New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 123578 = | 110 (1.250) | 7 (0.080) | 6/236 | NT | 6.6% | coding (290/783 nt) | znuB | zinc ABC transporter permease |
? | NC_002947 | 123598 = | 93 (1.110) | coding (270/783 nt) | znuB | zinc ABC transporter permease |
Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
CACAGCGCAGCGAGCAGCAGCAGGACCAGTGCGCTGCCACCGAGGATCCAGGCCAGGTCGGTGGTGCTGATGGCCAGCAGATCGC‑CGAACAGGTAAGCCATCAGGTCGATGCGCACATCGTGCATGAAGCTCAGCACCACCAGGCCCAGCGACAAGGTGCTGGGGGCCAGGATACCCAGGAGGGTGTCGGAGGCCAGCGGCTGGCGTTGCTGCAATGTCACCAGCAGAATCGCCAGCAACAGGCAGCCCACGGTTACCGCCAGTGCGGGGCTGACATCCAGGGCAAAGCCCAAG > NC_002947/123434‑123727 | gcgcagcgAGCAGCAGCAGGACCAGTGCGCTGCCACCGAGGATCCAGGCCAGGTCGGTGGTGCTGATGGCCAGCAGATCGC‑CGAACAGGTAAGCCATCAGGTCGATGCGCACATCGTGCATGAAGCTCAGCACCACCAGGCCCAGCGACa > 1:2101157/1‑150 (MQ=255) gcgcagcgAGCAGCAGCAGGACCAGTGCGCTGCCACCGAGGATCCAGGCCAGGTCGGTGGTGCTGATGGCCAGCAGATCGC‑CGAACAGGTAAGCAATAAGATCGATGCGCACATCGTGCATGAAGCTCAGCACCACCAGGCCCAGCGACa > 1:1323450/1‑150 (MQ=255) cagcgAGCAGCAGCAGGACCAGTGCGCTGCCACCGAGGATCCAGGCCAGGTCGGTGGTGCTGATGGCCAGCAGATCGC‑CGAACAGGTAAGCCATCAGGTCGATGCGCACATCGGGCATGGAGCTCAGCACCACCAGGCCCATCGACAAgg < 2:342376/150‑1 (MQ=255) gcgAGCAGCAGCAGGACCAGTGCGCTGCCACCGAGGATCCAGGCCAGGTCGGTGGTGCTGATGGCCAGCAGATCGC‑CGAACAGGTAAGCCATCAGGTCGATGCGCACATCGTGCATGAAGCTCAGCACCACCAGGCCCAGCGACAAGGTg < 1:111621/150‑1 (MQ=255) cgAGCAGCAGCAGGACCAGTGCGCTGCCACCGAGGATCCAGGCCAGGTCGGTGGTGCTGATGGCCAGCAGATCGC‑CGAACAGGTAAGCCATCAGGTCGATGCGCACATCGTGCATGAAGCTCAGCACCACCAGGCCCAGCGACAAGGTGc > 2:2130688/1‑150 (MQ=255) agcagcagcAGGACCAGTGCGCTGCCACCGAGGATCCAGGCCAGGTCGGTGGTGCTGATGGCCAGCAGATCGC‑CGAACAGGTAAGCCATCAGGTCGATGCGCACATCGTGCATGAAGCTCAGCACCACCAGGCCCAGCGACAAGGTGCTg < 2:1187136/150‑1 (MQ=255) cagcagcagGACCAGTGCGCTGCCACCGAGGATCCAGGCCAGGTCGGTGGTGCTGATGGCCAGCAGATCGC‑CGAACAGGTAAGCCATCAGGTCGATGCGCACATCGTGCATGAAGCTCAGCACCACCAGGCCCAGCGACAAGGTGCTggg < 1:730591/150‑1 (MQ=255) cagcagcagGACCAGCGCGCTGCCACCGAGGATCCAGGCCAGGTCGCTGGACGTCCCACACCGC‑CACCGCGCCATGAGCTAAGCCATGAGGTCGATCCGCACACCGTGCATGAAGCTCATCACCACCAGGCCCAGCGACAAGGTGCTggg < 1:2280359/150‑1 (MQ=255) gcagcagGACCAGTGCGCTGCCACCGAGGATCCAGGCCAGGTCGGTGGTGCTGATGGCCAGCAGATCGC‑CGAACAGGTAAGCCATCAGGTCGATGCGCACATCGTGCATGAAGCTCAGCACCACCAGGCCCAGCGACAAGGTGCTggggg > 1:335274/1‑150 (MQ=255) gcagGACCAGTGCGCTGCCACCGAGGATCCAGGCCAGGTCGGTGGTGCTGATGGCCAGCAGATCGC‑CGAACAGGTAAGCCATCAGGTCGATGCGCACATCGTGCATGAAGCTCAGCACCACCAGGCCCAGCGACAAGGTGCTGGGGGCCa < 1:961671/150‑1 (MQ=255) gcagGACCAGTGCGCTGCCACCGAGGATCCAGGCCAGGTCGGTGGTGCTGATGGCCAGCAGATCGC‑CGAACAGGTAAGCCATCAGGTCGATGCGCACATCGTGCATGAAGCTCAGCACCACCAGGCCCAGCGACAAGGTGCTGGGGGCCa < 2:269965/150‑1 (MQ=255) gctttgccctggatgtcagccccgcactggcggtaaccgtgggctgcctgttgctggcgattctgctggtgacattgcagcaacgccagccgctggcctccgacaccctcctgggtatcctggccCCCAGCGACAAGGTGCTGGGGGCCa > 1:1218603‑M1/126‑150 (MQ=255) aagGAACAGTGCGCTGCCACCGAGGATCCATGCCAGGTCGGTGGTGCTGATGGCCAGCAGATCGC‑CGAACAGGTAAGCCATCAGGTCGATGCGCACATCGTGCATGAAGCTCAGCACCACCAGGCCCAGCGACAAGGTGCTGGGGGCCAg < 1:1652770/149‑1 (MQ=255) ggACCAGTGCGCTGCCACCGAGGATCCAGGCCAGGTCGGTGGTGCTGATGGCCAGCAGATCGC‑CGAACAGGTAAGCCATCAGGTGGATGCGCACATCGTGCATGAAGCTCAGCACCACCAGGCCCAGCGACAAGGTGCTGGGGGCCAGGa < 1:806176/150‑1 (MQ=255) cgcTGCCACCGAGGATCCAGGCCAGGTCGGTGGTGCTGATGGCCAGCAGATCGC‑CGAACAGGTAAGCCATCAGGTCGATGCGCACATCGTGCATGAAGCTCAGCACCACCAGGCCCAGCGACAAGGTGCTGGGGGCCAGGATACCCagga < 2:2157004/150‑1 (MQ=255) gcTGCCACCGAGGATCCAGGCCAGGTCGGTGGTGCTGATGGCCAGCAGATCGC‑CGAACAGGTAAGCCATCAGGTCGATGCGCACATCGTGCATGAAGCTCAGCACCACCAGGCCCAGCGACAAGGTGCTGGGGGCCAGGATACCCaggag < 2:1897743/150‑1 (MQ=255) ccGAGGATCCAGGCCAGGTCGGTGGTGCTGATGGCCAGCAGATCGC‑CGAACAGGTAAGCCATCAGGTCGATGCGCACATCGTGCATGAAGCTCAGCACCACCAGGCCCAGCGACAAGGTGCTGGGGGCCAGGATACCCAGGAGGGTGTCg > 1:1315059/1‑150 (MQ=255) cGAGGATCCAGGCCAGGTCGGTGGTGCTGATGGCCAGCAGATCGC‑CGAACAGGTAAGCCATCAGGTCGATGCGCACATCGTGCATGAAGCTCAGCACCACCAGGCCCAGCGACAAGGTGCTGGGGGCCa > 2:1806037/1‑129 (MQ=255) cGAGGATCCAGGCCAGGTCGGTGGTGCTGATGGCCAGCAGATCGC‑CGAACAGGTAAGCCATCAGGTCGATGCGCACATCGTGCATGAAGCTCAGCACCACCAGGCCCAGCGACAAGGTGCTGGGGGCCa < 1:1806037/129‑1 (MQ=255) gggATCCAGGCCAGGTCGGTGGTGCTGATGGCCAGCAGATCGC‑CGAACAGGTAAGCCATCAGGTCGATGCGCACATCGTGCATGAAGCTCAGCACCACCAGGCCCAGCGACAAGGTGCTGGGGGCCAGGATACCCAGGAGGGTGTCGGAg < 2:1242003/149‑1 (MQ=255) aGGATCCAGGCCAGGTCGGTGGTGCTGATGGCCAGCAGATCGC‑CGAACAGGTAAGCCATCAGGTCGATGCGCACATCGTGCATGAAGCTCAGCACCACCAGGCCCAGCGACAAGGTGCTGGGGGCAAGGATACCCAGGAGGGTGTCGGAg > 2:362003/1‑150 (MQ=255) ggATCCAGGCCAGGTCGGTGGTGCTGATGGCCAGCAGATCGC‑CGAACAGGTAAGCCATCAGGTCGATGCGCACATCGTGCATGAAGCTCAGCACCACCAGGCCCAGCGACAAGGTGCTTGGGGCCAGGATACCCAGGAGGGTGTCGGAgg < 2:750003/150‑1 (MQ=255) gATCCAGGCCAGGTCGGTGGTGCTGATGGCCAGCAGATCGC‑CGAACAGGTAAGCCATCAGGTCGATGCGCACATCGTGCATGAAGCTCAGCACCACCAGGCCCAGCGACAAGGTGCTGGGGGCCAGGATACCCAGGAGGGTGTCGGAGGc < 1:2147071/150‑1 (MQ=255) tCCAGGCCAGGTCGGTGGTGCTGATGGCCAGCAGATCGC‑CGAACAGGTAAGCCATCAGGTCGATGCGCACATCGTGCATGAAGCTCAGCACCACCAGGCCCAGCGACAAGGTGCTGGGGGCCAGGATACCCAGGAGGGTGTCGGAGGCCa > 1:887724/1‑150 (MQ=255) ccaggccaggTCGGTGGTGCTGATGGCCAGCAGATCGC‑CGAACAGGTAAGCCATCAGGTCGATGCGCACATCGTGCATGAAGCTCAGCACCACCAGGCCCAGCGACAAGGTGCTGGGGGCCAGGATACCCAGGAGGGTGTCGGAg > 1:438878/1‑145 (MQ=255) ccaggccaggTCGGTGGTGCTGATGGCCAGCAGATCGC‑CGAACAGGTAAGCCATCAGGTCGATGCGCACATCGTGCATGAAGCTCAGCACCACCAGGCCCAGCGACAAGGTGCTGGGGGCCAGGATACCCAGGAGGGTGTCGGAg < 2:438878/145‑1 (MQ=255) aggccaggTCGGTGGTGCTGATGGCCAGCAGATCGC‑CGAACAGGTAAGCCATCAGGTCGATGCGCACATCGTGCATGAAGCTCAGCACCACCAGGCCCAGc < 2:2305870/101‑1 (MQ=255) aggTCGGTGGTGCTGATGGCCAGCAGATCGC‑CGAACAGGTAAGCCATCAGGTCGATGCGCACATCGTGCATGAAGCTCAGCACCACCAGGCCCAGCGACAAGGTGCTGGGGGcc > 2:2293044/1‑114 (MQ=255) aggTCGGTGGTGCTGATGGCCAGCAGATCGC‑CGAACAGGTAAGCCATCAGGTCGATGCGCACATCGTGCATGAAGCTCAGCACCACCAGGCCCAGCGACAAGGTGCTGGGGGcc < 1:2293044/114‑1 (MQ=255) aggTCGGTGGTGCTGATGGCCAGCAGATCGC‑CGAACAGGTAAGCCATCAGGTCGATGCGCACATCGTGCATGAAGCTCAGCACCACCAGGCCCAGCGACAAGGTGCTGGGGGCCAGGATACCCAGGAGGGTGTCGGAGGCCAGCGGCTgg < 1:1257282/150‑1 (MQ=255) gtgggctgcctgttgctggcgattctgctggtgacattgcagcaacgccagccgctggcctccgacaccctcctgggtatcctggccCCCAGCGACAAGGTGCTgggg < 2:1873056‑M1/21‑1 (MQ=255) gtgggctgcctgttgctggcgattctgctggtgacattgcagcaacgccagccgctggcctccgacaccctcctgggtatcctggccCCCAGCGACAAGGTGCTgggg > 1:1873056‑M1/88‑108 (MQ=255) tggtgCTGATGGCCAGCAGATCGC‑CGAACAGGTAAGCCATCAGGTCGATGCGCACATCGTGCATGAAGCTCAGCACCACCAGGCCCAGCGACAAGGTGCTGGGGGCCAGGATACCCAGGAGGGTGTCGGAGGCCAGCGGCTGGCGTtgct > 2:1876815/1‑150 (MQ=255) gtgCTGATGGCCAGCAGATCGC‑CGAACAGGTAAGCCATCAGGTCGATGCGCACATCGTGCATGAAGCTCAGCACCACCAGGCCCAGCGACAAGGTGCTGGGGGCCAGGATACCCag > 2:243529/1‑116 (MQ=255) gtgCTGATGGCCAGCAGATCGC‑CGAACAGGTAAGCCATCAGGTCGATGCGCACATCGTGCATGAAGCTCAGCACCACCAGGCCCAGCGACAAGGTGCTGGGGGCCAGGATACCCag < 1:243529/116‑1 (MQ=255) 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aGCTCAGCACCACCAGGCCCAGCGACAAGGTGCTGGGGGCCAGGATACCCAGGAGGGTGTCGGAGGCCAGCGGCTGGCGTTGCTGCAATGTCACCAGCAGAATCGCCAGCAACAGGCAGCCCACg > 1:2146861/1‑125 (MQ=255) aGCTCAGCACCACCAGGCCCAGCGACAAGGTGCTGGGGGCCAGGATACCCAGGAGGGTGTCGGAGGCCAGCGGCTGGCGTTGCTGCAATGTCACCAGCAGAATCGCCAGCAACAGGCAGCCCACg < 2:2146861/125‑1 (MQ=255) tCAGCACCACCAGGCCCAGCGACAAGGTGCTGGGGGCCAGGATACCCagga > 2:1286526/1‑51 (MQ=255) tCAGCACCACCAGGCCCAGCGACAAGGTGCTGGGGGCCAGGATACCCAGGAGGGTGTCGGAGGCCAGCGGCTGGCGTTGCTGCAATGTCACCAGCAGAATCGCCAGCAACAGGCAGCCCACGGTTACCGCCAGTGCGGGGCTGACATCCa > 2:2334737/1‑150 (MQ=255) catcaccacCAGGCCCAGCGACAAGGTGCTGGGCGCCAGGATACCCAGGAGGGTGTCGGAGGCCAGCGGCTGGCGTTGCTGCAATGTCACCATCAGAATCGCCAGCAACAGGCAGCCCACGGTTACCGCCAGTGCGGGGCTGACATCCAg < 2:954801/147‑1 (MQ=255) aGCACCACCAGGCCCAGCGACAAGGTGCTGGGGGCCAGGATACCCAGGAGGGTGTCGGAGGCCAGCGGCTGGCGTTGCTGCAATGTCACCAGCAGAATCGCCAGCAACAGGCAGCCCACGGTTACCGCCAGTGCGGGGCTGACATCCCgg < 1:2334737/150‑1 (MQ=255) aGCACCACCAGGCCCAGCGACAAGGTGCTGGGGGCCAGGATACCCAGGAGGGTGTCGGAGGCCAGCGGCTGGCGTTGCTGCAATGTCACCAGCAGAATCGCCAGCAACAGGCAGCCCACGGTTACCGCCAGTGCGGGGCTGACATCCAgg < 1:1060231/150‑1 (MQ=255) gCACCACCAGGCCCAGCGACAAGGTGCTGGGGGCCAGGATACCCAGGAGGGTGTCGGAGGCCAGCGGCTGGCGTTGCTGCAATGTCACCAGCAGAATCGCCAGCAACAGGCAGCCCACGGTTACCGc < 2:164741/127‑1 (MQ=255) gCACCACCAGGCCCAGCGACAAGGTGCTGGGGGCCAGGATACCCAGGAGGGTGTCGGAGGCCAGCGGCTGGCGTTGCTGCAATGTCACCAGCAGAATCGCCAGCAACAGGCAGCCCACGGTTACCGCCAGTGCGGGGCTGACATCCAggg > 1:2086998/1‑150 (MQ=255) caccacCAGGCCCAGCGACAAGGTGCTGGGGGCCAGGATACCCAGGAGGGTGTCGGAGGCCAGCGGCTGGCGTTGCTGCAATGTCACCAGCAGAATCGCCAGCAACAGGCAGCCCACGGTTACCGCCAGTGCGGGGCTGACATCCAGGGc < 1:1631415/150‑1 (MQ=255) caccaGGCCCAGCGACAAGGTGCTGGGGGCCAGGATACCCAGGAGGGTGTCGGAGGCCAGCGGCTGGCGTTGCTGCAATGTCACCAGCAGAATCGCCAGCAACAGGCAGCCCACGGTTACCGCCAGTGCggg < 2:1975094/132‑1 (MQ=255) accaGGCCCAGCGACAAGGTGCTGGGGGCCAGGATACCCAGGAGGGTGTCGGAGGCCAGCGGCTGGCGTTGCTGCAATGTCACCAGCAGAATCGCCAGCAACAGGCAGCCCACGGTTACCGCCAGTGCGGGGCTGACATCCAGGGCAAAg > 2:1624819/1‑150 (MQ=255) ccaGGCCCAGCGACAAGGTGCTGGGGGCCAGGATACCCaggagg < 2:1042958/44‑1 (MQ=255) ccaGGCCCAGCGACAAGGTGCTGGGGGCCAGGATACCCaggagg > 1:1042958/1‑44 (MQ=255) caGGCCCAGCGACAAGGTGCTGGGGGCCAGGATACCCAGGAGGGTGTCGGAGGCCAGCGGCTGGc < 1:1907000/65‑1 (MQ=255) aGGCCCAGCGACAAGGTGCTGGGGGCCAGGATACCCAGGAGGGTGTCGGAGGCCAGCGGCTGGCGTTGCTGCAATGTCACCAGCAGAATCGCCAGCAACAGGCAGCCCACGGTTACCGCCAGTGCGGGGCTGACATCCAGGGCAAAGccc < 2:2086998/150‑1 (MQ=255) gCCCAGCGACAAGGTGCTGGGGGCCAGGATACCCAGGAGGGTGTCGGAGGCCAGCGGCTGGCGTTGCTGCAATGTCACCAGCAGAATCGCCAGCAACAGGCAGCCCACGGTTACCGCCAGTGCGGGGCTGACATCCAGGGCAAAGCCCaa > 1:195848/1‑150 (MQ=255) gCCCAGCGACAAGGTGCTGGGGGCCAGGATACCCAGGAGGGTGTCGGAGGCCAGCGGCTGGCGTTGCTGCAATGTCACCAGCAGAATCGCCAGCAACAGGCAGCCCACGGTTAACGCCAGTGCGGGGCTGACATCCAGGGCAAAGCCCaa < 1:1300363/150‑1 (MQ=255) | CACAGCGCAGCGAGCAGCAGCAGGACCAGTGCGCTGCCACCGAGGATCCAGGCCAGGTCGGTGGTGCTGATGGCCAGCAGATCGC‑CGAACAGGTAAGCCATCAGGTCGATGCGCACATCGTGCATGAAGCTCAGCACCACCAGGCCCAGCGACAAGGTGCTGGGGGCCAGGATACCCAGGAGGGTGTCGGAGGCCAGCGGCTGGCGTTGCTGCAATGTCACCAGCAGAATCGCCAGCAACAGGCAGCCCACGGTTACCGCCAGTGCGGGGCTGACATCCAGGGCAAAGCCCAAG > NC_002947/123434‑123727 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |