| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 274134 = | 84 (0.950) | 11 (0.130) | 11/238 | NT | 11.7% | coding (436/801 nt) | PP_0221 | methionine ABC transporter substrate‑binding protein |
| ? | NC_002947 | 274166 = | 85 (1.000) | coding (404/801 nt) | PP_0221 | methionine ABC transporter substrate‑binding protein | |||||
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
GGCCGGGTAACCCTGCACCAGGTCGGCGTCGTCGTAGGCGCGTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTTGATGATGCCCGGGGCGTAAGGCACAA > NC_002947/273985‑274283 | ggCCGGGTAACCCTGCACCAGGTCGGCGTCGTCGTAGGCGCGTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAAccc < 1:605485/150‑1 (MQ=255) cGGGTAACCCTGCACCAGGTCGGCGTCGTCGTAGGCGCGTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGc > 2:1704736/1‑150 (MQ=255) cccTGCACCAGGTCGGCGTCGTCGTAGGCGCGTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGcc > 2:1232377/1‑150 (MQ=255) ccTGCACCAGGTCGGCGTCGTCGTAGGCGCGTACCAGTTGCACCGCCTAGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCGTGGcct > 1:1008597/1‑149 (MQ=255) cTGCACCAGGTCGGCGTCGTCGTAGGCGCGTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCcag > 2:115536/1‑150 (MQ=255) cTGCACCAGGTCGGCGTCGTCGTAGGCGCGTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCcag < 1:1658473/150‑1 (MQ=255) gCACCAGGTCGGCGTCGTCGTAGGCGCGTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCcagca < 1:2169262/150‑1 (MQ=255) tgcaggcttcaaccttgttccttacgccccgggcatcatcaacaacgttggcctgtactcgaaaaagtacaaaagctttgccgagctgcctgaaggcgccagcgtggccatcgccaacgacctgatcaaccCGGCCTTGGCcagcagcag < 2:2182966‑M1/19‑1 (MQ=255) gTCGGCGTCGTCGTAGGCGCGTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCcagcagcagcag > 1:2304688/1‑150 (MQ=255) ttcaaccttgtgccttacgccccgggcatcatcaacaacgttggcctgtactcgaaaaagtacaaaagctttgccgagctgcctgaaggcgccagcgtggccatcgccaacgacccgatcaacagCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGc < 2:268792‑M1/24‑1 (MQ=255) ttcaaccttgtgccttacgccccgggcatcatcaacaacgttggcctgtactcgaaaaagtacaaaagctttgccgagctgcctgaaggcgccagcgtggccatcgccaacgacccgatcaacagCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGc > 1:268792‑M1/126‑149 (MQ=255) gCGTCGTCGTAGGCGCGTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCa > 2:600147/1‑150 (MQ=255) aaccttgtgccttacgccccgggcatcatcaacaacgttggcctgtactcgaaaaagtacaaaagctttgccgagctgcctgaaggcgccagcgtggccatcgccaacgacccgatcaacagCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACg > 2:771912‑M1/123‑150 (MQ=255) gtcgtAGGCGCGTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAAGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGcc > 2:1674023/1‑150 (MQ=255) tcgtAGGCGCGTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCg > 2:570384/1‑150 (MQ=255) gtAGGCGCGTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCca > 1:1198852/1‑128 (MQ=255) gtAGGCGCGTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCca < 2:1198852/128‑1 (MQ=255) aGGCGCGTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTg < 2:1004882/122‑1 (MQ=255) aGGCGCGTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTg > 1:1004882/1‑122 (MQ=255) aGGCGCGTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGt < 2:819814/150‑1 (MQ=255) gcgTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCCGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCTTTAGCCAGCAGCAGCACGCCACGGCCGCtaatgaa > 2:52388/1‑144 (MQ=255) cgTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATc < 1:1532508/150‑1 (MQ=255) tACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCgg < 2:2111834/150‑1 (MQ=255) cAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTc < 1:600147/150‑1 (MQ=255) gCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTgg < 1:1993314/150‑1 (MQ=255) cACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTggg > 2:1658137/1‑149 (MQ=255) aCCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCg > 2:1386801/1‑150 (MQ=255) ccGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTGTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGa > 2:1755119/1‑150 (MQ=255) cGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGAt > 1:1480693/1‑150 (MQ=255) cGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCGTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTCGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTTATCGGGTCGTTCGCGAt > 2:2192424/1‑150 (MQ=255) gCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATg < 1:115536/150‑1 (MQ=255) cTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGc > 2:810887/1‑150 (MQ=255) aaGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATc > 2:256257/1‑124 (MQ=255) aaGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATc < 1:256257/124‑1 (MQ=255) ttCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCa < 1:1067330/150‑1 (MQ=255) ttCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCa > 1:947570/1‑150 (MQ=255) ttCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCa < 1:1350077/150‑1 (MQ=255) ttCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCa < 1:630322/150‑1 (MQ=255) ttCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCa < 2:1200472/150‑1 (MQ=255) tCATCTTTTTAGGGTTGGCGAGGCTGCCCGCCTAGGTGGCCTTTTACCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAg < 2:1777866/150‑1 (MQ=255) 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tGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCCGCCGGCCACTGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTTGATGATGCCCg < 2:2301335/150‑1 (MQ=255) aGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTTGATGATGCCCggg < 2:947570/150‑1 (MQ=255) gggTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCGCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTTGATGATGCCCgggg < 1:52388/150‑1 (MQ=255) ggTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCtttt < 1:346810/105‑1 (MQ=255) ggTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCtttt > 2:346810/1‑105 (MQ=255) gATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATc < 2:709920/49‑1 (MQ=255) gATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATc > 1:709920/1‑49 (MQ=255) tCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTTGATGATGccc > 1:968284/1‑140 (MQ=255) tCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTTGATGATGCCCGGGGCGTAAg < 2:2165413/150‑1 (MQ=255) cAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTTGATGATGCCCGGGGCGTAAgg < 1:1947268/150‑1 (MQ=255) aacagCGGCCGTGGCCTGCTGCTGCTGGCCAAGGCCGG‑GTTGATCAGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTTGATGATGCCCGGGGCGTAAGGc < 1:1036717‑M1/145‑1 (MQ=255) aaCCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTTGATGATGCCCGGGGCGTAAGGc > 1:664513/1‑150 (MQ=255) aCCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAgg > 2:1429950/1‑79 (MQ=255) aCCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAgg < 1:1429950/79‑1 (MQ=255) cccGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTTGATGATGCCCg < 2:1171982/137‑1 (MQ=255) cccGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTTGATGATGCCCg > 1:1171982/1‑137 (MQ=255) cccGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTTGATGATGCCCGGGGCGTAAGGcac > 1:214874/1‑150 (MQ=255) ccGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTTGATGATGCCCGGGGCGTAAGGcaca > 1:1775527/1‑150 (MQ=255) ccGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTTGATGATGCCCGGGGCGTAAGGcaca > 2:2206404/1‑150 (MQ=255) CGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCAGGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTTGATGATGCCCGGGGCGTAAGGCACaa > 1:1038610‑M1/1‑150 (MQ=255) CGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTTGATGATGCCCGGGGCGTAAGGCACaa < 1:215476‑M1/150‑1 (MQ=255) | GGCCGGGTAACCCTGCACCAGGTCGGCGTCGTCGTAGGCGCGTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTTGATGATGCCCGGGGCGTAAGGCACAA > NC_002947/273985‑274283 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |