| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 165 total aligned reads displayed.
ACCCGTTCCGTGCGGGAGCTGGAGTTGCAGGTGGGCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTG‑CGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGAACGCTTGGCCAGAAACGGCGGCAGATACAACCCCAGATACGCTTCGAACACCCGCT > NC_002947/295564‑295859 | accCGTTCCGTGCGGGAGCTGGAGTTGCAGGTGGGCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCG‑GCACGCCCGCTCCCACAG < 1:1383509‑M1/150‑1 (MQ=255) cccGTTCCGTGCGGGAGCTGGAGTTGCAGGTGGGCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCG‑GCACGCCCGCTCCCACAgg > 2:764450/1‑150 (MQ=255) cGTGCGGGAGCTGGAGTTGCAGGTGGGCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTACTc < 2:424472/148‑1 (MQ=255) 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cAGGTGGGCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTG‑cgcgcg > 2:556816/1‑150 (MQ=255) aGGTGGGCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTG‑CGCGCgg > 1:527774/1‑150 (MQ=255) gTGGGCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTG‑CGCGCGGGc > 2:1345019/1‑150 (MQ=255) gTGGGCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCCCCAGGGTG‑CGCGCGGGc > 1:2255977/1‑150 (MQ=255) cAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCG‑GCACGCCCGCTCCCACAGagcccgcgcgcaccctggagcttgcgagtacctgt < 2:1428996‑M1/150‑36 (MQ=255) 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(MQ=255) gCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTG‑CGCGCGGGCTctgtgggagcgggcttgccggcgaagggctgcaaag < 2:1775676‑M2/77‑37 (MQ=255) tCCCACAGagcccgcgcgcaccctggagcttgcgagtacctgtgggagcgggcgtgccggcgaagggctgcaaagcagccccaatatcgacccgccgcatcacagcttggcgatagacacttcggtcgacttcacaaaggcaatcacttc > 2:290473‑M1/1‑8 (MQ=255) tCCCACAGGTACTCGCAAGCCCCAGGGTG‑CGCGCGGGCTctgtgggagcgggcgtgccggcgaagggctgcaaagcagccccaatatcgacccgcctcatcacagcttggcgatagacacttcggtcgacttcacaaaggcaatcacttc < 2:697480‑M2/150‑112 (MQ=255) cccACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTG‑CGCGCGGGCTctgtgggagcgggcgtgccggcgaagggctgcaaagcagccccaatatcgacccgccgcatcacagcttggcgatagacacttcggtcgacttcacaaaggcaatcacttca > 2:2216344‑M2/1‑38 (MQ=255) ccACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTG‑CGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGc < 2:1264046/77‑1 (MQ=255) ccACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTG‑CGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAg > 2:1190139/1‑91 (MQ=255) ccACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTG‑CGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAg < 1:1190139/91‑1 (MQ=255) ccACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTG‑CGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGAACGCTTGGCCAGAAACGGCGGCAGATACAACCCCAGATACGCTTCGAACACCCg > 1:110231/1‑150 (MQ=255) cacaGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTG‑CGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGAACGCTTGGCCAGAAACGGCGGCAGATACAACCCCAGATACGCTTCGAACACCCGc > 2:605825/1‑150 (MQ=255) cacaGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTG‑CGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGAACGCTTGGCCAGAAACGGCGGCAGATACAACCCCAGATACGCTTCGAACACCCGc < 2:85781/150‑1 (MQ=255) cacaGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTG‑CGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGAACGCTTGGCCAGAAACGGCGGCAGATACAACCCCAGATACGCTTCGAACACCCGc < 1:1341153/150‑1 (MQ=255) acaGagcccgcgcgcaccctggagcttgcgagtac < 2:966947‑M1/35‑32 (MQ=255) acaGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTG‑CGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGAACGCTTGGCCAGAAACGGCGGCAGATACAACCCCAGATACGCTTCGAACACCCGCt > 1:2004190/1‑150 (MQ=255) caGggcccgcgcgcaccctgcagcttgcgagtacctgtgggagcgggcgtgccggcgaagggctgcaaagcagccccaatatcgacccgccgcatcacagcttggcgatagacacttcggtcgacttcacaaaggcaatcacttcactgc < 1:2104659‑M1/150‑148 (MQ=255) | ACCCGTTCCGTGCGGGAGCTGGAGTTGCAGGTGGGCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTG‑CGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGAACGCTTGGCCAGAAACGGCGGCAGATACAACCCCAGATACGCTTCGAACACCCGCT > NC_002947/295564‑295859 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |