| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 3947984 | 35 (0.580) | 3 (0.070) | 3/184 | NT | 7.6% | coding (109/1797 nt) | PP_3483 | type II secretion system protein |
| ? | NC_002947 | = 3948013 | 46 (1.000) | coding (80/1797 nt) | PP_3483 | type II secretion system protein | |||||
CCAGGCAGTCGAGCAGGCGCTCGTCAGTGGCTTGCAGACGGGCCTGGGCCAGGAGGTCGCGGGGGTAGGCGGAAATTTTTGCTGGGTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCTTTGCAGATTCCGGGGTTGCATCGAATGCTTCTGGCATGGCCTGCGACTCCGCTCAGGGGCGCGTCGCAGGCTGGCTCGGCCAGGGGTGCGGGCGCCGCTATTCCCCT > NC_002947/3947870‑3948162 | gatctcagtcgAGCAGGCGCTCGTCAGTGGCTTGCAGACGGGCCTGGGCCAGGAGGTCGCGGGGGTAGGCGGAAATTTTTGCTGGGTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATcctgtg > 2:1519195‑M2/6‑144 (MQ=255) cAGGCAGTCGAGCAGGCGCTCGTCAGTGGCTTGCAGACGGGCCTGGGCCAGGAGGTCGCGGGGGTATACCTAGATTTTTGCTGGGTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATcctgtgg > 1:848960‑M2/1‑143 (MQ=255) cAGGCAGTCGAGCAGGCGCTCGTCAGTGGCTTGCAGACGGGCCTGGGCCAGGAGGTCGCGGGGGTAGGCGGAAATTTTTGCTGGGTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATcctgtgg > 1:1584721‑M2/1‑143 (MQ=255) aGGCAGTCGAGCAGGCGCTCGTCAGTGGCTTGCAGACGGGCCTGGGCCAGGAGGTCGCGGGGGTAGGCGGAAATTTTTGCTGGGTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATcctgtggg < 1:1011233‑M2/150‑9 (MQ=255) aGTCGAGCAGGCGCTCGTCAGTGGCTTGCAGACGGGACTGGCTAAGGAGGACGCGGGGGTAGGCGGAAAGTTTTGCTGGGTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATcctgtggagatc < 1:1519195‑M2/150‑13 (MQ=255) ggcgaGCAGGCGCTCGTCAGTTGCTTGCAGACGGGCCTGGGCCAGGAGGTGGCGGGGGTAGGCGGAAATTTTTGCTGGGTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATcctgtgggagcgg > 2:595146‑M2/3‑137 (MQ=255) gTCGAGCAGGCGCTCGTCAGTGGCTTGCAGACGGGCCTGGGCCAGGAGGTCGCGGGGGTAGGCGGAAATTTTTGCTGGGTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATcctgtgggagcgg > 1:799602‑M2/1‑137 (MQ=255) gTCGAGCAGGCGCTCGTCAGTGGCTTGCAGACGGGCCTGGGCCAGGAGGTCGCGGGGGTAGGCGGAAATTTTTGCTGGGTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATcctgtgggagcgg > 1:799490‑M2/1‑137 (MQ=255) gAGCAGGCGCTCGTCAGTGGCTTGCAGACGGGCCTGGGCCAGGAGGTCGCGGGGGTAGGCGGAAATTTTTGCTGGGTTCTTCGCGGGCATGCCCGCCACCACGAGTACATCAAAGGTCTGTGGGCTGCATACATcctgtcggagcgggcc < 2:543823‑M2/150‑17 (MQ=255) gacggagcTCGTGGGGGGGTTGCAGGCGGGGCTGGGCCAGGGGGTCGCGGGGGTAGGCGGAAATGTTTGCTGGGTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATCCTGTGGGAGCGGGCATg < 2:335557/144‑1 (MQ=38) cAGGCGCTCGTCAGTGGCTTGCAGACGGGCCTGGGCCAGGAGGTCGCGGGGGTAGGCGGAAATTTTTGCTGGGTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTCGGCTGCATACATcctgtgggagcgggcatgc > 2:1011233‑M2/1‑131 (MQ=255) tCGTCAGTGGCTTGCAGACGGGGCTGCGCCAGGAGGCCGGGGGGGTAGGCGGAAATTTTTGCTGGGTTCTTCGCGGGCATGCGCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATcctgtgggagcgggcatgcccgcgaa > 2:956427‑M2/1‑124 (MQ=255) cttcaaGACGGGCCTGGGCCAGGAGGTCGCGGGGGTAGGCGGAACAGTGGGCTGGGTTCTTCGCGGGCATCCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCCGTGGGCTGCATACCTCCTGTGGGAGCGAGCATGCCAGCGAAGCCGCCGGTg > 2:1143145/6‑150 (MQ=255) gCCAGGAGGTCGCGGGGGTAGGAGGAAATTTTTGCTGGGTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCGACAGGTATATCACAGGTCTGTGGTCTGCATACATCCTGAGGGATCGGGCATGGGCGCAGAGAGGTCGGGGCAGGCTTTGCAGATTcc > 2:837735/1‑150 (MQ=255) cAGGAGGTCGCGGGGGTAGGCGGAAATTTTTGCTGGGTTCTTCGCGGGCATGCCCGCGGCCACAGGTACACAACAGATCTGTGGGCTGGAAAGATAGTGATGAGGGGTGCGTCCCCGCGAGGACGTGGGGGCAGGCTTTGCAGAATCCgg > 2:457478/1‑150 (MQ=255) gaggTCGCGGGGGTAGGCGGAAATTTTTGCTGGGTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATcctgt > 1:1607424‑M2/1‑92 (MQ=255) gaggTCGCGGGGGTAGGCGGAAATTTTTGCTGGGTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATcctgt < 2:1607424‑M2/97‑6 (MQ=255) gTCGCGGGGGTAGGCGGAAATTTTTGCTGGGTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATcctgtggga > 1:1350465‑M2/1‑89 (MQ=255) gTCGCGGGGGTAGGCGGAAATTTTTGCTGGGTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATcctgtggga < 2:1350465‑M2/98‑10 (MQ=255) gggggTAGGCGGAAATTTTTGCTGGGTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTCCATACATcctgtgggagcgggcatgccc < 2:809492‑M2/105‑22 (MQ=255) gggggTAGGCGGAAATTTTTGCTGGGTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTCCATACATcctgtgggagcgggcatgccc > 1:809492‑M2/1‑84 (MQ=255) gtggTAGGCGGAAATTTTTGCTGGGTTCTGCGCGGGCAGGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATTCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCTTTGCAGATTCCGGGGTTGCATCGaa < 1:968990/148‑1 (MQ=255) gTAGGCGGAAATTTCTGCTGGGTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCACACAGGTACATCACAGGTCTGGGGGCTGCATACATCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCGTTGCAGATTCCGGGGTTGCCTGGAATGc > 2:433260/1‑150 (MQ=39) gccgagaTTTGTACTGCGTTTGTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACGGGTACTGCACAGGTCTGCGGGATGCCTACATCCGGTGTGAGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCTTTGCAGATTCCGGGGTTGCATCGAATGCTTCt < 1:585416/144‑1 (MQ=255) gCGGAAATTTTTGCTGGGTTCTTCGCCGGAGTGCCCGCTCCGACAGGTACATAACCGTTCTGTGTGCTGCATACATCCTGTGGGAGCGGGCATGCGCGCGAGGACGTCGGTGCAGGCTTTGCAGATTCCGGGGTTGCATCGAATGCTTCt > 1:42560/1‑150 (MQ=255) cGGAAATTTTTGCTGGGTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATcctgtgggagcgggcat < 2:330464‑M2/92‑18 (MQ=255) cGGAAATTTTTGCTGGGTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATcctgtgggagcgggcat > 1:330464‑M2/1‑75 (MQ=255) ctttttGCTGGGTTCTTCGCGGGCATGCTCGCTCCCACAGGTCAAAAATTGGCTAGGTGTTTTCATACATCCTGTGGGCGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCTTTGCAGATTCCGGGGTTGCATCGAATGCTTCTGGCATg < 2:42560/149‑1 (MQ=255) gttttGAGGGGTTCTTTGCGGGCATGCCCGCTCGCAAAGGTATATCACAGGTCTGTGGATGTCTTACATCCTGTGGGCGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCTTTGCAGATTCCGGGGTTGCATCGAATGCTTCTGGCATgg < 1:837735/149‑1 (MQ=255) ttgttgGGTTTTGCGCGGGCATGCCCGCTCCCACGGGTCCCGCGCAGGTCTGTGGGCTGCATACATGCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCTTTGCAGATTCCGGGGTTGCATCGAATGCTTCTGGCATGGCCt < 1:543823/150‑1 (MQ=255) cTGGGTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCTTTGCAGATTCCGGGGTTGCATCGAATGCtt > 2:310971/1‑135 (MQ=255) cTGGGTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCTTTGCAGATTCCGGGGTTGCATCGAATGCtt < 1:310971/135‑1 (MQ=255) ggTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCTTTGCAGATTCCGGGGTTGCATCGAATGCTTCTGGCATGGCCTGCGACt > 1:96465/1‑150 (MQ=255) gTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATCCTGTGGGAGCGTGCATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCGGGCTTTGCAGAGTCAGGGGTTGCATCGAATGCTTCTGGCATGGCCTGCGACTc > 1:1248631/1‑150 (MQ=255) tcttcGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATCCTGTGAGAGCGGGCCAGACCGAAAAGAACGCGAGTAAGGCGTTGCAGAGGCCGGGTTTTCATCGAATGTTTGTGGCATGGCCTGCGACGCCg > 2:595055/1‑150 (MQ=19) ttcGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGCGGGCTGTCTACATCCCGTGGGAGCGGGCATGTCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCTTTGCAGATTCCGGGGATGCAAGTAATGCGTCTGTCATGGCCTGCGACTCCGCt > 1:1519340/1‑150 (MQ=37) gCATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATcctgtgggagcgggcatgcccgcgaagaacccagcaaaaatttccgcctac > 2:1040172‑M2/1‑48 (MQ=255) gCATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATcctgtgggagcgggcatgcccgcgaagaacccagcaaaaatttccgcctac < 1:1040172‑M2/99‑52 (MQ=255) gCATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCTTTGCAGATTCCGGGGTTGCATCGAATGCTTCTGGCATGGCCTGCGACTCCGCTCa > 1:1047133/1‑145 (MQ=255) gCATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCTTTGCAGATTCCGGGGTTGCATCGAATGCTTCTGGCATGGCCTGCGACTCCGCTCa < 2:1047133/145‑1 (MQ=255) aTGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGAACCGTGGGCTGCATACATCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCTTTGCAGATTCCGGGGTTGCATCGAATGCTTCTGGCATGGCCTGCGACTCCGCTCAGGGgcgc > 1:41796/1‑150 (MQ=255) gCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCTTTGCAGATTCCGGGGTTGCATCGAATGCTTCTGGCATGGCCTGCGACTCCGCTCAgg < 1:853732/143‑1 (MQ=255) gCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCTTTGCAGATTCCGGGGTTGCATCGAATGCTTCTGGCATGGCCTGCGACTCCGCTCAgg > 2:853732/1‑143 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAc > 1:616528/1‑71 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAc < 2:616528/71‑1 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCTTTGCAGATTCCGGGGTTGCATCGAATGCTTc < 2:370686/115‑1 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCTTTGCAGATTCCGGGGTTGCATCGAATGCTTc > 1:370686/1‑115 (MQ=255) cGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATcctgtgggagcgggcatgcccgcgaagaacccagcaaaaatttccgcctacccccgcgacctcctggcccaggcccgtctgcaagccactgacgagcgcctgctcgact < 1:581182‑M2/150‑110 (MQ=255) tCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCTTTGCAGATTCCGGGGTTACATCGACTGCATGTGTGTTTGCCGGCGACTCCGCTCAGGGGCGCGTCGCAgg > 2:130541/1‑150 (MQ=255) ccACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCTTTGCAGATTCCGGGGTTGCATCGAATGCTTCTGGCATGGCCTGCGACTCCGCTCAGGGGCGCGTCGCAggct > 1:1079227/1‑150 (MQ=255) ccACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCTTTGCAGATTCCGGGGTTGCATCGAATGCTTCTGGCATGGCCTGCGACTCCGCTCAGGGGCGCGTCGCAggct > 1:1481263/1‑150 (MQ=255) cacaGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATcctgtgggagcgggcatgcccgcgaaga < 2:335697‑M2/63‑29 (MQ=255) cacaGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATcctgtgggagcgggcatgcccgcgaaga > 1:335697‑M2/1‑35 (MQ=255) acaGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCTTTGCAGATTCCGGGGTTGCATCGAATGCTTCTg > 1:126284/1‑109 (MQ=255) acaGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCTTTGCAGATTCCGGGGTTGCATCGAATGCTTCTg < 2:126284/109‑1 (MQ=255) acaGGTACATCACAGGGCTGTGGGCTGCATACCTCCTGTGGGCGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCTTTGCAGATTCCGGGGTTGCATCGAATGCTTCTGGCATGGCCTGCGACTCCGCTCAGGGGCGCGTCGCAggctgg < 2:96465/150‑1 (MQ=255) cagaGGTCTGTCGGCCGCACACGTCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCTTTGCAGATTCCGGGGTTGCATCGAATGCTTCTGGCATGGCCTGCGACTCCGCTCAGGGGCGCGTCGCAGGCTGGCTCGGCCAgg < 1:595055/147‑1 (MQ=255) cacaGGTCTGTGGGCTGCATACATCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCTTTGCAGATTCCGGGGTTGCATCGAATGCTTCTGGCATGGCCTGCGACTCCGCTCAGGGGCGCGTCGCAGGCTGGCTCGGCCAgg > 2:67377/1‑150 (MQ=255) ccaGGTCTGTGGCCTGCATACACCCTGTGGTAGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCTTTGCAGATTCAGGGGTTGCATCGAATGCTTCTGGCATGGCCTGCGACTCCGCTCAGGGGCGCGTCGCAGGCTGGCTCGGCCAggg < 2:1248631/149‑1 (MQ=255) acaGGTCTGTGGGCTGCATACATCCTGTGGGAGCGGGCCTGCGCGTATCTTTACCGGTTCAGGCTTTGCAGATTCCGGGGTTGCATCGAATGCTTCTGGCATGGCCTGCGACTCCGCTCAGGGGCGCGTCGCAGGCTGGCTCGGCCAggg < 2:41796/150‑1 (MQ=255) acaGGTCTGTGGGCTGCATACATCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCTTTGCAGATTCCGGGGTTGCATCGAATGCTTCTGGCATGGCCTGCGACTCCGCTCAGGGGCGCGTCGCAGGCTGGCTCGGCCAggg > 1:843741/1‑150 (MQ=255) caGGTCTGTGGGCTGCATACATCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCTTTg < 2:1149115/67‑1 (MQ=255) caGGTCTGTGGGCTGCATACATCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCTTTg > 1:1149115/1‑67 (MQ=255) gggTCTGTGGGCTGCATACATCCTGTGGGGGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCTTTGCAGATTCCGGGGTTGCATCGAATGCTTCTGGCATGGCCTGCGACTCCGCTCAGGGGCGCGTCGCAGGCTGGCTCGGCCAGGGGt < 2:1572825/149‑1 (MQ=255) ggTCTGTGGGCTGCATACATCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCTTTGCAGATTCCGGGGTTGCATCGAATGCTTCTGGCATGGCCTGCGACTCCGCTCAGGGGCGCGTCGCAGGCTGGCTCGGCCAGGGGTg > 1:452175/1‑150 (MQ=255) gTCTGTGGGCTGCATACATCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCTTTGCAGATTCCGGGGTTGCATCGAATGCTTCTGGCATGGCCTGCGACTCCGCTCAGGGGCGCGTCGCAggctggc < 1:298043/136‑1 (MQ=255) gTCTGTGGGCTGCATACATCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCTTTGCAGATTCCGGGGTTGCATCGAATGCTTCTGGCATGGCCTGCGACTCCGCTCAGGGGCGCGTCGCAggctggc > 2:298043/1‑136 (MQ=255) tGCATACATCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCTTTGCAGATTCCGGGGTTGCATCGACCGGCCTTCGCATCGCCTGCGGCGCCGCTCAGGGGCGCGTCGAAGGCTGGCTCGGCCAGGGGTGCGGGCGCCGCt > 1:1264399/1‑150 (MQ=255) tcATACATCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCTTTGCAGATTCCGGGGTTGCATCGAATGCTTCTGGCATGGCCTGCGACTCCGCTCAGGGGCGCGTCGCAGGCTGGCTCGGCCAGGGGTGCGGGCGCCGCTa < 2:1377849/149‑1 (MQ=255) gCATACATCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCTTTGCAGATTCCGGGGTTGCATCGAATGCTTCTGGCATGGCCTGCGACTCCGCTCAGGGGCGCGTCGCAGGCTGGCTCGGCCAGGGGTGCGGGCGCCGCTa < 2:1519340/150‑1 (MQ=255) aTACATCCTGTGGGAGCGGGTATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGATTGCAAAATTCCGGGGTTGCATCGAATGCTTCTGGCATGGCCTGCGACTCCCCTCAGGGGCGCGTCGCAGGCTGGCTCGGCCAGGGGTGCGGGCGCCGCTAtt > 1:707044/1‑150 (MQ=255) aTACATCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCTTTGCAGATTCCGGGGTTGCATCGAATGCTTCTGGCATGGCCTGCGACTCCGCTCAGGGGCGCGTCGCAGGCTGGCTCGGCCAGGGGt > 1:1188328/1‑135 (MQ=255) aTACATCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCTTTGCAGATTCCGGGGTTGCATCGAATGCTTCTGGCATGGCCTGCGACTCCGCTCAGGGGCGCGTCGCAGGCTGGCTCGGCCAGGGGt < 2:1188328/135‑1 (MQ=255) aTCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCTTTGCAGATTCCgg < 1:1469700/57‑1 (MQ=255) aTCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCTTTGCAGATTCCgg > 2:1469700/1‑57 (MQ=255) tCCTGTGTGAGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCTTTGCAGATTCCGGGGTTGCATCGAATGCTTCTGGCATGGCCTGCGACTCCGCTCAGGGGCGCGTCGCAGGCTGGCTCGGCCAGGGGTGCGGGCGCCGCTATTCCCCt < 1:433260/150‑1 (MQ=255) tCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCTTTGCAGATTCCGGGGTTGCATCGAATGCTTCTGGCATGGCCTGCGACTCCGCTCAGGGGCGCGTCGCAGGCTGGCTCGGCCAGGGGTGCGGGCGCCGCTATTCCCCt < 2:843741/150‑1 (MQ=255) | CCAGGCAGTCGAGCAGGCGCTCGTCAGTGGCTTGCAGACGGGCCTGGGCCAGGAGGTCGCGGGGGTAGGCGGAAATTTTTGCTGGGTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACATCACAGGTCTGTGGGCTGCATACATCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGACGTCGGTGCAGGCTTTGCAGATTCCGGGGTTGCATCGAATGCTTCTGGCATGGCCTGCGACTCCGCTCAGGGGCGCGTCGCAGGCTGGCTCGGCCAGGGGTGCGGGCGCCGCTATTCCCCT > NC_002947/3947870‑3948162 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |