| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 1114899 | 34 (0.390) | 9 (0.130) | 9/198 | NT | 20.7% | intergenic (‑88/+91) | rlmF/valS | ribosomal RNA large subunit methyltransferase F/valine‑‑tRNA ligase |
| ? | NC_002947 | = 1114925 | 42 (0.600) | intergenic (‑114/+65) | rlmF/valS | ribosomal RNA large subunit methyltransferase F/valine‑‑tRNA ligase | |||||
Only 100 of 122 total aligned reads displayed.
GGGAAGTCGTAGCGACCCTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCAC‑‑‑AGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTCG > NC_002947/1114750‑1115044 | tcgagaaggaacgcgccaagctggccgagtccgaacaggccctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGACACAAGGCCGCTCCCAC‑‑‑agga > 1:2277615‑M1/126‑150 (MQ=255)gggAAGTCGTAGCGACCCTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTACTGGCGTGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCAC‑‑‑AGGA < 1:734845‑M1/150‑1 (MQ=255) ccacaacgaacgccccaaacttgcagagtccgaacacgccctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttngtgccgctgnacggccctntcGCGACACAAGGCCGCTCCCAc‑‑‑aggan > 1:1129607‑M1/125‑149 (MQ=255) gaacgcgccaagctggccgagtccgaacaggccctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGACACAAGGCCGCTCCCAC‑‑‑AGGA‑GGGTGgcg < 2:1656670‑M1/33‑1 (MQ=255) tAGCGACCCTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCAC‑‑‑AGGA‑GGGTGgcgc > 2:682569/1‑150 (MQ=255) gACCCTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCAC‑‑‑AGGA‑GGGTGGCTCCTTg < 1:245442/150‑1 (MQ=255) cccTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCAC‑‑‑AGGA‑GGGTGGCGCCTTGaa < 2:1384638/150‑1 (MQ=255) cccTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCAC‑‑‑AGGA‑GGGTGGCGCCTTGaa < 2:280917/150‑1 (MQ=255) ccTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCAC‑‑‑AGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAg < 2:1017918/150‑1 (MQ=255) ccTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTCGCGACACAAGGCCGCTCCCAC‑‑‑AGGAcggcgccaaccttcaa > 1:272776‑M1/1‑134 (MQ=255) ggTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCAC‑‑‑AGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGcc < 1:617706/150‑1 (MQ=255) cgagtccgaacaggccctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggcctctgtacggccctttcGCGACACAAGGCCGCTCCCAC‑‑‑AGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGcc < 1:2210896‑M1/50‑1 (MQ=255) gtccgaacaggccctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggcctctgtacggccctttcGCGACACAAGGCCGCTCCCAC‑‑‑AGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTc > 2:2210896‑M1/98‑150 (MQ=255) tccgaacaggccctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcactgccgtaatcactagagagaccggtggggccgctgtacggccctttcGCGACACAAGGCCGCTCCCAC‑‑‑AGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTcc < 1:44925‑M1/54‑1 (MQ=255) cgGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCAC‑‑‑AGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgt > 2:2090523‑M2/1‑144 (MQ=255) cgGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTCGCGACACAAGGCCGCTCCCAC‑‑‑AGGAcggcgccaaccttcaaggcgccaccctcctgt < 2:272776‑M1/150‑33 (MQ=255) tGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCAGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGAcggcgccaaccttcaaggcgccaccctcctgtg < 1:1445867‑M1/150‑34 (MQ=255) aggccctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGACACAAGGCCGCTCCCAC‑‑‑AGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGa > 1:1656670‑M1/90‑150 (MQ=255) cctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGACACAAGGCCGCTCCCAC‑‑‑AGGA‑CGG‑‑‑CGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTc > 1:737331‑M1/86‑135 (MQ=255) cctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGACACAAGGCCGCTCCCAC‑‑‑AGGA‑CGG‑‑‑CGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTc < 2:737331‑M1/50‑1 (MQ=255) ggtgggtTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCCCACAC‑‑‑AGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtgggagcggc > 2:329388‑M2/1‑135 (MQ=255) ctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGACACAAGGCCGCTCCCAC‑‑‑AGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGc > 2:44925‑M1/85‑150 (MQ=255) gccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGACACAAGGCCGCTCCCAC‑‑‑AGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCtt > 1:2326117‑M1/82‑150 (MQ=255) gtTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCAC‑‑‑AGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtgggagcggccttgt < 1:857833‑M2/150‑21 (MQ=255) gtTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCAC‑‑‑AGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtgggagcggccttgt < 1:2251190‑M2/150‑21 (MQ=255) gtTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCAC‑‑‑AGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGGTGGCGCCGtcctgtgggagcggccttgt < 1:1683516‑M2/150‑21 (MQ=255) tttGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCAC‑‑‑AGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtg < 1:689879‑M2/136‑8 (MQ=255) ttGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCAC‑‑‑AGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtgggagcggccttgtgt > 1:1154980‑M2/1‑128 (MQ=255) ttCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGCCCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCAC‑‑‑AGCC‑AAGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtgggagcggccttgtgtcgc > 1:1590926‑M2/1‑125 (MQ=255) cgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGACACAAGGCCGCTCCCAC‑‑‑AGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGaaa > 1:811300‑M1/71‑150 (MQ=255) aTGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCAC‑‑‑AGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtgggagcggc < 2:2030708‑M2/131‑16 (MQ=255) aTGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCAC‑‑‑AGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtgggagcggc > 1:2030708‑M2/1‑116 (MQ=255) gtCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCAC‑‑‑AGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCg < 2:857833/150‑1 (MQ=255) cAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCAC‑‑‑AGGAcggcgccaaccttcaaggcgccac > 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agcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGACACAAGGCCGCTCCCAC‑‑‑AGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTgg < 2:290122‑M1/59‑1 (MQ=255) agcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGACACAAGGCCGCTCCCAC‑‑‑AGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTgg > 1:290122‑M1/50‑108 (MQ=255) gCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCAC‑‑‑AGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGtctctc < 2:1147451/150‑1 (MQ=255) actagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGACACAAGGCCGCTCCCAC‑‑‑AGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGTCGCCGTCCTGTGGGa < 1:736094‑M1/61‑1 (MQ=255) actagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGACACAAGGCCGCTCCCAC‑‑‑AGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGa > 2:736094‑M1/38‑98 (MQ=255) cTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCAC‑‑‑AGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGAt > 1:2182424/1‑150 (MQ=255) 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ccaggggCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCAC‑‑‑AGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAgcgca > 1:2337148/4‑149 (MQ=255) ccTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCAC‑‑‑AGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCt > 2:1999779/1‑150 (MQ=255) gctgctGCCCAGCCCTTTTGCTACACAAGGCCGCTCCCAC‑‑‑AGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGGGCGGCCTGGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATc < 1:78793/150‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCAC‑‑‑AGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCcg > 1:747663/1‑150 (MQ=255) tgcGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCAC‑‑‑AGGTcggcgccaaccttcaaggcgccaccctcct > 2:1346763‑M1/1‑39 (MQ=255) tgcGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCAC‑‑‑AGGAcggcgccaaccttcaaggcgccaccctcct < 1:1346763‑M1/69‑31 (MQ=255) gcgcAGCCCTTTTGCGACACACGGCAGCT‑ACAC‑‑‑AACACGCGTCACTCTTTCCATATTGGCGCCTTTCTGTGTGTGCGGCCTTTTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTTATTTCTGCTTTGCAATCCGCTCa < 2:1674661/150‑1 (MQ=255) cAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCAC‑‑‑AGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCAtgc < 1:1845498/150‑1 (MQ=255) cAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCAC‑‑‑AGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCAtgc > 2:1617785/1‑150 (MQ=255) cTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCAC‑‑‑AGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACgg > 2:465921/1‑108 (MQ=255) cTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCAC‑‑‑AGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACgg < 1:465921/108‑1 (MQ=255) ttttGCGACACAAGGCCGCTCCCAC‑‑‑AGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCg > 1:1888638/1‑150 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gCCGCTCCCAC‑‑‑AGGAcggcgccaaccttcaaggcgccaccctcctgtgggagcggccttgtgtcgcaaaagggctgcgcagcagccccagggtcttcaagccaccgctcgtatagggctggacactgccat < 2:2030708‑M1/131‑117 (MQ=255) gCCGCTCCCAC‑‑‑AGGAcggcgccaaccttcaaggcgccaccctcctgtgggagcggccttgtgtcgcaaaagggctgcgcagcagccccagggtcttcaagccaccgctcgtatagggctggacactgccat > 1:2030708‑M1/1‑15 (MQ=255) GCCGCTCCCAC‑‑‑AGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGgggaagttacccac < 2:2240681‑M1/150‑7 (MQ=255) CCGCTCCCAC‑‑‑AGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAgg < 2:2027556‑M1/150‑1 (MQ=255) CGCTCCCAC‑‑‑AGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAggg < 1:452862‑M1/150‑1 (MQ=255) CCAC‑‑‑AGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGt < 1:2256586‑M1/150‑1 (MQ=255) cac‑‑‑aGGAcggcgccaaccttcaaggcgccaccctcctgtgggagcggccttgtgtcgcaaaagggctgcgcagcagccccagggtcttcaagccaccgctcgtatagggctggacactgccatgaccccgaacaaa < 1:689879‑M1/136‑130 (MQ=255) cac‑‑‑aGGAcggcgccaaccttcaaggcgccaccctcctgtgggagcggccttgtgtcgcaaaagggctgcgcagcagccccagggtcttcaagccaccgctcgtatagggctggacactgccatgaccccgaacaaa > 2:689879‑M1/1‑7 (MQ=255) cac‑‑‑aGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctcctgtgggagcggccttgtgtcgcaaaagggctgcgcagcagccccagggtcttcaagccactgctcgtatagggctggacactgccatgaccccgaacaaacccaccctgca < 1:1445867‑M2/150‑118 (MQ=255) CAC‑‑‑AGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGtt < 2:1080286‑M1/150‑1 (MQ=255) CAC‑‑‑AGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCACCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCaa > 2:1606998‑M1/1‑82 (MQ=255) CAC‑‑‑AGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCACCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCaa < 1:1606998‑M1/82‑1 (MQ=255) ac‑‑‑aGGAcggcgccaaccttcaaggcgccaccctcctgtgggagcggccttgtgtcgcaaaagggctgcgcagcagccccagggtcttcaagccaccgctcgtatagggctggacactgccatgaccccgaacaaacccaccctgcacccg > 2:2090523‑M1/1‑6 (MQ=255) ac‑‑‑aGGAcggcgccaaccttcaaggcgccaccctcctgtgggagcggccttgtgtcgcaaaagggctgcgcagcagccccagggtcttcaagccaccgctcgta > 2:996998‑M1/1‑6 (MQ=255) ac‑‑‑aGGAcggcgccaaccttcaaggcgccaccctcctgtgggagcggccttgtgtcgcaaaagggctgcgcagcagccccagggtcttcaagccaccgctcgta < 1:996998‑M1/103‑98 (MQ=255) ac‑‑‑aGGAcggcgccaaccttcaaggcgccaccctcctgtgggagcggcctagtgtcgcaaaagggctgcgcagcagccccagggtcttcaagccaccgctcgtatag > 1:948396‑M1/1‑6 (MQ=255) ac‑‑‑aGGAcggcgccaaccttcaaggcgccaccctcctgtgggagcggcctagtgtcgcaaaagggctgcgcagcagccccagggtcttcaagccaccgctcgtatag < 2:948396‑M1/106‑101 (MQ=255) AC‑‑‑AGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGATGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTGCAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTCGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCTGTGAAGTTGGCGAGGGCTTGTTc < 2:1001914‑M1/150‑1 (MQ=255) C‑‑‑AGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTCg > 2:1683516‑M1/1‑150 (MQ=255) agga‑ggGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtgggagcggccttgtgtcgcaaaagggctgcgca < 1:1346763‑M2/69‑40 (MQ=255) agga‑ggGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGacctgtgggagcggccttgtgtcgcaaaagggctgcgca > 2:1346763‑M2/1‑30 (MQ=255) AGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAggg < 2:669101‑M1/141‑1 (MQ=255) AGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAggg > 1:669101‑M1/1‑141 (MQ=255) GA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCtt < 1:356019‑M1/46‑1 (MQ=255) GA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCtt > 2:356019‑M1/1‑46 (MQ=255) | GGGAAGTCGTAGCGACCCTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCAC‑‑‑AGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTCG > NC_002947/1114750‑1115044 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |