New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1511002 = | 71 (1.190) | 8 (0.140) | 7/236 | NT | 10.2% | pseudogene (607/1851 nt) | PP_1325 | putative lipoprotein |
? | NC_002947 | 1511025 = | 71 (1.210) | pseudogene (584/1851 nt) | PP_1325 | putative lipoprotein |
GAGCTTGGTCAGGGCCAGCGGCAGTTGCTGGGCGGCAGGGTGGTCCGGGTGCTGTTTGACCCAGGCTTCGATGGCCGCTTGCTGCTGCTCCAGGGTGCCGGCGC‑TTTTCACGGCGAAGGCCAGGCTGG‑TCCAGCCAGCCAGGGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGCTCTGCAGGCAGCGAGGCGACCAAGGCCCAGATGGCGTCATTGTTGGTGCTGGCGGCCTGGCCGCCAAGCAGCGGGGCCAGCAGGATGCGCTGCTGTGCGGCAGCCAGGGCCTGGCCATCG > NC_002947/1510883‑1511174 | gAGCTTGGTCAGGGCCAGCGGCAGTTGCTGGGCGGCAGGGTGGTCCGGGTGCTGTTTGACCCAGGCTTCGATGGCCGCTTGCTGCTGCTCCTGGGTGCCGGCGC‑TTTTCACGGCGAAGGCCAGGCTGG‑TCCAGCCAGCCAGGGTCTGATc < 1:1187782/150‑1 (MQ=255) gTCAGGGCCAGCGGCAGTTGCTGGGCGGCAGGGTGGTCCGGGTGCTGTTTGACCCAGGCTTCGATGGCCGCTTGCTGCTGCTCCAGGGTGCCGGCGC‑TTTTCACGGCGAAGGCCAGGCTGG‑TCCAGCCAGCCAGGGTCTGATCgttggtt > 1:1583927/1‑150 (MQ=255) tCAGGGCCAGCGGCAGTTGCTGGGCGGCAGGGTGGTCCGGGTGCTGTTTGACCCAGGCTTCGATGGCCGCTTGCTGCTGCTCCAGGGTGCCGGCGC‑TTTTCACGGCGAAGGCCAGGCTGG‑TCCAGCCAGCCAGGGTCTGATCgttggttg > 1:202436/1‑150 (MQ=255) gggCCAGCGGCAGTTGCTGGGCGGCAGGGTGGTCCGGGTGCTGTTTGACCCAGGCTTCGATGGCCGCTTGCTGCTGCTCCAGGGTGCCGGCGC‑TTTTCACGGCGAAGGCCAGGCTGG‑TCCAGCCAGCCAGGGTCTGATCGTTGGTTGgct > 1:1563210/1‑150 (MQ=255) ggCCAGCGGCAGTTGCTGGGCGGCAGGGTGGTCCGGGTGCTGTTTGACCCAGGCTTCGATGGCCGCTTGCTGCTGCTCCAGGGTGCCGGCGC‑TTTTCACGGCGAAGGCCAGGCTGG‑TCCAGCCAGCCAGGGTCTGATCgttg < 2:189187/142‑1 (MQ=255) ggCCAGCGGCAGTTGCTGGGCGGCAGGGTGGTCCGGGTGCTGTTTGACCCAGGCTTCGATGGCCGCTTGCTGCTGCTCCAGGGTGCCGGCGC‑TTTTCACGGCGAAGGCCAGGCTGG‑TCCAGCCAGCCAGGGTCTGATCgttg > 1:189187/1‑142 (MQ=255) gCAGTTGCTGGGCGGCAGGGTGGTCCGGGTGCTGTTTGACCCAGGCTTCGATGGCCGCTTGCTGCTGCTCCAGGGTGCCGGCGC‑TTTTCACGGCGAAGGCCAGGCTGG‑TCCAGCCAGCCAGGGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGtt < 2:1558333/150‑1 (MQ=255) gCTGGGCGGCAGGGTGGTCCGGGTGCTGTTTGACCCAGGCTTCGATGGCCGCTTGCTGCTGCTCCAGGGTGCCGGCGC‑TTTTCACGGCGAAGGCCAGGCTGG‑TCCAGCCAGCCAGGGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGCTCTg > 1:1559172/1‑150 (MQ=255) gggCGGCAGGGTGGTCCGGGTGCTGTTTGACCCAGGCTTCGATGGCCGCTTGCTGCTGCTCCAGGGTGCCGGCGC‑TTTTCACGGCGAAGGCCAGGCTGG‑TCCAGCCAGCCAGGGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGCTCTgcag > 1:614694/1‑150 (MQ=255) gggTGGTCCGGGTGCTGTTTGACCCAGGCTTCGATGGCCGCTTGCTGCTGCTCCAGGGTGCCGGCGC‑TTTTCACGGCGAAGGCCAGGCTGG‑TCCAGCCAGCCAGGGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGCTCTGCAGGCAGCGAg < 2:614694/150‑1 (MQ=255) gggTGGTCCGGGTGCTGTTTGACCCAGGCTTCGATGGCCGCTTGCTGCTGCTCCAGGGTGCCGGCGC‑TTTTCACGGCGAAGGCCAGGCTGG‑TCCAGCCAGCCAGGGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGCTCTGCAGGCAGCGAg > 2:413358/1‑150 (MQ=255) gtggtCCGGGTGCTGTTTGACCCAGGCTTCGATGGCCGCTTGCTGCTGCTCCAGGGTGCCGGCGC‑TTTTCACGGCGAAGGCCAGGCTGG‑TCCAGCCAGCCAGGGTCTGATc > 1:822899/1‑111 (MQ=255) gtggtCCGGGTGCTGTTTGACCCAGGCTTCGATGGCCGCTTGCTGCTGCTCCAGGGTGCCGGCGC‑TTTTCACGGCGAAGGCCAGGCTGG‑TCCAGCCAGCCAGGGTCTGATc < 2:822899/111‑1 (MQ=255) gtggtCCGGGTGCTGTTTGACCCAGGCTTCGATGGCCGCTTGCTGCTGCTCCAGGGTGCCGGCGC‑TTTTCACGGCGAAGGCCAGGCTGG‑TCCAGCCAGCCAGGGTCTGATCgtt < 1:1554430/114‑1 (MQ=255) gtggtCCGGGTGCTGTTTGACCCAGGCTTCGATGGCCGCTTGCTGCTGCTCCAGGGTGCCGGCGC‑TTTTCACGGCGAAGGCCAGGCTGG‑TCCAGCCAGCCAGGGTCTGATCgtt > 2:1554430/1‑114 (MQ=255) gtggtCCGGGTGCTGTTTGACCCAGGCTTCGATGGCCGCTTGCTGCTGCTCCAGGGTGCCGGCGC‑TTTTCACGGCGAAGGCCAGGCTGG‑TCCAGCCAGCCAGGGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGCTCTGCAGGCAGCGAGGc > 1:1404218/1‑150 (MQ=255) gTGCTGTTTGACCCAGGCTTCGATGGCCGCTTGCTGCTGCTCCAGGGTGCCGGCGC‑TTTTCACGGCGAAGGCCAGGCTGG‑TCCAGCCAGCCAGGGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAg > 2:236108/1‑120 (MQ=255) gTGCTGTTTGACCCAGGCTTCGATGGCCGCTTGCTGCTGCTCCAGGGTGCCGGCGC‑TTTTCACGGCGAAGGCCAGGCTGG‑TCCAGCCAGCCAGGGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAg < 1:236108/120‑1 (MQ=255) tGTTTGACCCAGGCTTCGATGGCCGCTTGCTGCTGCTCCAGGGTGCCGGCGC‑TTTTCACGGCGAAGGCCAGGCTGG‑TCCAGCCAGCCAGGGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGCTCTGCAGGCAGCGAGGCGACCAAGGCCCAg > 1:318401/1‑150 (MQ=255) tGTTTGACCCAGGCTTCGATGGCCGCTTGCTGCTGCTCCAGGGTGCCGGCGC‑TTTTCACGGCGAAGGCCAGGCTGG‑TCCAGCCAGCCAGGGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGCTCTGCAGGCAGCGAGGCGACCAAGGCCCAg > 1:360981/1‑150 (MQ=255) gccatctgggccttggtcgcctcgctgcctgcagagcaactgcagcagccaaccaacgatcagacccaggctggtccagccagccaggGTCTGATCgttg < 1:337408‑M2/12‑1 (MQ=255) gccatctgggccttggtcgcctcgctgcctgcagagcaactgcagcagccaaccaacgatcagacccaggctggtccagccagccaggGTCTGATCgttg > 2:337408‑M2/89‑100 (MQ=255) aCCCAGGCTTCGATGGCCGCTTGCTGCTGCTCCAGGGTGCCGGCGC‑TTTTCACGGCGAAGGCCAGGCTGG‑TCCAGCCAGCCAGGGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGCTCTGCAGGCAGCGAGGCGACCAAGGCCCAGATGGCg > 1:282023/1‑150 (MQ=255) cccAGGCTTCGATGGCCGCTTGCTGCTGCTCCAGGGTGCCGGCGC‑TTTTCACGGCGAAGGCCAGGCTGG‑TCCAGCCAGTCAGGGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGCTCTGCAGGCAGCGAGGCGAc > 1:228074/1‑133 (MQ=255) cccAGGCTTCGATGGCCGCTTGCTGCTGCTCCAGGGTGCCGGCGC‑TTTTCACGGCGAAGGCCAGGCTGG‑TCCAGCCAGTCAGGGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGCTCTGCAGGCAGCGAGGCGAc < 2:228074/133‑1 (MQ=255) ccAGGCTTCGATGGCCGCTTGCTGCTGCTCCAGGGTGCCGGCGC‑TTTTCACGGCGAAGGCCAGGCTGG‑TCCAGCCAGCCAGGGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGCTCTGCAGGCAGCGAGGCGACCAAGGCCCAGATGGCGTc > 2:73406/1‑150 (MQ=255) gCTTCGATGGCCGCTTGCTGCTGCTCCAGGGTGCCGGCGC‑TTTTCACGGCGAAGGCCAGGCTGG‑TCCAGCCAGCCAGGGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGCTCTGCAGGCAGCGAGGCGACCAAGGCCCAGATGGc < 2:1152525/143‑1 (MQ=255) gCTTCGATGGCCGCTTGCTGCTGCTCCAGGGTGCCGGCGC‑TTTTCACGGCGAAGGCCAGGCTGG‑TCCAGCCAGCCAGGGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGCTCTGCAGGCAGCGAGGCGACCAAGGCCCAGATGGc > 1:1152525/1‑143 (MQ=255) gCTTCGATGGCCGCTTGCTGCTGCTCCAGGGTGCCGGCGC‑TTTTCACGGCGAAGGCCAGGCTGG‑TCCAGCCAGCCAGGGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGCTCTGCAGGCAGCGAGGCGACCAAGGCCCAGATGGCGTCAttg > 2:540999/1‑150 (MQ=255) ttCGATGGCCGCTTGCTGCTGCTCCAGGGTGCCGGCGCTTTTTCACGGCGAAGGCCAGGCTGG‑TCCAGCCAGCCAGGGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGctc < 1:361311/109‑1 (MQ=255) ttCGATGGCCGCTTGCTGCTGCTCCAGGGTGCCGGCGCTTTTTCACGGCGAAGGCCAGGCTGG‑TCCAGCCAGCCAGGGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGctc > 2:361311/1‑109 (MQ=255) tCGATGGCCGCTTGCTGCTGCTCCAGGGTGCCGGCGC‑TTTTCACGGCGAAGGCCAGGCTGG‑TCCAGCCAGCCAGGGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGCTCTGCAGGCAGCGAGGCGACCAAGGCCCAGATGGCGTCAttgttg < 2:1563210/150‑1 (MQ=255) gttGGCTGCTTGCTGCTGCTCCAGGGTGCCGGCGC‑TTTTCGCGGTGAAGGCCAGGTTGG‑TCCTGTTAGTCAGGGTCTGTTCGTTGGTTGGCTGGTGAAGTTGTTCTGGAGGGTGCGAGTCGACCAATGTCCAGATGGCGTCAtttttgtt < 2:579295/148‑3 (MQ=255) ccGCTTGCTGCTGCTCCAGGGTGCCGGCGC‑TTTTCACGGCGAAGGCCAGGCTGG‑TCCAGCCAGCCAGGGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGCTCTGCAGGCAGCGAGGCGACCAAGGCCCAGATGGCGTCATTGTTGGTGCTgg > 2:210631/1‑150 (MQ=255) ccGCTTGCTGCTGCTCCAGGGTGCCGGCGC‑TTTTCACGGCGAAGGCCAGGCTGG‑TCCAGCCAGCCAGGGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGCTCTGCAGGCAGCGAGGCGACCAAGGCCCAGATGGCGTCATTGTTGGTGCTgg > 1:375056/1‑150 (MQ=255) gCTTGCTGCTGCTCCAGGGTGCCGGCGC‑TTTTCACGGCGAAGGCCAGGCTGG‑TCCAGCCAGCCAGGGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGCTCTGCAGGCAGCGAGGCGACCAAGGCCCAGATGGCGTCATTGTTGGTGCTggcg < 2:282023/150‑1 (MQ=255) ttGCTGCTGCTCCAGGGTGCCGGCGC‑TTTTCACGGCGATGTTCAGGCTGG‑TCCAGCCAGCCAGGGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGCTCTGCAGGCAGCGAGGCGACCAAGGCCCAGATGGCGTCATTGTTGGTGCTggcggc < 1:14983/150‑1 (MQ=255) tgctgctCCAGGGTGCCGGCGC‑TTTTCACGGCGAAGGCCAGGCTGG‑TCCAGCCAGCCAGGGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGc > 1:78631/1‑90 (MQ=255) tgctgctCCAGGGTGCCGGCGC‑TTTTCACGGCGAAGGCCAGGCTGG‑TCCAGCCAGCCAGGGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGc < 2:78631/90‑1 (MQ=255) tgctgctCCAGGGTGCCGGCGC‑TTTTCACGGCGAAGGCCAGGCTGG‑TCCAGCCAGCCAGGGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGCTCTGCAGGCAGCGAGGCGACCAAGGCCCAGATGGCGTCATTGTTGGTGCTGGCGGCCTgg > 1:487567/1‑150 (MQ=255) gctgctCCAGGGTGCCGGCGC‑TTTTCACGGCGAAGGCCAGGCTGG‑TCCAGCCAGCCAGGGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGCTCTGCAGGCAGCGAGGc < 1:663439/106‑1 (MQ=255) gctgctCCAGGGTGCCGGCGC‑TTTTCACGGCGAAGGCCAGGCTGG‑TCCAGCCAGCCAGGGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGCTCTGCAGGCAGCGAGGc > 2:663439/1‑106 (MQ=255) tgctCCAGGGTGCCGGCGC‑TTTTCACGGCGAAGGCCAGGCTGG‑TCCAGCCAGCCAGGGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGCTCTGCAGGCAGCGAGGCGACCAAGGCCCAGATGGCGTCATTGTTGGTGCTGGCGGCCTGgccg < 1:871677/150‑1 (MQ=255) cagagcaactgcagcagccaaccaacgatcagacCCAGGCTGG‑TCCAGCCAGCCAGGGt < 2:1462738‑M1/25‑1 (MQ=255) cagagcaactgcagcagccaaccaacgatcagacCCAGGCTGG‑TCCAGCCAGCCAGGGt > 1:1462738‑M1/35‑59 (MQ=255) ctCCAGGGTGCCGGCGC‑TTTTCACGGCGAAGGCCAGGCTGG‑TCCAGCCAGCCAGGGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGCTCTGCAGGCAGCGAGGCGACCAAGGCCCAGATGGCGTCATTGTTGGTGCTGGCGGCCTGgccgcc < 1:540999/150‑1 (MQ=255) tCCAGGGTGCCGGCGC‑TTTTCACGGCGAAGGCCAGGCTGG‑TCCAGCCAGCCAGGGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGCTCTGCAGGCAGCGAGGCGACCAAGGCCCAGATGGCGTCAttgt < 1:307358/127‑1 (MQ=255) tCCAGGGTGCCGGCGC‑TTTTCACGGCGAAGGCCAGGCTGG‑TCCAGCCAGCCAGGGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGCTCTGCAGGCAGCGAGGCGACCAAGGCCCAGATGGCGTCAttgt > 2:307358/1‑127 (MQ=255) ccAGGGTGCCGGCGC‑TTTTCACGGCGAAGGCCAGGCTGG‑TCCAGCCAGCCAGGGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGCTCTGCAGGCAGCGAGGCGACCAAGGCCCAGATGGCGTCATTGTTGGTGCTGGCGGCCTGGCCGCCaa < 2:360981/150‑1 (MQ=255) gggTGCCTGCGC‑TTTTCACGGCGAAGGCCAGGCTCG‑TCCAGCCCGCCAGGTTCTCATCGTTTGTTGTCTGCTGCAGTTGCTCTGCAGGAAGCGAGGCGACAAAGGCCCAGATGGCGTCATTGTTGGTGCTGGCGGCCTGGCCGCCAagca < 2:458135/150‑1 (MQ=255) tGCCGGCGC‑TTTTCACGGCGAAGGCCAGGCTGG‑TCCAGCCAGCCAGGGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGCTCTGCAGGCAGCGAGGCGACCAAGGCCCAGATGGCGTCATTGTTGGTGCTGGCGGCCTGGCCGCCAAGCAGCg > 2:435534/1‑150 (MQ=255) gCCGGCGC‑TTTTCACGGCGAAGGCCAGGCTGG‑TCCAGCCAGCCAGGGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGCTCTGCAGGCAGCGAGGCGACCAAGGCCCAGATGGCGTCATTGTTGGTGCTGGCGGCCTGGCCGCCAAGCAGCgg < 1:8063/150‑1 (MQ=255) gCCGGCGC‑TTTTCACGGCGAAGGCCAGGCTGG‑TCCAGCCAGCCAGGGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGCTCTGCAGGCAGCGAGGCGACCAAGGCCCAGATGGCGTCATTGTTGGTGCTGGCGGCCTGGCCGCCAAGCAGCgg < 1:73406/150‑1 (MQ=255) ccGGCGC‑TTTTCACGGCGAAGGCCAGGCTGG‑TCCAGCCAGCCAGGGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGCTCTGCAGGCAGCGAGGCGACCAAGGCCCAGATGGCGTCATTGTTGGTGCTGGCGGCCTGGCCGCCAAGCAGCggg < 1:210631/150‑1 (MQ=255) cGGCGC‑TTTTCACGGCGAAGGCCAGGCTGG‑TCCAGCCAGCCAGGGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGCTCTGCAGGCAGCGAg < 2:618578/89‑1 (MQ=255) cGGCGC‑TTTTCACGGCGAAGGCCAGGCTGG‑TCCAGCCAGCCAGGGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGCTCTGCAGGCAGCGAg > 1:618578/1‑89 (MQ=255) ggCGC‑TTTTCACGGCGAAGGCCAGGCTGG‑TCCAGCCAGCCAGGGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGCTCTgcaggcag < 1:233462/84‑1 (MQ=255) ggCGC‑TTTTCACGGCGAAGGCCAGGCTGG‑TCCAGCCAGCCAGGGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGCTCTgcaggcag > 2:233462/1‑84 (MQ=255) gc‑TTTTCACGGCGAAGGCCAGGCTGG‑TCCAGCCAGCCAGGGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGCTCTGCAGGCAGCGAGGCGACCAAGGCCCAGATGGCGTCATTGTTGGTGCTGGCGGCCTGGCCGCCAAGCAGCGGGGCcag > 2:1482799/1‑150 (MQ=255) ttttCACGGCGAAGGCCAGGCTGG‑TCCAGCCAGCCAGGGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGCTCTGCAGGCAGCGAGGCGACCAAGGCCCAGATGGCGTCATTGTTGGTGCTGGCGGCCTGGCCGCCAAGCAGCg < 1:1456102/141‑1 (MQ=255) ttttCACGGCGAAGGCCAGGCTGG‑TCCAGCCAGCCAGGGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGCTCTGCAGGCAGCGAGGCGACCAAGGCCCAGATGGCGTCATTGTTGGTGCTGGCGGCCTGGCCGCCAAGCAGCg > 2:1456102/1‑141 (MQ=255) caacgatcagacCCTGGCTGGCTGGA‑CCAGCCTGGGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGCTCTGCAGGCAGCGAGGCGACCAAGGCCCAGATGGc < 1:337408‑M1/88‑1 (MQ=255) caacgatcagacCCTGGCTGGCTGGA‑CCAGCCTGGGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGCTCTGCAGGCAGCGAGGCGACCAAGGCCCAGATGGc > 2:337408‑M1/13‑100 (MQ=255) cACGGCGAAGGCCAGGCTGG‑TCCAGCCAGCCAGGGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGCTCTGCAGGCAGCGAGGCGACCAAGGCCCAGATGGCGTCATTGTTGGTGCTGGCGGCCTGGCCGCCAAGCAGCGGGGCCAGCAGGAt < 1:1482799/150‑1 (MQ=255) aCGGCGAAGGCCAGGCTGG‑TCCAGCCAGCCAGGGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGCTCTGCAGGCAGCGAGGCGACCAAGGCCCAGATGGCGTCATTGTTGGTGCTGGCGGCCTGGCCGCCAag > 2:191067/1‑131 (MQ=255) aCGGCGAAGGCCAGGCTGG‑TCCAGCCAGCCAGGGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGCTCTGCAGGCAGCGAGGCGACCAAGGCCCAGATGGCGTCATTGTTGGTGCTGGCGGCCTGGCCGCCAag < 1:191067/131‑1 (MQ=255) aCGGCGAAGGCCAGGCTGG‑TCCAGCCAGCCAGGGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGCTCTGCAGGCAGCGAGGCGACCAAGGCCCAGATGGCGTCATTGTTGGTGCTGGCGGCCTGGCCGCCAAGCAGCGGGGCCAGCAGGATg > 2:197729/1‑150 (MQ=255) aCGGCGAAGGCCAGGCTGG‑TCCAGCCAGCCAGGGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGCTCTGCAGGCAGCGAGGCGACCAAGGCCCAGATGGCGTCATTGTTGGTGCTGGCGGCCTGGCCGCCAAGCAGCGGGGCCAGCAGGATg > 1:502690/1‑150 (MQ=255) ggCGAAGGCCAGGCTGG‑TCCAGCCAGCCAGGGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGCTCTGCAGGCAGCGAGGCGACCAAGGCCCAGATGGCGTCATTGTTGGTGCTGGCGGCCTGGCCGCCAAGCAGCGGGGCCAGCAGGATgcg > 2:673274/1‑150 (MQ=255) aGGCCAGGCTGG‑TCCAGCCAGCCAGGGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGCTCTGCAGGCAGCGAGGCGACCAAGGCCCAGATGGCGTCATTGTTGGTGCTGGCGGCCTGGCCGCCAAGCAGCGGGGCCAGCAGGATGCgctgct < 1:794846/150‑1 (MQ=255) ggCCAGGCTGG‑TCCAGCCAGCCAGGGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGCTCTGCAGGCAGCGAGGCGACCAAGGCCCAGATGGCGTCATTGTTGGTGCTGGCGGCCTGGCCGCCAAGCAGCGGGGCCAGCAGGATGCGctgctg > 2:709359/1‑150 (MQ=255) accctggctggctggaccagcctggGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGCTCTg < 2:1462738‑M2/34‑1 (MQ=255) accctggctggctggaccagcctggGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGCTCTg > 1:1462738‑M2/26‑59 (MQ=255) CCAGGCTGG‑TCCAGCCAGCCAGGGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGCTCTGCAGGCAGCGAGGCGACCAAGGCCCAGATGGCGTCATTGTTGGTGCTGGCGGCCTGGCCGCCAAGCAGCGGGGCCAGCAGGATGCGCTGCtgtg > 2:1071884‑M1/1‑150 (MQ=255) cctggctggctggaccagcctggGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAg > 2:203927‑M2/24‑49 (MQ=255) cctggctggctggaccagcctggGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAg < 1:203927‑M2/26‑1 (MQ=255) cctggctggctggaccagccaggGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGCTCTGCAGGCAGCGGGGCGACCAAGGCCCAGATGGTGTCATGGTTGGTGCTGGCGGCCTGGCCGGAAAGCAGCAGGGATACCAGGATGCGCTGCtgtg > 1:903483‑M2/24‑150 (MQ=255) ctggctggctggaccagcctggGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGCTCTGCAGGCAGCGAGGCGACCAAGGCCCAGATGGCGTCATTGTTGGTGCTGGCGGCCTGGCCGCCAAGCAGCGGGGCCAGCAGGATGCGCTGCTGTGc > 1:37321‑M2/23‑150 (MQ=255) ggCTGG‑TCCAGCCAGCCAGGGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGCTCTGCAGGCAGCGAGGCGACCAAGGCCCAGATGGCGTCATTGTTGGTGCTGGCGGCCTGGCCGCCAAGCAGCGGGGCCAGCAGGATGCGCTGCTGTGCgg < 2:318401/150‑1 (MQ=255) cTGG‑TCCAGCCAGCCAGGGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGCTCTGCAGGCAGCGAGGCGACCAAGGCCCAGATGGCGTCATTGTTGGTGCTGGCGGCCTGGCCGCCAAGCAGCGGGGCCAGCAGGATGCGCTGCTGTGCGGCa < 2:375056/150‑1 (MQ=255) tCCAGCCAGCCAGGGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGCTCTGCAGGCAGCGAGGCGACCAAGGCCCAGATGGCGTCATTGTTGGTGCTGGCGGCCTGGCCGCCAAGCAGCGGGGCCAGCAGGATGCGCTGCTGTGCGGCAGccc > 2:534388/1‑149 (MQ=255) gccagccagGGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGCTCTGCAGGCAGCGAGGCGACCAAGGCCCAGATGGCGTCATTGTTGGTg > 1:667143/1‑88 (MQ=255) gccagccagGGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGCTCTGCAGGCAGCGAGGCGACCAAGGCCCAGATGGCGTCATTGTTGGTg < 2:667143/88‑1 (MQ=255) gccagccagGGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGCTCTGCAGGCAGCGAGGCGACCAAGGCCCAGATGGCGTCATTGTTGGTGCTGGCGGCCTGGCCGCCAAGCAGCGGGGCCAGCAGGATGCGCTGCTGTGCGGCAGCCAGGGc > 1:247133/1‑150 (MQ=255) agccagGGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGCTCTGCAGGCAGCGAGGCGACCAAGGCCCAGATGGCGTCATTGTTGGTGCTGGCGGCCTGGCCGCCAAGCAGCGGGGCCAGCAGGATGCGCTGCTGTGCGGCAGCCAGGGCCTg > 2:859195/1‑150 (MQ=255) agccagGGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGCTCTGCAGGCAGCGAGGCGACCAAGGCCCAGATGGCGTCATTGTTGGTGCTGGCGGCCTGGCCGCCAAGCAGCGGGGCCAGCAGGATGCGCTGCTGTGCGGCAGCCAGGGCCTg < 1:435534/150‑1 (MQ=255) ggGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGCTCTGCAGGCAGCGAGGCGACCAAGGCCCAGATGGCGTCATTGTTGGTGCTGGCGGCCTGGCCGCCAAGCAGCGGGGCCAGCAGGATGCGCTGCTGTGCGGCAGCCAGGGCCTGGCCAt < 1:673274‑M2/148‑1 (MQ=255) gGTCTTATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGCTCTGCAGGCAGCGAGGCGACCAAGGCCCAGATGGCGTCATTGTTGGTGCTGGCGGCCTGGCCGCCAAGCAGCGGGGCCAGCAGGATGCGCTGCTGTGCGGCAGCCAGGGCCTGGCCATc < 1:413358‑M2/149‑1 (MQ=255) gGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGCTCTGCAGGCAGCGAGGCGACCAAGGCCCAGATGGCGTCATTGTTGGTGCTGGCGGCCTGGCCGCCAAGCAGCGGGGCCAGCAGGATGCGCTGCTGTGCGGCAGCCAGGGCCTGGCCATc > 2:1434141‑M2/2‑150 (MQ=255) gTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGCTCTGCAGGCAGCGAGGCGACCAAGGCCCAGATGGCGTCATTGTTGGTGCTGGCGGCCTGGCCGCCAAGCAGCGGGGCCAGCAGGATGCGCTGCTGTGCGGCAGCCAGGGCCTGGCCATCg < 1:461578/150‑1 (MQ=255) | GAGCTTGGTCAGGGCCAGCGGCAGTTGCTGGGCGGCAGGGTGGTCCGGGTGCTGTTTGACCCAGGCTTCGATGGCCGCTTGCTGCTGCTCCAGGGTGCCGGCGC‑TTTTCACGGCGAAGGCCAGGCTGG‑TCCAGCCAGCCAGGGTCTGATCGTTGGTTGGCTGCTGCAGTTGCTCTGCAGGCAGCGAGGCGACCAAGGCCCAGATGGCGTCATTGTTGGTGCTGGCGGCCTGGCCGCCAAGCAGCGGGGCCAGCAGGATGCGCTGCTGTGCGGCAGCCAGGGCCTGGCCATCG > NC_002947/1510883‑1511174 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |