New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 170824 = | 81 (0.920) | 5 (0.060) | 7/220 | NT | 6.8% | intergenic (+5/‑565) | PP_0159/PP_16SA | family III CoA‑transferase/16S ribosomal RNA |
? | NC_002947 | 170856 = | 65 (0.830) | intergenic (+37/‑533) | PP_0159/PP_16SA | family III CoA‑transferase/16S ribosomal RNA |
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
GCCCGATACGGTTGTCGGAGACGCCAGTGGAGTATCGCCGGGCGCCACCACTGCTGGGCGAGCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATCCCCTTATAATGCGCCCCACTTCCAGCGACATCGGAACGAAAAACTCCTTGAGATTCA > NC_002947/170677‑170967 | ccctttcagcttttgccttaactacttaactcattgaatctcaaggagtttttcgttccgatgtcgctggaagtggggcgcattataaggggattcgagagggcgtcaacctttaatttcaattacctttgatagcgctgaaaaacAAAg < 1:1768838‑M1/4‑1 (MQ=255) ccGATACGGTTGTCGGAGACGCCAGTGGAGTATCGCCGGGCGCCACCACTGCTGGGCGAGCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGc < 1:279846/150‑1 (MQ=255) ccGATACGGTTGTCGGAGACGCCAGTGGAGTATCGCCGGGCGCCACCACTGCTGGGCGAGCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGc > 2:457114/1‑150 (MQ=255) tttcagcttttgccttaactacttaactcattgaatctcaaggagtttttcgttccgatgtcgctggaagtggggcgcattataaggggattcgagagggcgtcaacctttaatttcaattacctttgatagcgctgaaaaacAAAGCgg < 2:1980878‑M1/7‑1 (MQ=255) aTACGGTTGTCGGAGACGCCAGTGGAGTATCGCCGGGCGCCACCACTGTGTGGTGAGCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCggg < 1:1310827/150‑1 (MQ=255) aTACGGTTGTCGGAGACGCCAGTGGAGTATCGCCGGGCGCCACCACTGCTGGGCGAGCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCggg < 1:863855/150‑1 (MQ=255) aTACGGTTGTCGGAGACGCCAGTGGAGTATCGCCGGGCGCCACCACTGCTGGGCGAGCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATCCGAGGGTGCTCTAGATGAAAAGCggg < 1:1483581/150‑1 (MQ=255) ggTTGTCGGAGACGCCAGTGGAGTATCGCCGGGCGCCACCACTGCTGGGCGAGCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAgg < 1:674947/150‑1 (MQ=255) ggTTGTCGGAGACGCCAGTGGAGTATCGCCGGGCGCCACCACTGCTGGGCGAGCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGGGCTCTAGATGAAAAGCGGAGAgg > 1:676940/1‑150 (MQ=255) gtttttacttaactacttcactcattgaatctcaaggagtttttcgttccgatgtcgctggaagtggggcgaattataaggggattcgagagggcgtcaacctttaatttccctcacctttgatagcgctgaaaaacAAAGCGGAGAGGc > 1:1016105‑M1/138‑150 (MQ=255) cttttgccttaactacttaactcattgaatctcaaggagtttttcgttccgatgtcgctggaagtggggcgcattataaggggattcgagagggcgtcaacctttaatttcaattacctttgatagcgctgaaaaacAAAGCGGGGAGGc > 1:1575615‑M1/138‑150 (MQ=255) cttttgccttaactacttaactcattgaatctcaaggagtttttcgttccgatgtcgctggaagtggggcgcattataaggggattcgagagggcggcaacctttaatttcaattacctttgatagcgctgaaaaacAAAGCGGGGAGGc > 2:2070820‑M1/138‑150 (MQ=255) tgccttaactacttaactcattgaatctcaaggagtttttcgttccgatgtcgctggaagtggggcgcattataaggggattcgagagggcgtcaacctttaatttcaattacctttgatagcgctgaaaaacAAAGCGGGGAGGCC‑GTc > 1:1724552‑M1/134‑150 (MQ=255) gcGGAGACGTCAGTGGAGTATCGCCGTGCGTCACCACTGCTGGGCGAGCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTc < 1:1647511/149‑1 (MQ=255) ggAGACGCCAGTGGAGTATCGCCGGGCGCCACCACTGCTGGGCGAGCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGTGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAg < 2:80088/150‑1 (MQ=255) actacttaactcattgaatctcaaggagtttttcgttccgatgtcgctggaagtggggcgcattataaggggattcgagagggcgtcaacctttaatttcaattacctttgatagcgctgaaaaacAAAGc < 2:798466‑M1/5‑1 (MQ=255) actacttaactcattgaatctcaaggagtttttcgttccgatgtcgctggaagtggggcgcattataaggggattcgagagggcgtcaacctttaatttcaattacctttgatagcgctgaaaaacAAAGc > 1:798466‑M1/127‑131 (MQ=255) cagggtaGTATCGCCGGGCGCCACCACTGCTGGGCGAGCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTcccc > 2:624859/7‑150 (MQ=255) ggTGGAGTCTCGCCGGGCGCCAACACTGCTGGGCGAGCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCg < 2:311428/149‑1 (MQ=255) aGTGGAGTATCGCCGGGCGCCACCACTGCTGGGCGAGCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGACGGATGGGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCg > 1:1874435/1‑150 (MQ=255) tCGCCGGGCGCCACCACTGCTGGGCGAGCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGtttt > 1:687063/1‑150 (MQ=255) gggCGCCACCACTGCTGGGCGAGCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAgc < 2:1565283/150‑1 (MQ=255) cgcCACCACTGCTGGGCGAGCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCt > 2:232536/1‑150 (MQ=255) caccacTGCTGGGCGAGCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATc < 2:874459/150‑1 (MQ=255) cacTGCTGGGCGAGCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCaaa < 1:1782179/150‑1 (MQ=255) cacTGCTGGGCGAGCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGCGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCaaa < 2:1680345/150‑1 (MQ=255) acTGCTGGGCGAGCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCggg > 2:1722280/1‑106 (MQ=255) acTGCTGGGCGAGCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCggg < 2:1899655/106‑1 (MQ=255) acTGCTGGGCGAGCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCggg > 1:1899655/1‑106 (MQ=255) acTGCTGGGCGAGCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCggg < 1:1722280/106‑1 (MQ=255) tttcgttccgatgtcgctggaagtggggcgcattataaggggattcgagagggcgtcaacctttaatttcaattacctttgatagcgctgaaaaacAAAGCGGGGAGGc > 1:1172330‑M1/97‑109 (MQ=255) tttcgttccgatgtcgctggaagtggggcgcattataaggggattcgagagggcgtcaacctttaatttcaattacctttgatagcgctgaaaaacAAAGCGGGGAGGc < 2:1172330‑M1/13‑1 (MQ=255) tgctgGGCGAGCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGt < 2:980446/150‑1 (MQ=255) tgctgGGCGAGCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGt > 1:2060521/1‑150 (MQ=255) tcgttccgatgtcgctggaagtggggcgcattataaggggattcgagagggcgtcaacctttaatttcaattacctttgatagcgctgaaaaacAAAGCGGGGAGGCC‑GTc < 1:2063556‑M1/17‑1 (MQ=255) tcgttccgatgtcgctggaagtggggcgcattataaggggattcgagagggcgtcaacctttaatttcaattacctttgatagcgctgaaaaacAAAGCGGGGAGGCC‑GTc > 2:2063556‑M1/95‑111 (MQ=255) ggCGAGCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCgg > 2:1344460/1‑98 (MQ=255) ggCGAGCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCgg < 1:1344460/98‑1 (MQ=255) gAGCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGaaa < 1:338392/150‑1 (MQ=255) gAGCATACCGAAGTGGTGCTGAGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGaaa > 2:862460/1‑150 (MQ=255) gatgtcgctggaagtggggcgcattataaggggattcgagagggcgtcaacctttaatttcaattacctttgatagcgctgaaaaacAAAGCggg > 1:2089072‑M1/88‑95 (MQ=255) gatgtcgctggaagtggggcgcattataaggggattcgagagggcgtcaacctttaatttcaattacctttgatagcgctgaaaaacAAAGCggg < 2:2089072‑M1/8‑1 (MQ=255) aCCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTccc < 2:1145484/108‑1 (MQ=255) aCCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTccc > 1:1145484/1‑108 (MQ=255) ccGAAGTGGGGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAgg < 2:453587/150‑1 (MQ=255) ctgttgCTGGGGTAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GGCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGAc < 1:2145379/146‑1 (MQ=255) tggtgCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTaaa > 2:664942/1‑142 (MQ=255) tggtgCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGCACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTaaa < 1:664942/142‑1 (MQ=255) gtgCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGcc < 1:844645/150‑1 (MQ=255) tgCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGccc < 2:50515/150‑1 (MQ=255) ggggAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAAt < 2:825962/124‑1 (MQ=255) ggAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGaa > 2:494865/1‑150 (MQ=255) gAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGa < 2:342266/124‑1 (MQ=255) gAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGa > 1:342266/1‑124 (MQ=255) 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(MQ=255) gATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGAc > 2:2183921/1‑96 (MQ=255) tGCTGGGGTGCTCTAGCTCAACAGCGGGGCGACC‑GTCAGGACTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATCCCCTTATAATGCGCCCCACTTCCAGCGACATCGGAACGaaaaa < 2:1874435/150‑1 (MQ=25) tGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATCCCCTTATAATGCGCCCCACTTCCAGCGACATCGGAACGaaaaa < 1:2093143/150‑1 (MQ=255) tGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATCCCCTTATAATGCGCCCCACTTCCAGCGACATCGGAACGAAAAACTc < 1:28326/150‑1 (MQ=255) gggTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATCCCCTTATAATGCGCCCCACTTCCAGCGACATCGGAACGAAAAACTCCt > 2:2218332/1‑150 (MQ=255) gTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATCCCCTTATAATGCGCCCCACTTCCAGCGACATCGGAACGAAAAACTCCTTg < 2:889401/150‑1 (MQ=255) tGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATCCCCTTATAATgcgc > 2:2159084/1‑113 (MQ=255) tGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATCCCCTTATAATgcgc < 1:2159084/113‑1 (MQ=255) ctAGATGAGAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATCCCCTTATAAGGCTGTCCTCTTCCAGCGACATCGGAACGAAAAACTCCTTGAGAtt < 1:2158406/150‑1 (MQ=25) ctAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATCCCCTTATAATGCGCCCCACTTCCAGCGACATCGGAACGAAAAACTCCTTGAGAtt < 1:1469736/150‑1 (MQ=255) aaaaacAAAGCGGGGAGGCCTGAC‑GGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATCCCCTTATAATGCGCCCCACTTCCAGCGACATCGGAACGAAAAACTCCTTGAGATTCa < 1:1086668‑M1/144‑1 (MQ=255) gATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATCCCCTTATAATGCGCCCCACTTCCAg > 1:1396205/1‑117 (MQ=255) gATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATCCCCTTATAATGCGCCCCACTTCCAg < 2:1396205/117‑1 (MQ=255) aaacAAAGCGGGGAGGCCTGAC‑GGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATCCCCTTATAATGCGCCCCACTTCCAGCGACATc > 1:1569454‑M1/5‑123 (MQ=255) aaacAAAGCGGGGAGGCCTGAC‑GGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATCCCCTTATAATGCGCCCCACTTCCAGCGACATc < 2:1569454‑M1/119‑1 (MQ=255) aTGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATCCCCTTATAATGCGCCCCACTTCCAGCGACATCGGAAc < 1:1314783/128‑1 (MQ=255) aTGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATCCCCTTATAATGCGCCCCACTTCCAGCGACATCGGAAc > 2:1314783/1‑128 (MQ=255) | GCCCGATACGGTTGTCGGAGACGCCAGTGGAGTATCGCCGGGCGCCACCACTGCTGGGCGAGCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATCCCCTTATAATGCGCCCCACTTCCAGCGACATCGGAACGAAAAACTCCTTGAGATTCA > NC_002947/170677‑170967 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |