| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 1098124 = | 115 (1.300) | 9 (0.110) | 7/240 | NT | 7.4% | coding (460/525 nt) | kdsC | 3‑deoxy‑D‑manno‑octulosonate 8‑phosphate phosphatase |
| ? | NC_002947 | 1098151 = | 115 (1.350) | coding (433/525 nt) | kdsC | 3‑deoxy‑D‑manno‑octulosonate 8‑phosphate phosphatase | |||||
Only 100 of 137 total aligned reads displayed.
TCCAGTAGCCAATGGCTACCAACAGGGCGGCTATCGCCCCCAGCAGCACAATGTTTCGGGCTTTCTTGCTGAGCATGGGCAGCCTTACAGGTAGTTGGCGTTGGCAGAGTCCAGGGTGCCCTGGGCCTGCATGATCATTTCGCAGAATTCACGGGCCGCGCCTTCGCCGCCACGTGCCTGGGTCACGCCGTGGGCGTGCTGGCGTACGAACGGTGCGGCGTTGGCTACGGCCATGCCCAGAGCCACCCGGCGAATCACCGGCAGGTCGGGCAGGTCGTCGCCCAGGTAAGCCACTT > NC_002947/1097975‑1098270 | gctcgccgaactgggcctaagctatgatcaagtggcttacctgggcgacgacctgcccgacctgccggtgattcgccgggtggctctgggcatggccctagccaacgccgcaccgttcgtacgccagcacgcccacggcgtgacccaggc > 1:1813229‑M1/150‑150 (MQ=255) ctcgccgaactgggcctaagctatgatcaagtggcttacctgggcgacgacctgcccgacctgccggtgattcgccgggtggctctgggcatggccgtagccaacgccgcaccgttcgtacgccagcacgcccacggcgtgacccaggCa < 1:1919892‑M1/2‑1 (MQ=255) aGTAGCCAATGGCTACCAACAGGGCGGCTATCGCCCCCAGCAGCACAATGTTTCGGGCTTTCTTGCTGAGCATGGGCAGCCTTACAGGTAGTTGGCGTTGGCAGAGTCCAGGGTGCCCTGGGCCTGCATGATCATTTCGCAGAATTCACg > 2:962826/1‑150 (MQ=255) gCCAATGGCTACCAACAGGGCGGCTATCGCCCCCAGCAGCACAATGTTTCGGGCTTTCTTGCTGAGCATGGGCAGCCTTACAGGTAGTTGGCGTTGGCAGAGTCCAGGGTGCCCTGGGCCTGCATGATCATTTCGCAGAATTCACGGGcc > 1:1781358/1‑150 (MQ=255) ccAATGGCTACCAACAGGGCGGCTATCGCCCCCAGCAGCACAATGTTTCGGGCTTTCTTGCTGAGCATGGGCAGCCTTACAGGTAGTTGGCGTTGGCAGAGTCCAGGGTGCCCTGGGCCTGCATGATCATTTCGCAGAATTCACGGGCcg > 2:229257/1‑150 (MQ=255) aaTGGCTACCAACAGGGCGGCTATCGCCCCCAGCAGCACAATGTTTCGGGCTTTCTTGCTGAGCATGGGCAGCCTTACAGGTAGTTGGCGTTGGCAGAGTCCAGGGTGCCCTGGGCCTGCATGATCATTTCGCAGAATTCACGGGCcgcg > 1:764330/1‑150 (MQ=255) aTGGCTACCAACAGGGCGGCTATCGCCCCCAGCAGCACAATGTTTCGGGCTTTCTTGCTGAGCATGGGCAGCCTTACAGGTAGTTGGCGTTGGCAGAGTCCAGGGTGCCCTGGGCCTGCATGATCATTTCGCAGAATTCACGGGCCgcgc > 1:12764/1‑150 (MQ=255) cctaagctatgatcaagtggcttacctgggcgacgacctgcccgacctgccggtgattcgccgggtggctctgggcatggccgtggccaacgccgcaccgttcgtacgccagcacgcccacggcgtgacccaggCACGGGCCGCGCCTTc < 1:1624581‑M1/16‑1 (MQ=255) ccAACAGGGCGGCTATCGCCCCCAGCAGCACAATGTTTCGGGCTTTCTTGCTGAGCATGGGCAGCCTTACAGGTAGTTGGCGTTGGCAGAGTCCAGGGTGCCCTGGGCCTGCATGATCATTTCGCAGAATTCAc < 1:663944/134‑1 (MQ=255) ccAACAGGGCGGCTATCGCCCCCAGCAGCACAATGTTTCGGGCTTTCTTGCTGAGCATGGGCAGCCTTACAGGTAGTTGGAGTTGGCAGAGTCCAGGGTGCCCTGGGCCTGCATGATCATTTCGCAGAATTCAc > 2:663944/1‑134 (MQ=255) cAACAGGGCGGCTATCGCCCCCAGCAGCACAATGTTTCGGGCTTTCTTGCTGAGCATGGGCAGCCTTACAGGTAGTTGGCGTTGGCAGAGTCCAGGGTGCCCTGGGCCTGCATGATCATTTCGCAGAATTCACGGGCCGCGCCTTcgccg > 1:1638636/1‑150 (MQ=255) aGGGCGGCTATCGCCCCCAGCAGCACACTGTTTCGGGCTTTCTTGCTGAGCATGGGCAGCCTTACAGGTAGTTGGCGTTGGCAGAGTCCAGGGTGCCCTGGGCCTGCATGATCATTTCGCAGAATTCACGGGCCGCGCCTTCGCCGCCAc > 2:1141470/1‑150 (MQ=255) gcTATCGCCCCCAGCAGCACAATGTTTCGGGCTTTCTTGCTGAGCATGGGCAGCCTTACAGGTAGTTGGCGTTGGCAGAGTCCAGGGTGCCCTGGGCCTGCATGATCATTTCGCAGAATTCACGGGCCGCGCCTTCGCCGCCACGTGCCt > 1:332939/1‑150 (MQ=255) aagtggcttacctgggcgacgacctgcccgacctgccggtgattcgccgggtggctctgggcatggccgtggccaacgccgcaccgttcgtacgccagcacgcccacggcgtgacccaggCACGGGCCGCGCCTTCGCCGCCACTTGCCt > 2:1624581‑M1/121‑150 (MQ=255) cTATCGCCCCCAGCAGCACAATGTTTCGGGCTTTCTTGCTGAGCATGGGCAGCCTTACAGGTAGTTGGCGTTGGCAGAGTCCAGGGTGCCCTGGGCCTGCATGATCATTTCGCAGAATTCAc < 1:658999/122‑1 (MQ=255) cTATCGCCCCCAGCAGCACAATGTTTCGGGCTTTCTTGCTGAGCATGGGCAGCCTTACAGGTAGTTGGCGTTGGCAGAGTCCAGGGTGCCCTGGGCCTGCATGATCATTTCGCAGAATTCACGGGCCGCGcc < 2:1811990/132‑1 (MQ=255) cTATCGCCCCCAGCAGCACAATGTTTCGGGCTTTCTTGCTGAGCATGGGCAGCCTTACAGGTAGTTGGCGTTGGCAGAGTCCAGGGTGCCCTGGGCCTGCATGATCATTTCGCAGAATTCACGGGCCGCGcc > 1:1811990/1‑132 (MQ=255) tATCGCCCCCAGCAGCACAATGTTTCGGGCTTTCTTGCTGAGCATGGGCAGCCTTACAGGTAGTTGGCGTTGGCAGAGTCCAGGGTGCCCTGGGCCTGCATGATCATTTCGCAGAATTCACGGGCCGCGCCTTCGCCGCCACGTGCCTgg < 2:332939/150‑1 (MQ=255) tCGCCCCCAGCAGCACAATGTTTCGGGCTTTCTTGCTGAGCATGGGCAGCCTTACAGGTAGTTGGCGTTGGCAGAGTCCAGGGTGCCCTGGGCCTGCATGATCATTTCGCAGAATTCACGGGCCGCGCCTTCGCCGCCACGTGCCTGGGt < 2:764330/150‑1 (MQ=255) gCCCCCAGCAGCACAATGTTTCGGGCTTTCTTGCTGAGCATGGGCAGCCTTACAGGTAGTTGGCGTTGGCAGAGTCCAGGGTGCCCTGGGCCTGCATGATCATTTCGCAGAATTCACGGGCCGCGCCTTCG‑CGCCACGTGCCTGGGTCAc > 1:13780/1‑150 (MQ=255) ccccAGCAGCACAATGTTTCGGGCTTTCTTGCTGAGCATGGGCAGCCTTACAGGTAGTTGGCGTTGGCAGAGTCCAGGGGGCCCTAGGACTGCAAGAATATTTCGCAGAATTCACGGGCCGCGCCTTCGCCGCCACGTGCCTGGGTCACg > 2:317068/1‑150 (MQ=255) cccAGCAGCACAATGTTTCGGGCTTTCTTGCTGAGCATGGGCAGCCTTACAGGTAGTTGGCGTTGGCAGAGTCAAGGGTGCCCTGGGCCTGCATGATCATTTCGCAGAATTCACGGGCCGCGCCTTCGCCGCCACGTGCCTGGGTCACGc > 1:1046324/1‑150 (MQ=255) ccAGCAGCACAATGTTTCGGGCTTTCTTGCTGAGCATGGGCAGCCTTACAGGTAGTTGGCGTTGGCAGAGTCCAGGCAGCTCTGCGACAGCGACGCGGTTGGACAGAGGTCACGGGCCGCGCCTTCGCCGCCACGTGCCTGGGTCACGcc > 1:2027042/1‑150 (MQ=255) cagcaCAATGGTTCGGGCTTTCTTGCTGAGCATGGGCAGCCTTACAGGTAGTTGGCGTTGGCAGAGTCCAGGGTGCCCTGGGCCTGCATGACCATTTCGCAGAATTCACGGGCCGCGCCTGCGCCGCCACGTGCCTGGGTCACGCCGTgg < 2:860872/150‑1 (MQ=255) cacaATGTTTCGGGCTTTCTTGCTGAGCATGGGCAGCCTTACAGGTAGTTGGCGTTGGCAGAGTCCAGGGTGCCCTGGGCCTGCATGATCATTTCGCAGAATTCACGGGCCGCGCCTTCGCCGCCACGTGCCTGGGTCACGCCGTGGGCg > 1:829735/1‑150 (MQ=255) cacaATGTTTCGGGCTTTCTTGCTGAGCATGGGCAGCCTTACAGGTAGTTGGCGTTGGCAGAGTCCAGGGTGCCCTGGGCCTGCATGATCATTTCGCAGAATTCACGGGCCGCGCCTTCGCCGCCACGTGCCTGGGTCACGCCGTGGGCg > 1:1762831/1‑150 (MQ=255) acaATGTTTCGGGCTTTCTTGCTGAGCATGGGCAGCCTTACAGGTAGTTGGCGTTGGCAGAGTCCAGGGTGCCCTGGGCCTGCATGATCATTTCGCAGAATTCACGGGCCGCGCCTTCGCCGCCACGTGCCTGGGTCACGCCGTGGGCGt > 2:484231/1‑150 (MQ=255) tGTTTCGGGCTTTCTTGCTGAGAATGGGCAGCCTTACAGGTAGTTCGCGTTGGCAGAGTTTACGGTCGTTTTCTCCTGCATGATCATTTCGCAGAATTCACGGGCCGCGCCTTCGCCGCCACGTGCCTGGGTCACGCCGTGGGCGTGCTg < 1:1796810/150‑1 (MQ=255) ctgcccgacctgccggtgattcgccgggtggctctgggcatggccatagccaacgccgcaccgttcgtacgccagcacgcccacggcgtgacccaggCACGGGCCGCGCCTTCGCCGCCACGTGCCTgg > 2:241265‑M1/98‑129 (MQ=255) ctgcccgacctgccggtgattcgccgggtggctctgggcatggccatagccaacgccgcaccgttcgtacgccagcacgcccacggcgtgacccaggCACGGGCCGCGCCTTCGCCGCCACGTGCCTgg < 1:241265‑M1/32‑1 (MQ=255) ggCTTTCTTGCTGAGCATGGGCAGCCTTACAGGTAGTTGGCGTTGGCAGAGTCCAGGGTGCCCTGGGCCTGCATGATCATTTCGCAGAATTCACGGGCCGCGCCTTCGCCGCCACGTGCCTGGGTCACGCCGTGGGCGTGCTGTCGTACg > 2:2254512/1‑150 (MQ=255) ggCTTTCTTGCTGAGCATGGGCAGCCTTACAGGTAGTTGGCGTTGGCAGAGTCCAGGGTGCCCTGGGCCTGCATGATCATTTCGCAGAATTCACGGGCCGCGCCTTCGCCGCCACGTGCCTGGGTCACGCCGTGGGCGTGCTGGCGTACg > 1:490249/1‑150 (MQ=255) gCTTTCTTGCTGAGCATGGGCAGCCTTACAGGTAGTTGGCGTTGGCAGAGTCCAGGGTGCCCTGGGCCTGCATGATCATTTCGCAGAATTCACGGGCCGCGCCTTCGCCGCCACGTGCCTGGGTCACGCCGTGGGCGTGCTGGCGTACGa > 1:1807405/1‑150 (MQ=255) cTTTCTTGCTGAGCATGGGCAGCCTTACAGGTAGTTGGCGTTGGCAGAGTCCAGGGTGCCCTGGGCCTGCATGATCATTTCGTAGAATTCACGGGCCGCGCCTTCGCCGCCACGTGCCTGGGTCACGCCGTGGGCGTGCTGGCGTACGaa > 2:2307810/1‑150 (MQ=255) tCTTGCTGAGCATGGGCAGCCTTACAGGTAGTTGGCGTTGGCAGAGTCCAGGGTGCCCTGGGCCTGCATGATCATTTCGCAGAATTCACGGGCCGCTCCTTCGCCGCCACGTGCCTGGGTCACGCCGTGGGCGTGCTGGCGTACGAACgg < 1:415618/150‑1 (MQ=255) 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caacgccgcaccgttcgtacgccagcacgcccacggcgtgacccaggCACGGGCCGCGCCTTCGCCGCCACGTGCCTgg > 2:1278155‑M1/48‑79 (MQ=255) gcAGAGTCCAGGGTGCCCTGGGCCTGCATGATCATTTCGCAGAATTCACGGGCCGCGCCTTCGCCGCCACGTGCCTGGGTCACGCCGTGGGCGTGCTGGCGTACGaa < 1:453984/107‑1 (MQ=255) gcAGAGTCCAGGGTGCCCTGGGCCTGCATGATCATTTCGCAGAATTCACGGGCCGCGCCTTCGCCGCCACGTGCCTGGGTCACGCCGTGGGCGTGCTGGCGTACGaa > 2:453984/1‑107 (MQ=255) agagTCCAGGGTGCCCTGGGCCTGCATGATCATTTCGCAGAATTCACGGGCCGCGCCTTCGCCGCCACGTGCCTGGGTCACGCCGTGGGCGTGCTGGCGTACGAACGGTGCGGCGTTGGCTACGGCCATGCCCAGAGCCACCCGGCGAAt > 2:1592057/1‑150 (MQ=255) tCCAGGGTGCCCTGGGCCTGCATGATCATTTCGCAGAATTCACGGGCCGCGCCTTCGCCGCCACGTGCCTGGGTCACGCCGTGGGCGTGCTGGCGTACGAACGGTGCGGCGTTGGCTACGGCCATGCCCaga < 1:458082/132‑1 (MQ=255) tCCAGGGTGCCCTGGGCCTGCATGATCATTTCGCAGAATTCACGGGCCGCGCCTTCGCCGCCACGTGCCTGGGTCACGCCGTGGGCGTGCTGGCGTACGAACGGTGCGGCGTTGGCTACGGCCATGCCCAGAGCCACCCGGCGAATCAcc > 1:2158610/1‑150 (MQ=255) 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ggCCTGCATGATCATTTCGCAGAATTCACGGGCCGCGCCTTCGCCGCCACGTGCCTGGGTCACGCCGTGGGCGTGCTGGCGTACGAACGGTGCGGCGTTGGCTACGGCCATGCCCAGAGCCACCCGGCGAATCACCggcaggtcgggcag < 2:2048285/150‑1 (MQ=255) ggCCTGCATGATCATTTCGCAGAATTCACGGGCCGCGCCTTCGCCGCCACGTGCCTGGGTCACGCCGTGGGCGTGCTGGCGTACGAACGGTGCGGCGTTGGCTACGGCCATGCCCAGAGCCACCCGGCGAATCACCggcaggtcgggcag < 2:942928/150‑1 (MQ=255) gCATGATCATTTCGCAGAATTCACGGGCCGCGCCTTCGCCGCCACGTGCCTGGGTCACGCCGTGGGCGTg < 2:209892/70‑1 (MQ=255) gCATGATCATTTCGCAGAATTCACGGGCCGCGCCTTCGCCGCCACGTGCCTGGGTCACGCCGTGGGCGTg > 1:209892/1‑70 (MQ=255) cATGATCATTTCGCAGAATTCACGGGCCGCGCCTTCGCCGCCACGTGCCTGGGTCACGCCGTGGGCGTGCTGGCGTACGAACGGTGCGGCGTTg < 2:458094/94‑1 (MQ=255) cATGATCATTTCGCAGAATTCACGGGCCGCGCCTTCGCCGCCACGTGCCTGGGTCACGCCGTGGGCGTGCTGGCGTACGAACGGTGCGGCGTTGGCTACGGCCATGCCCAGAGCCACCCGGCGAATCACCGGCAGGTCGGGCAGctcgtc > 2:1871095/1‑150 (MQ=255) tCATTTCGCAGAATTCACGCGCCGCGCCTTCGCCGCCACGTGCCTGGGTCACGCCGTGGGCGTGCTGGCGTACGAACGGTGCGGCGTTGGCTACGGCCATGCCCAGAGCCACCCGGCGAATCACCGGCAGGTCGGGCAGGTCGTCGCCCa < 1:8559/150‑1 (MQ=255) cATTTCGCAGAATTCACGGGCCGCGCCTTCGCCGCCACGTGCCTGGGTCACGCCGTGGGCGTGCTGGCGTACGAACGGTGCGGCGTTGGCTACGGCCATGCCCAGAGCCATCCGGTGATTCACCGGCAGGTCGGGCAGGTCGTCGCCCAg < 1:1032422/150‑1 (MQ=255) tttCGCAGAATTCACGGGCCGCGCCTTCGCCGCCACGTGCCTGGGTCACGCCGTGGGCGTGCTGGCGTACGAACGGTGCGGCGTTGGCTACGGCCATGCCCAGAGCCACCCGGCGAATCACCGGCAGGTCGGGCAGGTCGTCGCCCAGGt < 2:464857/150‑1 (MQ=255) gCAGAATTCACGGGCCGCGCCTTCGCCGCCACGTGCCTGGGTCACGCCGTGGGCGTGCTGGCGTACGAACGGTgc > 2:1627958/1‑75 (MQ=255) gAATTCACGGGCCGCGCCTTCGCCGCCACGTGCCTGGGTCACGCCGTGGGCGTGCTGGCGTACGAACGGTGCGGCGTTGGCTACGGCCATGCCCAGAGCCACCCGGCGAATCAcc > 1:1204157/1‑115 (MQ=255) gAATTCACGGGCCGCGCCTTCGCCGCCACGTGCCTGGGTCACGCCGTGGGCGTGCTGGCGTACGAACGGTGCGGCGTTGGCTACGGCCATGCCCAGAGCCACCCGGCGAATCAcc < 2:1204157/115‑1 (MQ=255) aaTTCACGGGCCGCGCCTTCGCCGCCACGTGCCTGGGTCACGCCGTGGGCGTGCTGGCGTACGAACGGTGCGGCGTTGGCTACGGCCATGCCCAGAGCCACCCGGCGAATCACCGGCAGGTCGGGCAGGTCGTCGCCCAGGTAAGCCACt < 1:983862/150‑1 (MQ=255) aTTCACGGGCCGCGCCTTCGCCGCCACGTGCCTGGGTCACGCCGTGGGCGTGCTGGCGTACGAACGGTGCGGCGTTGGCTACGGCCATGCCCAGAGCCACCCGGCGAATCACCGGCAGGTCGGGCAGGTCGTCGCCCAGGTAAGCCACtt < 1:1141470/150‑1 (MQ=255) | TCCAGTAGCCAATGGCTACCAACAGGGCGGCTATCGCCCCCAGCAGCACAATGTTTCGGGCTTTCTTGCTGAGCATGGGCAGCCTTACAGGTAGTTGGCGTTGGCAGAGTCCAGGGTGCCCTGGGCCTGCATGATCATTTCGCAGAATTCACGGGCCGCGCCTTCGCCGCCACGTGCCTGGGTCACGCCGTGGGCGTGCTGGCGTACGAACGGTGCGGCGTTGGCTACGGCCATGCCCAGAGCCACCCGGCGAATCACCGGCAGGTCGGGCAGGTCGTCGCCCAGGTAAGCCACTT > NC_002947/1097975‑1098270 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |