| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | 2562704 = | 81 (0.920) | 4 (0.050) | 4/236 | NT | 5.0% | coding (399/1137 nt) | dauA | FAD‑dependent catabolic D‑arginine dehydrogenase |
| ? | NC_002947 | 2562731 = | 74 (0.880) | coding (426/1137 nt) | dauA | FAD‑dependent catabolic D‑arginine dehydrogenase | |||||
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
AGCCTGGAGCAGCGGGAACTGCTTGAGCAAACTTTCGCGCAGAACCTGGCCAATGGCACAGAAGTCACCCTGCTGGACCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCCTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTTGAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAGGCTTCT‑TGCGTGGTTATCGCACTGCCGGCGGTGAACTGCGCTGCAACGCCGAGCTGATCCAGGCCTGCTACCTGGACGACGTGTGGCAGGTGGAGTTGGCTGATGGCAGCCGCC > NC_002947/2562582‑2562879 | aGCCTGGAGCAGCGGGAACTGCTTGAGCAAACTTTCGCGCAGAACCTGGCCAATGGCACAGAAGTCACCCTGCTGGACCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCCTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTTGAGCCAGGt < 2:789968/150‑1 (MQ=255) gcagcGGGAACTGCTTGAGCAAACTTTCGCGCAGAACCTGGCCAATGGCACAGAAGTCACCCTGCTGGACCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCCTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTTGAGCCAGGTGCGAt > 2:1372692/1‑147 (MQ=255) gcagcGGGAACTGCTTGAGCAAACTTTCGCGCAGAACCTGGCCAATGGCACAGAAGTCACCCTGCTGGACCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCCTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTTGAGCCAGGTGCGAt < 1:1372692/147‑1 (MQ=255) cGGGAACTGCTTGAGCAAACTTTCGCGCAGAACCTGGCCAATGGCACAGAAGTCACCCTGCTGGACCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCCTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTTGAGCCAGGTGCGATGGACCtt < 2:2126129/150‑1 (MQ=255) cGGGAACTGCTTGAGCAAACTTTCGCGCAGAACCTGGCCAATGGCACAGAAGTCACCCTGCTGGACCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCCTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTTGAGCCAGGTGCGATGGACCtt > 1:903018/1‑150 (MQ=255) gAACTGCTTGAGCAAACTTTCGCGCAGAACCTGGCCAATGGCACAGAAGTCACCCTGCTGGACCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCCTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTTGAGCCAGGTGCGATGGACCTTGAc < 1:94732/150‑1 (MQ=255) gAACTACTTGAGCAAACTTTCGCGCAGAACCTGGCCAATGGCACAGAAGTCACCCTGCTGGACCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCCTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTTGAGCCAGGTGCGATGGACCTTGAc > 1:2194346/1‑150 (MQ=255) cTGCTTGAGCAAACTTTCGCGCAGAACCTGGCCAATGGCACAGAAGTCACCCTGCTGGACCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCCTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTTGAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTa < 1:90166/150‑1 (MQ=255) gCAAACTTTCGCGCAGAACCTGGCCAATGGCACAGAAGTCACCCTGCTGGACCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCCTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTTGAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCtt < 2:1000710/150‑1 (MQ=255) tttCGCGCAGAACCTGGCCAATGGCACAGAAGTCACCCTGCTGGACCGGGACGCGGCCTTGCCACTGATACCCAGCCTGCGTGGCGAAACCCGCGCCGGCGCGGTGCTTGAGCCATGCGGGATGGGCCTTGACGTACATGCCTTGCACCa > 2:115249/1‑150 (MQ=255) tCGCGCAGAACCTGGCCAATGGCACAGAAGTCACCCTGCTGGACCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCCTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTTGAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAg < 1:409741/150‑1 (MQ=255) gcAGAACCTGGCCAATGGCACAGAAGTCACCCTGCTGGACCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCCTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTTGAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAg > 2:73528/1‑146 (MQ=255) gcAGAACCTGGCCAATGGCACAGAAGTCACCCTGCTGGACCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCCTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTTGAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAg < 1:73528/146‑1 (MQ=255) 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GCCGGCGCGGTGCTTGAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAGGCTTCT‑TGCGTGGTTATCGCACTGCCGGCGGTGAACTGCGCTGCAACGCCGAGCTGATCCAGGCCTGCTACCTGGACGACGTGTGGCAGGTg > 1:1523924‑M1/1‑150 (MQ=255) GCCGGCGCGGTGCTTGAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAGGCTTCT‑TGCGTGGTTATCGCACTGCCGGCGGTGAACTGCGCTGCAACGCCGAGCTGATCCAGGCCTGCTACCTGGACGACGTGTGGCAGGTg > 2:1825429‑M1/1‑150 (MQ=255) gcgGTGCTTGAGCCAGGTGCGATGGACCTTGAAGTAGTGGCCTTGCACCAAGGCTTCT‑TGCGTGGTTATCGCACTGCCGGCGGTGAACTGCGCTGCAACGCCGAGCTGATCCAGGCCTGCTACCTGGACGACGTGTGGCAGGTGGAGTTg < 2:186633/150‑1 (MQ=255) cgGTGCTTGAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAGGCTTCT‑TGCGTGGTTATCGCACTGCCGGCGGTGAACTGCGCTGCAACGCCGAGCTGATCCAGGCCTGCTACCTGGACGACGTGTGGCAGGTGGAGTTgg < 2:1525121/150‑1 (MQ=255) gTGCTTGAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAGGCTTCT‑TGCGTg < 2:119837/61‑1 (MQ=255) gTGCTTGAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAGGCTTCT‑TGCGTg > 1:119837/1‑61 (MQ=255) cTTGAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAGGCTTCT‑TGCGTGGTTATCGCACTGCCGGCGGTGAACTGCGCTGCAACGCCGAGCTGATCCAGGc < 1:1177701/110‑1 (MQ=255) cTTGAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAGGCTTCT‑TGCGTGGTTATCGCACTGCCGGCGGTGAACTGCGCTGCAACGCCGAGCTGATCCAGGc > 2:1177701/1‑110 (MQ=255) cTTGAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAGGCTTCT‑TGCGTGGTTATCGCACTGCCGGCGGTGAACTGCGCTGCAACGCCGAGCTGATCCAGGCCTGCTACCTGGACGACGTGTGGCAGGTGGAGTTGGCTGAt < 2:2287791/150‑1 (MQ=255) ttGAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAGGCTTCT‑TGCGTGGTTATCGCACTGCCGGCGGTGAACTGCGCTGCAACGCCGAGCTGATCCAGGCCTGCTACCTGGACGACGTGTGGCAGGTGGAGTTGGCTGATg < 2:874612/150‑1 (MQ=255) ttGAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAGGCTTCT‑TGCGTGGTTATCGCACTGCCGGCGGTGAACTGCGCTGCAACGCCGAGCTGATCCAGGCCTGCTACCTGGACGACGTGTGGCAGGTGGAGTTGGCTGATg < 1:1563105/150‑1 (MQ=255) cgcgcctggTGCGGGGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAGGCGTCT‑TGCGTGGTTATCGCACTGCCGGCGGTAACCTGCGCTGCAACGCCGAGCTTATCCAGGCCTGCTACCTGGACGACGTGTGGCAGGTGGAGTTGGCTGATgg < 1:611951‑M2/141‑1 (MQ=255) aGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAGGCTTCT‑TGCGTGGTTATCGCACTGCCGGCGGTGAACTGCGCTGCAACGCCGAGCTGATCCAGGCCTGCTACCTGGACGACGTGTGGCAGGTGGAGTTGGCTGATGGCa < 1:661205/150‑1 (MQ=255) aGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAGGCTTCT‑TGCGTGGTTATCGCACTGCCGGCGGTGAACTGCGCTGCAACGCCGAGCTGATCCAGGCCTGCTACCTGGACGACGTGTGGCAGGTGGAGTTGGCTGATGGCa > 2:1410895/1‑150 (MQ=255) gccaggTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAGGCTTCT‑TGCGTGGTTATCGCACTGCCGGCGGTGAACTGCGCTGCAACGCCGAGCTGATCCAGGCCTGCTACCTGGACGACGTGTGGCAGTAGGAGTTGGCTGATGGCAg > 2:1246084‑M2/7‑150 (MQ=255) gccaggTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAGGCTTCT‑TGCGTGGTTATCGCACTGCCGGCGGTGAACTGCGCTGCAACGCCGAGCTGATCCAGGCCTGCTACCTGGACGACGTGTGGCAGGTGGAGTTGGCTGATGGCAg < 1:219233‑M2/144‑1 (MQ=255) ccaggTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACAAAGGCTTCT‑TGCGTGGTTATAGCACTGCCGCCAGTGAACTGCGCTGCAACGCCGAGCTGATCCGGGCCTGCTACCTGGACGACGTGTGGCAGAGAGAGTTGGCCGAtggcgcc > 2:257730‑M2/6‑147 (MQ=255) ccAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTT‑CCCGGACGCTTCTCTGCAGGCAGGTCGCGCTGCCGGCGGTCGGGGGCGCTGCAACGCCGAGCTGATCCAGGCCTGCTACCTGGCCGTCGTGTTGCAGGTGGAGTTGGCTGATGGCAgc > 1:406004/1‑150 (MQ=255) aggTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAGGCTTCT‑TGCGTGGTTATCGCACTGCCGGCGGTGAACTGCGCTGCAACGCCGAGCTGATCCAGGCCTGCTACCTGGACGACGTGTGGCAGGTGGAGTTGGCTGATGGCAgccg > 1:1921097‑M2/4‑150 (MQ=255) gTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAGGCTTCT‑TGCGTGGTTATCGCACTGCCGGCGGTGAACTGCGCTGCAACGCCGAGCTGATCCAGGCCTGCTACCTGGACGACGTGTGGCAGGTGGAGTTGGCTGATGGCAgccgcc < 2:1921097‑M2/149‑1 (MQ=255) gTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAGGCTTCT‑TGCGTGGTTATCGCACTGCCGCCGGTGAACTGCGCTGCAACGCCGAGCTGATCCAGGCCTGCTACCTGGACGACGTGTGGCAGGTGGAGTTGGCTGATGGCAgccgcc > 1:348598‑M2/2‑150 (MQ=255) | AGCCTGGAGCAGCGGGAACTGCTTGAGCAAACTTTCGCGCAGAACCTGGCCAATGGCACAGAAGTCACCCTGCTGGACCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCCTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTTGAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAGGCTTCT‑TGCGTGGTTATCGCACTGCCGGCGGTGAACTGCGCTGCAACGCCGAGCTGATCCAGGCCTGCTACCTGGACGACGTGTGGCAGGTGGAGTTGGCTGATGGCAGCCGCC > NC_002947/2562582‑2562879 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |