New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 771606 = | 96 (1.090) | 5 (0.060) | 5/236 | NT | 5.1% | coding (1287/1389 nt) | PP_0662 | threonine synthase |
? | NC_002947 | 771634 = | 93 (1.110) | coding (1315/1389 nt) | PP_0662 | threonine synthase |
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
GGGTATTCGCCGGGCGCCTGCACCGGCGCAACATCGGTGCGCCCATCGTCACGCTGGGGCAGTTTGCCCCCGAAAAGTCTGCCGGGCTGCTGGCGGAGCTGGGGGCCTGGCACGGTGAGGTGCCCGCCGGCGCGGTCGGCACAGCGGGCGATGGGCCGCTGTTGGCACCTGACGACCTGGCCGGTGTTCATGCCTTGTTGACCCGGTTGCAGGCTGGGCGATGAAGCGCATCCTCGACCCCCTCGACGAGCGCATTCTCGCCGAGCTCACCGCCAATGCGCGTATCGCCCACGCCGAGT > NC_002947/771485‑771783 | gggTATTCGCCGGGCGCCTGCACCGGCGCAACATCGGTGCGCCCATCGTCACGCTGGGGCAGTTTGCCCCCGAGAGGTCTGCCGGGCTGCTGGCGGAGCGGGGGGCCTGGCACGGTGAGGTGCCCGCCGGCGCGGTCGGCACAGCGGGCg > 1:2273115/1‑150 (MQ=255) tATTCGCCGGGCGCCTGCACCGGCGCAACATCGGTGCGCCCATCGTCACGCTGGGGCAGTTTGCCCCCGAAAAGTCTGCCGGGCTGCTGGCGGAGCTGGGGGCCTGGCACGGTGAGGTGCCCGCCGGCGCGGTCGGCACAGCGGGCGATg > 2:6673/1‑150 (MQ=255) aTTCGCCGGGCGCCTGCACCGGCGCAACATCGGTGCGCCCATCGTCACGCTGGGGCAGTTTGCCCCCGAAAAGTCTGCCGGGCTGCTGGCGGAGCTGGGGGCCTGGGACGGTGAGGTGCCCGCCGGCGCGGTCGGCACAGCGGGCGATgg < 2:1697099/150‑1 (MQ=255) 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CCCGCCGGCGCGGTCGGCACAGCGGGCGATGGGCCGCTGTTGGCACCTGACGACCTGGCCGGTGTTCATGCCTTGTTGACCCGGTTGCAGGCTGGGCGATGAAGCGCATCCTCGACCCCCTCGACGAGCGCATTCTCGCCGAGCTCACCg > 1:2107931‑M1/1‑150 (MQ=255) CCCGCCGGCGCGGTCGGCACAGCGGGCGATGGGCCGCTGTTGGCACCTGACGACCTGGCCGGTGTTCATGCCTTGTTGACCCGGTTGCAGGCTGGGCGATGAAGCGCATCCTCGACCCCCTCGACGAGCGCATTCTCGCCGAGCTCACCg > 1:1970871‑M1/1‑150 (MQ=255) CCCGCCGGCGCGGTCGGCACAGCGGGCGATGGGCCGCTGTTGGCACCTGACGACCTGGCCGGTGTTCATGCCTTGTTGACCCGGTTGCAGGCTGGGCGATGAAGCGCATCCTCGACCCCCTCGACGAGCGCATTCTCGCCGAGCTCACCg < 1:235699‑M1/150‑1 (MQ=255) CCGCCGGCGCGGTCGGCACAGCGGGCGATGGGCCGCTGTTGGCACCTGACGACCTGGCCGGTGTTCATGCCTTGTTGACCCGGTTGCAGGCTGGGCGATGAAGCGCATCCTCGACCCCCTCGACGAGCGCATTCTCGCCGAGCTCACCGc < 1:1743339‑M1/150‑1 (MQ=255) CGCCGGCGCGGTCGGCACAGCGGGCGATGGGCCGCTGTTGGCACCTGACGACCTGGCCGGTGTTCATGCCTTGTTGACCCGGTTGCAGGCTGGGCGATGAAGCGCATCCTCGACCCCCTc > 1:2025839‑M1/1‑120 (MQ=255) CCGGCGCGGTCGGCACAGCGGGCGATGGGCCGCTGTTGGCACCTGACGACCTGGCCGGTGTTCATGCCTTGTTGACCCGGTTGCAGGCTGGGCGATGAAGCGCATCCTCGACCCCCTCGACGAGCGCATTCTCGCCGAGCTCACCGCCaa < 1:858112‑M1/150‑1 (MQ=255) gcgcGGTCGGCACAGCGGGCGATGGGCCGCTGTTGGCACCTGACGACCTGGCCGGTGTTCATGCCTTGTTGACCCGGTTGCAGGCTGGGCGATGAAGCGCATCCTCGACCCCCTCGACGAGCGCATTCTCGCCGAGCTCACCGCCAATgc < 2:319418/150‑1 (MQ=255) gcgGTCGGCACAGCGGGCGATGGGCCGCTGTTGGCACCTGACGACCTGGCCGGTGTTCATGCCTTGTTGACCCGGTTGCAGGCTGGGCGATGAAGCGCATCCTCGACCCCCTCGACGAGCGCATTCTCGCCGAGCTCACCGCCAATgcgc < 2:1141232/150‑1 (MQ=255) gtgccaacaGCGGGCGATGGGCCGCTGTTGGCACCTGACGACCTGGCCGGTGTTCATGCCTTGTTGACCCGGTTGCAGGCTGGGCGATGAAGCGCATCCTCGACCCCCTCGACGAGCGCATTCTCGCCGAGCTCACCGCCAATgcgc > 2:711679/7‑147 (MQ=255) gtgccaacaGCGGGAGATGGGCCGCTGTTGGCACCTGACGACCTGGCCGGTGTTCATGCCTTGTTGACCCGGTTGCAGGCTGGGCGATGAAGCGCATCCTCGACCCCCTCGACGAGCGCATTCTCGCCGAGCTCACCGCCAATgcgc < 1:711679/141‑1 (MQ=255) gTCGGCACAGCGGGCGATGGGCCGCTGTTGGCACCTGACGACCTGGCCGGTGTTCATGCCTTGTTGACCCGGTTGCAGGCTGGGCGATGAAGCGCATCCTCGACCCCCTCGACGAGCGCATTCTCGCCGAGCTCACCGCCAATGCGCGTa < 2:877873/150‑1 (MQ=255) gTCGGCACAGCGGGCGATGGGCCGCTGTTGGCACCTGACGACCTGGCCGGTGTTCATGCCTTGTTGACCCGGTTGCAGGCTGGGCGATGAAGCGCATCCTCGACCCCCTCGACGAGCGCATTCTCGCCGAGCTCACCGCCAATGCGCGTa > 1:769732/1‑150 (MQ=255) tCGGCACAGCGGGCGATGGGCCGCTGTTGGCACCTGACGACCTGGCCGGTGTTCATGCCTTGTTGACCCGGTTGCAGGCTGGGCGATGAAGCGCATCCTCGACCCCCTCGACGAGCGCATTCTCGCCGAGCTCACCGCCAATGCGCGTAt > 2:117290/1‑150 (MQ=255) cGGCACAGCGGGCGATGGGCCGCTGTTGGCACCTGACGACCTGGCCGGTGTTCACGCCTTGTTGACCCGGTTGCAGGCTGGGCGATGAAGCGCATCCTCGACCCCCTCGACGAGCGCATTCTCGCCGAGCTCACCGCCAATGCGCGTATc < 1:25222/150‑1 (MQ=255) ggCACAGCGGGCGATGGGCCGCTGTTGGCACCTGACGACCTGGc < 1:1205654/44‑1 (MQ=255) ggCACAGCGGGCGATGGGCCGCTGTTGGCACCTGACGACCTGGc > 2:1205654/1‑44 (MQ=255) gCACAGCGGGCGATGGGCCGCTGTTGGCACCTGACGACCTGGCCGGTGTTCATGCCTTGTTGACCCGGTTGCAGGCTGGGCGAt > 2:1023620/1‑84 (MQ=255) gCACAGCGGGCGATGGGCCGCTGTTGGCACCTGACGACCTGGCCGGTGTTCATGCCTTGTTGACCCGGTTGCAGGCTGGGCGAt < 1:1023620/84‑1 (MQ=255) gCACAGCGGGCGATGGGCCGCTGTTGGCACCTGACGACCTGGCCGGTGTTCATGCCTTGTTGACCCGGTTGCAGGCTGGGCGATGAAGCGCATCCTCGACCCCCTCGACGAGCGCATTCTCGCCGAGCTCACCGCCAATGCGCGTATCGc < 2:1743339/150‑1 (MQ=255) gCACAGCGGGCGATGGGCCGCTGTTGGCACCTGACGACCTGGCCGGTGTTCATGCCTTGTTGACCCGGTTGCAGGCTGGGCGATGAAGCGCATCCTCGACCCCCTCGACGAGCGCATTCTCGCCGAGCTCACCGCCAATGCGCGTATCGc > 2:816430/1‑150 (MQ=255) gATGGGCCGCTGTTGGCACCTGACGACCTGGCCGGTGTTCATGCCTTGTTGACCCGGTTGCAGGCTGGGCGATGAAGCGCATCCTCGACCCCCTCGACGAGCGCATTCTCGCCGAGCTCACCGCCAATGCGCGTATCGCCCACGCCGAGt > 2:2236576/1‑150 (MQ=255) gATGGGCCGCTGTTGGCACCTGACGACCTGGCCGGTGTTCATGCCTTGTTGACCCGGTTGCAGGCTGGGCGATGAAGCGCATCCTCGACCCCCTCGACGAGCGCATTCTCGCCGAGCTCACCGCCAATGCGCGTATCGCCCACGCCGAGt > 2:163297/1‑150 (MQ=255) | GGGTATTCGCCGGGCGCCTGCACCGGCGCAACATCGGTGCGCCCATCGTCACGCTGGGGCAGTTTGCCCCCGAAAAGTCTGCCGGGCTGCTGGCGGAGCTGGGGGCCTGGCACGGTGAGGTGCCCGCCGGCGCGGTCGGCACAGCGGGCGATGGGCCGCTGTTGGCACCTGACGACCTGGCCGGTGTTCATGCCTTGTTGACCCGGTTGCAGGCTGGGCGATGAAGCGCATCCTCGACCCCCTCGACGAGCGCATTCTCGCCGAGCTCACCGCCAATGCGCGTATCGCCCACGCCGAGT > NC_002947/771485‑771783 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |