New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5591042 = | 40 (0.670) | 5 (0.090) | 5/226 | NT | 11.5% | coding (271/453 nt) | PP_4918 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 5591062 = | 39 (0.690) | coding (251/453 nt) | PP_4918 | hypothetical protein |
ACCCAGGAACAGGTTGAGCTGGGCCTTTTCGTCCGGCTGGTGCATGGCATCGTTCGGATACGGGTAGATGCTGCGCAGGCGCCGGGTGTGTTCGGCGCTGACCACTTCGGCCATGCGCGCATCGTGATACACCTGCACTTCCAGGTGTGGCACTGGCAACCACGGCAGGCTGTGTTCCTGGCGCACATGCAGGGTGGTGGTATACGGGCAGGCCAGCACCACGTCGAGCACCAGCACGCCAAGCATCTGGTCACCCTGGGTCATGCCGATGCGGCGCGAGCTCTGGGTGGTGCG > NC_002947/5590914‑5591207 | ccccAGGAACAGGTTGAGCTGGGCCTTTTCGTCCGGGTGGTACATGGCATCCTTCGGATACGGGTAGATGCTGCGCAGGCTCCGGGTGTGTTCGGCGCTGACCACTTCGGCCATGCGCGCATCGTGATACACCTGCACTTCCAGGTGTgg < 1:489025/149‑1 (MQ=255) ttGAGCTGGGCCTTTTCGTCCGGCTGGTGCATGGCATCGTTCGGATACGGGTAGATGCTGCGCAGGCGCCGGGTGTGTTCGGCGCTGACCACTTCGGCCATGCGCGCATNGTGATACACCTGCACTTCCAGGTGTGGCACTGGCAACCAc < 1:1248505/150‑1 (MQ=255) aGCTGGGCCTTTTCGTCCGGCTGGTGCATGGCATCGTTCGGATACGGGTAGATGCTGCGCAGGCGCCGGGTGTGTTCGGCGCTGACCACTTCGGCCATGCGCGCATCGTGATACACCTGCACTTCCAGGTGTGGCACTGGCAACCACGGc > 1:1005444/1‑150 (MQ=255) aGCTGGGCCTGTTCGTCCGGCTGGTGCATGGCATCGTTCGGATACGGGTAGATGCTGCGCAGGCGCCGGGTGTGTTCGGCGCTCACCACTTCGGCCATGCGCGCATCGTGATACACCTGCACTTCCAGGTGTGGCACTGGCAACCACGGc < 1:480942/150‑1 (MQ=255) tGGGCCTTTTCGTCCGGCTGGTGCATGGCATCGTTCGGATACGGGTAGATGCTGCGCAGGCGCCGGGTGTGTTCGGCGCTGACCACTTCGGCCATGCGCGCATCGTGATACACCTGCACTTCCAGGTGTGGCACTGGCAACCACGGCAgg > 2:1136798/1‑150 (MQ=255) ccTTTTCGTCCGGCTGGTGCATGGCATCGTTCGGATACGGGTAGATGCTGCGCAGGCGCCGGGTGTGTTCGGCGCTGACCACTTCGGCCATGCGCGCATCGTGATACACCTGCACTTCCAGGTGTGGCACTGGCAACCACGGCAGGCtgt < 1:1359677/150‑1 (MQ=255) tttCGTCCGGCTGGTGCATGGCATCGTTCGGATACGGGTAGATGCTGCGCAGGCGCCGGGTGTGTTCGGCGCTGACCACTTCGGCCATGCGCGCATCGTGATACACCTGCACTTCCAGGTGTGGCACTGGCAACCACGGCAGGCTGTGtt > 2:592407/1‑150 (MQ=255) gTGCATGGCATCGTTCGGATACGGGTAGATGCTGCGCAGGCGCCGGGTGTGTTCGGCGCTGACCACTTCGGCCATGCGCGCATCGTGATACACCTGCACTTCCAGGTGTGGCACTGGCAACCACGGCAGGCTGTGTTCCTGGCGCACATg < 1:1136798/150‑1 (MQ=255) gTGCATGGCATCGTTCGGATACGGGTAGATGCTGCGCAGGCGCCGGGTGTGTTCGGCGCTGACCACTTCGGCCATGCGCGCATCGTGATACACCTGCACTTCCAGGTGTGGCACTGGCAACCACGGCAGGCTGTGTTCCTGGCGCACATg > 1:627984/1‑150 (MQ=255) gTGCATGGCATCGTTCGGATACGGGCAGATGCTGCGCAGGCGCCGGGTGTGTTCGGCGCTGACCCCTTCGGCCATGCGCGCATCGTGATACACCTGCACTTCCAGGTGTGGCACTGGCAACCACGGCAGGCTGTGTTCCTGGCGCACATg > 1:1628382/1‑150 (MQ=255) gCATGGCATCGTTCGGATACGGGTAGATGCTGCGCAGGCGCCGGGTGTGTTAGGCGCTGACCACTTCGGCCATGCGCGCATCGTGATACACCTGCACTTCCAGGTGTGGCACTGGCAACCACGGCAGGCTGTGTTCCTGGCGCACATGCa < 2:1005444/150‑1 (MQ=255) aTGGCATCGTTCGGATACGGGTAGATGCTGCGCAGGCGCCGGGTGTGTTCGGCGCTGACCACTTCGGCCATGCGCGCATCGTGATACACCTGCACTTCCAGGTGTGGCACTGGCAACCACGGCAGGCTGTGTTCCTGGCGCACATGCAgg < 1:963218/150‑1 (MQ=255) aTGGCATCGTTCGGATACGGGTAGATGCTGCGCAGGCGCCGGGTGTGTTCGGCGCTGACCACTTCGGCCATGCGCGCATCGTGATACACCTGCACTTCCAGGTGTGGCACTGGCAACCACGGCAGGCTGTGTTCCTGGCGCACATGCAgg < 1:307115/150‑1 (MQ=255) aTGGCATCGTTCGGATACGGGTAGATGCTGCGCAGGCGCCGGGTGTGTTCGGCGCTGACCACTTCGGCCATGCGCGCATCGTGATACACCTGCACTTCCAGGTGTGGCACTGGCAACCACGGCAGGCTGTGTTCCTGGCGCACATGCAgg < 1:1539548/150‑1 (MQ=255) tACGGGTAGATGCTGCGCAGGCGCCGGGTGTGTTCGGCGCTGACCACTTCGGCCATGCGCGCATCGGGATACACCTGCTCTTCCAGCTGTGGCACTGGCAACCACGGCAGGCTGTCTTCCTGGCGCACATGCAGGGTGGTGGTATACggg < 2:552740/150‑1 (MQ=255) gggTAGATGCTGCGCAGGCGCCGGGTGTGTTCGGCGCTGACCACTTCGGCCATGCGCGCATCGTGATACACCTGCACTTCCAGGTGTGGCACTGGCAACCACGGCAGGCTGTGTTCCTGGCGCACATGCAGGGTGGTGGTATACgg > 1:20517/1‑146 (MQ=255) gggTAGATGCTGCGCAGGCGCCGGGTGTGTTCGGCGCTGACCACTTCGGCCATGCGCGCATCGTGATACACCTGCACTTCCAGGTGTGGCACTGGCAACCACGGCAGGCTGTGTTCCTGGCGCACATGCAGGGTGGTGGTATACgg < 2:20517/146‑1 (MQ=255) gTAGATGCTGCGCAGGCGCCGGGTGTGTTCGGCGCTGACCACTTCGGCCATGCGCGCATCGTGATACACCTGCACTTCCAGGTGTGGCACTGGCAACCACGGCAGGCTGTGTTCCTGGCGCACATGCAGGGTGGTGGTATACGGGCAGGc > 1:1346467/1‑150 (MQ=255) gATGCTGCGCAGGCGCCGGGTGTGTTCGGCGCTGACCACTTCGGCCATGCGCGCATCGTGATACACCTGCACTTCCAGGTGTGGCACTGGCAACCACGGCAGGCTGTGTTCCTGGCGCACATGCAGGGTGGTGGTATACGGGCAGGCCAg > 1:925539/1‑150 (MQ=255) aTGCTGCGCAGGCGCCGGGTGTGTTCGGCGCTGACCACTTCGGCCATGCGCGCATCGTGATACACCTGCACTTCCAGGTGTGGCACTGGCAACCACGGCAGGCTGTGTTCCTGGCGCACATGCAGGGTGGTGGTATACGGGCAGGCCAGc > 2:1106470/1‑150 (MQ=255) tgctgcGCAGGCGCCGGGTGTGTTCGGCGCTGACCACTTCGGCCATGCGCGCATCGTGATACACCTGCACTTCCAGGTGTGGCACTGGCAACCACGGCAGGCTGTGTTCCTGGCGTACACGCAGGGGGCTGGTATCCGGGCAGGccgaca > 2:353579/1‑146 (MQ=255) gctgcGCAGGCGCCGGGTGTGTTCGGCGCTGACCACTTCGGCCATGCGCGCATCGTGATACACCTGCACTTCCAGGTGTGGCACTGGCAACCACGGCAGGCTGTGTTCCTGGCGCACATGCAGGGTGGTGGTATACGGGCAGGCCAGcac < 1:826293/150‑1 (MQ=255) cAGGCGCCGGGTGTGTTCGGCGCTGACCACTTCGGCCATGCGCGCATCGTGATACACCTGCACTTCCAGGTGTGGCACTGGCAACCACGGCAGGCTGTGTTCCTGGCGCACATGCAGGGTGGTGGTATACGGGCAGGCCAGCACCACGTc < 2:627984/150‑1 (MQ=255) cAGGCGCCGGGTGTGTTCGGCGCTGACCACTTCGGCCATGCGCGCATCGTGATACACCTGCACTTCCAGGTGTGGCACTGGCAACCACGGCAGGCTGTGTTCCTGGCGCACATGCAGGGTGGTGGTATACGGGCAGGCCAGCACCACGTc < 2:1346467/150‑1 (MQ=255) cAGGCGCCGGGTGTGTTCGGCGCTGACCACTTCGGCCATGCGCGCATCGTGATACACCTGCACTTCCAGGTGTGGCACTGGCAACCACGGCAGGCTGTGTTCCTGGCGCACATGCAGGGTGGTGGTATACGGGCAGGCCAGCACCACGTc < 1:353579/150‑1 (MQ=255) ccaccctgcatgtgcgccaggaacacagcctgccgtggttgccagtgccacacctgcacttccaggtgtGGCACTGGCaa < 2:1402076‑M2/11‑1 (MQ=255) ccaccctgcatgtgcgccaggaacacagcctgccgtggttgccagtgccacacctgcacttccaggtgtGGCACTGGCaa > 1:1402076‑M2/70‑80 (MQ=255) ggTGTGTTCGGCGCTGACCACTTCGGCCATGCGCGCATCGTGATACACCTGCACTTCCAGGTGTGGCACTGGCAACCACGGCAGGCTGTGTTCCTGGCGCACATGCAGGGTGGTGGTATACGGGCAGGCCAGCACCACGTCGAGCACCAg < 2:1281491/150‑1 (MQ=255) gtgtTCGGCGCTGACCACTTCGGCCATGCGCGCATCGTGATACACCTGCACTTCCAGGTGTGGCACTGGCAAACACGGCAGGCTGTGTTCCTGGCGCACATGCAGGGTGGTGGTATACGGGCAGGCCAGCACCACGTCGAGCACCAGCAc < 2:1513394/150‑1 (MQ=255) ttCGGCGCTGACCACTTCGGCCATGCGCGCATCGTGATACACCTGCACTTCCAGGTGTGGCACTGGCAACCACGGCAGGCTGTGTTCCTg > 1:782429/1‑90 (MQ=255) ttCGGCGCTGACCACTTCGGCCATGCGCGCATCGTGATACACCTGCACTTCCAGGTGTGGCACTGGCAACCACGGCAGGCTGTGTTCCTg < 2:782429/90‑1 (MQ=255) gtgcgccaggaacacaacctgccgtggttgccagtgccACACCTGCACTTCCAGGTGTGGCACt < 2:915843‑M1/26‑1 (MQ=255) gtgcgccaggaacacaacctgccgtggttgccagtgccACACCTGCACTTCCAGGTGTGGCACt > 1:915843‑M1/39‑64 (MQ=255) cACTTCGGCCATGCGCGCATCGTGATACACCTGCACTTCCAGGTGTGGCACTGGCAACCACGGCAGGCTGTGTTCCTGGCGCACATGCAGGGTGGTGGTATACGGGCAGGCCAGCACCACGTCGAGCACCAGCACGCCAAGCATCTGGTc > 2:685284/1‑150 (MQ=255) ttCGGCCATGCGCGCATCGTGCTACAGCTGCAATTACAGGGGTGGCACTGGCACCAACGGCAGGCTGAGGTCCTGGCGGACGTACAGGGGGCTGGTAAACGGGCAGCACAGCACCACGTGGGGTACCAGCACGCCAAGCAGGTGGTCatc > 2:129885/1‑148 (MQ=255) ttCGGCCATGCGCGCATCGTGATACACCTGCACTTCCAGGTGTGGCACTGGCAACCACGGCAGGCTGTGTTCCTGGCGCACATGCAGggtggtg < 2:1581630/94‑1 (MQ=255) ttCGGCCATGCGCGCATCGTGATACACCTGCACTTCCAGGTGTGGCACTGGCAACCACGGCAGGCTGTGTTCCTGGCGCACATGCAGggtggtg > 1:1581630/1‑94 (MQ=255) gCCATGCGCGCATCGTGATACACCTGCACTTCCAGGTGTGGCACTGGCAACCACGGCAGGCTGTGTTCCTGGCGCACATGCAGGGTGGTGGTATACGGGCAGGCCAGCACCACGTCGAGCACCAGCACGCCAAGCATCTGGTCACCCTgg > 2:1380260/1‑150 (MQ=255) aTGCGCGCATCGTGATAGACATGCAATTCCAGGTGTGGCACTGGCAACCACGGCAGGCTGTGTTCCTGGCGCACATGCAGGGTGGTGGTATACGGGCAGGCCAGCACCACGTCGAGCACCAGCACGCCAAGCATCTGGTCACCCTGGGTc > 2:837714/1‑150 (MQ=255) gcgcATCGTTATACACCTGGACTTCCAGGTGTTGCCCTGGCAACCACGGCAGGCTGTGTTCCTGGGCCACATGCAGGGTGGTGGTTTACGGGCAGGCCAGCACCACGTCGAGCACCAGCACGCCAAGCATCTGGTCACCCTGGGTCATGc < 2:1628382/150‑1 (MQ=255) ttgccagtgccACACCTGGAAGTGCAGGTGTGGCACTGGCAACCACGGCAGGCTGTGTTCCTGGCGCACATGCAGggtgg > 1:1402076‑M1/12‑80 (MQ=255) ttgccagtgccACACCTGGAAGTGCAGGTGTGGCACTGGCAACCACGGCAGGCTGTGTTCCTGGCGCACATGCAGggtgg < 2:1402076‑M1/69‑1 (MQ=255) aTCGTGATACACCTGCACTTCCAGGTGTGGCACTGGCAACCACGGCAGGCTGTGTTCCTGGCGCACATGCAGGGTGGTGGTATACGGGCAGGCCAGcacca < 2:189468/101‑1 (MQ=255) aTCGTGATACACCTGCACTTCCAGGTGTGGCACTGGCAACCACGGCAGGCTGTGTTCCTGGCGCACATGCAGGGTGGTGGTATACGGGCAGGCCAGcacca > 1:189468/1‑101 (MQ=255) agtgccacacctggaagtgcaggtgtGGCACTGGCAACCACGGCAGGTTGTGTTCCTGGCGcac < 2:915843‑M2/38‑1 (MQ=255) agtgccacacctggaagtgcaggtgtGGCACTGGCAACCACGGCAGGTTGTGTTCCTGGCGcac > 1:915843‑M2/27‑64 (MQ=255) tGATACACCTGCACTTCCAGGTGTGGCACTGGCAACCACGGCAGGCTGTGTTCCTGGCGCACATGCAGGGTGGTGGTATACGGGCAGGCCAGCACCACGTCGAGCACCAGCACGCCAAGCATCTGGTCACCCTGGGTCATGCCGATgcgg > 2:276991/1‑150 (MQ=255) tACACCTGCACTTCCAGGTGTGGCACTGGCAACCACGGCAGGCTGTGTTCCTGGCGCACATGCAGGGTGGTGGTATACGGGCAGGCCAGCACCACGTCGAGCACCAGCACGCCAAGCATCTGGTCACCCTGGGTCATGCCGATGCGgcgc < 1:276991/150‑1 (MQ=255) acacctggaagtgcaggtgtGGCACTGGCAACCACGGCAGGCTGTGTTCCTGGCGCACATGCAGGGTGGTGGTATACGGGCAGGCCAGCACCACGTCGAGCACCAGCACGCCAAGCATCTGGTCACCCTGGGTCATGCCGATGCGGcgcg > 2:984618‑M2/21‑150 (MQ=255) CACCTGCACTTCCAGGTGTGGCACTGGCAACCACGGCAGGCTGTGTTCCTGgc > 1:490208‑M1/1‑53 (MQ=255) CACCTGCACTTCCAGGTGTGGCACTGGCAACCACGGCAGGCTGTGTTCCTGgc < 2:490208‑M1/53‑1 (MQ=255) ACCTGCACTTCCAGGTGTGGCACTGGCAACCACGGCAGGCTGTGTTCCTGGCGCACATGCAGGGTGGTGGTATACGGGCAGGCCAGCACCACGTCGAGCACCAGCACGCCAAGCATCTGGTCACCCTGGGTCATGCCGATGCGGCGCGAg < 1:1629780‑M1/150‑1 (MQ=255) CTGCACTTCCAGGTGTGGCACTGGCAACCACGGCAGGCTGTGTTCCTGGCGCACATGCAGGGTGGTGGTATACGGGCAGGCCAGCACCACGTCGAGCACCAGCACGCCAAGCATCTGGTCACCCTGGGTCATGCCGATGCGGCGCGAGct < 1:743685‑M1/150‑1 (MQ=255) CTGCACTTCCAGGTGTGGCACTGGCAACCACGGCAGGCTGTGTTCCTGGCGCACATGCAGGGTGGTGGTATACGGGCAGGCCAGCACCACGTCGAGCACCAGCACGCCAAGCATCTGGTCACCCTGGGTCATGCCGATGCGGCGCGAGct < 2:1518506‑M1/150‑1 (MQ=255) tggaCTTCCAGGTGTGGCACTGGCAACCACGGCAGGCTGTGTTCCTGGCGCACATGCAGGGTGGTGGTATACGGGCAGGCCAGCACCACGTCGAGCACCAGCACGCCAAGCATCTGGTCACCCTGGGTCATGCCGATGCGGCGCGAGctc > 1:1643123/4‑150 (MQ=255) TGCACTTCCAGGTGTGGCACTGGCAACCACGGCAGGCTGTGTTCCTGGCGCACATGCAGGGTGGTGGTATACGGGCAGGCCAGCACCACGTCGAGCACCAGCACGCCAAGCATCTGGTCACCCTGGGTCATGCCGATGCGGCGCGAGctc < 2:1431575‑M1/150‑1 (MQ=255) GCACTTCCAGGTGTGGCACTGGCAACCACGGCAGGCTGTGTTCCTGGCGCACATGCAGggtggtg > 2:731590‑M1/1‑65 (MQ=255) GCACTTCCAGGTGTGGCACTGGCAACCACGGCAGGCTGTGTTCCTGGCGCACATGCAGggtggtg < 1:731590‑M1/65‑1 (MQ=255) aagtgcaggtgtGGCACTGGCAACCACGGCAGGCTGTGTTCCTGGCGCACATGCAGGGTGGTGGTATACGGGCAGGCCAGCACCACGTCGAGCACCAGCACGCCAAGCATCTGGTCACCCTGGGTCATGCCGATGCGGCGCGAGCTCTgg > 1:1252982‑M2/13‑150 (MQ=255) ccAGGTGTGGCACTGGCAACCACGGCAGGCTGTGTTCCTGGCGCACATGCAGGGTGGTGGTATACGGGCAGGCCAGCACCACGTCGAGCACCAGCACGCCAAGCATCTGGTCACCCTGGGTCATGCCGATGCGGCGCGAGCTCTGggtcg < 1:1380260/150‑3 (MQ=255) caggtgtGGCACTGGCAACCACGGCAGGCTGTGTTCCTGGCGCACATGCAGGGTGGTGGTATACGGGCAGGCCAGCACCACGTCGAGCACCAGCACGCCAAGCATCTGGTCACCCTGGGTCATGCCGATGCGGCGCGAGCTCTGggtggt > 2:1331737‑M2/8‑150 (MQ=255) caggtgtGGCACTGGCAACCACGGCAGGCTGTGTTCCTGGCGCACATGCAGGGTGGTGGTATACGGGCAGGCCAGCACCACGTCGAGCACCAGCACGCCAAGCATCTGGTCACCCTGGGTCATGCCGATGCGGCGCGAGCTCTGggtggt < 1:1431575‑M2/143‑1 (MQ=255) gtgtGGCACTGGCAACCACGGCAGGCTGTGTTCCTGGCGCACATGCAGGGTGGTGGTATACGGGCAGGCCAGCACCACGTCGAGCACCAGCACGCCAAGCATCTGGTCACCCTGGGTCATGCCGATGCGGCGCGAGCTCTGGGTGGTgcg < 2:1252982‑M2/146‑1 (MQ=255) | ACCCAGGAACAGGTTGAGCTGGGCCTTTTCGTCCGGCTGGTGCATGGCATCGTTCGGATACGGGTAGATGCTGCGCAGGCGCCGGGTGTGTTCGGCGCTGACCACTTCGGCCATGCGCGCATCGTGATACACCTGCACTTCCAGGTGTGGCACTGGCAACCACGGCAGGCTGTGTTCCTGGCGCACATGCAGGGTGGTGGTATACGGGCAGGCCAGCACCACGTCGAGCACCAGCACGCCAAGCATCTGGTCACCCTGGGTCATGCCGATGCGGCGCGAGCTCTGGGTGGTGCG > NC_002947/5590914‑5591207 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |