| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 4964988 = | 63 (1.050) | 4 (0.070) | 4/230 | NT | 6.0% | coding (415/1476 nt) | fleQ | transcriptional regulator FleQ |
| ? | NC_002947 | 4965012 = | 66 (1.150) | coding (391/1476 nt) | fleQ | transcriptional regulator FleQ | |||||
CTTGCCGGTGCCGGACTCACCCAGGATCAGCACGCTGGCGTCGGTATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTGCGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTC‑G‑‑‑CGC‑GCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGAGTCCAGCAATTGGCTGTAGCTTGGCGGCATTTCCAGGTTGGAAAGCACCCGGCGGCGAAGGTCTTCCGGCAGCTCGGCGGAAGAAATTTCACCTAAAAGCAAAACC > NC_002947/4964863‑4965160 | cTTGCCGGTGCCGGACTCACCCAGGATCAGCACGCTGGCGTCGGTATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTGCGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTC‑g‑‑‑cgc‑gc > 1:1126950/1‑150 (MQ=255) cggtgccggACTCACCCAGGATCAGCACGCTGGCGTCGGTATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTGCGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTC‑G‑‑‑CGC‑GCCTGGt < 2:76145/150‑1 (MQ=255) gACTCACCCAGGATCAGCACGCTGGCGTCGGTATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTGCGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTC‑G‑‑‑CGC‑GCCTGGTCATACAtt > 1:1067435/1‑150 (MQ=255) tCACCCAGGATCAGCACGCTGGCGTCGGTATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTGCGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTC‑G‑‑‑CGC‑GCCTGGTCATACATTTcg > 2:1359451/1‑150 (MQ=255) cACCCAGGATCAGCACGCTGGCGTCGGTATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTTGTGCCAACCATGCTTCGGAATAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTC‑G‑‑‑CGC‑GCCTGGTCATACATTTcgc < 1:1019323/150‑1 (MQ=255) aCCCAGGATCAGCACGCTGGCGTCGGTATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTGCGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTC‑G‑‑‑CGC‑GCCTGGTCATACATTTcgcg < 1:1486483/150‑1 (MQ=255) ccAGGATCAGCACGCTGGCGTCGGTATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTGCGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTC‑G‑‑‑CGC‑GCCTGGTCATACATTTCGCGGt > 2:923945/1‑150 (MQ=255) gATCAGCACGCTGGCGTCGGTATCCGCCATTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGTTGCCAACCAGGCTGCGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTC‑G‑‑‑CGC‑GCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGAc > 2:1147127/1‑150 (MQ=255) gATCAGCACGCTGGCGTCGGTATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTGCGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTC‑G‑‑‑CGC‑GCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGAc < 2:567875/150‑1 (MQ=255) aaTCAGCACGCCGGCGTTGGTATCCGCCACTTGCTGCAGCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTAGTGCCAACCAAGCTGCGGAACAGATTGGGTTCGCGCTTGCGATCCCGCTA‑G‑‑‑CGC‑GCATGGTCATACATTTCCCTCTAGAc < 2:285149/149‑1 (MQ=255) aGCACGCTGGCGTCGGTATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTGCGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTC‑G‑‑‑CGC‑GCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCtag > 2:1235737/1‑148 (MQ=255) gCACGCTGGCGTCGGTATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTGCGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTC‑G‑‑‑CGC‑GCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTggg > 2:1554511/1‑150 (MQ=255) gCTGGCGTCGGTATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTGCGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTC‑G‑‑‑CGC‑GCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACg < 1:1359451/150‑1 (MQ=255) gCTGGCGTCGGTATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTGCGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTC‑G‑‑‑CGC‑GCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACg < 2:180626/150‑1 (MQ=255) tGGCGTCGGTATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTGCGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTC‑G‑‑‑CGC‑GCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGt > 2:73473/1‑150 (MQ=255) gTCGGTATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTGCGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTC‑G‑‑‑CGC‑GCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAg > 1:24846/1‑150 (MQ=255) tCGGTATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTGCGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTC‑G‑‑‑CGC‑GCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGc < 1:1261967/150‑1 (MQ=255) tCGGTATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTGCGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTC‑G‑‑‑CGC‑GCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGc < 1:1147127/150‑1 (MQ=255) tATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTGCGGAACAGATTGGGTTCGCGCCGGCGACCCCGCTC‑G‑‑‑CGC‑GCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGAGt > 2:1370495/1‑150 (MQ=255) ccGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTGCGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTC‑G‑‑‑CGC‑GCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGAGTCCa < 2:62757/150‑1 (MQ=255) gCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTGCGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTC‑G‑‑‑CGC‑GCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGc > 2:201824/1‑141 (MQ=255) gCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTGCGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTC‑G‑‑‑CGC‑GCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGc < 1:201824/141‑1 (MQ=255) gCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTGCGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTC‑G‑‑‑CGC‑GCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGAGTCCAGc < 1:1554511/150‑1 (MQ=255) gCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTGCGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTC‑G‑‑‑CGC‑GCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGAGTCCAGc > 1:238582/1‑150 (MQ=255) gCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTGCGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTC‑G‑‑‑CGC‑GCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGAGTCCAGc > 1:6415/1‑150 (MQ=255) gCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCAAACAAGGCTTCGGAACAGATTATTTGGTCGCTGGCGACCCCGCTC‑G‑‑‑CGC‑GCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGAGTCCAGc > 1:1019477/1‑150 (MQ=255) tgctgcATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTGCGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTC‑G‑‑‑CGC‑GCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGAGTCCAGCAATTgg < 2:1126950/150‑1 (MQ=255) gccaagctacagccaattgctggactcgctgcaccgtgcccaggtctaccgcgaaatgtatgaccaggCGCGCTGGCGACCCCGCTC‑G‑‑‑CGC‑GCCTg > 1:1128376‑M1/69‑96 (MQ=255) gccaagctacagccaattgctggactcgctgcaccgtgcccaggtctaccgcgaaatgtatgaccaggCGCGCTGGCGACCCCGCTC‑G‑‑‑CGC‑GCCTg < 2:1128376‑M1/28‑1 (MQ=255) ctgcATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTGCGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTC‑G‑‑‑CGC‑GCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGAGTCCAGCAATTGGCt > 1:1271520/1‑150 (MQ=255) gcATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTGCGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTC‑G‑‑‑CGC‑GCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGAGTCCAGCAATTGGCTGt < 2:1271520/150‑1 (MQ=255) catcatCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTGCGGAACAGATTGGGATCGCGCTGGCGACCCCGCTC‑G‑‑‑CGC‑GCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGAGTCCAGCAATTGGCTGTa > 1:450290/1‑150 (MQ=255) atcatcTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTGCGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTC‑G‑‑‑CGC‑GCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGAGTCCAGCAATTGGCTGTAg < 2:1208118/150‑1 (MQ=255) tcatcTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTGCGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTC‑G‑‑‑CGC‑GCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGAGTCCAGCAATTGGCTGTAGc > 2:1059884/1‑150 (MQ=255) cgatctcACGGGCTGAGTGGCACGACTGGTGCCAACCAGGTTGCGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGGCCCCGCTC‑G‑‑‑CGC‑GCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGAGTCCAGCAATTGGCTGTAGCTTgg < 2:829724/144‑1 (MQ=255) aCGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTGCGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTC‑G‑‑‑CGC‑GCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGTAGCGAGTCCAGCAATTGGCTGTAGCTTggcagatcg > 1:829724/1‑144 (MQ=255) aCGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTGCGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCAATCTGTTCCGCAGCCTGGTCATACATTTCGCGGTa < 2:755190/103‑1 (MQ=255) aCGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTGCGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCAATCTGTTCCGCAGCCTGGTCATACATTTCGCGGTa > 1:755190/1‑103 (MQ=255) cTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTGCGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTC‑G‑‑‑CGC‑GCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGAGTCCAGCAATTGGCTGTAGCTTGGCGGCATTTCCAg < 1:591966/150‑1 (MQ=255) tGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTGCGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTC‑G‑‑‑CGC‑GCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGAGTCCAGCAATTGGCTGTAGCTTGGCGGCATTTCCggg < 2:24846/150‑1 (MQ=255) aacggCACGACTGGTGCCAACCAGGCTGCGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTC‑G‑‑‑CGC‑GCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGAGTCCAGCAATTGGCTGTAGCTTGGCGGCATTTCCAGGtt > 1:1643638/4‑150 (MQ=255) aaTGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTGCGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTC‑G‑‑‑CGC‑GCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGAGTCCAGCAATTGGCTGTAGCTTGGCGGCATTTCCAGGtt < 2:1067435/150‑1 (MQ=255) tcgctgcaccgtgcccaggtctaccgcgaaatgtatgaccaggCGCGCTGGCGACCCCGCTC‑G‑‑‑CGC‑GCCt < 2:53950‑M1/27‑1 (MQ=255) tcgctgcaccgtgcccaggtctaccgcgaaatgtatgaccaggCGCGCTGGCGACCCCGCTC‑G‑‑‑CGC‑GCCt > 1:53950‑M1/44‑70 (MQ=255) gCACGACTGGTGCCAACCAGGCTGCGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTC‑G‑‑‑CGC‑GCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGAGTCCAGCAATTGGCTGTAGCTTGGCGGCATTTCCAGGTTGGaa > 2:784326/1‑150 (MQ=255) cACGACTGGTGCCAACCAGGCTGCGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTC‑G‑‑‑CGC‑GCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGAGTCCAGCAATTGGCTGTAGCTTGGCGGCATTTCCAGGTTGGaaa < 1:784326/150‑1 (MQ=255) aCGACTGGTGCCAACCAGGCTGCGGCACAAATTTGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTC‑G‑‑‑CGC‑GCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGAGTCCAGCAATTGGCTGTAGCTTGGCGGCATTTCCAGGTTGGAAAg > 1:862521/1‑150 (MQ=255) aCGACTGGTGCCAACCAGGCTGCGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTC‑G‑‑‑CGC‑GCCTGGTCATACATTTCGCgg > 1:705663/1‑82 (MQ=255) aCGACTGGTGCCAACCAGGCTGCGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTC‑G‑‑‑CGC‑GCCTGGTCATACATTTCGCgg < 2:705663/82‑1 (MQ=255) aCGACTGGTGCCAACCAGGCTGCGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTC‑G‑‑‑CGC‑GCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGa < 2:1081839/105‑1 (MQ=255) aCGACTGGTGCCAACCAGGCTGCGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTC‑G‑‑‑CGC‑GCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGa > 1:1081839/1‑105 (MQ=255) aCGACTGGTGCCAACCAGGCTGCGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTC‑G‑‑‑CGC‑GCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGAGTCCAGCAATTGGCTGTAGCTTGGCGGCATTTCCAGGTTGGAAAg > 2:983566/1‑150 (MQ=255) cTGGTGCCAACCAGGCTGCGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTC‑G‑‑‑CGC‑GCCTGGTCATa < 2:1115160/68‑1 (MQ=255) cTGGTGCCAACCAGGCTGCGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTC‑G‑‑‑CGC‑GCCTGGTCATa > 1:1115160/1‑68 (MQ=255) tGCCAACCAGGCTGCGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTC‑G‑‑‑CGC‑GCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGAGTCCAGCAATTGGCTGTAGCTTGGCGGCATTTCCAGGTTGGAAAGCACCcggc > 1:63946/1‑150 (MQ=255) ccAACCAGGCTGCGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTC‑G‑‑‑CGC‑GCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGAGTCCAGCAATTGGCTGTAGCTTGGCGGCATTTCCAGGTTGGAAAGCACCcggcgg > 1:921627/1‑150 (MQ=255) ccAGGCTGCGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTC‑G‑‑‑CGC‑GCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGAGTCCAGCAATTGGCTGTAGCTTGGCGGCATTTCCAGGTTGGAAAGCACCCGGCGGCGaa > 2:1319003/1‑150 (MQ=255) aGGCTGCGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTC‑G‑‑‑CGC‑GCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGAGTCCAGCAATTGGCTGTAGCTTGGCGGCATTTCAAGGTTGGAAAGCACCCGGCGGCGAAgg < 1:983566/150‑1 (MQ=255) ggCTGCGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTC‑G‑‑‑CGC‑GCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGAGTCCAGCAATTGGCTGTAGCTTGGCGGCATTTCCAGGTTGGAAAGCACCCGGCGGCGAAGGt < 1:73473/150‑1 (MQ=255) gCTGCGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTC‑G‑‑‑CGC‑GCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGAGTCCAGCAATTGGCTGTAGCTTGGCGGCATTTCCAGGTTGGAAAGCACCCGGCGGCGAAGGTc > 1:420743/1‑150 (MQ=255) cGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTC‑G‑‑‑CGC‑GCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGAGTCCAGCAATTGGCTGTAGCTTGGCGGCATTTCCAGGTTGGAAAGCACCCGGCGGCGAAGGTCTTcc < 2:6415/150‑1 (MQ=255) gTTCGCGCTGGCGACCCCGCTC‑G‑‑‑CGC‑GCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGAGTCCAGCAATTGGCTGTAGCTTGGCGGCATTTCCAGGt < 2:746654/108‑1 (MQ=255) gTTCGCGCTGGCGACCCCGCTC‑G‑‑‑CGC‑GCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGAGTCCAGCAATTGGCTGTAGCTTGGCGGCATTTCCAGGt > 1:746654/1‑108 (MQ=255) tCGCGCTGGCGACCCCGCTC‑G‑‑‑CGC‑GCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGAGTCCAGCAATTGGCTGTAGCTTGGCGGCATTTCCAGGTTGGAAAGCACCCGGCGGCGAAGGTCTTCCGGCAGCTCGGCGgaa < 1:1059884/150‑1 (MQ=255) caggcgcgcgagcggggtcgccagcgcgCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGAGTCCAGCAATTGGCTGTAGCTTggc < 2:1128376‑M2/68‑1 (MQ=255) caggcgcgcgagcggggtcgccagcgcgCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGAGTCCAGCAATTGGCTGTAGCTTggc > 1:1128376‑M2/29‑96 (MQ=255) aggcgcgcgagcggggtcgccagcgcgCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGa < 2:53950‑M2/43‑1 (MQ=255) aggcgcgcgagcggggtcgccagcgcgCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGa > 1:53950‑M2/28‑70 (MQ=255) CTGGCGACCCCGCTC‑G‑‑‑CGC‑GCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGAGTCCAGCAATTGGCTGTAGCTTGGCGGCATTTCCAGGTTGGAAAGCACCCGGCGGCGAAGGTCTTCCGGCAGCTCGGCGGAAGAAAt > 2:238582‑M1/1‑150 (MQ=255) gCGACCCCGCTC‑G‑‑‑CGC‑GCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGAGTCCAGCAATTGGCTGTAGCTTGGCGGCATTTCCAGGTTGGAAAGCACCCGGCGGCGAAGGTCTTCCGGCAGCTCGGCGGAAGAAATTTc > 1:1322675/1‑150 (MQ=255) gACCCCGCTC‑G‑‑‑CGC‑GCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGAGTCCAGCAATTGGCTGTAGCTTGGCGGCATTTCCAGGTTGGAAAGCACCCGGCGGCGAAGGTCTTCCGGCAGCTCGGCGGAAGAAATTTCAc > 1:250310/1‑150 (MQ=255) gACCCCGCTC‑G‑‑‑CGC‑GCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGAGTCCAGCAATTGGCTGTAGCTTGGCGGCATTTCCAGGTTGGAAAGCACCCGGCGGCGAAGGTCTTCCGGCAGCTCGGCGGAAGAAATTTCAc < 1:923945/150‑1 (MQ=255) ccccGCTC‑G‑‑‑CGC‑GCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGAGTCCAGCAATTGGCTGTAGCTTggc < 1:148461/81‑1 (MQ=255) ccccGCTC‑G‑‑‑CGC‑GCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGAGTCCAGCAATTGGCTGTAGCTTggc > 2:148461/1‑81 (MQ=255) cccGCTC‑G‑‑‑CGC‑GCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGAGTCCAGCAATTGGCTGTAGCTTGGCGGCATTTCCAg < 2:54575/91‑1 (MQ=255) cccGCTC‑G‑‑‑CGC‑GCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGAGTCCAGCAATTGGCTGTAGCTTGGCGGCATTTCCAg > 1:54575/1‑91 (MQ=255) cTC‑G‑‑‑CGC‑GCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGAGTCCAGCAATTGGCTGTAGCTTGGCGGCATTTCCAGGTTGGAAAGCACCCGGCGGCGAAg > 1:87233/1‑111 (MQ=255) cTC‑G‑‑‑CGC‑GCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGAGTCCAGCAATTGGCTGTAGCTTGGCGGCATTTCCAGGTTGGAAAGCACCCGGCGGCGAAg < 2:87233/111‑1 (MQ=255) gCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGAGTCCAGCAATTGGCTGTAGCTTGGCGGCATTTCCAGGTAGGAAAGCACCCGGCGGCGAAGGTCTTCCGGCAGCTCGGCGGAAGAAATTTCACCTGAAAGCAAAAcc > 2:207175‑M2/2‑150 (MQ=255) | CTTGCCGGTGCCGGACTCACCCAGGATCAGCACGCTGGCGTCGGTATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTGCGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTC‑G‑‑‑CGC‑GCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGAGTCCAGCAATTGGCTGTAGCTTGGCGGCATTTCCAGGTTGGAAAGCACCCGGCGGCGAAGGTCTTCCGGCAGCTCGGCGGAAGAAATTTCACCTAAAAGCAAAACC > NC_002947/4964863‑4965160 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |