New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1268668 | 79 (1.320) | 4 (0.070) | 4/232 | NT | 5.0% | coding (770/1341 nt) | PP_1109 | GntR family transcriptional regulator |
? | NC_002947 | = 1268685 | 75 (1.300) | coding (753/1341 nt) | PP_1109 | GntR family transcriptional regulator |
GGAGAAGCTGCCGATGTAGATAACCCGGTCAAGGTTGTCCAGCTCGGCAAAGGTCTGGCGCACAGCAGGGCTGAAGTCCCCATAAACGTCGTCCTCGACCACGAAGAACTCGTGCTCCACCGCCAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTTGCTGCCGGTCGGGTTGTGGAAGGTGCTGTTGCAGAAAAACGCCTTGACCTTGTGCCTGGCCAGGTGGCTTCTCATTTCTTCCACGTCCGGCCCGTCCTGGGTCCGCCGAATGCCGACGACGTGTCCGCCA > NC_002947/1268538‑1268829 | ggAGAAGCTGCCGATGTAGATAACCCGGTCAAGGTTGTCCAGCTCGGCAAAGGTCTGGCGCACAGCAGGGCTGAAGTCCCCATAAACGTCGTCCTCGACCACGAAGAACTCGTGCTCCACCGCCAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGtg < 1:772277‑M2/150‑3 (MQ=255) gagaAGCTGCCGATGTAGATAACCCGGTCAAGGTTGTCCAGCTCGGCAAAGGTCTGGCGCACAGCAGGGCTGAAGTCCCCATAAACGTCGTCCTCGACCACGAAGAACTCGTGCTCCACCGCCAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGtgc < 1:902125‑M2/150‑4 (MQ=255) cTGCCGATGTAGATAACCCGGTCAAGGTTGTCCAGCTCGGCAAAGGTCTGGCGCACAGCAGGGCTGAAGTCCCCATAAACGTCGTCCTCGACCACGAAGAACTCGTGCTCCACCGCCAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTg < 2:772277/150‑1 (MQ=255) tGCCGATGTAGATAACCCGGTCAAGGTTGTCCAGCTCGGCAAAGGTCTGGCGCACAGCAGGGCTGAAGTCCCCATAAACGTCGTCCTCGACCACGAAGAACTCGTGCTCCACCGCCAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGa < 1:145375/150‑1 (MQ=255) aTGTAGATAACCCGGTCAAGGTTGTCCAGCTCGGCAAAGGTCTGGCGCACAGCAGGGCTGAAGTCCCCATAAACGTCGTCCTCGACCACGAAGAACTCGTGCTCCACCGCCAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTtg < 1:842995/150‑1 (MQ=255) aGATAACCCGGTCAAGGTTGTCCAGCTCGGCAAAGGTCTGGCGCACAGCAGGGCTGAAGTCCCCATAAACGTCGTCCTCGACCACGAAGAACTCGTGCTCCACCGCCAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTtgctgc > 1:872221/1‑150 (MQ=255) aTAACCCGGTCAAGGTTGTCCAGCTCGGCAAAGGTCTGGCGCACAGCAGGGCTGAAGTCCCCATAAACGTCGTCCTCGACCACGAAGAACTCGTGCTCCACCGCCAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTTGCTGCCg > 2:329116/1‑150 (MQ=255) aTAACCCGGTCAAGGTTGTCCAGCTCGGCAAAGGTCTGGCGCACAGCAGGGCTGAAGTCCCCATAAACGTCGTCCTCGACCACGAAGAACTCGTGCTCCACCGCCAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTTGCTGCCg > 2:1628842/1‑150 (MQ=255) aTAACCCGGTCAAGGTTGTCCAGCTCGGCAAAGGTCTGGCGCACAGCAGGGCTGAAGTCCCCATAAACGTCGTCCTCGACCACGAAGAACTCGTGCTCCACCGCCAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTTGCTGCCg > 1:1013046/1‑150 (MQ=255) aTAACCCGGTCAAGGTTGTCCAGCTCGGCAAAGGTCTGGCGCACAGCAGGGCTGAAGTCCCCATAAACGTCGTCCTCGACCACGAAGAACTCGTGCTCCACCGCCAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTTGCTGCCg < 2:885616/150‑1 (MQ=255) aCCCGGTCAAGGTTGTCCAGCTCGGCAAAGGTCTGGCGCACAGCAGGGCTGAAGTCCCCATAAACGTCGTCCTCGACCACGAAGAACTCGTGCTCCACCGCCAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTTGCTGCCGGTc < 1:417767/150‑1 (MQ=255) cccGGTCAAGGTTGTCCAGCTCGGCAAAGGTCTGGCGCACAGCAGGGCTGACGTCCCCATAAACGTCGTCCTCGACCACGAAGAACTCGTGCTCCACCGCCAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTTGCTGCCGGTCg > 2:637081/1‑150 (MQ=255) ccGGTCAAGGTTGTCCAGCTCGGCAAAGGTCTGGCGCACAGCAGGGCTGAAGTCCCCATAAACGTCGTCCTCGACCACGAAGAACTCGTGCTCCACCGCCAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTtgct > 2:612089/1‑141 (MQ=255) ccGGTCAAGGTTGTCCAGCTCGGCAAAGGTCTGGCGCACAGCAGGGCTGAAGTCCCCATAAACGTCGTCCTCGACCACGAAGAACTCGTGCTCCACCGCCAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTtgct < 1:612089/141‑1 (MQ=255) ccGGTCAAGGTTGTCCAGCTCGGCAAAGGTCTGGCGCACAGCAGGGCTGAAGTCCCCATAAACGTCGTCCTCGACCACGAAGAACTCGTGCTCCACCGCCAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTTGCTGCCCGTCgg > 2:932324/1‑150 (MQ=255) ccGGTCAAGGTCGTCCAGCTCGGCAAAGGTCTGGCGCACAGCAGGGCTGAAGTCCCCATAAACGTCGTCCTCGACCACGAAGAACTCGTGCTCCACCGCCAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTtgctgc < 1:1483592/143‑1 (MQ=255) ccGGTCAAGGTCGTCCAGCTCGGCAAAGGTCTGGCGCACAGCAGGGCTGAAGTCCCCATAAACGTCGTCCTCGACCACGAAGAACTCGTGCTCCACCGCCAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTtgctgc > 2:1483592/1‑143 (MQ=255) cGGTCAAGGTTGTCCAGCTCGGCAAAGGTCTGGCGCACAGCAGGGCTGAAGTCCCCATAAACGTCGTCCTCGACCACGAAGAACTCGTGCTCCACCGCCAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTTGCTGCCGGTCggg < 2:1427265/150‑1 (MQ=255) gTCAAGGTCGTCCAGCTCGGCAAAGGTCTGGCGCACAGCAGGGCTGAAGTCCCCATAAACGTCGTCCTCGACCACGAAGAACTCGTGCTCCACCGCCAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTTGCTGCCGGTCGGGtt < 1:907734/150‑1 (MQ=255) tCAAGGTTGTCCAGCTCGGCAAAGGTCTGGCGCACAGCAGGGCTGAAGTCCCCATAAACGTCGTCCTCGACCACGAAGAACTCGTGCTCCACCGCCAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTTGCTGCCGGTCGGGTtg < 2:926973/150‑1 (MQ=255) ttGTCCAGCTCGGCAAAGGTCTGGCGCACAGCAGGGCTGAAGTCCCCATAAACGTCGTCCTCGACCACGAAGAACTCGTGCTCCACCGCCAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTTGCTGCCGGTCGGGTTGTGGAAg < 1:329116/150‑1 (MQ=255) agccGGCAAAGGTCTGGCGCACAGCAGGGCTGAAGTCCCCATAAACGTCGTCCTCGACCACGAAGAACTCGTGCTCCACCGCCAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTTGCTGCCGGTCGGGTTGTGGAAGGTGCTGt > 1:471217/4‑150 (MQ=255) tCGGCAAAGGTCTGGCGCACAGCAGGGCTGAAGTCCCCATAAACGTCGTCCTCGACCACGAAGAACTCGTGCTCCACCGCCAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTTGCTGCCGGTCGGGTTGTGGAAGGTGCTg < 1:561117/147‑1 (MQ=255) tCGGCAAAGGTCTGGCGCACAGCAGGGCTGAAGTCCCCATAAACGTCGTCCTCGACCACGAAGAACTCGTGCTCCACCGCCAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTTGCTGCCGGTCGGGTTGTGGAAGGTGCTg > 2:561117/1‑147 (MQ=255) cGGCAAAGGTCTGGCGCACAGCAGGGCTGAAGTCCCCATAAACGTCGTCCTCGACCACGAAGAACTCGTGCTCCACCGCCAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTTGCTGCCGGTCGGGTTGTGGAAGGTGCTGTTGc < 1:440957/150‑1 (MQ=255) gCAAAGGTCTGGCGCACAGCAGGGCTGAAGTCCCCATAAACGTCGTCCTCGACCACGAAGAACTCGTGCTCCACCGCCAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTTGCTGCCGGTCGGGTTGTGGAAGGTGCTGtt > 2:187369/1‑146 (MQ=255) gCAAAGGTCTGGCGCACAGCAGGGCTGAAGTCCCCATAAACGTCGTCCTCGACCACGAAGAACTCGTGCTCCACCGCCAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTTGCTGCCGGTCGGGTTGTGGAAGGTGCTGtt < 1:187369/146‑1 (MQ=255) aaaGGTCTGGCGCACAGCAGGGCTGAAGTCCCCATAAACGTCGTCCTAGAAACCGGAAAACTCGTGCTCCACCGCCAGTCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTTGCTGCCGGTCGGGTTGTGGAAGGTGCTGTTGCAGaa > 1:1020784/1‑150 (MQ=255) gTCTGGCGCACAGCAGGGCTGAAGTCCCCATAAACGTCGTCCTCGACCACGAAGAACTCGTGCTCCACCGCCAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTTGCTGCCGGTCGGGTTGTGGAAGGTGCTGTTGCAGAAAAAc > 1:545411/1‑150 (MQ=255) acaGCAGGGCTGAAGTCCCCATAAACGTCGTCCTCGACCACGAAGAACTCGTGCTCCACCGCCAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTTGCTGCCGGTCGGGTTGTGGAAGGTGCTGTTGCAGAAAAACGCCTTGAcc > 2:636562/1‑150 (MQ=255) gcagGGCTGAAGTCCCCATAAACGTCGTCCTCGACCACGAAGAACTCGTGCTCCACCGCCAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGtgc < 2:253969‑M2/87‑4 (MQ=255) gcagGGCTGAAGTCCCCATAAACGTCGTCCTCGACCACGAAGAACTCGTGCTCCACCGCCAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGtgc > 1:253969‑M2/1‑84 (MQ=255) cagGGCTGAAGTCCCCATAAACGTCGTCCTCGACCACGAAGAACTCGTGCTCCACCGCCAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTTGCTGCCGGTCGGGTTGTGGAAGGTGCTGTTGCAGAAAAACGCCTTGACCTtgt < 1:1629254/150‑1 (MQ=255) cagGGCTGAAGTCCCCATAAACGTCGTCCTCGACCACGAAGAACTCGTGCTCCACCGCCAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTTGCTGCCGGTCGGGTCGTGGAAGGTGCTGTTGCAGAAAAACGCCTTGACCTtgt > 1:1162955/1‑150 (MQ=255) agGGCTGAAGTCCCCATAAACGTCGTCCTCGACCACGAAGAACTCGTGCTCCACCGCCAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTTGCTGCCGGTCGGGTTGTGGAAGGTGCTGTTGCAGAAAAACGcc < 2:392481/139‑1 (MQ=255) agGGCTGAAGTCCCCATAAACGTCGTCCTCGACCACGAAGAACTCGTGCTCCACCGCCAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTTGCTGCCGGTCGGGTTGTGGAAGGTGCTGTTGCAGAAAAACGcc > 1:392481/1‑139 (MQ=255) gggCTGAAGTCCCCATAAACGTCGTCCTCGACCACGAAGAACTCGTGCTCCACCGCCAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTTGCTGCCGGTCGGGTTGTGGAAGGTGCTGTTGCAGAAAAACGCCTTGACCTTGTGc < 1:636562/150‑1 (MQ=255) cccATAAACGTCGTCCTCGACCACGAAGAACTCGTGCTCCACCGCCAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTTGCTGCCGGTCGGGTTGTGGAAGGTGCTGTTGCAGAAAAACGCCTTGACCTTGTGCCTGGCCAGGTg > 2:1459081/1‑150 (MQ=255) cccATAAACGTCGTCCTCGACCACGAAGAACTCGTGCTCCACCGCCAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTTGCTGCCAGCCGGGTTGTGGAAGGTGGGGTTGCAGAAAAACGACTTGACCTTGTGCCTGGCCAGGTg > 2:576828/1‑150 (MQ=255) ccATAAACGTCGTCCTCGACCACGAAGAACTCGTGCTCCACCGCCAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTTGCTGCCGGTCGGGTTGTGGAAGGTGCTGTTGCAGAAAAACGCCTTGACCTTGTGCCTGGCCAGGTgg > 1:1615582/1‑150 (MQ=255) cATAAACGTCGTCCTCGACCACGAACAACTCGTGCTCCACCGCCAGGCTCAGGACGCTCAAGGCGTTGTGCGGGCTGACGTTGATGCCCGTCGGGTTGTGGACGGGCCTGTTGCAGAAACACGCCTTCACCCTGTGCCTGGCCAGGGGGc > 2:581406/1‑150 (MQ=255) tAAACGTCGTCCTCGACCACGAAGAACTCGTGCTCCACCGCCAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTTGCTGCCGGTCGGGTTGTGGAAGGTGCTGTTGCAGAAAAACGCCTTGACCTTGTGCCTGGCCAGGTGGCtt < 1:95275/150‑1 (MQ=255) tAAACGTCGTCCTCGACCACGAAGAACTCGTGCTCCACCGCCAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTTGCTGCCGGTCGGGTTGTGGAAGGTGCTGTTGCAGAAAAACGCCTTGACCTTGTGCCTGGCCAGGTGGCtt > 2:71516/1‑150 (MQ=255) gtcgtcCTCGACCACGAAGAACTCGTGCTCCACCGCCAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTTGCTGCCGGTCGGGTTGTGGAAGGTGCTGTTGCa < 2:1194185/108‑1 (MQ=255) gtcgtcCTCGACCACGAAGAACTCGTGCTCCACCGCCAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTTGCTGCCGGTCGGGTTGTGGAAGGTGCTGTTGCa > 1:1194185/1‑108 (MQ=255) gtcgtcCTCGACCACGAAGAACTCGTGCTCCACCGCCAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTTGCTGCCGGTCGGGTTGTGGAAGGTGCTGTTGCAGAAAAACGCCTTGACCTTGTGCCTGGCCAGGTAGCTTATCAt > 2:752522/1‑150 (MQ=255) tcgtcCTCGACCACGAAGAACTCGTGCTCCACCGCCAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTTGCTGCCGGTCGGGTTGTGGAAGGTGCTGTTGCAGAAAAACGCCTTGACCTTGTGCCTGGCCAGGTGGCTTCTCAtt < 2:1013046/150‑1 (MQ=255) cTCGACCACGAAGAACTCGTGCTCCACCGCCAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTTGCTGCCGGTCGGGTTGTGGAAGGTGCTGTTGCAGAAAAACGCCTTGACCTTGTGCCTGGCCAGGTgg > 1:149199/1‑136 (MQ=255) cTCGACCACGAAGAACTCGTGCTCCACCGCCAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTTGCTGCCGGTCGGGTTGTGGAAGGTGCTGTTGCAGAAAAACGCCTTGACCTTGTGCCTGGCCAGGTgg < 2:149199/136‑1 (MQ=255) cTCGACCACGAAGAACTCGTGCTCCACCGCCAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTTGCTGCCGGTCGGGTTGTGGAAGGTGCTGTTGCAGAAAAACGCCTTGACCTTGTGCCTGGCCAGGTGGCTTCTCATttcttc < 2:902125/150‑1 (MQ=255) cTCGACCACGAAGAACTCGTGCTCCACCGCCAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTTGCTGCCGGTCGGGTTGTGGAAGGTGCTGTTGCAGAAAAACGCCTTGACCTTGTGCCTGGCCAGGTGGCTTCTCATttcttc < 2:150410/150‑1 (MQ=255) cGACCACGAAGAACTCGTGCTCCACCGCCAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTTGCTGCCGGTCGGGTTGTGGAAGGTGCTGTTGCAGAAAAACGCCTTGACCTTGTGCCTGGCCAGGTAGCTTCTCATTTCTTCCa < 1:752522/150‑1 (MQ=255) cGACCACGAAGAACTCGTGCTCCACCCCCAGCCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTTGCTGCCGGTCGGGTTGTGGGAGGTGCTGTTGCAGAAAAACGCCTTGACCTTGTGCCTGGCCAGGTGGCTTCTCATTTCTTCCa < 1:752068/150‑1 (MQ=255) ccACGAAGAACTCGTGCTCCACCGCCAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTTGCTGCCGGTCGGGTTGTGGAAGGTGCTGTTGCAGAAAAACGCCTTGACCTTGTGCCTGGCCAGGTGGCTTCTCATTTCTTCCACGt > 2:1547816/1‑150 (MQ=255) gaagaaCTCGTGCTCCACCGCCAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTTGCTGCCGGTCGGGTTGTGGAAGGTGCTGTTGCAGAAAAACGCCTTGACCTTGTGCCTGGCCAGGTGGCTTCTCAt < 1:159541/135‑1 (MQ=255) gaagaaCTCGTGCTCCACCGCCAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTTGCTGCCGGTCGGGTTGTGGAAGGTGCTGTTGCAGAAAAACGCCTTGACCTTGTGCCTGGCCAGGTGGCTTCTCAt > 2:159541/1‑135 (MQ=255) gaagaaCTCGTGCTCCACCGCCAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTTGCTGCCGGTCGGGTTGTGGAAGGTGCTGTTGCAGAAAAACGCCTTGACCTTGTGCCTGGCCAGGTGGCTTCTCATTTCTTCCACGTCCgg > 1:978409/1‑150 (MQ=255) gaagaaCTCGTGCTCCACCGCCAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTTGCTGCCGGTCGGGTTGTGGAAGGTGCTGTTGCAGAAAAAAGCCTGGACCTTGTGGCTGGCCAGGTGGCTTCTCATTTCTTCCACGTCCgg > 2:1570322/1‑150 (MQ=255) aagaaCTCGTGCTCCACCGCCAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGtgcgcctggcggtggagcacgagttcttcgtggtcgaggacgacgtttatgg < 2:488393‑M2/97‑53 (MQ=255) aagaaCTCGTGCTCCACCGCCAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGtgcgcctggcggtggagcacgagttcttcgtggtcgaggacgacgtttatgg > 1:488393‑M2/1‑45 (MQ=255) aagaaCTCGTGCTCCACCGCCAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTTGCTGCCGGTCGGGTTGTGGAAGGTGCTGTTGCAGAAAAACGCCTTGACCTTGTGCCTGGCCAGGTGGCTTCTCATTTCTTCCACGTCCGGc > 2:1473455/1‑150 (MQ=255) tCGTGCTCCACCGCCAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTTGCTGCCGGTCGGGTTGTGGAAGGTGCTGtt < 2:592036/83‑1 (MQ=255) tCGTGCTCCACCGCCAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTTGCTGCCGGTCGGGTTGTGGAAGGTGCTGtt > 1:592036/1‑83 (MQ=255) gTGCTCCACCGCCAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTTGCTGCCGGTCGGGTTGTGGAAGGTGCTGTTGCa > 1:1344581/1‑84 (MQ=255) gTGCTCCACCGCCAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTTGCTGCCGGTCGGGTTGTGGAAGGTGCTGTTGCa < 2:1344581/84‑1 (MQ=255) cACCGCCAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTTGCTGCCGGTCGGGTTGTGGAAGGTGCTGTTGCAGAAAAACGCCTTGACCTTGTGCCTGGCCAGGTGGCTTCTCATTTCTTCCACGTCCGGc < 1:1100426/136‑1 (MQ=255) cACCGCCAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTTGCTGCCGGTCGGGTTGTGGAAGGTGCTGTTGCAGAAAAACGCCTTGACCTTGTGCCTGGCCAGGTGGCTTCTCATTTCTTCCACGTCCGGc > 2:1100426/1‑136 (MQ=255) cACCGCCAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTTGCTGCCGGTCGGGTTGTGGAAGGTGCTGTTGCAGAAAAACGCCTTGACCTTGTGCCTGGCCAGGTGGCTTCTCATTTCTTCCACGTCCGGCCCGTCCTGGGTccg > 1:1280249/1‑150 (MQ=255) ccGCCAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTTGCTGCCGGTCGGGTTGTGGAAGGTGCTGTTGCAGAAAAACGCCTTGACCTTGTGCCTGGCCAGGTGGCTTCTCATTTCTTCCACGTCCGGCCCGTCCTGGGTccgcc > 1:1409958/1‑150 (MQ=255) ccAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTTGCTGCCGGTCGGGTTGTGGAAGGTGCTGTTGCa < 2:662820/73‑1 (MQ=255) ccAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTTGCTGCCGGTCGGGTTGTGGAAGGTGCTGTTGCa > 1:662820/1‑73 (MQ=255) ccAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTTGCTGCCGGTCGGGTTGTGGAAGGTGCTGTTGCa > 1:664621/1‑73 (MQ=255) ccAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTTGCTGCCGGTCGGGTTGTGGAAGGTGCTGTTGCa < 2:664621/73‑1 (MQ=255) ccAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTTGCTGCCGGTCGGGTTGTGGAAGGTGCTGTTGCAGAAAAACGc < 2:937458/82‑1 (MQ=255) ccAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTTGCTGCCGGTCGGGTTGTGGAAGGTGCTGTTGCAGAAAAACGc > 1:937458/1‑82 (MQ=255) ccAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTTGCTGCCGGTCGGGTTGTGGAAGGTGCTGTTGCAGAAAAACGCCTTGACCTTGTGCCTGGCCAGGTGGCTTCTCATTTCTTCCACGTCCGGCCCGTCCTGGGTCCGCCGaa < 1:932324/150‑1 (MQ=255) aGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTTGCTGCCGGTCGGGTTGTGGAAGGTGCTGTTGCAGAAAAACGCCTTGACCTTGTGCCTGGCCAGGTGGCTTCTCATTTCTTCCACGTCCGGCCCGTCCTGGGTCCGCCGAATg < 1:1459081/150‑1 (MQ=255) gcgcAGGACGCTGAAGGCGTTGtgcgcctggcggtggagcacgagttcttcgtggtcgaggacgacgtttatggggacttcagccctgctgtgcgccagacct < 2:1436070‑M2/103‑82 (MQ=255) gcgcAGGACGCTGAAGGCGTTGtgcgcctggcggtggagcacgagttcttcgtggtcgaggacgacgtttatggggacttcagccctgctgtgcgccagacct > 1:1436070‑M2/1‑22 (MQ=255) gcgcAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTTGCTGCCGGTCGGGTTGTGGAAGGTGCTGTTGCAGAAAAACGCCTTGACCTTGTGCCTGGCCAGGTGGCTTCTCATTTCTTCCACGTCCGGCCCGTCCTGGGTCCGCCGAATGcc < 1:1628842/150‑1 (MQ=255) gACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTTGCTGCCGGTCGGGTtgt > 2:1480456/1‑47 (MQ=255) gACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTTGCTGCCGGTCGGGTtgt < 1:1480456/47‑1 (MQ=255) cTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTTGCTGCCGGTCGGGTTGTGGAAGGTGCTGTTGCAGAAAAACGCCTTGACCTTGTGCCTGGCCAGGTGGCTTCTCATTTCTTCCACGTCCGGCCCGTCCTGGGTCCGCCGAATGCCGACGACgtgt > 1:1227288/1‑150 (MQ=255) gCGTTGTGCGGGCTGATGTTGCTGCCGGTCGGGTTGTGGAAGGTGCTGTTGCAGAAAAACGCCTTGACCTTGTGCCTGGCCAGGTGGCTTCTCATTTCTTCCACGTCCGGCCCGTCCTGGGTCCGCCGAATGCCGACGACGTGTCCgcca < 2:1409958/150‑1 (MQ=255) | GGAGAAGCTGCCGATGTAGATAACCCGGTCAAGGTTGTCCAGCTCGGCAAAGGTCTGGCGCACAGCAGGGCTGAAGTCCCCATAAACGTCGTCCTCGACCACGAAGAACTCGTGCTCCACCGCCAGGCGCAGGACGCTGAAGGCGTTGTGCGGGCTGATGTTGCTGCCGGTCGGGTTGTGGAAGGTGCTGTTGCAGAAAAACGCCTTGACCTTGTGCCTGGCCAGGTGGCTTCTCATTTCTTCCACGTCCGGCCCGTCCTGGGTCCGCCGAATGCCGACGACGTGTCCGCCA > NC_002947/1268538‑1268829 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |