| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | = 403269 | 90 (1.020) | 9 (0.120) | 8/218 | NT | 9.5% | intergenic (‑69/+100) | msrA/PP_0337 | peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/sensory box protein |
| ? | NC_002947 | = 403299 | 92 (1.190) | intergenic (‑99/+70) | msrA/PP_0337 | peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/sensory box protein | |||||
Only 100 of 155 total aligned reads displayed.
GCGTGTCGCGGCCAGGCAGGGCCTGTTCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCAGGCCACCGGGCCACGCGGATAGCGCTTCAGCCGCTCGGCCAGTTC > NC_002947/403122‑403416 | gCGTGTCGCGGCCAGGCAGGGCCTGTTCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTa > 2:1996265/1‑150 (MQ=255) tCGCGGCCAGGCAGGGCCTGTTCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGca < 2:1318687/150‑1 (MQ=255) gcgGCCAGGCAGGGCCTGTTCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGcaca < 2:409325/150‑1 (MQ=255) caggcaggGCCTGTTCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGaaca > 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acaGGaacaccacaacctttgaaacctgtgctgtacctgtgggagcgggcatgcccgcgaaggcccaaacccctaccccactgaa > 1:509140‑M1/1‑5 (MQ=255) acaGGaacaccacaacctttgaaacctgtgctgtacctgtgggagcgggcatgcccgcgaaggcccaaacccctaccccactgaa < 2:509140‑M1/85‑81 (MQ=255) acaGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTcctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaggcccaaacccctaccccactgaataaa < 2:26708‑M2/89‑55 (MQ=255) aGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCAGGCCACCGGGCCACGCGGATAGCGCTTCAGCCGCTCGGCCAGTTc < 1:926084/150‑1 (MQ=255) ggTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTcctgtgggagcgggcatgcccgcgaaggcccaaacccctaccccactgaataaacacagag < 1:1915263‑M2/93‑62 (MQ=255) ggTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTcctgtgggagcgggcatgcccgcgaaggcccaaacccctaccccactgaataaacacagag > 2:1915263‑M2/1‑32 (MQ=255) gTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCAGGCCACCGGGCCAcgc < 1:824326/119‑1 (MQ=255) gTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCAGGCCACCGGGCCAcgc > 2:824326/1‑119 (MQ=255) gTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCAGGCCACCGGGCCACGCGGATAGCGCTTCAGCCGCTCGGCCAGt < 2:890143/146‑1 (MQ=255) gTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCAGGCCACCGGGCCACGCGGATAGCGCTTCAGCCGCTCGGCCAGt > 1:890143/1‑146 (MQ=255) | GCGTGTCGCGGCCAGGCAGGGCCTGTTCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCAGGCCACCGGGCCACGCGGATAGCGCTTCAGCCGCTCGGCCAGTTC > NC_002947/403122‑403416 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |