New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4572333 | 75 (1.250) | 7 (0.120) | 6/228 | NT | 8.7% | coding (2153/2775 nt) | treY | maltooligosyl trehalose synthase |
? | NC_002947 | = 4572365 | 75 (1.320) | coding (2185/2775 nt) | treY | maltooligosyl trehalose synthase |
AGAAGGCCCTGCGCGAGGCCAAGCTGCGCAGTAGCTGGAGCGCGCCGAACGAGGCCTACGAAGGCGCCTGCGCTCATTACCTCGACGGCCTGCTGCTGGACAGCGAGAACCAGCAACTGCGCAAGTCGCTGGCCGACGCGGCGCAGCTGCTGGCCTGCCCCGGCGCTCTCAATGGCCTGGTCCA‑GGCCCTGTTGCGCATGACCACACCCGGTGTGCCCGACCTGTACCAGGGTAACGAATACTGGGACTTCAGCCTGGTCGACCCGGACAACCGCCGCGCCGTGGACTACGCTT > NC_002947/4572219‑4572512 | aGAAGGCCCTGCGCGAGGCCAAGCTGCGCAGTAGCTGGAGCGCGCCGAACGAGGCCTACGAAGGCGCCTGCGCTCATTACCTCGACGGCCTGCTGCTGGACAGCGAGAACCAGCAACTGCGCAAGTCGCTGGCCGACGCGGCGCAGCtgc < 1:1303942‑M2/150‑4 (MQ=255) ggCCCTGCGCGAGGCCAAGCTGCGCAGTAGCTGGAGCGCGCCGAACGAGGCCTACGAAGGCGCCTGCGCTCATTACCTCGACGGCCTGCTGCTGGACAGCGAGAACCAGCAACTGCGCAAGTCGCTGGCCGACGCGGCGCAGCTGCTGGc < 2:6569/150‑1 (MQ=255) gAGGCCAAGCTGCGCAGTAGCTGGAGCGCGCCGAACGAGGCCTACGAAGGCGCCTGCGCTCATTACCTCGACGGCCTGCTGCTGGACAGCGAGAACCAGCAACTGCGCAAGTCGCTGGCCGACGCGGCGCAGCtg < 2:1311664‑M2/135‑3 (MQ=255) gAGGCCAAGCTGCGCAGTAGCTGGAGCGCGCCGAACGAGGCCTACGAAGGCGCCTGCGCTCATTACCTCGACGGCCTGCTGCTGGACAGCGAGAACCAGCAACTGCGCAAGTCGCTGGCCGACGCGGCGCAGCtg > 1:1311664‑M2/1‑133 (MQ=255) ccAAGCTGCGCAGTAGCTGGAGCGCGCCGAACGAGGCCTACGAAGGCGCCTGCGCTCATTACCTCGACGGCCTGCTGCTGGACAGCGAGAACCAGCAACTGCGCAAGTCGCTGGCCGACGCGGCGCAGCTGCTGGCCTGCCCCGGCGctc > 2:1126815/1‑150 (MQ=255) ccAAGCTGCGCAGTAGCTGGAGCGCGCCGAACGAGGCCTACGAAGGCGCCTGCGCTCATTACCTCGACGGCCTGCTGCTGGACAGCGAGAACCAGCAACTGCGCAAGTCGCTGGCCGACGCGGCGCAGCTGCTGGCCTGCCCCGGCGctc > 1:349649/1‑150 (MQ=255) cAAGCTGCGCAGTAGCTGGAGCGCGCCGAACGAGGCCTACGAAGGCGCCTGCGCTCATTACCTCGACGGCCTGCTGCTGGACAGCGAGAACCAGCAACTGCGCAAGTCGCTGGCCGACGCGGCGCAGCTGCTGGCCTGcc > 1:439465/1‑140 (MQ=255) cAAGCTGCGCAGTAGCTGGAGCGCGCCGAACGAGGCCTACGAAGGCGCCTGCGCTCATTACCTCGACGGCCTGCTGCTGGACAGCGAGAACCAGCAACTGCGCAAGTCGCTGGCCGACGCGGCGCAGCTGCTGGCCTGcc < 2:439465/140‑1 (MQ=255) cAAGCTGCGCAGTAGCTGGAGCGCGCCGAACGAGGCCTACGAAGGCGCCTGCGCTCATTACCTCGACGGCCTGCTGCTGGACAGCGAGAACCAGCAACTGCGCAAGTCGCTGGCCGACGCGGCGCAGCTGCTGGCCTGCCCCGGCGctct > 2:1020122/1‑150 (MQ=255) aaGCTGCGCAGTAGCTGGAGCGCGCCGAACGAGGCCTACGAAGGCGCCTGCGCTCATTACCTCGACGGCCTGCTGCTGGACAGCGAGAACCAGCAACTGCGCAAGTCGCTGGCCGACGCGGCGCAGCTGCTGGCCTGcc > 1:1424549/1‑139 (MQ=255) aaGCTGCGCAGTAGCTGGAGCGCGCCGAACGAGGCCTACGAAGGCGCCTGCGCTCATTACCTCGACGGCCTGCTGCTGGACAGCGAGAACCAGCAACTGCGCAAGTCGCTGGCCGACGCGGCGCAGCTGCTGGCCTGcc < 2:1424549/139‑1 (MQ=255) gcAGTAGCTGGAGCGCGCCGAACGAGGCCTACGAAGGCGCCTGCGCTCATTACCTCGACGGCCTGCTGCTGGACAGCGAGAACCAGCAACTGCGCAAGTCGCTGGCCGACGCGGCGCAGCTGCTGGCCTGCCCCGGCGCTCTCAATGGcc > 2:612090/1‑150 (MQ=255) aGTAGCTGGAGCGCGCCGAACGAGGCCTACGAAGGCGCCTGCGCTCATTACCTCGACGGCCTGCTGCTGGACAGCGAGAACCAGCAACTGCGCAAGTCGCTGGCCGACGCGGCGCAGCTGCTGGCCTGCCCCGGCGCTCTCAATGGCTTg < 2:698639/150‑1 (MQ=255) tGGAGCGCGCCGAACGAGGCCTACGAAGGCGCCTGCGCTCATTACCTCGACGGCCTGCTGCTGGACAGCGAGAACCAGCAACTGCGCAAGTCGCTGGCCGACGCGGCGCAGCTGCTGGCCTGCCCCGgcg < 2:1045271/130‑1 (MQ=255) tGGAGCGCGCCGAACGAGGCCTACGAAGGCGCCTGCGCTCATTACCTCGACGGCCTGCTGCTGGACAGCGAGAACCAGCAACTGCGCAAGTCGCTGGCCGACGCGGCGCAGCTGCTGGCCTGCCCCGgcg > 1:1045271/1‑130 (MQ=255) cgcgcCGAACGAGGCCTACGAAGGCGCCTGCGCTCATTACCTCGCCGGCCTGCTGCTGGCCCGCGAGAACCTGCAACTGCGGGTTTCGCTGGCCGTCGCGTCGCAGCTGCTGGGCTGCCCCGGCGCTCTCAATGGCCTGGACCA‑GGccat < 2:596868/150‑3 (MQ=255) gcCGAACGAGGCCTACGAAGGCGCCTGCGCTCATTACCTCGACGGCCTGCTGCTGTACAGCGAGAACCAGCAACTGCGCAAGTCGCTGGCCGACGCGGCGCAGCTGCTGGCCTGCCCCGGCGCTCTCAATGGCCTGGTCCA‑GGCCCTGtt > 2:844780/1‑150 (MQ=255) gcCGAACGAGGCCTACGAAGGCGCCTGCGCTCATTACCTCGACGGCCTGCTGCTGGACAGCGAGAACCAGCAACTGCGCAAGTCGCTGTCCGACGCGGCGCAGCTGCTGGCCTGCCCCGGCGCTCTCAATGGCCGGGTCCA‑GGCCCGGtt > 1:639169/1‑150 (MQ=255) gcCGAACGAGGCCTACGAAGGCGCCTGCGCTCATTACCTCGACGGCCTGCTGCTGGACAGCGAGAACCAGCAACTGCGCAAGTCGCTGGTCGACGCGGCGCAGCTGCTGGCCTGCCCCGGCGCTCTCAATg < 1:886844/131‑1 (MQ=255) gcCGAACGAGGCCTACGAAGGCGCCTGCGCTCATTACCTCGACGGCCTGCTGCTGGACAGCGAGAACCAGCAACTGCGCAAGTCGCTGGTCGACGCGGCGCAGCTGCTGGCCTGCCCCGGCGCTCTCAATg > 2:886844/1‑131 (MQ=255) 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(MQ=255) cTGCGCTCATTACCTCGACGGCCTGCTGCTGGACAGCGAGAACCAGCAACTGCGCAAGTCGCTGGCCGACGCGGCGCAGCtgctg > 2:554130‑M2/1‑80 (MQ=255) cTGCGCTCATTACCTCGACGGCCTGCTGCTGGACAGCGAGAACCAGCAACTGCGCAAGTCGCTGGCCGACGCGGCGCAGCTGCTGGCCTGCCCCGGCGCTCTCAATGGCCTGGTCCA‑GGCCCTGTTGCGCATGACCACACCCGGTGTGcc > 2:885401/1‑150 (MQ=255) tGCGCTCATTACCTCGACGGCCTGCTGCTGGACAGCGAGAACCAGCAACTGCGCAAGTCGCTGGCCGACGCGGCGCAGCTGCTGGCCTGCCCCGGCGCTCTCAATGGCCTGGTCCA‑GGCCCTGTTGCGCATGACCACACCCGGTGTGccc > 2:1299546/1‑150 (MQ=255) tGCGCTCATTACCTCGACGGCCTGCTGCTGGACAGCGAGAACCAGCAACTGCGCAAGTCGCTGGCCGACGCGGCGCAGCTGCTGGCCTGCCCCGGCGCTCTCAATGGCCTGGTCCA‑GGCCCTGTTGCGCATGACCACACCCGGTGTGccc < 1:1602554/150‑1 (MQ=255) cgcTCATTACCTCGACGGCCTGCTGCTGGACAGCGAGAACCAGCAACTGCGCAAGTCGCTGGCCGACGCGGCGCAGCTGCTGGCCTGCCCCGGCGCTCTCAATGGCCTGGTCCA‑GGCCCTGTTGCGCATGACCACACCCGGTGTGCCCGa < 1:34937/150‑1 (MQ=255) gcTCATTACCTCGGCGGCCTGCGGGGGGACAGCGAGAACCAGCAACTGCGCAAGTCGCTGGCAGACCGGACGCAGCTGCTGGCCTGCCCCGGCGCTCTCAATGGCCTGGTCCA‑GGCCCTGTTGCGCATGACCACACCCGGTGTGCCCGAc < 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ccccggcGGCCCGGTGGTGGACAGCGGGAACCGGCAAGTGCGCAAGTCGCTGGTCGGCTGGGCGCAGCTGCTGGGCTGCCCCGGCGCTCTCAATGGGCTGGTCCA‑GGCTCTGTTGCCCATGACCACTACCGGTGTCCTCGACCTGTAccc < 2:355751/144‑2 (MQ=255) ccTCGACGGCCTGCTGCTGGACAGCGAGAACCAGCAACTGCGCACGTCGCTGGCCGAGGCGGCGCAGCTGCTGGCCTGCCCCGGCGCTCTCAATGGCCTGGTCCA‑GGCCCTGTTGCGCATGACCACACCCGGTGTGCCCGACCTGTACCa < 2:356087/150‑1 (MQ=255) gtccTGCTGCTGGACAGCGAGAACCAGCAACTGCGCAAGTCGCTGGCCGACGCGGCGCAGCTGCTGGCCTGCCCCGgc > 1:384060/3‑78 (MQ=255) gtccTGCTGCTGGACAGCGAGAACCAGCAACTGCGCAAGTCGCTGGCCGACGCGGCGCAGCTGCTGGCCTGCCCCGgc < 2:384060/76‑1 (MQ=255) ggCCTGCTGCTGGACAGCGAGAACCAGCAACTGCGCAAGTCGCTGGCCGACGCGGCGCAGCTGCTGGCCTGCCCCGGCGCTCTCAATGGCCTGGTCCA‑GGCCCTGTTGCGCATGACCACACCCGGTGTGCCCGACCTGTACCAGGGTAAc < 1:1262232/150‑1 (MQ=255) ggCCTGCTGCTGGACAGCGAGAACCAGCAACTGCGCAAGTCGCTGGCCGACGCGGCGCAGCTGCTGGCCTGCCCCGGCGCTCTCAATGGCCTGGTCCA‑GGCCCTGTTGCGCATGACCACACCCGGTGTGCCCGACCTGTACCAGGGTAAc < 2:97156/150‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |