| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 1022665 = | 85 (0.960) | 4 (0.050) | 4/230 | NT | 5.1% | coding (1051/1635 nt) | dppA‑I | dipeptide ABC transporter substrate‑binding protein |
| ? | NC_002947 | 1022695 = | 71 (0.870) | coding (1021/1635 nt) | dppA‑I | dipeptide ABC transporter substrate‑binding protein | |||||
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
CAGGCGCGGGTTGGGGTTGGTCGGGCCGCCGCCGTTGCGGGTGAACAGGGTGATTACCGTGCCCTCGGGTACACCGGCCTGGCTGAGCAGTGCGCGGGCTTTATCGAGGTCGCGCGGTGGGTTCTGGTTATGGGTGTTGTAGCCGATCATGGTGGGTGGGTAAGGGTTTACACCCACCAGTGCGTTGCCTTTGCCAAACAGTTGGTCGACATGGGTCTGGCGGTCGAAGGCCATGTTGATGGCTTTACGCACGCGCACGTCGTTGAGGTATTTGTGCTGGGTATTCATGGCGATGTAGC > NC_002947/1022516‑1022814 | ggttgaagaaatcgaggccctggtcaccggctacatcgccatgaatacccagcacaaatacctcaacgacgtgcgcgtgcgtaaagccatcaacatggccttcgaccgccagacccatgtcgaccaactgtttggcaaaggcaacgcact < 2:954939‑M1/1‑1 (MQ=255)ggttgaagaaatcgaggccctggtcaccggctacatcgccatgaatacccagcacaaatacctcaacgacgtgcgcgtgcgtaaagccatcaacatggccttcgaccgccagacccatgtcgaccaactgtttggcaaaggcaacgcact > 2:1771493‑M1/150‑150 (MQ=255)cAGGCGCGGGTTGGGGTTGGTCGGGCCGCCGCCGTTGCGGGTGAACAGGGTGATTACCGTGTCCTCGGGTACACCGGCCTGGCTGAGCAGTGCGCGGGCTTTATCGAGGTCGCGCGGTGGGTTCTGGTTATGGGTGTTGTAGCCGATCAt > 1:568197/1‑150 (MQ=255) 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tcgaggccctggtcaccggctacatcgccatgaatacccagcacaaatacctcaacgacgtgcgcgtgcgtaaagccatcaacatggccttcgaccgccagacccatgtcgaccaactgtttggcaaaggcaacgcactggtgg > 2:380218‑M1/139‑144 (MQ=255) gggttggTCGGGCCGCCGCCGTTGCGGGTGAACAGGGTGATTACCGTGCCCTCGGGTACACCGGCCTGGCTGAGCAGTGCGCGGGCTTTATCGAGGTCGCGCGGTGGGTTCTGGTTATGGGTGTTGTAGCCGATCAtggtg > 2:866815/1‑141 (MQ=255) gggttggTCGGGCCGCCGCCGTTGCGGGTGAACAGGGTGATTACCGTGCCCTCGGGTACACCGGCCTGGCTGAGCAGTGCGCGGGCTTTATCGAGGTCGCGCGGTGGGTTCTGGTTATGGGTGTTGTAGCCGATCAtggtg < 1:866815/141‑1 (MQ=255) ggttggTCGGGCCGCCGCCGTTGCGGGTGAACAGGGTGATTACCGTGCCCTCGGGTACACCGGCCTGGCTGAGCAGTGCGCGGGCTTTATCGAGGTCGCGCGGTGGGTTCTGGTTATGGGTGTTGTAGCCGATCATGGTGGGTGGGTagg > 2:336796/1‑148 (MQ=255) ggttggTCGGGCCGCCGCCGTTGCGGGTGAACAGGGTGATTACCGTGCCCTCGGGTACACCGGCCTGGCTGAGCAGTGCGCGGGCTTTATCGAGGTCGCGCGGTGGGTTCTGGTTATGGGTGTTGTAGCCGATCATGGTGGGTGGGTAAg > 2:1761102/1‑150 (MQ=255) gttggTCGGGCCGCCGCCGTTGCGGGTGAACAGGGTGATTACCGTGCCCTCGGGTACACCGGCCTGGCTGAGCAGTGCGCGGGCTTTATCGAGGTCGCGCGGTGGGTTCTGGTTATGGGTGTTGTAGCCGATCATGGTGGGTGGGTAAgg < 1:597179/150‑1 (MQ=255) ttggTCGGGCCGCCGCCGTTGCCGGTGAACAGGGTGATTTCCGTGCCCTCGGGTACACCGGCCTGGCTGAGCAGTGCGCGGGCTTTATCGAGGTCGCGCGGTGGGTTCTGGTTATGTGTGTTGTCGCCGATCATGGTGGGTGGGTAAggg < 2:751876/150‑1 (MQ=255) tggTCGGGCCGCCGCCGTTGCGGGTGAACAGGGTGATTACCGTGCCCTCGGGTACACCGGCCTGGCTGAGCAGTGCGCGGGCTTTATCGAGGTCGCGCGGTGGGTTCTGGTTATGGGTGTTGTAGCCGATCATGGTGGGTGGGTAAGGGt < 2:1609716/150‑1 (MQ=255) ggTCGGGCCGCCGCCGTTGCGGGTGAACAGGGTGCTTCCGGTGCCCTCGGGTACACCGGCCTGGCTGAGCAGTGCGCGGGCTTTATCGAGGTCGCGCGGTGGGTTCTGGTTATGGGTGTTGTAGCCGATCATGGTGGGTGGGTAAGGGtt < 1:613871/150‑1 (MQ=255) tCGGGCCGCCGCCGTTGCGGGTGAACAGGGTGATTACCGTGCCCTCGGGTACACCGGCCTGGCTGAGCAGTGCGCGGGCTTTATCGAGGTCGCGCGGTGGGTTCTGGTTATGGGTGTTGTGGCCGATCATGGTGGGTGGGTAAGGGTTTa < 1:1529118/150‑1 (MQ=255) tCGGGCCGCCGCCGTTGCGGGTGAACAGGGTGATTACCGTGCCCTCGGGTACACCGGCCTGGCTGAGCAGTGCGCGGGCTTTATCGAGGTCGCGCGGTGGGTTCTGGTTATGGGTGTTGTAGCCGATCATGGTGGGTGGGTAAGGGTTTa < 1:2275627/150‑1 (MQ=255) tCGGGCCGCCGCCGTTGCGGGTGAACAGGGTGATTACCGTGCCCTCGGGTACACCGGCCTGGCTGAGCAGTGCGCGGGCTTTATCGAGGTCGCGCGGTGGGTTCTGGTTATGGGTGTTGTAGCCGATCATGGTGGGTGGGTAAGGGTTTa < 1:625392/150‑1 (MQ=255) cGGGCCGCCGCCGTTGCGGGTGAACAGGGTGATTACCGTGCCCTCGGGTACACCGGCCTGGCTGAGCAGTGCGCGGGCTTTATCGAGGTCGCGCGGTGGGTTCTGGTTATGGGTGTTGTAGCCGATCATGGTGGGTGGGTAAGGGTTTac < 1:1732281/150‑1 (MQ=255) gccgccgccGTTGCGGGTGAACAGGGTGATTACCGTGCCCTCGGGTACACCGGCCTGGCTGAGCAGTGCGCGGGCTTTATCGAGGTCGCGCGGTGGGTTCTGGTTATGGGTGTTGTAGCCGATCATGGTGGGTGGGTAAGGGTTTAcacc < 1:1849306/150‑1 (MQ=255) gccgccgccGTTGCGGGTGAACAGGGTGATTACCGTGCCCTCGGGTACACCGGCCTGGCTGAGCAGTGCGCGGGCTTTATCGAGGTCGCGCGGTGGGTTCTGGTTATGGGTGTTGTAGCCGATCATGGTGGGTGGGTAAGGGTTTAcacc < 2:725780/150‑1 (MQ=255) ccgccgccgTTGCGGGTGAACAGGGTGATTACCGTGCCCTCGGGTACACCGGCCTGGCTGAGCAGTGCGCGGGCTTTATCGAGGTCGCGCGGTGGGTTCTGGTTATGGGTGTTGTAGCCGATCATGGTGGGTGGGTAAGGGTTTAcaccc < 2:1426053/150‑1 (MQ=255) gccgccgTTGCGGGTGAACAGGGTGATTACCGTGCCCTCGGGTACACCGGCCTGGCTGAGCAGTGCGCGGGCTTTATCGAGGTCGCGCGGTGGGTTCTGGTTATGGGTGTTGTAGCCGATCATGGTGGGTGGGTAAGGGTTTAcacccac < 2:2194525/150‑1 (MQ=255) gccgccgTTGCGGGTGAACAGGGTGATTACCGTGCCCTCGGGTACACCGGCCTGGCTGAGCAGTGCGCGGGCTTTATCGAGGTCGCGCGGTGGGTTCTGGTTATGGGTGTTGTAGCCGATCATGGTGGGTGGGTAAGGGTTTAcacccac < 1:946792/150‑1 (MQ=255) gccgccgTTGCGGGTGAACAGGGGGATTACCGTGCCCTCGGTTACACCGGCCTGGCTGAGCAGTGCGCGGGCTTTATCGAGGTCGCGCGGTGGGTTCTGGTTATGGGTGTTGTAGCCGATCATGGTGGGTGGGTAAGGGTTTAcacccac > 1:1220322/1‑150 (MQ=255) cggctacatcgccatgaatacccagcacaaatacctcaacgacgtgcgcgtgcgtaaagccatcaacatggccttcgaccgccagacccatgtcgaccaactgtttggcaaaggcaacgcacTGGTGGGTGGGTAAGGGTTTAcacccac > 2:1404327‑M1/123‑150 (MQ=255) 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gTTCTGGTTATGGGTGTTGTAACCGATCATGGTGGGTGGGTAAGGGTTTACACCCACCAGTGCGTTGCCTTTGCCAAACAGTTGGTCGACATGGGTCTGGCGGTCGAAGGCCATGTTGATGGCTTTACGCACGCGCACGTCGTTGAGGTa > 2:1286991/1‑150 (MQ=255) ttCTGGTTATGGGTGTTGTAGCCGATCATGGTGGGTGGGTAAGGGTTTACACCCACCAGTGCGTTGCCTTTGCCAAACAGTTGGTCGACATGGGTCTGGCGGTCGAAGGCCATGTTGATGGCTTTACGCACGCGCACGTCGTTGAGGTAt > 2:497010/1‑150 (MQ=255) cTGGTTATGGGTGTTGTAGCCGATCATGGTGGGTGGGTAAGGGTTTACACCCACCAGTGCGTTGCCTTTGCCAAACAGTTGGTCGACATGGGTCTGGCGGTCGAAGGCCATGTTGATGGCTTTACGCACGCGCACGTCGTTGAGGTAttt < 1:2126831/150‑1 (MQ=255) gTTATGGGTGTTGTAGCCGATCATGGTGGGTGGGTAAGGGTTTACACCCACCAGTGCGTTGCCTTTGCCAAACAGTTGGTCGACATGGGTCTGGCGGTCGAAGGCCATGTTGATGGCTTTACGCACGCGCACGTCGTTGAGGTATTtgtg < 2:1220322/150‑1 (MQ=255) ttggTGTTGTAGCCGATCATGGTGGGTGGGTAAGGGTTTACACCCACCAGTGCGTTGCCTTTGCCAAACAGTTGGTCGACATGGGTCTGGCGGTCGAAGGCCATGTTGATGGCTTTACGCACGCGCACGTCGTTGAGGTATTTGTGCTgg < 1:2140188/148‑1 (MQ=255) tGGGTGTTGTAGCCGATCATGGTGGGTGGGTAAGGGTTTACACCCACCAGTGCGTTGCCTTTGCCAAACAGTTGGTCGACATGGGTCTGGCGGTCGAAGGCCATGTTGATGGCTTTACGCACGCGCACGTCGTTGAGGTATTTGTGCTgg < 2:94660/150‑1 (MQ=255) tGGGTGTTGTAGCCGATCATGGTGGGTGGGTAAGGGTTTACACCCACCAGTGCGTTGCCTTTGCCAAACAGTTGGTCGACATGGGTCTGGCGGTCGAAGGCCATGTTGATGGCTTTACGCACCCCCACGTCGTTGAGGTATTTGTGCTgg < 1:1231215/150‑1 (MQ=255) gggTGTTGTAGCCGATCATGGTGGGTGGGTAAGGGTTTACACCCACCAGTGCGTTGCCTTTGCCAAACAGTTGGTCGACATGGGTCTGGCGGTCGAAGGCCATGTTGATGGCTTTACGCACGCGCACGTCGTTGAGGTATTTGTGCTggg < 2:568197/150‑1 (MQ=255) gggTGTTGTAGCCGATCATGGTGGGTGGGTAAGGGTTTACACCCACCAGTGCGTTGCCTTTGCCAAACAGTTGGTCGACATGGGTCTGGCGGTCGAAGGCCATGTTGATGGCTTTACGCACGCGCACGTCGTTGAGGTATTTGTGCTggg < 2:1634694/150‑1 (MQ=255) gtgtTGTGGCCGATCATGGTGGGTGGGTAAGGGTTTACACCCACCAGTGCGTTGCCTTTGCCAAACAGTTGGTCGACATGGGTCTGGCGGTCGAAGGCCATGTTGATGGCTTTACGCACGCGCACGTCGTTGAGGTAtt > 2:2196432/1‑139 (MQ=255) gtAGCCGATCATGGTGGGTGGGTAAGGGTTTACACCCACCAGTGCGTTGCCTTTGCCAAACAGTTGGTCGACATGGGTCTGGCGGTCGAAGGCCATGTTGAt > 2:932974/1‑102 (MQ=255) gtAGCCGATCATGGTGGGTGGGTAAGGGTTTACACCCACCAGTGCGTTGCCTTTGCCAAACAGTTGGTCGACATGGGTCTGGCGGTCGAAGGCCATGTTGAt < 1:932974/102‑1 (MQ=255) cGATCATGGTGGGTGGGTAAGGGTTTACACCCACCAGTGCGTTGCCTTTGCCAAACAGTTGGTCGACATGGGTCTGGCGGTCGAAGGCCATGTTGATGGCTTTACGCACGCGCACGTCGTTGAGGTATTTGTGCTGGGTATTAATGGCGa > 2:3708/1‑150 (MQ=255) gATCATGGTGGGTGGGTAAGGGTTTACACCCACCAGTGTTTTTCCTTTGACAAACAGTTGGTCGACATGGGTCTGGCGGTCGAAGGCCATGTTGATGGCTTTACGCACGCGCACGTCGTTGAGGTATTTGTGCTGGGTATTCATGGCGAt < 1:611894/150‑1 (MQ=255) aTGGTGGGTGGGTAAGGGTTTACAACCACCAGTGCGTTGCCTTTGCCAAACAGTTGGTCGACATGAGTCTGGCGGTCGAAGGCAATGTTGATGCCTTTACAAACGCGCTCTGTATGGAGTGAGTTTTGCTGGGTATTCATGGCGATGTAg > 2:510565/1‑150 (MQ=255) TGGTGGGTGTGTAAGGGTTTACACCCACCAGTGCGTTGCCTTTGCCAAACAGTTGGTCGACATGGGTCTGGCGGTCGAAGGCCATGTTGATGGCTTTACGCACGCGCACGTCGTTGAGGTATTTGTGCTGGGTATTCATGGCGATGTAGc > 1:722532‑M1/1‑150 (MQ=255) TGGTGGGTGGGTAAGGGTTTACACCCACCAGTGCGTTGCCTTTGCCAAACAGTTGGTCGACATGGGTCTGGCgg < 2:910526‑M1/74‑1 (MQ=255) TGGTGGGTGGGTAAGGGTTTACACCCACCAGTGCGTTGCCTTTGCCAAACAGTTGGTCGACATGGGTCTGGCgg > 1:910526‑M1/1‑74 (MQ=255) TGGTGGGTGGGTAAGGGTTTACACCCACCAGTGCGTTGCCTTTGCCAAACAGTTGGTCGACATGGGTCTGGCGGTCGAAGGCCATGTTGATGGCTTTACGCACGCGCACGTCGTTGAGGTATTTGTGCTGGGTATTCATGGCGATGTAGc < 2:1700805‑M1/150‑1 (MQ=255) | CAGGCGCGGGTTGGGGTTGGTCGGGCCGCCGCCGTTGCGGGTGAACAGGGTGATTACCGTGCCCTCGGGTACACCGGCCTGGCTGAGCAGTGCGCGGGCTTTATCGAGGTCGCGCGGTGGGTTCTGGTTATGGGTGTTGTAGCCGATCATGGTGGGTGGGTAAGGGTTTACACCCACCAGTGCGTTGCCTTTGCCAAACAGTTGGTCGACATGGGTCTGGCGGTCGAAGGCCATGTTGATGGCTTTACGCACGCGCACGTCGTTGAGGTATTTGTGCTGGGTATTCATGGCGATGTAGC > NC_002947/1022516‑1022814 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |