New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_002947 | 2562731 = | 74 (0.880) | coding (426/1137 nt) | dauA | FAD‑dependent catabolic D‑arginine dehydrogenase |
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
GAGCCGCGAGGCTGTCTGTATGTGGCCAGCCTGGAGCAGCGGGAACTGCTTGAGCAAACTTTCGCGCAGAACCTGGCCAATGGCACAGAAGTCACCCTGCTGGACCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCCTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTTGAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAGGCTTCTTGCGTGGTTATCGCACTGCCGGCGGTGAACTGCGCTGCAACGCCGAGCTGATCCAGGCCTGCTACCTGGACGACGTGTGGCA > NC_002947/2562555‑2562853 | ggcggctgccatcagccaactccacctgccacacgtcgtccaggtagcaggcctggatcagctcggcgttgcagcgcagttcaccggcggcagtgcgataaccacgcaagaagccttggtgcaaggcatgtacgtcaaggtccatcgcac > 1:348598‑M1/150‑150 (MQ=255) ggcggctgccatcagccaactccacctgccacacgtcgtccaggtagcaggcctggatcagctcggcgttgcagcgcagttcaccgccggcagtgcgataaccacgcaagaagccttggtgcaaggcatgtacgtcaaggtccatcgcac < 2:1921097‑M1/1‑1 (MQ=255) gAGCCGCGAGGCTGTCTGTATGTGGCCAGCCTGGAGCAGCGGGAACTGCTTGAGCAAACTTTCGCGCAGAACCTGGCCAATGGCACAGAAGTCACCCTGCTGGACCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCCTGCGTGGCGAAAcc > 1:1028425/1‑150 (MQ=255) cggctgccatcagccaactccacctgccacacgtcgtccaggtagcaggcctggatcagctcggcgttgcagcgcagttcaccgccggcagtgcgataaccacgcaagaagccttggtgcaaggcatgtacgtcaaggtccatcgcaCCt > 1:1921097‑M1/148‑150 (MQ=255) ccGCGAGGCTGTCTGTATGTGGCCAGCCTGGAGCAGCGGGAACTGCTTGAGCAAACTTTCGCGCAGAACCTGGCCAATGGCACAGAAGTCACCCTGCTGGACCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCCTGCGTGGCGAAACCCTg < 2:2158869/150‑1 (MQ=255) ggcgccatcggccaactctctctgccacacgtcgtccaggtagcaggcccggatcagctcggcgttgcagcgcagttcactggcggcagtgctataaccacgcaagaagcctttgtgcaaggcatgtacgtcaaggtccatcgcaCCTgg > 2:257730‑M1/146‑150 (MQ=255) gcgAGGCTGTCTGTATGTGGCCAGCCTGGAGCAGCGGGAACTGCTTGAGCAAACTTTCGCGCAGAACCTGGCCAATGGCACAGAAGTCACCCTGCTGGACCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCCTGCGTGGCGAAACCCTGGc > 1:1802880/1‑150 (MQ=255) ctgccatcagccaactcctactgccacacgtcgtccaggtagcaggcctggatcagctcggcgttgcagcgcagttcaccgccggcagtgcgataaccacgcaagaagccttggtgcaaggcatgtacgtcaaggtccatcgcaCCTGGc > 2:1246084‑M1/145‑150 (MQ=255) ctgccatcagccaactccacctgccacacgtcgtccaggtagcaggcctggatcagctcggcgttgcagcgcagttcaccgccggcagtgcgataaccacgcaagaagccttggtgcaaggcatgtacgtcaaggtccatcgcaCCTGGc < 1:219233‑M1/6‑1 (MQ=255) ccatcagccaactccacctgccacacgtcgtccaggtagcaggcctggataagctcggcgttgcagcgcaggttaccgccggcagtgcgataaccacgcaagacgccttggtgcaaggcatgtacgtcaaggtcccccgcaCCaggcgcg < 1:611951‑M1/9‑4 (MQ=255) gtctgtATGTGGCCAGCCTGGAGCAGCGGGAACTGCTTGAGCAAACTTTCGCGCAGAACCTGGCCAATGGCACAGAAGTCACCCTGCTTGACCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCTTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCgg < 1:209045/150‑1 (MQ=255) ctgtATGTGGCCAGCCTGGAGCAGCGGGAACTGCTTGAGCAAACTTTCGCGCAGAACCTGGCCAATGGCACAGAAGTCACCCTGCTGGACCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCCTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTg > 1:1525121/1‑150 (MQ=255) tATGTGGCCAGCCTGGAGCAGCGGGAACTGCTTGAGCAAACTTTCGCGCAGAACCTGGCCAATGGCACAGAAGTCACCCTGCTGGACCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCCTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCtt > 1:423120/1‑150 (MQ=255) gtgGCCAGCCTGGAGCAGCGGGAACTGCTTGAGCAAACTTTCGCGCAGAACCTGGCCAATGGCACAGAAGTCACCCTGCTGGACCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCCTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTTGAg < 1:1058819/150‑1 (MQ=255) ggCCAGCCTGGAGCAGCGGGAACTGCTTGAGCAAACTTTCGCGCAGAACCTGGCCAATGGCACAGAAGTCACCCTGCTGGACCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCCTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTTGAGcc > 2:1244736/1‑150 (MQ=255) ggCCAGCCTGGAGCAGCGGGAACTGCTTGAGCAAACTTTCGCGCAGAACCTGGCCAATGGCACAGAAGTCACCCTGCTGGACCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCCCCGCTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTTGAGcc < 1:1133726/150‑1 (MQ=255) gCCAGCCTGGAGCAGCGGGAACTGCTTGAGCAAACTTTCGCGCAGAACCTGGCCAATGGCACAGAAGTCACCCTGCTGGACCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCCTGCGTGGCGAAACCCTgg < 1:1583951/130‑1 (MQ=255) gCCAGCCTGGAGCAGCGGGAACTGCTTGAGCAAACTTTCGCGCAGAACCTGGCCAATGGCACAGAAGTCACCCTGCTGGACCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCCTGCGTGGCGAAACCCTgg > 2:1583951/1‑130 (MQ=255) gCCAGCCTGGAGCAGCGGGAACTGCTTGAGCAAACTTTCGCGCAGAACCTGGCCAATGGCACAGAAGTCACCCTGCTGGACCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCCTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTTGa > 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cAATGGCACAGAAGTCACCCTGCTGGACCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCCTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTTGAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAGGCTTCTTGCGTGGTTa > 2:1899080/1‑150 (MQ=255) aaTGGCACAGAAGTCACCCTGCTGGACCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCCTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTTGAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAGGCTTCTTGCGTGGTTAt > 2:1214421/1‑150 (MQ=255) acaGAAGTCACGCTGCTGGACCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCCTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTTGAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAGGCTTCTTGCGTGGTTATCGCACt > 2:219233/1‑150 (MQ=255) acaGAAGTCACCCTGCTGGACCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCCTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTTGAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAGGCTTCTTGCGTGGTTATCGCACt < 2:302783/150‑1 (MQ=255) acaGAAGTCACCCTGCTGGACCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCCTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTTGAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAGGCTTCTTGCGTGGTTATCGCACt < 1:1214421/150‑1 (MQ=255) 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ccAGCCTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTTGAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAGGCTTCTTGCGTGGTTATCGCACTGCCGGCGGTGAACTGCGCTGCAACGCCGAGCTGATCCAGGCCTGCt > 1:696825/1‑150 (MQ=255) cAGCCTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTTGAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAGGCTTCTTGCGTGGTTATCGCACTGCCGGCGGTGAACTGCGCTGCAACGCCGAGCTGATCCAGGCCTGCTa > 1:997887/1‑150 (MQ=255) aGCCTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTTGAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAGGCTTCTTGCGTGGTTATCGCACTGCCGGCGGTGAACTGCGCTGCAACGCCGAGCTGATCCAGGCCTGCTAc < 2:3766/150‑1 (MQ=255) aGCCTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTTGAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAGGCTTCTTGCGTGGTTATCGCACTGCCGGCGGTGAACTGCGCTGCAACGCCGAGCTGATCCAGGCCTGCTAc > 2:1563105/1‑150 (MQ=255) ccTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTTGAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAGGCTTCTTGCGTGGTTATCGCACTGCCGGCGGTGAACTGCGCTGCAACGCCGAGCTGATCCAGGCCTGCTACCt < 2:925452/150‑1 (MQ=255) cTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTTGAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTCCATGCCTTGCACCAAGGCTTCTTGCGTGGTTATAGCACTGCCCGCGGTGAACAGCGCGGCGACGCCGAGCTGATCCGGGCCTGCTACCTg > 2:611951/1‑150 (MQ=255) gCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTTGAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAGGCTTCTTGCGTGGTTATCGCACTGCCGGCGGTGAACTGCGCTGCAACGCCGAGCTGATCCAGGCCTGCTACCTGga < 1:438725/150‑1 (MQ=255) gCGTGGCCAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTTGAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTCCACCAAGGCTTCTTGCGTGGTTATCGCACTGCCGGCGGTGAACTGCGCTGCAACGCCGAGCTGATCCAGGCCTGCTACCTgta < 1:335478/150‑3 (MQ=255) ggCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTTGAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAGGCTTCTTGCGTGGTTATCGCACTGCCGGCGGTGAACTGCGCTGCAACGCCGAGCTGATCCAGGCCTGCTACCTGgacgac < 2:696825/150‑1 (MQ=255) gAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTTGAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAGGCTTCTTGCGTGGTTATCGCACTGCCGGCGGTGAACTGCGCTGCAACGCCGAGCTGATTCAGGCCTGCTACCTGGACGACgtg > 2:2054056/1‑150 (MQ=255) gAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTTGAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAGGCTTCTTGCGTGGTTATCGCACTGCCGGCGGTGAACTGCGCTGCAACGCCGAGCTGATCCAGGCCTGCTACCTGGACGACgtg > 2:2027522/1‑150 (MQ=255) aaaCCCTGGCCGGCGCGGTGCTTGAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAGGCTTCTTGCGTGGTTATCGCAGGGCCGGCGGTGAGCTGCGCTGCAACGGCGAGCTGATCCAGGCCTGCTACCTGGACGACgtgt < 2:2194346/150‑1 (MQ=255) aaaCCCTGGCCGGCGCGGTGCTTGAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAGGCTTCTTGCGTGGTTATCGCACTGCCGGCGGTGAACTGCGCTGCAACGCCGAGCTGATCCAGGCCTGCTACCTGGACGACgtgt < 1:193872/150‑1 (MQ=255) aCCCTGGCCGGCGCGGTGCTTGAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAGGCTTCTTGCGTGGTTATCGCACTGCCGGCGGTGAACTGCGCTGCAACGCCGAGCTGATCCAGGc > 2:1106531/1‑128 (MQ=255) aCCCTGGCCGGCGCGGTGCTTGAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAGGCTTCTTGCGTGGTTATCGCACTGCCGGCGGTGAACTGCGCTGCAACGCCGAGCTGATCCAGGc < 1:1106531/128‑1 (MQ=255) aCCCTGGCCGGCGCGGTGCTTGAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAGGCTTCTTGCGTGGTTATCGCACTGCCGGCGGTGAACTGCGCTGCAACGCCGAGCTGATCCAGGCCTGCTACCTGGACGACGTGTgg > 2:1523924/1‑150 (MQ=255) cccTGGCCGGCGCGGTGCTTGAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAGGCTTCTTGCGTGGTTATCGCACTGCCGGCGGTGAACTGCGCTGCAACGCCGAGCTGATCCAGGCCTGCTACCTGGACGACGTGTGGc > 2:326282/1‑150 (MQ=255) CCTGGCCGGCGCGGTGCTTGAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAGGCTTCTTGCGTGGTTATCGCACTGCCGGCGGTGAACTGCGCTGCAACGCCGAGCTGATCCAGGCCTGCTACCTGGACGACGTGTGGCa < 2:835936‑M1/150‑1 (MQ=255) | GAGCCGCGAGGCTGTCTGTATGTGGCCAGCCTGGAGCAGCGGGAACTGCTTGAGCAAACTTTCGCGCAGAACCTGGCCAATGGCACAGAAGTCACCCTGCTGGACCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCCTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTTGAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAGGCTTCTTGCGTGGTTATCGCACTGCCGGCGGTGAACTGCGCTGCAACGCCGAGCTGATCCAGGCCTGCTACCTGGACGACGTGTGGCA > NC_002947/2562555‑2562853 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |