New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2271256 | 51 (0.580) | 6 (0.080) | 5/216 | NT | 10.6% | intergenic (+34/‑186) | PP_2002/PP_t31 | oxidoreductase/tRNA‑Val |
? | NC_002947 | = 2271306 | 57 (0.740) | intergenic (+84/‑136) | PP_2002/PP_t31 | oxidoreductase/tRNA‑Val |
GCAGGGTAGGGACCGTGGAAGATGTCGCGGCCATGGTTGCCTGGTTGCTGTCACGCCAGGCGGCATTTGTCACCGGCCAGGAGTTTGTGGTCGATGGCGGCATGACCCGCAAGATGATCTATACCTGAGCACCTTGTTTAAACTGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/2271095‑2271256 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gccggcctcttcgcggGTAAACCCGCTCCTACAGTCGGACATTAACCGTTGTAGGAGCGGGTTTAGCCGCGAAGAGGCCGGCGCAGTTTAAACAAGGTGCTCAGGTATAGATCATCTTGCGGGTCATGCCGCCATCGACCACAAACTCCTGGCCGGTGACAAATG < NC_002947/2271306‑2271158 GCAGGGTAGGGACCGTGGAAGATGTCGCGGCGATGGTTGCCTGGTTGCTGTCACGCCAGGCGGCATTTGTCACCGGCCAGGAGTTTGTGGTCGATGGCGGCATGACCCGCAAGATGATCTATACCTGAGCACCTTGTTTAAACTGCGCCG < 1:1530681/150‑1 AGGGTAGGGACCGTGGAAGATGTCGCGGCCATGGTTGCCTGGTTGCTGTCACGCCAGGCGGCATTTGTCACCGGCCAGGAGTTTGTGGTCGATGGCGGCATGACCCGCAAGATGATCTATACCTGAGCACCTTGTTTAAACTGCGCCGGC < 2:1211393/150‑1 AGGGTAGGGACCGTGGAAGATGTCGCGGCCATGGTTGCCTGGTTGCTGTCACGCCAGGCGGCATTTGTCACCGGCCAGGAGTTTGTGGTCGATGGCGGCATGACCCGCAAGATGATCTATACCTGAGCACCTTGTTTAAACTGCGCCGGC > 1:2304409/1‑150 GGGACCGTGGAAGATGTCGCGGCCATGGTTGCCTGGTTGCTGTCACGCCAGGCGGCATTTGTCACCGGCCAGGAGTTTGTGGTCGATGGCGGCATGACCCGCAAGATGATCTATACCTGAGCACCTTGTTTAAACTGCGCCGGCCTCTTC < 2:1946183/150‑1 GGACCGTGGAAGATGTCGCGGCCATGGTTGCCTGGTTGCTGTCACGCCAGGCGGCATTTGTCACCGGCCAGGAGTTTGTGGTCGATGGCGGCATGACCCGCAAGATGATCTATACCTGAGCACCTTGTTTAAACTGCGCCGGCCTCTTCG < 2:1224031/150‑1 GTGGAAGATGTCGCGGCCATGGTTGCCTGGTTGCTGTCACGCCAGGCGGCATTTGTCACCGGCCAGGAGTTTGTGGTCGATGGCGGCATGACCCGCAAGATGATCTATACCTGAGCACCTTGTTTAAACTGCGCCGGCCTCTTCGCGGGT > 2:1817615/1‑150 CGGCCATGGTTGCCTGGTTGCTGTCACGCCAGGCGGCATTTGTCACCGGCCAGGAGTTTGTGGTCGATGGCGGCATGACCCGCAAGATGATCTATACCTGAGCACCTTGTTTAAACTGCGCCGGCCTCTTCGCGGATAAACACGCTaatc < 2:1844059/150‑5 CTGTCACGCCAGGCGGCATTTGTCACCGGCCAGGAGTTTGTGGTCGATGGCGGCATGACCCGCAAGATGATCTATACCTGAGCACCTTGTTTAAACTGCGCCGGCCTCTTCGCGG < 2:323796/115‑1 CTGTCACGCCAGGCGGCATTTGTCACCGGCCAGGAGTTTGTGGTCGATGGCGGCATGACCCGCAAGATGATCTATACCTGAGCACCTTGTTTAAACTGCGCCGGCCTCTTCGCGG > 1:323796/1‑115 CAGGCGGCATTTGTCACCGGCCAGGAGTTTGTGGTCGATGGCGGCATGACCCGCAAGATGATCTATACCTGAGCACCTTGTTTAAACTGCGCCGGCCTCTTCGCGGCTAAACCCGCTCCTACAGTCGGACATTAACCGTTG < 2:178918/141‑1 CAGGCGGCATTTGTCACCGGCCAGGAGTTTGTGGTCGATGGCGGCATGACCCGCAAGATGATCTATACCTGAGCACCTTGTTTAAACTGCGCCGGCCTCTTCGCGGCTAAACCCGCTCCTACAGTCGGACATTAACCGTTG > 1:178918/1‑141 GCGGCATTTGTCACCGGCCAGGAGTTTGTGGTCGATGGCGGCATGACCCGCAAGATGATCTATACCTGAGCACCTTGTTTAAACTGCGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTCGGACATTAACCGTTGTAGGAGCGGGTT < 1:1817615/150‑1 GATCTATACCTGAGCACCTTGTTTAAACTGCGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTCGGACATTAACCGTTGTAGGAGCGG < 1:2296237/91‑1 GATCTATACCTGAGCACCTTGTTTAAACTGCGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTCGGACATTAACCGTTGTAGGAGCGG > 2:2296237/1‑91 GCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTCGGACATTAACCGTTGTAGGAGCGGGTTTAGCCGCGAAGAGGCCGGCGCAGTTTAAACAAGGTGCTCAGGTATAGATCATCTTGCGGGTCATGCCGCCATCGACCACAAACTCCT < 1:1521136/150‑1 CCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTCGGACATTAACCGTTGTAGCAGCGGGTTTAGCCGCGAAGAGGCCGGCGCAGTTTAAACAAGGTGCTCAGGTATAGATCATCTTGCGGGTCATGCCGCCATCGACCACAGACTCCTG < 2:1197365/150‑1 CGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTCGGACATTAACCGTTGTAGGAGCGGGTTTAGCCGCGAAGAGGCCGGCGCAGTTTAAACAAGGTGCTCAGGTATAGATCATCTTGCGGGTCATGCCGCCATCGACCACAAACTCCTGG > 2:1808225/1‑150 CGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTCGGACATTAACCGTTGTAGGAGCGGGTTTAGCCGCGAAGAGGCCGGCGCAGTTTAAACAAGGTGCTCAGGTATAGATCATCTTGCGGGTC < 2:1009846/123‑1 CGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTCGGACATTAACCGTTGTAGGAGCGGGTTTAGCCGCGAAGAGGCCGGCGCAGTTTAAACAAGGTGCTCAGGTATAGATCATCTTGCGGGTC > 1:1009846/1‑123 GGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTCGGACATTAACCGTTGTAGGAGCGGGTTTAGCCGCGAAGAGGCCGGCGCAGTTTAAACAAGGTGCTCAGGTATAGATCATCTTGCGGGTCATGCCGCCATCGACCACAAACTCCTGGC > 2:702119/1‑150 GCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTCGGACATTAACCGTTGTAGGAGCGGGTTTAGCCGCGAAGAGGCCGGCGCAGTTTAAACAAGGTGCTCAGGTATAGATCATCTTGCGGGTCATGCCGCCATCGACCACAAACTCCTGGCC > 2:2318690/1‑150 CCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTCGGACATTAACCGTTGTAGGAGCGGGTTTAGCCGCGAAGAGGCCGGCGCAGTTTAAACAAGGTGCTCAG < 1:627353/99‑1 CCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTCGGACATTAACCGTTGTAGGAGCGGGTTTAGCCGCGAAGAGGCCGGCGCAGTTTAAACAAGGTGCTCAG > 2:627353/1‑99 CTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTCGGACATTAACCGTTGTAGGAGCGGGTTTAGCCGCGAAGAGGCCGGCGCAGTTTAAACAAGGTGCTCAGGTATAGATCATCTTGCGGGTCATGCCGCCATCGACCACAAACTCCTGGCCGG > 2:51876/1‑150 CTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTCGGACATTAACCGTTGTAAGAGCGGTTTTAGCCGCGAAGAGGCCGGCGCAGTTTAAACAAGGTGCTCAGGTATAGATCATCTTGCGGGTCATGCCGCCATCGACCACAAACTCCTGGCCGG > 1:1572969/1‑150 TCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTCGGACATTAACCGTTGTAGGAGCGGGTTTAGCCGCGAAGAGGCCGGCGCAGTTTAAACAAGGTGCTCAGGTATAGATCATCTTGCGGGTCATGCCGCCATCGACCACAAACTCCTGGCCGGT < 2:1935506/150‑1 TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTCGGACATTAACCGTTGTAGGAGCGGGTTTAGCCGCGAAGAGGCCGGCGCAGTTTAAACAAGGTGCTCAGGTATAGATCATCTTGCGGGTCATGCCGCCATCGACCACAAACTCCTGGCCGGTGA < 1:91125/150‑1 TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTCGGACATTAACCGTTGTAGGAGCGGGTTTAGCCGCGAAGAGGCCGGCGCAGTTTAAACAAGGTGCTCAGGTATAGATCATCTTGCGGGTCATGCCGCCATCGACCACAAACTCCTGGCCGGTGA < 2:299510/150‑1 TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTCGGACATTAACCGTTGTAGGAGCGGGTTTAGCCGCGAAGAGGCCGGCGCAGTTTAAACAAGGTGCTCAGG < 1:69444/96‑1 TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTCGGACATTAACCGTTGTAGGAGCGGGTTTAGCCGCGAAGAGGCCGGCGCAGTTTAAACAAGGTGCTCAGG > 2:69444/1‑96 GCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTCGGACATTAACCGTTGTAGGAGCGGGTTTAGCCGCGAAGAGGCCGGCGCAGTTTAAACAAGGTGCTCAGGTATAGATCATCTTGCGGGTCATGCCGCCATCGACCACAAACTCCTGGCCGGTGACAA > 2:1527089/1‑150 CGGGTAAACCCGCTCCTACAGTCGGACAATAACCGTTGTAGGAGCGGGTTTAGCCGCGAAGAGGCCGGCGCAGTTTAAACAAGGTGCTCAGGTATAGATCATCTTGCGGGTCATGCCGCCATCGACCACAAACTCCTGGCCGGTGACAAA < 1:1172137/150‑1 GGTAAACCCGCTCCTACAGTCGGACATTAACCGTTGTAGGAGCGGGTTTAGCCGCGAAGAGGCCGGCGCAGTTTAAACAAGGTGCTCAGGTATAGATCATCTTGCGGGTCATGCCGCCATCGACCACAAACTCCTGGCCGGTGACAAATG > 1:611025/1‑150 GGTAAACCCGCTCCTACAGTCGGACATTAACCGTTGTAGGAGCGGGTTTAGCCGCGAAGAGGCCGGCGCAGTTTAAACAAGGTGCTCAGGTATAGATCATCTTGCGGGTCATGCCGCCATCGACCACAAACTCCTGGCCGGTGACAAATG > 1:2060742/1‑150 GCAGGGTAGGGACCGTGGAAGATGTCGCGGCCATGGTTGCCTGGTTGCTGTCACGCCAGGCGGCATTTGTCACCGGCCAGGAGTTTGTGGTCGATGGCGGCATGACCCGCAAGATGATCTATACCTGAGCACCTTGTTTAAACTGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/2271095‑2271256 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gccggcctcttcgcggGTAAACCCGCTCCTACAGTCGGACATTAACCGTTGTAGGAGCGGGTTTAGCCGCGAAGAGGCCGGCGCAGTTTAAACAAGGTGCTCAGGTATAGATCATCTTGCGGGTCATGCCGCCATCGACCACAAACTCCTGGCCGGTGACAAATG < NC_002947/2271306‑2271158 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |