New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 771606 = | 96 (1.090) | 5 (0.060) | 5/236 | NT | 5.1% | coding (1287/1389 nt) | PP_0662 | threonine synthase |
? | NC_002947 | 771634 = | 93 (1.110) | coding (1315/1389 nt) | PP_0662 | threonine synthase |
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
CGCAGTAGACCCCCATGCCGCGACAGGGGTATTCGCCGGGCGCCTGCACCGGCGCAACATCGGTGCGCCCATCGTCACGCTGGGGCAGTTTGCCCCCGAAAAGTCTGCCGGGCTGCTGGCGGAGCTGGGGGCCTGGCACGGTGAGGTGCCCGCCGGCGCGGTCGGCACAGCGGGCGATGGGCCGCTGTTGGCACCTGACGACCTGGCCGGTGTTCATGCCTTGTTGACCCGGTTGCAGGCTGGGCGATGAAGCGCATCCTCGACCCCCTCGACGAGCGCATTCTCGCCGAGCTCAC > NC_002947/771459‑771754 | cgcAGTAGACCCCCATGCCGCGACAGGGGTATTCGCCGGGCGCCTGCACCGGCGCAACATCGGTGCGCCCATCGTCACGCTGGGGCAGTTTGCCCCCGAAAAGTCTGCCGGGCTGCTGGCGGAGCTGGGGGCCTGGCACGGTGAGGTGcc > 1:1649187/1‑150 (MQ=255) gcAGTAGACCCCCATGCCGCGACAGGGGTATTCGCCGGGCGCCTGCACCGGCGCAACATCGGTGCGCCCATCGTCACGCTGGGGCAGTTTGCCCCCGAAAAGTCTGCCGGGCTGCTGGCGGAGCTGGGGGCCTGGCACGGTGAGGTGccc < 1:910986/150‑1 (MQ=255) gACCCCCATGCCGCGACAGGGGTATTCGCCGGGCGCCTGCACCGGCGCAACATCGGTGCGCCCATCGTCACGCTGGGGCAGTTTGCCCCCGAAAAGTCTGCCGGGCTGCTGGCGGAGCTGGGGGCCTGGCACGGTGAGGTGCGCGCCGgc > 1:755552/1‑150 (MQ=255) ccccATGCCGCGACAGGGGTATTCGCCGGGCGCCTGCACCGGCGCAACATCGGTGCGCCCATCGTCACGCTGGGGCAGTTTGCCCCCGAAAAGTCTGCCGGGCTGCTGGCGGAGCTGGGGGCCTGGCACGGTGAGGTGCCCGCCGgcg > 1:1425083/1‑148 (MQ=255) ccATGCCGCGACAGGGGTATTCGCCGGGCGCCTGCACCGGCGCAACATCGGTGCGCCCATCGTCACGCTGGGGCAGTTTGCCCCCGAAAAGTCTGCCGGGCTGCTGGCGGAGCTGGGGGCCTGGCACGGTGAGGTGCCCGCCGGCGCGGt < 1:1373115/150‑1 (MQ=255) tGCCGCGACAGGGGTCTTCGCCGGGCGCCTGCACCGGCGCAACATCGGTGCGCCCATCGTCACGCTGGGGCAGTTTGCCCCCGAAAAGTCTGCCGGGCTGCTGGCGGAGCTGGGGGCCTGGCACGGTGAGGTGCCCGCCGGCGCGGTCgg < 2:1627833/150‑1 (MQ=255) ccGCGACAGGGGTATTCGCCGGGCGCCTGCACCGGCGCAACATCGGTGCGCCCATCGTCACGCTGGGGCAGTTTGCCCCCGAAAAGTCTGCCGGGCTGCTGGCGGAGCTGGGGGCCTGGCACGGTGAGGTGCCCGCCGGCGCGGTCGGca > 1:1141232/1‑150 (MQ=255) gACAGGGGTATTCGCCGGGCGCCTGCACCGGCGCAACATCGGTGCGCCCATCGTCACGCTGGGGCAGTTTGCCCCCGAAAAGTCTGCCGGGCTGCTGGCGGAGCTGGGGGCCTGGCACGGTGAGGTGCCCGCCGGCGCGGTCGGCACAGc < 1:2063978/150‑1 (MQ=255) gggTATTCGCCGGGCGCCTGCACCGGCGCAACATCGGTGCGCCCATCGTCACGCTGGGGCAGTTTGCCCCCGAGAGGTCTGCCGGGCTGCTGGCGGAGCGGGGGGCCTGGCACGGTGAGGTGCCCGCCGGCGCGGTCGGCACAGCGGGCg > 1:2273115/1‑150 (MQ=255) gggTATTCGCCGGGCGCCTGCACCGGCGCAACATCGGTGCGCCCATCGTCACGCTGGGGCAGTTTGCCCCCGAAAAGTCTGCCGGGCTGCTGGCGGAGCTGGGGGCCTGGCACGGTGAGGTGCCCGCCGGCGCGGTCGGCACAg > 1:1050794/1‑144 (MQ=255) gggTATTCGCCGGGCGCCTGCACCGGCGCAACATCGGTGCGCCCATCGTCACGCTGGGGCAGTTTGCCCCCGAAAAGTCTGCCGGGCTGCTGGCGGAGCTGGGGGCCTGGCACGGTGAGGTGCCCGCCGGCGCGGTCGGCACAg < 2:1050794/144‑1 (MQ=255) ggTATTCGCCGGGCGCCTGCACCGGCGCAACATCGGTGCGCCCATCGTCACGCTGGGGCAGTTTGCCCCCGAAAAGTCTGCCGGGCTGCTGGCGGAGCTGGGGGCCTGGCACGGTGAGGTGCCCGCCGGCGCGGTCGGCACAGCGGGCGa < 2:311453/150‑1 (MQ=255) tATTCGCCGGGCGCCTGCACCGGCGCAACATCGGTGCGCCCATCGTCACGCTGGGGCAGTTTGCCCCCGAAAAGTCTGCCGGGCTGCTGGCGGAGCTGGGGGCCTGGCACGGTGAGGTGCCCGCCGGCGCGGTCGGCACAGCGGGCGATg > 2:6673/1‑150 (MQ=255) 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gggCGCCTGCACCGGCGCAACATCGGTGCGCCCATCGTCACGCTGGGGCAGTTTGCCCCCGAAAAGTCTGCCGGGCTGCTGGCGGAGCTGGGGGCCTGGCACGGTGAGGTGCCCGCCGGCGCGGTCGGCACAGCGGGCGATGGGCCGCTg > 1:319418/1‑150 (MQ=255) gcgcCTGCACCGGCGCAACATCGGTGCGCCCATCGTCACGCTGGGGCAGTTTGCCCCCGAAAAGTCTGCCGGGCTGCTGGCGGAGCTGGGGGCCTGGCACGGTGAGGTGCCCGCCGGCGCGGTCGGCACAGCGGGCGATGGGCCGCTGtt < 1:1015580/150‑1 (MQ=255) gcgcCTGCACCGGCGCAACATCGGTGCGCCCATCGTCACGCTGGGGCAGTTTGCCCCCGAAAAGTCTGCCGGGCTGCTGGCGGAGCTGGGGGCCTGGCACGGTGAGGTGCCCGCCGGCGCGGTCGGCACAGCGGGCGATGGGCCGCTGtt > 2:926118/1‑150 (MQ=255) gaatgcgctcgtcgagggggtcgaggatgcgcttcatcgcccagcctgcaaccgggtcaacaaggcatgaacaccggccaggtcgtcaggtgccaacagcggcccatcGCCCGCCGGCGCGGTCGGCACAGCGGGCGATGGGCCGCTGtt > 1:482922‑M1/109‑150 (MQ=255) cTGCACCGGCGCAACATCGGTGCGCCCATCGTCACGCTGGGGCAGTTTGCCCCCGAAAAGTCTGCCGGGCTGCTGGCGGAGCTGGGGGCCTGGCACGGTGAGGTGCCCGCCGGCGCGGTCGGCACAGCGGGCGATGGGCCGCTGTTGGCa > 2:1711498/1‑150 (MQ=255) tGCACCGGCGCAACATCGGTGCGCCCATCGTCACGCTGGGGCAGTTTGCCCCCGAAAAGTCTGCCGGGCTGCTGGCGGAGCTGGGGGCCTGGCACGGTGAGGTg < 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> 2:309048/2‑150 (MQ=255) gcgcAACATCGGTGCGCCCATCGTCACGCTGGGGCAGTTTGCCCCCGAAAAGTCTGCCGGGCTGCTGGCGGAGCTGGGGGCCTGGCACGGTGAGGTGCCCGCCGGCGCGGTCGGCACAGCGGGCGATGGGCCGCTGTTGGCACCTgacga < 1:1009627/150‑1 (MQ=255) cATCGGTGCGCCCATCGTCACGCTGGGGCAGTTTGCCCCCGAAAAGTCTGCCGGGCTGCTGGCGGAGCTGGGGGCCTGGCACGGTGAGGTGCCCGCCGGCGCGGTCGGCACAGCGGGCGATGGGCCGCTGTTGGCACCTGACGACCTGGc > 1:954185/1‑150 (MQ=255) cATCGGTGCGCCCATCGTCACGCTGGGGCAGTTTGCCCCCGAAAAGTCTGCCGGGCTGCTGGCGGAGCTGGGGGCCTGGCACGGTGAGGTGCCCGCCGGCGCGGTCGGCACAACGGGCGATGGGCCGCTGTTGGCACCTGACGACCTGGc < 1:2275407/150‑1 (MQ=255) aTCGGTGCGCCCATCGTCACGCTGGGGCAGTTTGCCCCCGAAAAGTCTGCCGGGCTGCTGGCGGAGCTGGGGGCCTGGCACGGTGAGGTGCCCGCCGGCGCGGTc > 1:1848964/1‑105 (MQ=255) tCGGTGCGCCCATCGTCACGCTGGGGCAGTTTGCCCCCGAAAAGTCTGCCGGGCTGCTGGCGGAGCTGGGGGCCTGGCACGGTGAGGTGCCCGCCGGCGCGGTCGGCACAGCGGGCGATGGGCCGCTGTTGGCACCTGACGACCTGGCCg < 2:954185/150‑1 (MQ=255) gcCCATCGTCACGCTGGGGCAGTTTGCCCCCGAAAAGTCTGCCGGGCTGCTGGCGGAGCTGGGGGCCTGGCACGGTGAGGTGc < 2:1101619/83‑1 (MQ=255) 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tgctgGCGGAGCTGGGGGCCTGGCACGGTGAGGTGCCCGCCGGCGCGGTCGGCACAGCGGGCGATGGGCCGCTGTTGGCACCTGACGACCTGGCCGGTGTTCATGCCTTGTTGACCCGGTTGCAGGCTGGGCGATGAAGCGCATCCTCGa < 2:535862/150‑1 (MQ=255) gCGGAGCTGGGGGCCTGGCACGGTGAGGTGCCCGCCGGCGCGGTCGGCACAGCGGGCGATGGGCCGCTGTTGGCACCTGACGACCTGGCCGGTGTTCATGCCTTGTTGACCCGGTTGCAGGCTgg > 2:402145/1‑125 (MQ=255) gCGGAGCTGGGGGCCTGGCACGGTGAGGTGCCCGCCGGCGCGGTCGGCACAGCGGGCGATGGGCCGCTGTTGGCACCTGACGACCTGGCCGGTGTTCATGCCTTGTTGACCCGGTTGCAGGCTgg < 1:402145/125‑1 (MQ=255) cGGAGCTGGGGGCCTGGCACGGTGAGGTGCCCGCCGGCGCGGTCGGCACAGCGGGCGATGGGCCGCTGTTGGCACCTGACGACCTGGCCGGTGTTCATGCCTTGTTGACCCGGTTGCAGGCTGGGCGATGAAGCGCATCCTCGACCCCCt < 2:1386579/150‑1 (MQ=255) ggAGCTGGGGGCCTGGCACGGTGAGGTGCCCGCCGGCGCGGTCGGCACAGCGGGCGATGGGCCGCTGTTGGCACCTGACGACCTGGCCGGTGTTCATGCCTTGTTGACCCGGTTGCAGGCTGGGCGATGAAGCGCATCCTCGACCCCCTc > 1:1502846/1‑150 (MQ=255) ggAGCTGGGGGCCTGGCACGGTGAGGTGCCCGCCGGCGCGGTCGGCACAGCGGGCGATGGGCCGCTGTTGGCACCTGACGACCTGGCCGGTGTTCATGCCTTGTTGACCCGGTTGCAGGCTGGGCGATGAAGCGCATCCTCGACCCCCTc < 1:1711498/150‑1 (MQ=255) gCTGGGGGCCTGGCACGGTGAGGTGCCCGCCGGCGCGGTCGGCACAGCGGGCGATGGGCCGCTGTTGGCACCTGACGACCTGGCCGGTGTTCATGCCTTGTTGACCCGGTTGCAGGCTGGGCGATGAAGCGCATCCTCGACCCCCTcgac < 1:2059570/150‑1 (MQ=255) gggggCCTGGCACGGTGAGGTGCCCGCCGGCGCGGTCGGCACAGCGGGCGATGGGCCGCTGTTGGCACCTGACGACCTGGCCGGTGTTCATGCCTTGTTGACCCGGTTGCAGGCTGGGCGATGAAGCGCATCCTCGACCCCCTCGACGAg < 2:897055/150‑1 (MQ=255) gggggCCTGGCACGGTGAGGTGCCCGCCGGCGCAGGCGGCACAGCGGGCGATGGGCCGCTGTTGGCACCTGAAGGCCCGAACGGTTGTCATGCCTTGTTGACCCGGTTGCAGGCTGGGCGATGAAGCGCATCCTCGACCCCCTCGACGAg > 1:1355145/1‑150 (MQ=255) ggggCCTGGCACGGTGAGGTGCCCGCCGGCGCGGTCGGCACAGCGGGCGATGGGCCGCTGTTGGCACCTGACGACCTGGCCGGTGTTCATGCCTTGTTGAccc < 1:1679158/103‑1 (MQ=255) ggggCCTGGCACGGTGAGGTGCCCGCCGGCGCGGTCGGCACAGCGGGCGATGGGCCGCTGTTGGCACCTGACGACCTGGCCGGTGTTCATGCCTTGTTGAccc > 2:1679158/1‑103 (MQ=255) ggggCCTGGCACGGTGAGGTGCCCGCCGGCGCGGTCGGCACAGCGGGCGATGGGCCGCTGTTGGCACCTGACGACCTGGCCGGTGTTCATGCCTTGTTGACCCGGTTGCAGGCTGGGCGATGAAGCGCAt < 2:2002931/130‑1 (MQ=255) ggggCCTGGCACGGTGAGGTGCCCGCCGGCGCGGTCGGCACAGCGGGCGATGGGCCGCTGTTGGCACCTGACGACCTGGCCGGTGTTCATGCCTTGTTGACCCGGTTGCAGGCTGGGCGATGAAGCGCAt > 1:2002931/1‑130 (MQ=255) ggggCCTGGCACGGTGAGGTGCCCGCCGGCGCGGTCGGCACAGCGGGCGATGGGCCGCTGTTGGCACCTGACGACCTGGCCGGTGTTCATGCCTTGTTGACCCGGTTGCAGGCTGGGCGATGAAGCGCATCCTCGACCCCCTcgac < 1:1394977/146‑1 (MQ=255) ggggCCTGGCACGGTGAGGTGCCCGCCGGCGCGGTCGGCACAGCGGGCGATGGGCCGCTGTTGGCACCTGACGACCTGGCCGGTGTTCATGCCTTGTTGACCCGGTTGCAGGCTGGGCGATGAAGCGCATCCTCGACCCCCTcgac > 2:1394977/1‑146 (MQ=255) gggCCTGGCACGGTGAGGTGCCCGCCGGCGCGGTCGGCACAGCGGGCGATGGGCCGCTGTTGGCACCTGACGACCTGGCCGGTGTTCATGCCTTGTTGACCCGGTTGCAGGCTGGGCGATGAAGCGCATCCTc < 2:669206/133‑1 (MQ=255) gggCCTGGCACGGTGAGGTGCCCGCCGGCGCGGTCGGCACAGCGGGCGATGGGCCGCTGTTGGCACCTGACGACCTGGCCGGTGTTCATGCCTTGTTGACCCGGTTGCAGGCTGGGCGATGAAGCGCATCCTc > 1:669206/1‑133 (MQ=255) gggCCTGGCACGGTGAGGTGCCCGCCGGCGCGGTCGGCACAGCGGGCGATGGGCCGCTGTTGGCACCTGACGACCTGGCCGGTGTTCATGCCTTGTTGACCCGGTTGCAGGCTGGGCGATGAAGCGCATCCTCGACCCCCTCGACGAgcg > 1:56608/1‑150 (MQ=255) tGGCACGGTGAGGTGCCCGCCGGCGCGGGCGGCACAGCGGGCGATGGGCCGCTGTTGGCACCTGACGACCTGGCCGGTGTTCATGCCTTGTTGACCCGGTTGCAGGCTGGGCGATGAAGCGCATCCTCGACCCCCTCGACGAGCGCATtc > 1:1806782/1‑150 (MQ=255) gCACGGTGAGGTGCCCGCCGGCGCGGTCGGCACAGCGGGCGATGGGCCGCCGTTGGCACCTGACGACCTGGCCGGTGTTCATGCCTTGTTGACCCGGTTGCAGGCTGGGCGATGAAGCGCATCCTCGACCCCCTCGACGAGCGCATtctc > 1:1641497/1‑150 (MQ=255) aCGGTGAGGTGCCCGCCGGCGCGGTCGGCACAGCGGGCGATGGGCCGCTGTTGGCACCTGACGACCTGGCCGGTGTTCATGCCTTGTTGACCCGGTTGCAGGCTGGGCGATGAAGCGCATCCTCGACCCCCTCGACGAgc < 2:1839751/140‑1 (MQ=255) ggTGAGGTGCCCGCCGGCGCGGTCGGCACAGCGGGCGATGGGCCGCTGTTGGCACCTGACGACCTGGCCGgt < 2:2206913/72‑1 (MQ=255) ggTGAGGTGCCCGCCGGCGCGGTCGGCACAGCGGGCGATGGGCCGCTGTTGGCACCTGACGACCTGGCCGgt > 1:2206913/1‑72 (MQ=255) ggTGCCCGCCGGCGCGGTCGGCACAGCGGGCGATGGGCCGCTGTTGGCACCTGACGACCTGGCCGGTGTTCATGCCTTGTTGACCCGGTTGCAGGCTGGGCGATGAAGCGCATCCTCGACCCCCTCGACGAGCGCATTCTCGCCGAGCTc < 2:2274088/150‑1 (MQ=255) tGCCCGCCGGCGCGGTCGGCACAGCGGGCGATGGGCCGCTGTTGGCACCTGACGACCTGGCCGGTGTTCATGCCTTGTTGACCCGGTTGCAGGCTGGGCGATGAAGCTCATCCTCGACCCCCTCGACGAGCGCATTCTCGCCgctctccc > 2:838463/1‑143 (MQ=255) | CGCAGTAGACCCCCATGCCGCGACAGGGGTATTCGCCGGGCGCCTGCACCGGCGCAACATCGGTGCGCCCATCGTCACGCTGGGGCAGTTTGCCCCCGAAAAGTCTGCCGGGCTGCTGGCGGAGCTGGGGGCCTGGCACGGTGAGGTGCCCGCCGGCGCGGTCGGCACAGCGGGCGATGGGCCGCTGTTGGCACCTGACGACCTGGCCGGTGTTCATGCCTTGTTGACCCGGTTGCAGGCTGGGCGATGAAGCGCATCCTCGACCCCCTCGACGAGCGCATTCTCGCCGAGCTCAC > NC_002947/771459‑771754 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |