New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1695753 = | 58 (0.970) | 6 (0.110) | 5/224 | NT | 11.3% | coding (388/648 nt) | PP_1491 | CheW domain‑containing protein |
? | NC_002947 | 1695786 = | 40 (0.720) | coding (421/648 nt) | PP_1491 | CheW domain‑containing protein |
GCCGAAATCGCCCCGTTGCAGGCGGTGCATTCATTGCCGCACCAGCGCTCGCGGCTGCTGCACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCTGATTCTGGCCGCCGAAGGCGGGCCGGTGGTGATGGCTGTCGAGGAAATCGACGGTATTCACCGGCTCGACCCGCAGTTGCTGGGCAGTGGCCGGGACGCCACACGCTTCACCGCCGCAG > NC_002947/1695639‑1695933 | gCCGAAATCGCCCCGTTGCAGGCGGTGCATTCATTGCCACACCAGCGCTCGCGGCTGCTGCACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCCCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGCAACGc > 2:1319855/1‑150 (MQ=255) gTTGCAGGCGGTGCATTCATTGCCGCACCAGCGCTCGCGGCTGCTGCACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGAt < 2:413746/150‑1 (MQ=255) gTTGCAGGCGGTGCATTCATTGCCGCACCAGCGCTCGCGGCTGCTGCACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGAt < 2:413740/150‑1 (MQ=255) gCAGGCGGTGCATTCATTGCCGCACCAGCGCTCGCGGCTGCTGCACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGATGcc < 2:340171/150‑1 (MQ=255) aGGCGGTGCATTCATTGCCGCACCAGCGCTCGCGGCTGCTGCACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGATGCCAc > 2:1294080/1‑150 (MQ=255) gCATTCATTGCCGCACCAGCGCTCGCGGCTGCTGCACGGGGTTGCCAATGTTGGTGGTTCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACCTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCt < 2:1118442/150‑1 (MQ=255) gCATTCATTGCCGCACCAGCGCTCGCGGCTGCTGCACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCt > 1:1033297/1‑150 (MQ=255) cattcattGCCGCACCAGCGCTCGCGGCTGCTGCACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGCAACGCa > 1:1047202/1‑124 (MQ=255) cattcattGCCGCACCAGCGCTCGCGGCTGCTGCACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGCAACGCa < 2:1047202/124‑1 (MQ=255) attcattGCCGCACCAGCGCTCGCGGCTGCTGCACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCGCTGAGCAACGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCTGa > 1:1320129/1‑150 (MQ=255) ccccgtgCACCAGCGCTCGCGGCTGCTGCACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGTGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCTGATTca > 1:302459/7‑149 (MQ=255) attGCCGCACCAGCGCTCGCGGCTGCTGCACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCTGATTCt > 1:838810/1‑150 (MQ=255) attGCCGCACCAGCGCTCGCGGCTGCTGCACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGACCAAGTCGCTCGGGGGGCAGGCCGGCTCCACCGAGAACCGAAGCGCGCGGGCGATGCCACGTATGCTGATTCt > 1:1264257/1‑150 (MQ=255) ttGCCGCACCAGCGCTCGCGGCTGCTGCACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGTACGTTCGACCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCTGATTCTg < 1:1276222/150‑1 (MQ=255) cACCAGCGCTCGCGGCTGCTGCACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTAGCTGACCTTCTCGGGGTGCAGGCGGGCTCTACCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCTGATTCTGgccgcc < 1:1434024/150‑1 (MQ=255) cggcgcTCGCGGCTGCTGCACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCTGATTCTGGCCGCCGaa > 1:1551312/3‑150 (MQ=255) gcgcTCGCGGCTGCTGCACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCTGATTCTGGCCGCCGAAgg < 2:1551312/150‑1 (MQ=255) ctgctgCACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCTGATTCTGGCCGCCGAAGGCGGGCCggtg < 2:1033297/150‑1 (MQ=255) ctgctgCACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCTGATTCTGGCCGCCGAAGGCGGGCCggtg < 1:55081/150‑1 (MQ=255) ccgcACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCTGATTCTGGCCGCCGAAGGCGGGCCGgtggtg > 1:917658/3‑150 (MQ=255) cACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCTGATTCTGGCCGCCGAAGGCGGGCCGGTGGTGCTg < 1:1645456/150‑1 (MQ=255) aCGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCTGATTCTGGCCGCCGAAGGCGGGCCGGTGGTGATgg > 2:1500270/1‑150 (MQ=255) ggggTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCTGATTCTGGCCGCCGAAGGCGGGCCGGTGGTGATGGCt > 2:1148172/1‑150 (MQ=255) gTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGAt > 2:1054629/1‑98 (MQ=255) gTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGAt < 1:1054629/98‑1 (MQ=255) gTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCTGGTTCTGGCCGCCGAAGGCGGGCCGGTGGTGATGGCTGTc < 1:440999/150‑1 (MQ=255) cAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGCGAGATCGTATGCTGATTCTGGCCGCCGAAGGCGGGCCGGTGGTGATGGCTGTCGAGGa > 2:1041935/1‑150 (MQ=255) ggTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCTGATTCTGGCCGCCGAAGGCGGGCCGGTGGTGATGGCTGTCGAGGAAATCGACGGt > 1:1242029/1‑150 (MQ=255) ggTGCGTCGCGGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCGCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCTTATTCTGGCCGCCGAAGGCGGGCCGGTGGTGATGGCTGTCGAGGAAATCGACGGt < 1:69915/150‑1 (MQ=255) gTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCTGATTCTGGCCGCCGAAGGCGGGCCGGTGGTGATGGCTGTCGAGGAAATCGACGGTa < 2:1242029/150‑1 (MQ=255) gTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCTGATTCTGGCCGCCGAAGGCGGGCCGGTGGTGATGGCTGTCGAGGAAATCGACGGTa > 2:782191/1‑150 (MQ=255) ttGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCt > 1:1260827/1‑89 (MQ=255) ttGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCt < 2:1260827/89‑1 (MQ=255) gccgtgccTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCTGATTCTGGCCGCCGAAGGCGGGCCGGTGGTGATGGCTGTCGAGGAAATCGACGGTATTCACCGGCt > 2:247320/1‑150 (MQ=255) ccgtgccTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCTGATTCTGGCCGCCGAAGGCGGGCCGGTGGTGATGGCTGTCGAGGAAATCGACGGTATTCACCGGCTc > 2:1337473/1‑150 (MQ=255) cgtgccTGTCACTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCTGATTCTGGCCGCCGAAGGCGGGCCGGTGGTGATGGCTGTCGAGGAAATCGACGGTATTCACCGGCTCg > 1:1460214/1‑150 (MQ=255) tgccTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCTGATTCTGGCCGCCGAAGGCGGGCCGGTGGTGATGGCTGTCGAGGAAATCGACGGTATTCACCGGCTCGAc < 2:1264257/150‑1 (MQ=255) gccTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCTGATTCTGGCCGCCGAAGGCGGGCCGGTGGTGATGGCTGTCGAGGAAATCGACGGTATTCACCGGCTCGAcc < 1:1500270/150‑1 (MQ=255) TTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCTGATTCTGGCCGCCGAAGGCGGGCCGGTGGTGATGGCTGTCGAGGAAATCGACGGTATTCAc > 2:1023110‑M1/1‑123 (MQ=255) TTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCTGATTCTGGCCGCCGAAGGCGGGCCGGTGGTGATGGCTGTCGAGGAAATCGACGGTATTCAc < 1:1023110‑M1/123‑1 (MQ=255) TTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCTGATTCTGGCCGCCGAAGGCGGGCCGGTGGTGATGGCTGTCGAGGAAATCGACGGTATTCACCGGCTCGACCCGCAGTTGCTGGGCAGt < 1:299623‑M1/150‑1 (MQ=255) TGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCTGATTCTGGCCGCCGAAGGCGGGCCGGTGGTGATGGCTGTCGAGGAAATCGACGGTATTCACCGGCTCGACCCGCAGTTGCTGGGCAGTg > 2:1320129‑M1/1‑150 (MQ=255) GCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGATCATATTTATGCTGATTCTGGCCGCCGAAGGCGGGCCGGTGGTGATGGCTGTCGAGGAAATCGACGGTATTCACCGGCTCGACCCGCAGTTGCTGGGCAGTgg > 1:1178814‑M1/1‑150 (MQ=255) tcggtggagccggcctgcaccccgagcaaCGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCTGATTCTGGCCGCCGAAGGc > 1:419463‑M2/30‑77 (MQ=255) tcggtggagccggcctgcaccccgagcaaCGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCTGATTCTGGCCGCCGAAGGc < 2:419463‑M2/48‑1 (MQ=255) cggtggagccggcctgcaccccgagcaaCGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCTGATTCTGGCCGCCGAAg < 1:426368‑M2/46‑1 (MQ=255) cggtggagccggcctgcaccccgagcaaCGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCTGATTCTGGCCGCCGAAg > 2:426368‑M2/29‑74 (MQ=255) tcggtggagccggcctgcaccgagcaaCGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCTGATTCTGGCCGCCGAAGGCGGGCCGGTGGTGATGGCTGTCGAGGAAAt < 2:833671‑M2/77‑1 (MQ=255) tcggtggagccggcctgcaccgagcaaCGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCTGATTCTGGCCGCCGAAGGCGGGCCGGTGGTGATGGCTGTCGAGGAAAt > 1:833671‑M2/28‑104 (MQ=255) aGGCCGGCTCCACCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCTGATTCTGGCCGCCGAAGGCGGGCCGGTGGTGATGGCTGTCGAGGAAATCGACGGTATTCACCGGCTCGACCCGCAGTTGCTGGGCAGTGGCCGGGACGCca > 2:438038/1‑150 (MQ=255) ggCCGGCTCCACCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCTGATTCTGGCCGCCGAAGGCGGGCCGGTGGTGATGGCTGTCGAGGAAATCGACg > 1:717531/1‑101 (MQ=255) ggCCGGCTCCACCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCTGATTCTGGCCGCCGAAGGCGGGCCGGTGGTGATGGCTGTCGAGGAAATCGACg < 2:717531/101‑1 (MQ=255) ccGGCTCCACCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCTGATTCTGGCCGCCGAAGGCGGGCCGGTGGTGATGGCTGTCGAGGAAATCGACGGTATTCACCGGCTCGACCCGCAGTTGCTGGGCAGTGGCCTGGACGCca < 2:887311/147‑1 (MQ=255) ccGGCTCCACCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCTGATTCTGGCCGCCGAAGGCGGGCCGGTGGTGATGGCTGTCGAGGAAATCGACGGTATTCACCGGCTCGACCCGCAGTTGCTGGGCAGTGGCCGGGACGCca > 1:887311/1‑147 (MQ=255) cACCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCTGATTCTGGCCGCCGAAGGCGGGCCGGTGGTGATGGCTGTCGAGGAAATCGACGGTATTCACCGGCTCGACCCGCAGTTGCTGGGCAGTGGCCGGGACGCCACACGCTTCAc > 2:1538702/1‑150 (MQ=255) aCCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCTGATTCTGGCCGCCGAAGGCGGGCCGGTGGTGATGGCTGTCGAGGAAATCGACgg < 2:389813/92‑1 (MQ=255) aCCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCTGATTCTGGCCGCCGAAGGCGGGCCGGTGGTGATGGCTGTCGAGGAAATCGACgg > 1:389813/1‑92 (MQ=255) aCCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCTGATTCTGGCCGCCGAAGGCGGGCCGGTGGTGATGGCTGTCGAGGAAATCGACGGTATTCACCGGCTCGACCCGCAGTTGCTGGGCAg > 1:440639/1‑125 (MQ=255) aCCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCTGATTCTGGCCGCCGAAGGCGGGCCGGTGGTGATGGCTGTCGAGGAAATCGACGGTATTCACCGGCTCGACCCGCAGTTGCTGGGCAg < 2:440639/125‑1 (MQ=255) gagcaaCGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCTGATTCTGGCCGCCGAAGGCGGGCCGGTGGTGATGGCTGTCGAGGAAATCGACGGTATTCACCGGCTCGACCCGCAGTTGCTGGGCAGTGGCCGGGACGCCACACGCTTCAccgcc > 1:222185‑M2/7‑150 (MQ=255) gagcaaCGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCTGATTCTGGCCGCCGAAGGCGGGCCGGTGGTGATGGCTGTCGAGGAAATCGACGGTATTCACCGGCTCGACCCGCAGATGCTGGGCAGTGGCCGGGACGCCACACGCTTCAccgcc > 1:1167659‑M2/7‑150 (MQ=255) caaCGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCTGATTCTGGCCGCCGAAGGCGGGCCGGTGGTGATGGCTGTCGAGGAAATCGACGGTATTCACCGGCTCGACCCGCAGTTGCTGGGCAGTGGCCGGGACGCCACACGCTTCACCGCCGCa < 1:1538702‑M2/147‑1 (MQ=255) caaCGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCTGATTCTGGCCGCCGAAGGCGGGCCGGTGGTGATGGCTGTCGAGGAAATCGACGGTATTCACCGGCTCGACCCGCAGTTGCTGGGCAGTGGCCGGGACGCCACACGCTTCACCGCCGCa < 2:1460214‑M2/147‑1 (MQ=255) aaCGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCTGATTCTGGCCGCCGAAGGCGGGCCGGTGGTGATGGCTGTCGAGGAAATCGACGGTATTCACCGGCTCGACCCGCAGTTGCTGGGCAGTGGCCGGGACGCcaca > 2:538488‑M2/3‑134 (MQ=255) aaCGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCTGATTCTGGCCGCCGAAGGCGGGCCGGTGGTGATGGCTGTCGAGGAAATCGACGGTATTCACCGGCTCGACCCGCAGTTGCTGGGCAGTGGCCGGGACGCcaca < 1:538488‑M2/132‑1 (MQ=255) aaCGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCTGATTCTGGCCGCCGAAGGCGGGCCGGTGGTGATGGCTGTCGAGGAAATCGACGGTATTCACCGGCTCGACCCGCAGTTGCTGGGCAGTGGCCGGGACGCCACACGCTTCACCGCCGCAg > 2:1233085‑M2/3‑150 (MQ=255) | GCCGAAATCGCCCCGTTGCAGGCGGTGCATTCATTGCCGCACCAGCGCTCGCGGCTGCTGCACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCTGATTCTGGCCGCCGAAGGCGGGCCGGTGGTGATGGCTGTCGAGGAAATCGACGGTATTCACCGGCTCGACCCGCAGTTGCTGGGCAGTGGCCGGGACGCCACACGCTTCACCGCCGCAG > NC_002947/1695639‑1695933 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |