAGGTGCCGGA‑GCAACCGGCACCCCCTGCCGCACGAG‑‑AAGTGCAGGCGTTGATCTAGAGCCGGGTGCGGCTGATGGTGCTGGCCGGTTGCGCTCAgcatgggt > 1:1426994/1‑143 (MQ=255) aaTCCTCGGCGTGACGTACGTGCTGTTCTGGCAATGGGTTGCGCTGCAGGTGCCGGA‑GCAACCGGCACCCCCTGCCGCCTGAGCCATGCCCAACCGCTG‑‑CTATGGCCTGGGGCTGATGATGGTGCTGGCCGGTTGCACTCATGTTGGTcc > 2:326257/1‑150 (MQ=255) cGGCGTGACGTACGTGCTGTTCTGGCAATGGGTTGCGCTGCAGGTGCCGGA‑GCAACCGGCACCCCCTAACGCGTTAGCTATTCCCAACCGCTG‑‑CTATGGCCTGGGGCTGCTGATGGTGCTGGCCGGTTGCACTCAGGTTGGTCCGGAttt < 2:545422/150‑1 (MQ=255) gCGTGACGTACGTGCTGTTCTGGCAATGGGTTGCGCTGCAGGTGCCGGA‑GCAACCGGCACCCCCTGCCGCCTGAGCCATGCCCAACCGCTG‑‑CTATGGCCt < 2:79076/100‑1 (MQ=255) gCGTGACGTACGTGCTGTTCTGGCAATGGGTTGCGCTGCAGGTGCCGGA‑GCAACCGGCACCCCCTGCCGCCTGAGCCATGCCCAACCGCTG‑‑CTATGGCCt > 1:79076/1‑100 (MQ=255) cGTGACGTACGTGCTGTTCTGGCAATGGGTTGCGCTGCAGGTGCCGGA‑GCAACCGGCACCCCCTGCCGCCTGAGCCATGCCCAACCGCTG‑‑CTATGGCCTGGGGCTGCTGATGGTGCTGGCCGGTTGCACTCAGGTTGGTCCGGATTTCga < 2:728687/150‑1 (MQ=255) gACGTACGTGCTGTTCTGGCAATGGGTTGCGCTGCAGGTGCCGGA‑GCAACCGGCACCCCCTGCCGCCTGAGCCATGCCCAACCGCTG‑‑CTATGGCCTGGGGCTGCTGATGGTGCTGGCCGGTTGCACTCAGGTTGGTCCGGATTTCGAGaa < 1:542696/150‑1 (MQ=255) gtGCTGTTCTGGCAATGGGTTGCGCTGCAGGTGCCGGA‑GCAACCGGCACCCCCTGCCGCCTGAGCCATGCCCAACCGCTG‑‑CTATGGCCTGGGGCTGCTGATGGTGCTGGCCGGTTGCACTCAGGTTGGTCCGGATTTCGAGAAGCCCCaa < 1:318855/150‑1 (MQ=255) tGCTGTTCTGGCAATGGGTTGCGCTGCAGGTGCCGGA‑GCAACCGGCACCCCCTGCCGCCTGAGCCATGCCCAACCGCTG‑‑CTATGGCCTGGGGCTGCTGATGGTGCTGGCCGGTTGCACTCAg < 1:179987/122‑1 (MQ=255) tGCTGTTCTGGCAATGGGTTGCGCTGCAGGTGCCGGA‑GCAACCGGCACCCCCTGCCGCCTGAGCCATGCCCAACCGCTG‑‑CTATGGCCTGGGGCTGCTGATGGTGCTGGCCGGTTGCACTCAg > 2:179987/1‑122 (MQ=255) tGCTGTTCTGGCAATGGGTTGCGCTGCAGGTGCCGGA‑GCAACCGGCACCCCCTGCCGCCTGAGCCATGCCCAACCGCTG‑‑CTATGGCCTGGGGCTGCTGATGGTGCTGGCCGGTTGCACTCAGGTTGGTCCGGATTTCGAGAAGCCCCAAg > 1:1619184/1‑150 (MQ=255) tCTGGCAATGGGTTGCGCTGCAGGTGCCGGA‑GCAACCGGCACCCCCTGCCGCCTGAGCCATGCCCAACCGCTG‑‑CTATGGCCTGGGGCTGCTGATGGTGCTGGCCGGTTGCACTCAGGTTGGTCCGGATTTCGAGAAGCCCCAAGCGCCGt < 2:1351907/150‑1 (MQ=255) tGGCAATGGGTTGCGCTGCAGGTGCCGGA‑GCAACCGGCACCCCCTGCCGCCTGAGCCATGCCCAACCGCTG‑‑CTATGGCCTGGGGCTGCTGATg < 1:659689/93‑1 (MQ=255) tGGCAATGGGTTGCGCTGCAGGTGCCGGA‑GCAACCGGCACCCCCTGCCGCCTGAGCCATGCCCAACCGCTG‑‑CTATGGCCTGGGGCTGCTGATg > 2:659689/1‑93 (MQ=255) ggCAATGGGTTGCGCTGCAGGTGCCGGA‑GCAACCGGCACCCCCTGCCGCCTGAGCCATGCCCAACCGCTG‑‑CTATGGCCTGGGGCTGCTGATGGTGCTGGCCGGTTGCACTCAGGTTGGTCCGGATTTCGAGAAGCCCCAAGCGCCGTGGc > 1:747269/1‑150 (MQ=255) gCAATGGGTTGCGCTGCAGGTGCCGGA‑GCAACCGGCACCCCCTGCCGCCTGAGCCa > 2:1600469/1‑56 (MQ=255) gCAATGGGTTGCGCTGCAGGTGCCGGA‑GCAACCGGCACCCCCTGCCGCCTGAGCCa < 1:1600469/56‑1 (MQ=255) cAATGGGTTGCGCTGCAGGTGCCGGA‑GCAACCGGCACCCCCTGCCGCCTGAGCCATGCCCAACCGCTG‑‑CTATGGCCTggg > 2:1365547/1‑80 (MQ=255) cAATGGGTTGCGCTGCAGGTGCCGGA‑GCAACCGGCACCCCCTGCCGCCTGAGCCATGCCCAACCGCTG‑‑CTATGGCCTggg < 1:1365547/80‑1 (MQ=255) cAATGGGTTGCGCTGCAGGTGCCGGA‑GCAACCGGCACCCCCTGCCGCCTGAGCCATGCCCAACCGCTG‑‑CTATGGCCTGGGGCTGCTGATGGTGCTGGCCGGTTGCACTCAGGTTGGTCCGGATTTCGAGAAGCCCCAAGCGCCGTGGCTg > 2:733522/1‑150 (MQ=255) cgcTGCAGGTGCCGGA‑GCAACCGGCACCCCCTGCCGCCTGAGCCATGCCCAACCGCTG‑‑CTATGGCCTGGGGCTGCTGATGGTGCTGGCCGGTTGCACTCAGGTTGGTCCGGATTTCGAGAAGCCCCAAGCGCCGTGGCGGTACGGTTGGa < 2:1302392/150‑1 (MQ=255) gcTGCAGGTGCCGGA‑GCAAccggcacctgcagcgcaacccattgccagaacagcacgtacgtcacgccgaggattaccgggccgataaacaagc > 2:1527230‑M2/1‑19 (MQ=255) gcTGCAGGTGCCGGA‑GCAACCGGCACCCCCTGCCGCCTGAGCCATGCCCAAc < 2:1489925/52‑1 (MQ=255) gcTGCAGGTGCCGGA‑GCAACCGGCACCCCCTGCCGCCTGAGCCATGCCCAAc > 1:1489925/1‑52 (MQ=255) cTGCAGGTGCCGGC‑GCGACAGGCACCCCCTGCCGCCTGAGCCATGCCCAACCGCTG‑‑CTATGGCCTGGGGCTGCTGATGGTGCTGGCCGGTTGCACTCAGGTTGGTCCGGATTTCGAGAAGCCCCAAGCGCCGTGGCTGGACGGTTGGAGc > 2:1222232/1‑150 (MQ=255) cTGCAGGTGCCGGA‑GCAAccggcacctgcagcgcaacccattgccagaacagcacgtac < 2:657881‑M2/59‑42 (MQ=255) cTGCAGGTGCCGGA‑GCAAccggcacctgcagcgcaacccattgccagaacagcacgtac > 1:657881‑M2/1‑18 (MQ=255) tGCAGGTGCCGGA‑GCAACCGGCACCCCCTGCCGCCTGAGCCATGCCCAACCGCTG‑‑CTATGGCCTGGGGCTGCTGATGGTGCTGGCCGGTTGCACTCAGGTTGGTCCGGATTTCGAGAAGCCCCAAGCGCCGTGGCTGGACGGTTGGAGCa > 1:1640784/1‑150 (MQ=255) gTGCCGGA‑GCAAccggcacctgcagcgcaacccattgccagaacagcacgtacgtcacgcctaggattaccgggccgataaacaagccgatgatgcctttgaccaccatgccacctaatgccccgatcagtaccaccggcatcggtacat < 2:1368569‑M2/150‑139 (MQ=255) tGCCGGA‑GCAACCGGCACCCCCTGCCGCCTGAGCCATGCCCAACCGCTG‑‑CTATGGCCTGGGGCTGCTGATGGTGCTGGCCGGTTGCa < 2:776197/87‑1 (MQ=255) tGCCGGA‑GCAACCGGCACCCCCTGCCGCCTGAGCCATGCCCAACCGCTG‑‑CTATGGCCTGGGGCTGCTGATGGTGCTGGCCGGTTGCa > 1:776197/1‑87 (MQ=255) tGCCGGA‑GCAACCGGCACCCCCTGCCGCCTGAGCCATGCCCAACCGCTG‑‑CTATGGCCTGGGGCTGCTGATGGTGCTGGCCGGTTGCACTCAGGTTGGTCCGGATTTCGAGAAGCCCCAAGCGCCGTGGCTGGACGGTTGGAGCACGCCCa < 1:733522/150‑1 (MQ=255) aCCGGCACCCCCTGCCGCCTGAGCCATGCCCAACCGCTG‑‑CTATGGCCTGGGGCTGCTGATGGTGCTGGCCGGTTGCACTCAGGTTGGTCCGGATTTCGAGAAGCCCCAAGCGCCGTGGCTGGACGGTTGGAGCACGCCCATGATCGAgca > 1:1506971/1‑150 (MQ=255) | TGATGTACCGATGCCGGTGGTACTGATCGGGGCATTAGGTGGCATGGTGGTCAAAGGCATCATCGGCTTGTTTATCGGCCCGGTAATCCTCGGCGTGACGTACGTGCTGTTCTGGCAATGGGTTGCGCTGCAGGTGCCGGA‑GCAACCGGCACCCCCTGCCGCCTGAGCCATGCCCAACCGCTG‑‑CTATGGCCTGGGGCTGCTGATGGTGCTGGCCGGTTGCACTCAGGTTGGTCCGGATTTCGAGAAGCCCCAAGCGCCGTGGCTGGACGGTTGGAGCACGCCCATGATCGAGCA > NC_002947/830561‑830854 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |