New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 274134 = | 84 (0.950) | 11 (0.130) | 11/238 | NT | 11.7% | coding (436/801 nt) | PP_0221 | methionine ABC transporter substrate‑binding protein |
? | NC_002947 | 274166 = | 85 (1.000) | coding (404/801 nt) | PP_0221 | methionine ABC transporter substrate‑binding protein |
Only 100 of 122 total aligned reads displayed.
AGGCGCGTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTTGATGATGCCCGGGGCGTAAGGCACAAGGTTGAAGCCTGCAGCAGCCTTGGC > NC_002947/274020‑274308 | gccttacgccccgggcatcatcaacaacgttggcctgtactcgaaaaagtacaaaagctttgccgagctgcctgaaggcgccagcgtggccatcgccaacgacctgatcaacccggccttggccagcagcagcaggccacggccgCTGtt < 1:1036717‑M2/5‑1 (MQ=255) gcgTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCCGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCTTTAGCCAGCAGCAGCACGCCACGGCCGCtaatgaa > 2:52388/1‑144 (MQ=255) cgTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATc < 1:1532508/150‑1 (MQ=255) tACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCgg < 2:2111834/150‑1 (MQ=255) tACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCgg > 1:516879/1‑150 (MQ=255) cAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTc < 1:600147/150‑1 (MQ=255) cgggcatcatcaacaacgttggcctgtactcgaaaaagtacaaaagctttgccgagctgcctgaaggcgccagcgtggccatcgccaacgacccgatcaacccggccttggccagcagcagcaggccacggccgCTGTTGATCGGGTCGt < 2:243778‑M2/16‑1 (MQ=255) ggcatcatcaacaacgttggcctgtactcgaaaaagtacaaaagctttgccgagctgcctgaaggcgccagcgtggccatcgccaacgacctgatcaacccggccttggccagcagcagcaggccacggccgCTGTTGATCGGGTCGTTg < 1:1893164‑M2/18‑1 (MQ=255) gCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTgg < 2:2060411/150‑1 (MQ=255) gCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTgg < 1:1993314/150‑1 (MQ=255) cACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTggg > 2:1658137/1‑149 (MQ=255) cACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGc > 2:1392787/1‑150 (MQ=255) aCCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCg > 2:1386801/1‑150 (MQ=255) ccGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTGTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGa > 2:1755119/1‑150 (MQ=255) cGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCGTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTCGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTTATCGGGTCGTTCGCGAt > 2:2192424/1‑150 (MQ=255) gCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATg < 1:115536/150‑1 (MQ=255) cTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGc > 2:810887/1‑150 (MQ=255) aaGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATc < 1:256257/124‑1 (MQ=255) 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cAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAgg < 2:1079933/150‑1 (MQ=255) gCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATgg > 1:447558/1‑129 (MQ=255) tttttAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGAt < 1:1477076/125‑1 (MQ=255) ttAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCg < 1:1612602/150‑1 (MQ=255) aGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGgc < 2:410740/132‑1 (MQ=255) aGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGgc > 1:410740/1‑132 (MQ=255) 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gcctgctgctgctggccaaggccgCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTTGATGATGCCCGGGGCGTAAGGCACAAGGTTGaa > 1:268792‑M2/25‑149 (MQ=255) gcctgctgctgctggccaaggccgCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTTGATGATGCCCGGGGCGTAAGGCACAAGGTTGaa < 2:268792‑M2/125‑1 (MQ=255) ccAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTTGATGATGCCCGGGGCGTaa < 2:578866/134‑1 (MQ=255) ccAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTTGATGATGCCCGGGGCGTaa > 1:578866/1‑134 (MQ=255) gcagcagcagGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTTGATGATGCCCGGGGCGTAAGGCACAAGGTTGAAGCCTg < 2:664513/150‑1 (MQ=255) gcagcagcagGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTTGATGATGCCCGGGGCGTAAGGCACAAGGTTGAAGCCTg < 1:1222466/150‑1 (MQ=255) ctgctgctggccaaggccg‑GGTTGATCAGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTTGATGATGCCCGGGGCGTAAGGAACAAGGTTGAAGCCTgca < 2:2182966‑M2/131‑1 (MQ=255) agcagGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCAGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTTGATCATGCCCGGGGCGTAAGGCACAAGGTTGAAGCCTgcagca > 1:295171/1‑150 (MQ=255) ggCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACCCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAAAGTTGTTGATGATGCCCGGGGCGTAAGGCACAAGGTTGAAGCCTGAAGCAGCCt > 1:2231961/1‑150 (MQ=255) gCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACgttgt < 2:763588/101‑1 (MQ=255) gCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACgttgt > 1:763588/1‑101 (MQ=255) gCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTTGATGATGCCCGGGGCGTAAGGCACAAGGTTGAAGCCTGCAGCAGCCtt > 2:1254742/1‑150 (MQ=255) ccACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCa < 1:960108/51‑1 (MQ=255) ccACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCa < 1:960191/51‑1 (MQ=255) ccACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCa > 2:960108/1‑51 (MQ=255) ccACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCa > 2:960191/1‑51 (MQ=255) cACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTTGATGATGCCCGGGGCGTaa < 1:719361/119‑1 (MQ=255) cACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTTGATGATGCCCGGGGCGTaa > 2:719361/1‑119 (MQ=255) cACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTTGATGATGCCCGGGGCGTAAGGCACAAGGTTGAAGCCTGCAGCAGCCTTgg > 2:1358044/1‑150 (MQ=255) aCGGCCGCTGTTGTTCGGGTCGGTCGCGATGGCCACGCTAGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTTGATGATGCCCGGGGCGTAAGGCACAAGGTTGAAGCCTGCAGCAGCCTTGGc < 2:408527/150‑1 (MQ=255) aCGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTTGATGATGCCCGGGGCGTAAGGCACAAGGTTGAAGCCTGCAGCAGCCTTGGc < 2:2304688/150‑1 (MQ=255) aCGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTTGATGATGCCCGGGGCGTAAGGCACAAGGTTGAAGCCTGCAGCAGCCTTGGc > 1:707011/1‑150 (MQ=255) aCGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACGTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTTGATGATGCCCGGGGTATAATGCACAAGGTTGAAGCCTGCAGCAGCCTTGGc < 1:776281/150‑1 (MQ=255) | AGGCGCGTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGGCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTTGATGATGCCCGGGGCGTAAGGCACAAGGTTGAAGCCTGCAGCAGCCTTGGC > NC_002947/274020‑274308 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |