| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 170824 = | 81 (0.920) | 5 (0.060) | 7/220 | NT | 6.8% | intergenic (+5/‑565) | PP_0159/PP_16SA | family III CoA‑transferase/16S ribosomal RNA |
| ? | NC_002947 | 170856 = | 65 (0.830) | intergenic (+37/‑533) | PP_0159/PP_16SA | family III CoA‑transferase/16S ribosomal RNA | |||||
TCGCCGGGCGCCACCACTGCTGGGCGAGCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATCCCCTTATAATGCGCCCCACTTCCAGCGACATCGGAACGAAAAACTCCTTGAGATTCAATGAGTTAAGTAGTTAAGGCAAAAGCTGAAAGGGCTAC > NC_002947/170711‑171005 | tCGCCGGGCGCCACCACTGCTGGGCGAGCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGtttt > 1:687063/1‑150 (MQ=255) tgaatctcaaggagtttttcgttccgatgtcgctggaagtggggcgcattataaggggattcgagagggcgtcaacctttaatttcaattacctttgatagcgctgaaaaacaaagcggggaggccgtcaggcctccccgctttGttttt < 1:1086668‑M2/6‑1 (MQ=255) gggCGCCACCACTGCTGGGCGAGCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAgc < 2:1565283/150‑1 (MQ=255) cgcCACCACTGCTGGGCGAGCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCt > 2:232536/1‑150 (MQ=255) caccacTGCTGGGCGAGCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATc < 2:874459/150‑1 (MQ=255) cacTGCTGGGCGAGCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCaaa < 1:1782179/150‑1 (MQ=255) cacTGCTGGGCGAGCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGCGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCaaa < 2:1680345/150‑1 (MQ=255) tgctgGGCGAGCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGt < 2:980446/150‑1 (MQ=255) tgctgGGCGAGCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGt > 1:2060521/1‑150 (MQ=255) gAGCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGaaa < 1:457114/150‑1 (MQ=255) gAGCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGaaa < 1:338392/150‑1 (MQ=255) gAGCATACCGAAGTGGTGCTGAGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGaaa > 2:862460/1‑150 (MQ=255) gatgtcgctggaagtggggcgcattataaggggattcgagagggcgtcaacctttaatttcaattacctttgatagcgctgaaaaacaaagcggggaggccgtcaggcctccccgctttGttt < 2:1569454‑M2/4‑1 (MQ=255) gatgtcgctggaagtggggcgcattataaggggattcgagagggcgtcaacctttaatttcaattacctttgatagcgctgaaaaacaaagcggggaggccgtcaggcctccccgctttGttt > 1:1569454‑M2/120‑123 (MQ=255) ccGAAGTGGGGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAgg < 2:453587/150‑1 (MQ=255) ctgttgCTGGGGTAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GGCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGAc < 1:2145379/146‑1 (MQ=255) tggtgCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTaaa > 2:664942/1‑142 (MQ=255) tggtgCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGCACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTaaa < 1:664942/142‑1 (MQ=255) gtgCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGcc < 1:844645/150‑1 (MQ=255) tgCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGccc < 2:50515/150‑1 (MQ=255) ggggAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAAt < 2:825962/124‑1 (MQ=255) ggggAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAAt > 1:825962/1‑124 (MQ=255) ggAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGaa > 2:494865/1‑150 (MQ=255) ggAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGaa > 2:1768838/1‑150 (MQ=255) gAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGa > 1:342266/1‑124 (MQ=255) gAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGa < 2:342266/124‑1 (MQ=255) gAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAAt > 1:1511363/1‑150 (MQ=255) tgtTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATcccc < 2:1511363/150‑1 (MQ=255) ttGGGGCTGGATGCTGGAGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATCCCCtt > 2:1691517/1‑150 (MQ=255) ctGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATCCCCtt > 2:1257273/2‑150 (MQ=255) ggggattcgagagggcgtcaacctttaatttcaattacctttgatagcgctgaaaaacaaagcggggaggccgtcaggcctccccggtttGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTa < 1:1817700‑M2/23‑1 (MQ=255) ggggattcgagagggcgtcaacctttaatttcaattacctttgatagcgctgaaaaacaaagcggggaggccgtcaggcctccccgctttGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTa > 2:1817700‑M2/91‑113 (MQ=255) ggCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAAt < 2:765010/140‑1 (MQ=255) ggCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAAt > 1:765010/1‑140 (MQ=255) tGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATCCCCTTATAATgc > 2:1469736/1‑150 (MQ=255) tGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATCCCCTTATAATgc < 1:1187734/150‑1 (MQ=255) gATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATCCCCTTATAATgcgc < 1:2215238/150‑1 (MQ=255) gATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCACCGGTGTTTTTCAGCGCTATAAAAGATACTTGAAATTTAAGTTGTACGCCCTCTCGAATCCCCTTATAATtcgc > 1:2270611/1‑150 (MQ=255) gATGCTGGCGAGGGACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGCAAAGAGGGGGGACG‑CTGAGATCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATCCCCTTATAATgcgc < 1:862460/150‑1 (MQ=37) aTGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGttttt < 2:1100910/86‑1 (MQ=255) aTGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGttttt > 1:1100910/1‑86 (MQ=255) aTGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATCCCCTTATAATGCGcc < 2:2060521/150‑1 (MQ=255) tGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATCCCCCTATAACGCGCCCCAc > 2:2158406/1‑150 (MQ=255) gTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTGTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCGCTCTCGAATCCCCTTATAATGCGCCCCACTTCCAGc > 1:1654953/1‑150 (MQ=255) gTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATCCCCTTATAATGCGCCCCACTTCCAGc > 1:739910/1‑150 (MQ=255) gTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATCCCCTTATAATGCGCCCCACTTCCAGc < 1:232536/150‑1 (MQ=255) tACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATCCCCTTATAATGCGCCCCACTTCCa > 2:2130382/1‑147 (MQ=255) tACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATCCCCTTATAATGCGCCCCACTTCCa < 1:2130382/147‑1 (MQ=255) tACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATCCCCTTATAATGCGCCCCACTTCCAGCg > 2:28326/1‑150 (MQ=255) tGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTaa > 1:321055/1‑93 (MQ=255) tGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTaa < 2:321055/93‑1 (MQ=255) tGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATCCCCTTATTGAACTCCCCACTTCCAGCGACATCGGaa > 1:1755597/1‑150 (MQ=38) tGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGAC‑GTCAGGCCTCACCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATCCCCTTATAATGCGCCCCACTTCCAGCGACATCGGaa < 1:1430192/150‑1 (MQ=255) 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gctttGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATCCCCTTATAATGCGCCCCACTTCCAGCGACATCGGAACGAAAAACTCCTTGAGATTCAATGAGTTAagtagt < 2:798466‑M2/126‑1 (MQ=255) ctttGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATCCCCTTATAATGCGCCCCACTTCCAGCGACATCGGAACGAAAAACTCCTTGAGATTCAATGAGTTAAGTAGTTAAGGCAAAAGCTGAAAggg < 1:1768838‑M2/146‑1 (MQ=255) gTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATCCCCTTATAATGCGCCCCACTTCCAGCGACATCGGAACGAAAAACTCCTTGAGATTCAATGAGTTAAGTAGTTAAGGCAAAAGCTGAAAGGGCTAc < 1:2218332/150‑1 (MQ=255) | TCGCCGGGCGCCACCACTGCTGGGCGAGCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCC‑GTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATCCCCTTATAATGCGCCCCACTTCCAGCGACATCGGAACGAAAAACTCCTTGAGATTCAATGAGTTAAGTAGTTAAGGCAAAAGCTGAAAGGGCTAC > NC_002947/170711‑171005 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |