New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1607234 | 56 (0.940) | 6 (0.100) | 6/230 | NT | 10.0% | coding (342/888 nt) | PP_1408 | (R)‑3‑hydroxydecanoyl‑ACP:CoA transacylase |
? | NC_002947 | = 1607244 | 54 (0.940) | coding (332/888 nt) | PP_1408 | (R)‑3‑hydroxydecanoyl‑ACP:CoA transacylase |
TCATTGACCAGGTTGCCGACCTGATAACGGTCGCAGGCGGCCAGGTACTGGCAGCCACGGTCCAGATAGTCGCGCATCGGCTCGTTGATCACTGGCGAGAACGAACTCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGC‑GCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGACGGTTGTGCGGCTTGGACTTGCCTGAATAC > NC_002947/1607097‑1607390 | tCATTGACCAGGTTGCCGACCTGATAACGGTCGCAGGCGGCCAGGTACTGGCAGCCACGGTCCAGATAGTCGCGCATCGGCTCGTTGATCACTGGCGAGAACGAACTCACTACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGC‑GCCAGCGcc < 1:834570‑M2/150‑3 (MQ=255) tCATTGACCAGGTTGCCGACCTGATAACGGTCGCAGGCGGCCAGGTACTGGCAGCCACGGTCCAGATAGTCGCGCATCGGCTCGTTGATCACTGGCGAGAACGAACTCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGC‑GCCAGCGcc < 2:663421‑M2/150‑3 (MQ=255) aCCAGGTTGCCGACCTGATAACGGTCGCAGGCGGCCAGGTACTGGCAGCCACGGTCCAGATAGTCGCGCATCGGCTCGTTGATCACTGGCGAGAACGAACTCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGC‑GCCAGCGCCagcagc < 2:1083582/150‑1 (MQ=255) aCCAGGTTGCCGACCTGATAACGGTCGCAGGCGGCCAGGTACTGGCAGCCACGGTCCAGATAGTCGCGCATCGGCTCGTTGATCACTGGCGAGAACGAACTCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGC‑GCCAGCGCCagcagc > 2:5767/1‑150 (MQ=255) cAGGTTGCCGACCTGATAACGGTCGCAGGCGGCCAGGTACTGGCAGCCACGGTCCAGATAGTCGCGCATCGGCTCGTTGATCACTGGCGAGAACGAACTCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGC‑GCCAGCGCCAGCAGCGt > 2:401560/1‑150 (MQ=255) aGGTTGCCGACCTGATAACGGTCGCAGGCGGCCAGGTACTGGCAGCCACGGTCCAGATAGTCGCGCATCGGCTCGTTGATCACTGGCGAGAACGAACTCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGC‑GCCAGCGCCAGCAGCGTg < 1:577527/150‑1 (MQ=255) ggTTGCCGACCTGATAACGGTCGCAGGCGGCCAGGTACTGGCAGCCACGGTCCAGATAGTCGCGCATCGGCTCGTTGATCACTGGCGAGAACGAACTCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGC‑GCCAGCGCCAGCAgcgcgc < 1:1644023/150‑1 (MQ=255) ttGCCGACCTGATAACGGTCGCAGGCGGCCAGGTACTGGCAGCCACGGTCCAGATAGTCGCGCATCGGCTCGTTGATCACTGGCGAGAACGAACTCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGC‑GCCAGCGCCAGCAGCGTGCtt < 1:1614552/150‑1 (MQ=255) gACCTGATAACGGTCGCAGGCGGCCAGGTACTGGCAGCCACGGTCCAGATAGTCGCGCATCGGCTCGTTGATCACTGGCGAGAACGAACTCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGC‑GCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGcc > 2:257723/1‑150 (MQ=255) tAACGGTCGCAGGCGGCCAGGTACTGGCAGCCACGGTCCAGATAGTCGCGCATCGGCTCGTTGATCACTGGCGAGAACGAACTCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGC‑GCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCAc < 1:259497/150‑1 (MQ=255) tCGCAGGCGGCCAGGTACTGGCAGCCACGGTCCAGATAGTCGCGCATCGGCTCGTTGATCACTGGCGAGAACGAACTCACTACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGC‑GCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTTCGCCACCCCACGaaaaa < 2:834570/150‑1 (MQ=255) ccAGGTACTGGCAGCCACGGTCCAGATAGTCGCGCATCGGCTCGTTGATCACTGGCGAGAACGAACTCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGC‑GCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGt > 1:1370526/1‑150 (MQ=255) cAGGTACTGGCAGCCACGGTCCAGATAGTCGCGCATCGGCTCGTTGATCACTGGCGAGAACGAACTCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGC‑GCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTg > 2:204470/1‑150 (MQ=255) aGGTACTGGCAGCCACGGTCCAGATAGTCGCGCATCGGCTCGTTGATCACTGGCGAGAACGAACTCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGC‑GCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTgg < 1:5767/150‑1 (MQ=255) aGGTACTGGCAGCCACGGTCCAGATAGTCGCGCATCGGCTCGTTGATCACTGGCGAGAACGAACTCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGC‑GCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTgg > 2:419488/1‑150 (MQ=255) gTACTGGCAGCCACGGTCCAGATAGTCGCGCATCGGCTCGTTGATCACTGGCGAGAACGAACTCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGC‑GCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTc > 1:859588/1‑150 (MQ=255) tACTGGCAGCCACGGTCCAGATAGTCGCGCATCGGCTCGTTGATCACTGGCGAGAACGAACTCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGC‑GCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCt < 1:401560/150‑1 (MQ=255) tGGCAGCCACGGTCCAGATAGTCGCGCATCGGCTCGTTGATCACTGGCGAGAACGAACTCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGC‑GCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCAcccc < 2:145959/124‑1 (MQ=255) tGGCAGCCACGGTCCAGATAGTCGCGCATCGGCTCGTTGATCACTGGCGAGAACGAACTCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGC‑GCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCAcccc > 1:145959/1‑124 (MQ=255) cAGCCACGGTCCAGATAGTCGCGCATCGGCTCGTTGATCACTGGCGAGAACGAACTCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGC‑GCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTgg < 2:737740/150‑1 (MQ=255) gCCACGGTCCAGATAGTCGCGCATCGGCTCGTTGATCACTGGCGAGAACGAACTCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGC‑GCCAGCGCCAGCAGCGTGc < 1:103728/107‑1 (MQ=255) gCCACGGTCCAGATAGTCGCGCATCGGCTCGTTGATCACTGGCGAGAACGAACTCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGC‑GCCAGCGCCAGCAGCGTGc > 2:103728/1‑107 (MQ=255) cACGGTCCAGATAGTCGCGCATCGGCTCGTTGATCACTGGCGAGAACGAACTCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGC‑GCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGt > 1:193715/1‑150 (MQ=255) cGGTCCAGATAGTCGCGCATCGGCTCGTTGATCACTGGCGAGAACGAACTCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGC‑GCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGc < 2:1370526/150‑1 (MQ=255) cGGTCCAGATAGTCGCGCATCGGCTCGTTGATCACTGGCGAGAACGAACTCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGC‑GCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGc < 1:419488/150‑1 (MQ=255) aTAGTCGCGCATCGGCTCGTTGATCACTGGCGAGAACGAACTCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGC‑GCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGc > 2:518314/1‑142 (MQ=255) aTAGTCGCGCATCGGCTCGTTGATCACTGGCGAGAACGAACTCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGC‑GCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGc < 1:518314/142‑1 (MQ=255) tCGGCTCGTTGATCACTGGCGAGAACGAACTCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGC‑GCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACAGCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAggagga < 1:204470/150‑1 (MQ=255) cGGCTCGTTGATCACTGGCGAGAACGAACTCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGC‑GCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGcc < 1:1451787/121‑1 (MQ=255) cGGCTCGTTGATCACTGGCGAGAACGAACTCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGC‑GCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGcc > 2:1451787/1‑121 (MQ=255) ggCTCGTTGATCACTGGCGAGAACGAACTCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGC‑GCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGata > 2:154727/1‑150 (MQ=255) gCTCGTTGATCACTGGCGAGAACGAACTCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGCGCTGGC‑GCAccagccgcggtacgtgaagaaggcagtggtga > 2:46340‑M2/1‑69 (MQ=255) gCTCGTTGATCACTGGCGAGAACGAACTCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGCGCTGGC‑GCAccagccgcggtacgtgaagaaggcagtggtga < 1:46340‑M2/101‑33 (MQ=255) tCGTTGATCACTGGCGAGAACGAACTCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGC‑GCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATgc < 2:859588/150‑1 (MQ=255) gTTGATCACTGGCGAGAACGAACTCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGC‑GCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATgcgc < 1:656899/150‑1 (MQ=255) ttGATCACTGGCGAGAACGAACTCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGC‑GCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGcc < 1:663421/150‑1 (MQ=255) gCGAGAACGAACTCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGC‑GCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCt < 2:959917/150‑1 (MQ=255) aacTCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGC‑GCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCa > 2:504523/1‑150 (MQ=255) acaccacTGGCTTCTTCACGTAGCGCGGCTGGTGC‑ACCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGACACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTGTGCCTGGACGTGCTCGATGAGCTCAAAGAGGATATGCCCCTCGGTCTCCTTGCTGAGCAGcc > 2:557010/2‑150 (MQ=255) accacTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGC‑GCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGAc > 2:1366320/1‑75 (MQ=255) accacTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGC‑GCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGAc < 1:1366320/75‑1 (MQ=255) accacTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGC‑GCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATc > 1:907072/1‑105 (MQ=255) accacTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGC‑GCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATc < 2:907072/105‑1 (MQ=255) cacTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGC‑GCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCa < 1:72890/77‑1 (MQ=255) cacTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGC‑GCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCa > 2:72890/1‑77 (MQ=255) cacTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGC‑GCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGata < 2:1470307/118‑1 (MQ=255) cacTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGC‑GCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGata > 1:1470307/1‑118 (MQ=255) acTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGC‑GCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTg > 1:1069903/1‑80 (MQ=255) acTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGC‑GCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTg < 2:1069903/80‑1 (MQ=255) tGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGC‑GCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGcc < 2:1593932/85‑1 (MQ=255) tGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGC‑GCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTAcc > 1:1593932/1‑85 (MQ=255) gCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGC‑GCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGa < 1:1461878/150‑1 (MQ=255) ttcACGTACCGCGGCTGGTGC‑GCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGAc < 1:629177/145‑1 (MQ=255) ttcACGTACCGCGGCTGGTGC‑GCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGAc > 2:629177/1‑145 (MQ=255) aCGTACCGCGGCTGGTGC‑GCCAGCGccagccgcggtacgtgaagaaggcagtggtgagttcgttc > 2:1080098‑M2/1‑25 (MQ=255) aCGTACCGCGGCTGGTGC‑GCCAGCGccagccgcggtacgtgaagaaggcagtggtgagttcgttc < 1:1080098‑M2/65‑41 (MQ=255) aCGTACCGCGGCTGGTGC‑GCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGACGGTTGTGc < 2:89218/150‑1 (MQ=255) gTACCGCGGCTGGTGC‑GCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACATGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAaggagg < 2:703479/100‑1 (MQ=255) gTACCGCGGCTGGTGC‑GCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACATGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAaggagg > 1:703479/1‑100 (MQ=255) cgcgGCTGGTGC‑GCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGACGGTTGTGCGGCTTg < 1:154727/150‑1 (MQ=255) cgcgGCTGGTGC‑GCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGACGGTTGTGCGGCTTg < 1:257723/150‑1 (MQ=255) gcgGCTGGTGC‑GCCAGCGccagcagcggtacgtgaagaaggcagtggtgagttcgttctcgccagtgatcaacgagccgatgcgcgactatctggac < 2:1072228‑M2/97‑80 (MQ=255) gcgGCTGGTGC‑GCCAGCGccagcagcggtacgtgaagaaggcagtggtgagttcgttctcgccagtgatcaacgagccgatgcgcgactatctggac > 1:1072228‑M2/1‑18 (MQ=255) tGGTGC‑GCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGACGGTTGTGCGGCTTGGACtt < 1:562412/149‑1 (MQ=255) tGGTGC‑GCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGACGGTTGTGCGGCTTGGACtt > 2:562412/1‑149 (MQ=255) agcgccagcAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTTATCAGCCGTTCCTGACGGTTGTGCGGCTTGGACTTGCCTGAATAc < 2:193715/150‑1 (MQ=255) | TCATTGACCAGGTTGCCGACCTGATAACGGTCGCAGGCGGCCAGGTACTGGCAGCCACGGTCCAGATAGTCGCGCATCGGCTCGTTGATCACTGGCGAGAACGAACTCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGC‑GCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGACGGTTGTGCGGCTTGGACTTGCCTGAATAC > NC_002947/1607097‑1607390 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |