| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | = 1747750 | 107 (1.790) | 8 (0.150) | 5/220 | NT | 7.2% | intergenic (‑200/+331) | PP_5473/PP_5474 | LuxR family transcriptional regulator/hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | = 1747789 | 108 (1.970) | intergenic (‑239/+292) | PP_5473/PP_5474 | LuxR family transcriptional regulator/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 135 total aligned reads displayed.
GAAGGCATTGCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTA > NC_002947/1747640‑1747938 | gaAGGCATTGCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGaa > 1:1587394/1‑150 (MQ=255)gaAGGCATTGCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGaa > 2:1542640/1‑150 (MQ=255) aTTGCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGGGCCTATAGTGATCGTGTCCAGTTTTGCTCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGGCTACCGCCCGGCCCAAGGGCAGGGCGAAcgtcac < 1:674491‑M2/150‑7 (MQ=255) aTTGCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAAcgtcac > 1:1528605‑M2/1‑144 (MQ=255) gCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAAcgtcacgac > 2:1633513‑M2/1‑141 (MQ=255) gcgAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCa > 2:1389588/1‑150 (MQ=255) gcgcCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCgg > 1:1047697/1‑150 (MQ=255) aGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTaa < 1:1522122/150‑1 (MQ=255) cTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGtt > 2:77915/1‑150 (MQ=255) cTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGtt > 1:245283/1‑150 (MQ=255) tCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCCGTCGGTTTAAGGTTg > 2:195436/1‑150 (MQ=255) cGGCCTAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTCCCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTga < 2:674491/150‑1 (MQ=255) gCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTgatg < 1:167444/150‑1 (MQ=255) 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aTTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATg < 1:47401/125‑1 (MQ=255) aTTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATg > 2:47401/1‑125 (MQ=255) aTTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGgc > 1:941903/1‑136 (MQ=255) aTTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCAc > 2:1325067/1‑150 (MQ=255) aTTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTAACTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGACCGTCACGACCGATGCAGTCAATGTAGTAGTTATCGTTATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCAc < 1:850407/150‑1 (MQ=21) tttttGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCg < 2:319779/95‑1 (MQ=255) 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tGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCg > 1:191217/1‑150 (MQ=255) gACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCgg < 1:1389588/150‑1 (MQ=255) cGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCggg < 1:1443595/150‑1 (MQ=255) gTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAAcgtcacgaccgatgcagcccacaccgagatcaaaaatggacacgatcactatcggcgcatggataggccacctcggccgaggcctggcgcctcgcgaattgcaatgccttctcga < 2:1638225‑M2/145‑116 (MQ=255) gTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAAcgtcacgaccgatgcagcccacaccgagatcaaaaatggacacgatcactatcggcgcatggataggccacctcggccgaggcctggcgcctcgcgaattgcaatgccttctcga > 1:1638225‑M2/1‑30 (MQ=255) tACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCa > 2:859715/1‑150 (MQ=255) ccTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGGCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATggg > 2:677328/1‑76 (MQ=255) cTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCAttt > 1:737080/1‑150 (MQ=255) ccGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATc > 1:1096516/1‑121 (MQ=255) cGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTc < 2:737080/150‑1 (MQ=255) ccAAGGGGAGGGTGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCt < 2:110614/150‑1 (MQ=255) ccAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCt < 1:369919/150‑1 (MQ=255) aGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGt > 1:2819/1‑95 (MQ=255) ggggAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGc > 1:1555316/1‑150 (MQ=255) gggAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCt < 2:1555316/150‑1 (MQ=255) gggCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTAc > 1:1494757/1‑150 (MQ=255) gCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATggg < 2:1113710/56‑1 (MQ=255) cGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTg < 1:195436/150‑1 (MQ=255) cGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTg < 2:183057/150‑1 (MQ=255) cGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTg < 1:853980/150‑1 (MQ=255) gAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTgg < 2:1047697/150‑1 (MQ=255) | GAAGGCATTGCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTA > NC_002947/1747640‑1747938 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |