New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_002947 | = 1892582 | 92 (1.040) | intergenic (+50/‑45) | PP_1697/PP_1698 | transcriptional regulator, GntR family/MFS transporter |
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
CTGCCGGCCGACAGCCCGGTGGTCGTGATCGAGCGCCTGGCCCGCGATTACGCCGGCAAACCTCTGGAATGGCGCCGCTCGCGCGGCCATGCGCAGCACTTCCGCTACCGCATCGACATTCGTTAAACCGGTCGCTTCACCCTTCACCTGTCTGCGCCGTG‑CTGCCACGGCGCAGTGGCTTCGCCTGCCCGTCACACCCACGACTAGAAGGATAACAATCATGTTCAGCTGGTATCGCGAGATCACCTCACGGGAACGCAAGACATTCTGGGCCTGTTTCGGCGGCTGGTCGCTC > NC_002947/1892407‑1892701 | cTGCCGGCCGACAGCCCGGTGGTCGTGATCGAGCGCCTGGCCCGCGATTACGCCGGCAAACCTCTGGAATGGCGCCGCTCGCGCGGCCATGCGCAGCACTTCCGCTACCGCATCGACATTCGTTAAACCGGTCGCTTCACCCTTCACCTg > 2:1692338/1‑150 (MQ=255) gccggccgACAGCCCGGTGGTCGTGATCGAGCGCCTGGCCCGCGATTACGCCGGCAAACCTCTGGAATGGCGCCGCTCGCGCGGCCATGCGCAGCACTTCCGCTACCGCATCGACATTCGTTAAACCGGTCGCTTCACCCTTCACCTGTc < 1:478069/150‑1 (MQ=255) ccggccgACAGCCCGGTGGTCGTGATCGAGCGCCTGGCCCGCGATTACGCCGGCAAACCTCTGGAATGGCGCCGCTCGCGCGGCCATGCGCAGCACTTCCGCTACCGCATCGACATTCGTTAAACCGGTCGCTTCACCCTTCACCTGTCt < 1:383710/150‑1 (MQ=255) ggccgACAGCCCGGTGGTCGTGATCGAGCGCCTGGCCCGCGATTACGCCGGCAAACCTCTGGAATGGCGCCGCTCGCGCGGCCATGCGCAGCACTTCCGCTACCGCATCGACATTCGTTAAACCGGTCGCTTCACCCTTCACCTGTCTgc > 2:694640/1‑150 (MQ=255) gccgACAGCCCGGTGGTCGTGATCGAGCGCCTGGCCCGCGATTACGCCGGCAAACCTCTGGAATGGCGCCGCAAGGGCGGCCATGCGCAGCCCTTCCGCTACCGCAGCTACAGTCGTTAAACCGGTCGCTTCACCCTTCACCTGTCTgcg > 1:1105624/1‑150 (MQ=255) cgACAGCCCGGTGGTCGTGATCGAGCGCCTGGCCCGCGATTACGCCGGCAAACCTCTGGAATGGCGCCGCTCGCGCGGCCATGCGCAGCACTTCCGCTACCGCATCGACATTCGTTAAACCGGTCGCTTCACCCTTCACCTGTCTGCGcc < 2:1902369/150‑1 (MQ=255) gACAGCCCGGTGGTCGTGATCGAGCGCCTGGCCCGCGATTACGCCGGCAAACCTCTGGAATGGCGCCGCTCGCGCGGCCATGCGCAGCACTTCCGCTACCGCATCGACATTCGTTAAACCGGTCGCTTCACCCTTCACCTGTCTGCGCCg > 2:2080357/1‑150 (MQ=255) gACAGCCCGGTGGTCGTGATCGAGCGCCTGGCCCGCGATTACGCCGGCAAACCTCTGGAATGGCGCCGCTCGCGCGGCCATGCGCAGCACTTCCGCTACCGCATCGACATTCGTTAAACCGGTCGCTTCACCCTTCACCTGTCTGCGCCg < 2:234719/150‑1 (MQ=255) aGCCCGGTGGTCGTGATCGAGCGCCTGGCCCGCGATTACGCCGGCAAACCTGTGGAATGGCGCAGCTCGCGCGGCCATGCGCAGCACTTCCGCTACCGCATTGACATTTTTTAAACCGGTCGCTTCACCCTTCACCTGTCTGCGCCGtg‑c > 1:880207/1‑150 (MQ=255) gCCCGGTGGTCGTGATCGAGCGCCTGGCCCGCGATTACGCCGGCAAACCTCTGGAATGGCGCCGCTCGCGCGGCCATGCGCAGCACTTCCGCTACCGCATCGCCATTCGTTAAACCGATCGCGTCACCCGTTGCCGGTCTTCGCCGtg‑ct < 2:1780198/150‑1 (MQ=255) gCCCGGTGGTCGTGATCGAGCGCCTGGCCCGCGATTACGCCGGCAAACCTCTGGAATGGCGCCGCTCGCGCGGCCATGCGCAGCACTTCCGCTACCGCATCGACATTCGTTAAACCGGTCGCTTCACCCTTCACCTGTCTGCGCCGtg‑ct > 2:84967/1‑150 (MQ=255) cccGGTGGTCGTGATCGAGCGCCTGGCCCGCGATTACGCCGGCAAACCTCTGGAATGGCGCCGCTCGCGCGGCCATGCGCAGCACTTCCGCTACCGCATCGACATTCGTTAAACCGGTCGCTTCACCCTTCACCTGTCTGCGCCGtg‑ctg < 1:766985/150‑1 (MQ=255) cccGGTGGTCGTGATCGAGCCCCTGGCCCGCGATTACGCCGGCAAACCTCTGGAATGGCGCCGCTCGCGCGGCCATGCGCAGCACTTCCGCTACCGCATCGACATTCGTTAAACCGGTCGCTTCACCCTTCACCTGTCTGCGCCGtg‑ctg > 2:921097/1‑150 (MQ=255) ccGGTGGTCGTGATCGAGCGCCTGGCCCGCGATTACGCCGGCAAACCTCTGGAATGGCGCCGCTCGCGCGGCCATGCGCAGCACTTCCGCTACCGCATCGACATTCGTTAAACCGGTCGCTTCACCCTTCACCTGTCTGCGCCGtg‑ctgc < 1:84967/150‑1 (MQ=255) ggtggtCGTGATCGAGCGCCTGGCCCGCGATTACGCCGGCAAACCTCTGGAATGGCGCCGCTCGCGCGGCCATGCGCAGCACTTCCGCTACCGCATCGACATTCGTTAAACCGGTCGCTTCACCCTTCACCTGTCTGCGCCGTG‑CTGCCa > 1:1197553/1‑150 (MQ=255) gtggtCGTGATCGAGCGCCTGGCCCGCGATTACGCCGGCAAACCTCTGGAATGGCGCCGCTCGCGCGGCCATGCGCAGCACTTCCGCTACCGCATCGACATTCGTTAAACCGGTCGCTTCACCCTTCACCTGTCTGCGCCGTG‑CTGCCAc < 2:773864/150‑1 (MQ=255) gtCGTGATCGAGCGCCTGGCCCGCGATTACGCCGGCAAACCTCTGGAATGGCGCCGCTCGCGCGGCCATGCGCAGCACTTCCGCTACCGCATCGACATTCGTTAAACCGGTCGCTTCACCCTTCACCTGTCTGCGCCGTG‑CTGCCACGgc > 1:1820799/1‑150 (MQ=255) tGATCGAGCGCCTGGCCCGCGATTACGCCGGCCCACCTCTGGAATGGCGCCGCTCGCGCGGCCATGCGCAGCACTTCCGCTACCGCATCGACATTCGTTAAACCGGTCGCTTCACCCTTCACCTGTCTGCGCCGTG‑CTGCCACGGCGCAg > 1:1716506/1‑150 (MQ=255) 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ttAAACCGGTCGCTTCACCCTTCACCTGTCTGCGCCGTG‑CTGCCACGGCGCAGTGGCTTCGCCTGCCCGTCACACCCACGACTAGAAGGATAACAATCATGTTCAGCTGGTATCGCGAGATCACCTCACGGGAACGCAAGACATTCTggg < 2:1105624/150‑1 (MQ=255) tAAACCGGTCGCTTCACCCTTCACCTGTCTGCGCCGTG‑CTGCCACGGCGCAGTGGCTTCGCCTGCCCGTCACACCCACGACTAGAAGGATAACAATCATGTTCAGCTGGTATCGCGAGATCACCTCACGGGAACGCAAGACATTCTGGGc < 1:748877/150‑1 (MQ=255) ccGGTCGCTTCACCCTTCACCTGTCTGCGCCGTG‑CTGCCACGGCGCAGTGGCTTCGCCTGCCCGTCACACCCACGACTAGAAGGATAACAATCATGTTCAGCTGGTATCGCGAGATCACCTCACGGGAACGCCAGACATTCTGGGCCTGt < 1:2302784/150‑1 (MQ=255) cGGTCGCTTCACCCTTCACCTGTCTGCGCCGTG‑CTGCCACGGCGCAGTGGCTTCGCCTGCCCGTCACACCCACGACTAGAAGGATAACAATCAt > 2:2095360/1‑94 (MQ=255) cGGTCGCTTCACCCTTCACCTGTCTGCGCCGTG‑CTGCCACGGCGCAGTGGCTTCGCCTGCCCGTCACACCCACGACTAGAAGGATAACAATCAt < 1:2095360/94‑1 (MQ=255) gTCGCTTCACCCTTCACCTGTCTGCGCCGTG‑CTGCCACGGCGCAGTGGCTTCGCCTGCCCGTCACACCCACGACTAGAAGGATAACAATCATGTTCAGCTGGTATCGCGAGATCACCTCACGGGAACGCAAGACATTCTGGGCCTGTTTc > 2:236824/1‑150 (MQ=255) cGCTTCACCCTTCACCTGTCTGCGCCGTG‑CTGCCACGGCGCAGTGGCTTCGCCTGCCCGTCACACCCACGACTAGAAGGATAACAATCATGTTCAGCTGGTATCGCGAGATCACCTCACGGGAACGCAAGACATTCTGGGCCTGTTTcgg < 2:1820799/150‑1 (MQ=255) ttcacccttcaccTGtctgcgccgtgctgccacggcgcagtcaggtgaagggtgaagcgaccggtttaacgaatgtcgatgcggtagcggaagtgctgcgcatggccgcgcgagcggcgccattccagag > 1:2336155‑M1/1‑15 (MQ=255) tcacccttcaccTGtctgcgccgtgctgccacggcgcagacaggtgaagggtgaagcgaccggtttaacgaatgtcgatacggtagcggaagtgctgcgcatggccgcgcgagcggcgccattccagaggtttgccggcgtaatcgcggg > 2:1495469‑M1/1‑14 (MQ=255) cacccttcaccTGTCTGCTCCGTG‑CTGCCACGGCGCAGTGGCTTCGCCTGCCCGTCACACCCACGACTAGAAGGATAACAATCATGTTCAGCTGGTATCGCGAGATCACCTCACGGGAACGCAAGACATTCTGGGCCTGTTTCGGCGGCt < 1:1639082/150‑1 (MQ=255) cacccttcaccTGTCTGCGCCGTG‑CTGCCACGGCGCAGTGGCTTCGCCTGCCCGTCACACCCACGACTAGAAGGATAACAATCATGTTCAGCTGGTATCGCGAGATCACCTCACGGGAACGCAAGACATTCTGGGCCTGTTTCGGCGGCt > 2:1166052/1‑150 (MQ=255) cacccttcaccTGTCTGCGCCGTG‑CTGCCACGGCGCAGTGGCTTCGCCTGCCCGTCACACCCACGACTAGAAGGATAACAATCATGTTCAGCTGGTATCGCGAGATCACCTCACGGGAACGCAAGACATTCTGGGCCTGTTTCGGCGGCt < 1:1816386/150‑1 (MQ=255) cccttcaccTGTCTGCGCCGTG‑CTGCCACGGCGCAGTGGCTTCGCCTGCCCGTCACACCCACGACTAGAAGGATAACAATCATGTTCAGCTGGTATCGCGAGATCACCTCAc < 2:2309150/112‑1 (MQ=255) cttcaccTGtctgcgccgtgctgccacggcgcagtcaggtgaagggtgaagcgaccggtttaacgaatgtcgatgcggtagcggaagtgctgc > 2:1712606‑M1/1‑9 (MQ=255) cttcaccTGtctgcgccgtgctgccacggcgcagtcaggtgaagggtgaagcgaccggtttaacgaatgtcgatgcggtagcggaagtgctgc < 1:1712606‑M1/93‑85 (MQ=255) cccTGTCTGCGCCGTG‑CTTCCACGGCGCAGTGGCTTCGCCTGCCCGTCACACCCACGACTAGAAGGATAACAATCATGTTCAGCTGGTATCGCGAGATCACCTCACGGGAACGCAAGACATTCTGGGCCTGTTTCGGCGGCTGGTCGCta < 1:1340927/149‑2 (MQ=255) accTGTCTGCGCCGTG‑CTGCCACGGCGCAGTGGCTTCGCCTGCCCGTCACACCCACGACTAGAAGGATAACAATc > 2:553353/1‑75 (MQ=255) accTGTCTGCGCCGTG‑CTGCCACGGCGCAGTGGCTTCGCCTGCCCGTCACACCCACGACTAGAAGGATAACAATc < 1:553353/75‑1 (MQ=255) accTGTCTGCGCCGTG‑CTGCCACGGCGCAGTGGCTTCGCCTGCCCGTCACACCCACGACTAGAAGGATAACAATCATGTTCAGCTGGTATCGCGAGATCACCTCACGGGAACGCAAGACATTCTGGGCCTGTTTCGGCGGCTGGTCGc > 2:981234/1‑148 (MQ=255) cTGTCTGCGCCGTG‑CTGCCACGGCGCAGTGGCTTCGCCTGCCCGTCACACCCACGACTAGAAGGATAACAATCATGtt < 2:70917/78‑1 (MQ=255) cTGTCTGCGCCGTG‑CTGCCACGGCGCAGTGGCTTCGCCTGCCCGTCACACCCACGACTAGAAGGATAACAATCATGtt > 1:70917/1‑78 (MQ=255) | CTGCCGGCCGACAGCCCGGTGGTCGTGATCGAGCGCCTGGCCCGCGATTACGCCGGCAAACCTCTGGAATGGCGCCGCTCGCGCGGCCATGCGCAGCACTTCCGCTACCGCATCGACATTCGTTAAACCGGTCGCTTCACCCTTCACCTGTCTGCGCCGTG‑CTGCCACGGCGCAGTGGCTTCGCCTGCCCGTCACACCCACGACTAGAAGGATAACAATCATGTTCAGCTGGTATCGCGAGATCACCTCACGGGAACGCAAGACATTCTGGGCCTGTTTCGGCGGCTGGTCGCTC > NC_002947/1892407‑1892701 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |