| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_002947 | 6,098,326 | (CAAGCTGCG)2→1 | coding (811‑819/867 nt) | PP_5350 ← | RpiR family transcriptional regulator |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_002947 | 6098315 | 6098323 | 9 | 97 [0] | [0] 97 | PP_5350 | RpiR family transcriptional regulator |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | 6098324 = | 0 (0.000) | 86 (1.550) | 62/248 | 0.0 | 100% | coding (821/867 nt) | PP_5350 | RpiR family transcriptional regulator |
| ? | NC_002947 | = 6098314 | 0 (0.000) | coding (831/867 nt) | PP_5350 | RpiR family transcriptional regulator | |||||
CGCGGGCTTGCCCCGTTCACACAGGAATTGCACCGATTTATAGAAGTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAACAGGCCAGTACAGGTTGAATTCAGTCGTCGGTAGCCTTGATCGACTTGGGCGACAGACGCAAGCTGCGCAAGCTGCGTTTCACGCTCTTCAGGTGGTTGACCAGGCTAGGCCCGCGCGCCATGGCAACGCCCATGGCCAGCACGTCGATCACCACCAGGTGGGCAATACGCGAGGTCAGTGGGGTGTAGATCTCGGTGTCTTCATGCACGTCGATC > NC_002947/6098177‑6098473 | cggcctcttcgcgggcttgccccgttcacacaggaattgcaccgatttatagaagtgcacagtacctgtgggagcgggcaagcccgcgaacaggccagtacaggttgaattcagtcgtcggtagccttgatcgacttgggcgacagaCGc < 2:1474821‑M1/3‑1 (MQ=255) ggcctcttcgcgggcttgccccgttcacacaggaattgcaccgatttatagaagtgcacagtacctgtgggagcggggaatgccacgaacaggccagtacaggttgaattcagtcgtcggtagccttgatcgacttgggcgacagaCGCa < 1:1010361‑M1/4‑1 (MQ=255) gcctcttcgcgggcttgccccgttcacacaggaattgcaccgatttatagaagtgcacagtacctgtgggagcgggcaagcccgcgaacaggccagtacaggttgaattcagtcgtcggtagccttgatcgacttgggcgacagaCGCaa < 2:445166‑M1/5‑1 (MQ=255) 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ccccgttcacacaggaattgcaccgatgtatagaagtgcacagtacctgtgggagcgggcaagcacgcgaacaggccagtacaggttgaattcagtcgtcggtagccttgatcgacttgggcgacagaCGCAAGCTGCGTTTCACGctct < 2:365953‑M1/22‑1 (MQ=255) gttcacacaggaattgcaccgatttatagaagtgcacagtacctgtgggagcgggcaagcccgcgaacaggccagtacaggttgaattcagtcgtcggtagccttgatcgacttgggcgacagaCGCAAGCTGCGTTTCACGCTCTTCAg > 1:1174016‑M1/125‑150 (MQ=255) gttcacacaggaattgcaccgatttatagaagtgcacagtacctgtgggagcgggcaagcccgcgaacaggccagtacaggttgaattcagtcgtcggtagccttgatcgacttgggcgacagaCGCAAGCTGCGTTTCACGCTCTTCAg > 2:62453‑M1/125‑150 (MQ=255) acaggaattgcaccgatttatagaagtgcacagtacctgtgggagcgggcaagcccgcgaacaggccagtacaggttgaattcagtcgtcggtagtcttgatcgacttgggcgacagaCGCAAGCTGCGTTTCACGCTCTTCAGGTGGtt < 2:1148100‑M1/32‑1 (MQ=255) acaggaattgcaccgatttatagaagtgcacagtacctgtgggagcgggcaagcccgcgaacaggccagtacaggttgaattcagtcgtcggtagccttgatcgacttgggcgacagaCGCAAGCTGCGTTTCACGCTCTTCAGGTGGtt < 2:724279‑M1/32‑1 (MQ=255) 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accgatttatagaagtgcacagtacctgtgggagcgggcaagcccgcgaacaggccagtacaggttgaattcagtcgtcggtagccttgatcgacttgggcgacagaCGCaa < 1:153452‑M1/5‑1 (MQ=255) accgatttatagaagtgcacagtacctgtgggagcgggcaagcccgcgaacaggccagtacaggttgaattcagtcgtcggtagccttgatcgacttgggcgacagaCGCaa > 2:153452‑M1/108‑112 (MQ=255) accgatttatagaagtgcacagtacctgtgggagcgggcaagcccgcgaacaggccagtacaggttgaattcagtcgtcggtagccttgatcgacttgggcgacagaCGCAAGCTGCGTTTCACGCTCTTCAGGTGGTTGACCAGGCTAg < 2:1030675‑M1/43‑1 (MQ=255) accgatttatagaagtgcacagtacctgtgggagcgggcaagcccgcgaacaggccagtacaggttgaattcagtcgtcggtagccttgatcgacttgggcgacagaCGCAAGCTGCGTTTCACGCTCTTCAGGTGGTTGACCAGGCTAg < 1:1316361‑M1/43‑1 (MQ=255) ccgatttatagaagtgcacagtacctgtgggagcgggcaagcccgcgaacaggccagtacaggttgaattcagtcgtcggtagccttgatcgacttgggcgacagaCGCAAGCTGCGTTTCACGCTCTTCAGGTGGTTGACCAGGCTAgg < 1:157888‑M1/44‑1 (MQ=255) cgatttatagaagtgcacagtacctgtgggagcgggcaagcccgcgaacaggccagtacaggttgaattcagtcgtcggtagccttgatcgacttgggcgacagaCGCAAGCTGCGTTTCACGCTCTTCAg < 2:1220810‑M1/26‑1 (MQ=255) 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cttgatcgacttgggcgacagaCGCAAGCTGCGTTTCACGCTCTTCAGGTGGTTGACCAGGCTAGGCCCGCGCGCCATGGCAACGCCCATGGCCAGCACGTCGATCACCACCAgg > 1:340444‑M1/23‑115 (MQ=255) cttgatcgacttgggcgacagaCGCAAGCTGCGTTTCACGCTCTTCAGGTGGTTGACCAGGCTAGGCCCGCGCGCCATGGCAACGCCCATGGCCAGCACGTCGATCACCACCAgg < 2:340444‑M1/93‑1 (MQ=255) cttgatcgacttgggcgacagaCGCAAGCTGCGTTTCACGCTCTTCAGGTGGTTGACCAGGCTAGGCCCGCGCGCCATGGCAACGCCCATGGCCAGCACGTCGATCACCACCAGGTGGGCAATACGCGAGGTCAGTGGGGTGTAGAtctc < 1:287936‑M1/128‑1 (MQ=255) cttgatcgacttgggcgacagaCGCAAGCTGCGTTTCACGCTCTTCAGGTGGTTGACCAGGCTAGGCCCGCGCGCCATGGCAACGCCCATGGCCAGCACGTCGATCACCACCAGGTGGGCAATACGCGAGGTCAGTGGGGTGTAGAtctc < 2:857921‑M1/128‑1 (MQ=255) ttgatcgacttgggcgacagaCGCAAGCTGCGTTTCACGCTCTTCAGGTGGTTGACCAGGCTAGGCCCGCGCGCCATGGCAACGCCCATGGCCAGCACGTCGATCACCACCAGGTGGGCAATACGCGAGGTCAGTGGGGTGTAGATCTCg > 2:99645‑M1/22‑150 (MQ=255) gatcgacttgggcgacagaCGCAAGCTGCGTTTCACGCTCTTCAGGTGGTTGACCAGGCTAGGCCCGCGCGCCATGGCAACGCCCATGGCCAGCACGTCGATCACCACCAGGTGGGCAATACGCGAGGTCAGTGGGGTGTAGATCTCGgt > 1:335134‑M1/20‑150 (MQ=255) gatcgacttgggcgacagaCGCAAGCTGCGTTTCACGCTCTTCAGGTGGTTGACCAGGCTAGGCCCGCGCGCCATGGCAACGCCCATGGCCAGCACGTCGATCACCACCAGGTGGGCAATACGCGAGGTCAGTGGGGTGTAGATCTCGgt > 1:149519‑M1/20‑150 (MQ=255) gatcgacttgggcgacagaCGCAAGCTGCGTTTCACGCTCTTCAGGTGGTTGACCAGGCTAGGCCCGCGCGCCATGGCAACGCCCATGGCCAGCACGTCGATCACCACCAGGTGGGCAATACGCGAGGTCAGTGGGGTGTAGATCTCGgt > 1:1185153‑M1/20‑150 (MQ=255) cgacttgggcgacagaCGCAAGCTGCGTTTCACGCTCTTCAGGTGGTTGACCAGGCTAGGCCCGCGCGCCATGGCAACGCCCATGGCCAGCACGTCGATCACCACCAGGTGGGCAATACGCGAGGTCAGTGGGGTGTAGATCTCGGTGTc > 1:1395773‑M1/17‑150 (MQ=255) cttgggcgacagaCGCAAGCTGCGTTTCACGCTCTTCAGGTGGTTGACCAGGCTAGGCCCGCGCGCCATGGCAACGCCCATGGCCAGCACGTCGATCACCACCAGGTGGGCAATACGCGAGGTCAGTGGGGTGTAGATCTCGGTGTCTTc > 1:724279‑M1/14‑150 (MQ=255) cttgggcgacagaCGCAAGCTGCGTTTCACGCTCTTCAGGTGGTTGACCAGGCTAGGCCCGCGCGCCATGGCAACGCCCATGGCCAGCACGTCGATCACCACCAGGTGGGCAATACGCGAGGTCAGTGGGGTGTAGATCTCGGTGTCTTc > 2:891326‑M1/14‑150 (MQ=255) cttgggcgacagaCGCAAGCTGCGTTTCACGCTCTTCAGGTGGTTGACCAGGCCAGGCCCGCGCGCCATGGCAACGCCCATGGCCAGCACGTCGATCACCACCAGGTGGGCAATACGCGAGGTCAGTGGGGTGTAGATCTCGGTGTCTTc > 1:1431728‑M1/14‑150 (MQ=255) tgggcgacagaCGCAAGCTGCGTTTCACGCTCTTCAGGTGGTTGACCAGGCTAGGCCCGCGCGCCATGGCAACGCCCATGGCCAGCACGTCGATCACCACCAGGTGGGCAATACGCGAGGTCAGTGGGGTGTAGATCTCGGTGTCTTCAt > 2:1010651‑M1/12‑150 (MQ=255) gggcgacagaCGCAAGCTGCGTTTCACGCTCTTCAGGTGGTTGACCAGGCTAGGCCCGCGCGCCATGGCAACGCCCATGGCCAGCACGTCGATCACCACCAGGTGGGCAATACGCGAGGTCAGTGGGGTGTAGATCTCGGTGTCTTCATg < 2:1033705‑M1/140‑1 (MQ=255) ggcgacagaCGCAAGCTGCGTTTCACGCTCTTCAGGTGGTTGACCAGGCTAGGCCCGCGCGCCATGGCAACGCCCATGGCCAGCACg < 2:30070‑M1/78‑1 (MQ=255) ggcgacagaCGCAAGCTGCGTTTCACGCTCTTCAGGTGGTTGACCAGGCTAGGCCCGCGCGCCATGGCAACGCCCATGGCCAGCACg > 1:30070‑M1/10‑87 (MQ=255) acagaCGCAAGCTGCGTTTCACGCTCTTCAGGTGGTTGACCAGGCTAGGCCCGCGCGCCATGGCAACGCCCATGGCCAGCACGTCGATCACCACCAGGTGGGCAATACGCGAGGTCAGTGGGGTGTAGATCTCGGTGTCTTCATGCACGt > 1:1050615‑M1/6‑150 (MQ=255) cagaCGCAAGCTGCGTTTCACGCTCTTCAGGTGGTTGACCAGGCTAGGCCCGCGCGCCATGGCAACGCCCATGGCCAGCACGTCGATCACCACCAGGTGGGCAATACGCGAGGTCAGTGGGGTGTAGATCTCGGTGTCTTCATGCACGTc < 1:752976‑M1/146‑1 (MQ=255) CGCAAGCTGCGTTTCACGCTCTTCAGGTGGTTGACCAGGCTAGGCCCGCGCGCCATGGCAACGCCCATGGCCAGCACGTCGATCACCACCAGGTGGGCAATACGCGAGGTCAGTGGGGTGTAGATCTCGGTGTCTTCATGCACGTCGATc > 2:752976‑M1/1‑150 (MQ=255) | CGCGGGCTTGCCCCGTTCACACAGGAATTGCACCGATTTATAGAAGTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAACAGGCCAGTACAGGTTGAATTCAGTCGTCGGTAGCCTTGATCGACTTGGGCGACAGACGCAAGCTGCGCAAGCTGCGTTTCACGCTCTTCAGGTGGTTGACCAGGCTAGGCCCGCGCGCCATGGCAACGCCCATGGCCAGCACGTCGATCACCACCAGGTGGGCAATACGCGAGGTCAGTGGGGTGTAGATCTCGGTGTCTTCATGCACGTCGATC > NC_002947/6098177‑6098473 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |