| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | 413997 = | 73 (0.830) | 11 (0.160) | 10/192 | NT | 20.7% | intergenic (+14/‑189) | glnE/waaF | glutamate‑ammonia‑ligase adenylyltransferase/ADP‑heptose:LPS heptosyltransferase II |
| ? | NC_002947 | 414083 = | 28 (0.410) | intergenic (+100/‑103) | glnE/waaF | glutamate‑ammonia‑ligase adenylyltransferase/ADP‑heptose:LPS heptosyltransferase II | |||||
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
AAGTGTACAAAGCGTTCCGCTCGGCCTCCCACCGCCAGGCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGATCGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAGTGTGCAATCCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATAGGCCATGTGAGTGGTACACTGTCCGCCACATAGCCTGAATATAAAGAGGGGAG > NC_002947/413850‑414135 | accatgtcgccgacccagctggggccaatgatcagtattctcatgcttagtccagaaacgctcggggaggctacaggctgcggtacagcctggcctcccctctttatattcaggctatgtggcggacagtgtaccactcacatggccTAt < 2:2158061‑M1/3‑1 (MQ=255)aaGTGTACAAAGCGTTCCGCTCGGCCTCCCACGGCCAGGCCCTACAGAAGCAGGCTGGGGTGCTCGTTGCGGGACAGTACCCCGAAAAATGTTGTAAAGGGCGGCGGAGCTGCGGGGAGTGAGGTTCAAGATGATCCCGTGTTGGTTTAt > 2:406150/1‑150 (MQ=255) ccatgtcgccgacccagctggggccaatgatcagtattctcatgcttagtccagaaacgctcggggaggctacaggctgcggtacagcctggcctcccctctttatattcaggctatgtggcggacagtgtaccactcacatggccTAtt < 1:1094099‑M1/4‑1 (MQ=255) tgtcgccgacccagctggggccaatgatcagtattctcatgcttagtccagaaacgctcggggaggctacaggctgcggtacagcctggcctcccctctttatattcaggctatgtggcggacagtgtaccactcacatggccTATTcgc < 2:1775194‑M1/7‑1 (MQ=255) gtACAAAGCGTTCCGCTCGGCCTCCCACCGCCAGGCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGATCGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTcgc < 2:1784847/150‑1 (MQ=255) tACAAAGCGTTCCGCTCGGCCTCCCACCTCCAGGCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGATCGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTcgcg > 1:1480763/1‑150 (MQ=255) tACAAAGCGTTCCGCTCGGCCTCCCACCGCCAGGCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGATCGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTcgcg > 2:10315/1‑150 (MQ=255) aCAAAGCGTTCCGCTCGGCCTCCCACCGCCAGGCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGATCGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCgg < 2:1445579/150‑1 (MQ=255) aCAAAGCGTTCCGCTCGGCCTCCCACCGCCAGGCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGATCGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCgg < 2:91911/150‑1 (MQ=255) aCAAAGCGTTCCGCTCGGCCTCCCACCGCCAGGCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGATCGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCgg < 2:1788762/150‑1 (MQ=255) aCAAAGCGTTCCGCTCGGCCTCCCACCGCCAGGCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGATCGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCgg < 2:2076073/150‑1 (MQ=255) aCAAAGCGTTCCGCTCGGCCTCCCACCGCCAGGCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGATCGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCgg < 1:1277637/150‑1 (MQ=255) gccgacccagctggggccaatgatcagtattctcatgcttagtccagaaacgctcggggaggctacaggctgcggtacagcctggcctcccctctttatattcaggctatgtggcggacagtgtaccactcacatggccTATTCGCGGGc < 1:1603147‑M1/11‑1 (MQ=255) aaaGCGTTCCGCTCGGCCTCCCACCGCCAGGCCAACCAGAAGGAGGCCGGGGTGATCGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGc > 1:1715733/1‑150 (MQ=255) aaGCGTTCCGCTCGGCCTCCCACCGCCAGGCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGATCGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCa > 2:857775/1‑150 (MQ=255) acccagctggggccaatgatcagtattctcatgcttagtccagaaacgctcggggaggctacaggctgcggtacagcctggcctcccctctttatattcaggctatgtggcggacagtgtaccactcacatggccTATTCGCGGGCAAGc > 1:906267‑M1/136‑150 (MQ=255) cGCTCGGCCTCCCACCGCCAGGCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGATCGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCt > 2:820160/1‑150 (MQ=255) cTCGGCCTCCCACCGCCAGGCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGATCGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTcc < 1:2222908/150‑1 (MQ=255) cGGCCTCCCACCGCCAGGCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGATCGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCca < 1:1997168/150‑1 (MQ=255) gccaatgatcagtattctcatgcttagtccagaaacgctcggggaggctacaggctgcggtacagcctggcctcccctctttatattcaggctatgtggcggacagtgtaccactcacatggccTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCcaca > 2:1603147‑M1/125‑150 (MQ=255) gCCTCCCACCGCCAGGCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGATCGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCcaca > 2:756140/1‑150 (MQ=255) ccaatgatcagtattctcatgcttagtccagaaacgctcggggaggctacaggctgcggtacagcctggcctcccctctttatattcaggctatgtggcggacagtgtaccactcacatggccTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAg > 1:2314309‑M1/124‑150 (MQ=255) tCCCACCGCCAGGCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGATCGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAGTTTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGt > 1:1422407/1‑150 (MQ=255) agtattctcatgcttagtccagaaacgctcggggaggctacaggctgcggtacagcctggcctcccctctttatattcaggctatgtggcggacagtgtaccactcacatggccTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGcac < 1:1020970‑M1/36‑1 (MQ=255) ccAGGCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGATCGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGcaca > 2:716135/1‑150 (MQ=255) tattctcatgcttagtccagaaacgctcggggaggctacaggctgcggtacagcctggcctcccctctttatattcaggctatgtggcggacagtgtaccactcacatggccTATTCGCGGGCAAGCCCGCTc < 1:2102769‑M1/21‑1 (MQ=255) tattctcatgcttagtccagaaacgctcggggaggctacaggctgcggtacagcctggcctcccctctttatattcaggctatgtggcggacagtgtaccactcacatggccTATTCGCGGGCAAGCCCGCTc > 2:2102769‑M1/113‑133 (MQ=255) ggCCCTGGAGAAGGAGGCCGGGGTGATCGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAGGTGGGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGc < 2:1604477/150‑1 (MQ=255) ctcatgcttagtccagaaacgctcggggaggctacaggctgcggtacagcctggcctcccctctttatattcaggctatgtggcggacagtgtaccactcacatggccTATTCGCgg < 1:1882667‑M1/9‑1 (MQ=255) ctcatgcttagtccagaaacgctcggggaggctacaggctgcggtacagcctggcctcccctctttatattcaggctatgtggcggacagtgtaccactcacatggccTATTCGCgg > 2:1882667‑M1/109‑117 (MQ=255) cccTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGAGCGATGCGGCACAGTTTGCCGGTGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTGAGCTGATACCGGGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGGACAGGccc < 2:700072/150‑1 (MQ=255) cTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGATCGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTAAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAg > 1:1600711/1‑144 (MQ=255) cTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGATCGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTAAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAg < 2:1600711/144‑1 (MQ=255) tGCAGAAGGAGGCCGGGGTGATCGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGa < 2:917128/150‑1 (MQ=255) tGCAGAAGGAGGCCGGGGTGATCGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGa < 2:749634/150‑1 (MQ=255) 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1:1568026/1‑62 (MQ=255) tGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCgg < 2:1568026/62‑1 (MQ=255) tcccctctttatattcaggctatgtggcggacagtgtaccactcacatggccTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACt < 1:383352‑M1/32‑1 (MQ=255) aaGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAGTGTGCAATCCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATAGGCCATGTGAGTg < 1:1863244/150‑1 (MQ=255) tGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCTCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAGTGTGCAATCCCTATGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATAGGCCATGTGAGTGGTa < 1:2233115/150‑1 (MQ=255) gcggATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAGTGTGCAATCCCtgt > 1:273319/1‑107 (MQ=255) gcggATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAGTGTGCAATCCCtgt < 2:273319/107‑1 (MQ=255) gggTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAGtgtg > 2:1317267/1‑88 (MQ=255) gggTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAGtgtg < 1:1317267/88‑1 (MQ=255) gggTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGAGAGCACGTTCCATCCCACAGGTACTGCACATGCCCTGAGCAGTGTGCAATCCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATAGGCCATGTGAGTGGTACACTGTCCGCcac > 1:405324/1‑150 (MQ=255) aGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAGTGTGCAATCCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATAGGCCATGTGAGTGGTACACTGTCCGCCACATAGc < 1:716135/150‑1 (MQ=255) gTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAGTGTGCAATCCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATAGGCCATGTGAGTGGTACACTGTCCGCCACATAGcc < 1:820160/150‑1 (MQ=255) ggcggacagtgtaccactcacatggccTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAGTGTGCAATCCCTGTGGGAGCGGGc < 2:2078234‑M1/73‑1 (MQ=255) ggcggacagtgtaccactcacatggccTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAGTGTGCAATCCCTGTGGGAGCGGGc > 1:2078234‑M1/28‑100 (MQ=255) ggTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCTCCGGCAACCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAGTGTGCCATCCCTGTGGGTCAAACATCGACCGACATTACGGCATGCTGGTGTTACACTGTCCGCCACATAGCCTGaa < 1:406150/150‑1 (MQ=255) gCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCCCAGGCCCTGAGCGGTGTGCAATCCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATAGGCCATGTGAGTGGTACACTGTCCGCCACATAGCCTGAATATAAag > 2:1679670/1‑150 (MQ=255) gCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAAGTACCGCACAGGCCCTGAGCAGTGTGCAATCCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATAGGCCATGTGAGTGGTACACTGTCCGCCACATAGCCTGAATATAAag > 1:2158061/1‑150 (MQ=255) aCCGTGTGCGCTTATTCGCGTGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGCCCTGAGAAGTGTGCAATCCCTGTGGGAGCGGGCTTGCGCGAGAATAGGACATGTGAGTTGTACACTGTCCGCCACATAGCCTGAATATAAAGAGGGGa < 1:346671/150‑1 (MQ=38) ccGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCACCCCCACGTTCTGCCCAGTCGCTGAGCAGTCTGCAATCCCTGTGGGATCGGACTTGCCCGAGAATACGCCGTGTGAGTGGTACATGGTCCGCCACATAGCATGAATATAAAGAGGGGAg > 2:346671/1‑150 (MQ=255) cGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAGTGTGCAATCCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATa > 1:1925539/1‑96 (MQ=255) cGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAGTGTGCAATCCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATa < 2:1925539/96‑1 (MQ=255) cGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAGTGTGCAATCCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATAGGCCATGTGAGTGGTACACTGTCCGCCACATAGCCTGActatca < 2:1561662/140‑3 (MQ=255) cGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAGTGTGCAATCCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATAGGCCATGTGAGTGGTACACTGTCCGCCACATAGCCTGAATATaa > 1:1561662/1‑140 (MQ=255) ctATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGATTGCACAGGCCCTGAGCa > 1:2082906/2‑49 (MQ=11) ctATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGATTGCACAGGCCCTGAGCa < 2:2082906/48‑1 (MQ=11) | AAGTGTACAAAGCGTTCCGCTCGGCCTCCCACCGCCAGGCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGATCGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAGTGTGCAATCCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATAGGCCATGTGAGTGGTACACTGTCCGCCACATAGCCTGAATATAAAGAGGGGAG > NC_002947/413850‑414135 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |