| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | = 3045915 | 104 (1.180) | 8 (0.090) | 6/244 | NT | 7.8% | coding (449/894 nt) | pstA | phosphate ABC transporter permease |
| ? | NC_002947 | = 3045948 | 88 (1.010) | coding (482/894 nt) | pstA | phosphate ABC transporter permease | |||||
Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
CCTGGCAGCGGTGTTCCTGGCCGAACTCGGCCCCGACAGCAAACTGGCCAACGCTGCGCGCTTTGCCGCCAAGATGCTCACTGGCCTGCCATCGATCCTGGCCGGGGTGTTTGCCTACGCCTTGGTGGTGATGACCACCGGTACCTACTCGGCACCGGCAGGCGGCGTGGCGCTGGCGGTGCTGATGCTGCCGATCGTGGTGCTGACCGCCGAAGAGTCGATGAAGATGGTGCCCAAGATCATGAAGGACGCCGCCTACGGCATGGGTTGCACCCGTGCCCAGGTGATCTGGAAGATCG > NC_002947/3045766‑3046064 | cTGGCAGCGGTGTTCCTGGCCGAACTCGGCCCCGACAGCAAACTGGCCAACGCTGCGCGCTTTGCCGCCAAGATGCTCACTGGCCTGCCATCGATCCTGGCCGGGGTGTTTGCCTACGTTTTGGTTGTGATGACCACCGATACCTACACg < 2:272462/150‑1 (MQ=255) tGGCAGCGGTGTTCCTGGCCGAACTCGGCCCCGACAGCAAACTGGCCAACGCTGCGCGCTTTGCCGCCAAGATGCTCACTGGCCTGCCATCGATCCTGGCCGGGGTGTTTGCCTACGCCTTGGTGGTGATGACCACCGGTACCTACTCgg > 1:914458/1‑150 (MQ=255) tGGCAGCGGTGTTCCTGGCCGAACTCGGCCCCGACAGCAAACTGGCCAACGCTGCGCGCTTTGCCGCCAAGATGCTCACTGGCCTGCCATCGATCCTGGCCGGGGTGTTTGCCTACGCCTTGGTGGTGATGACCACCGGTACCTACTCgg > 1:556354/1‑150 (MQ=255) ggCAGCGGTGTTCCTGGCCGAACTCGGCCCCGACAGCAAACTGGCCAACGCTGCGCGCTTTGCCGCCAAGATGCTCACTGGCCTGCCATCGATCCTGGCCGGGGTGTTTGCCTACGCCTTGGTGGTGATGACCACCGGTACCTACTCGGc > 2:1637074/1‑150 (MQ=255) aGCGGTGTTCCTGGCCGAACTCGGCCCCGACAGCAAACTGGCCAACGCTGCGCGCTTTGCCGCCAAGATGCTCACTGGCCTGCCATCGATCCTGGCCGGGGTGTTTGCCTACGCCTTGGTGGTGATGACCACCGGTACCTACTCGGCAcc > 1:1537073/1‑150 (MQ=255) tgnTCCTGGCCGAACTCGGCCCCGACANCAAACTGGCCAANGCTGCGNGNTTTGCCGCCAAGATGCTCACTGGCCTGCCATCGATCCTGGCCGGGGTGTTTGCCTACGCCTTGGTGGTGATGACCACCGGTACCCACTCagcaccgccag > 1:1740732‑M1/1‑139 (MQ=255) ggCCGAACTCGGCCCCGACAGCAAACTGGCCAACGCTGCGCGCTTTGCCGCCAAGATGCTCACTGGCCTGCCATCGATCCTGGCCGGGGTGTTTGCCTACGCCTTGGTGGTGATGACCACCGGTACCTACTCGGCACCGGCAGGCGGCGt > 1:5981/1‑150 (MQ=255) cTCGGCCCCGACAGCAAACTGGCCAACGCTGCGCGCTTTGCCGCCAAGATGCTCACTGGCCTGCCATCGATCCTGGCCGGGGTGTTTGCCTACGCCTTGGTGGTGATGACCACCGGTACCTACTCGGCACCGGCAGGCGGCGGGGCGCTg > 1:1503986/1‑150 (MQ=255) tCGGCCCCGACAGCAAACTGGCCAACGCTGCGCGCTTTGCCGCCAAGATGCTCACTGGCCTGCCATCGATCCTGGCCGGGGTGTTTGCCTACGCCTTGGTGGTGATGACCACCGGTACCTACTCGGCGCGCGCGGGCGGCGTGGCGCTgg > 2:540273/1‑150 (MQ=255) tCGGCCCCGACAGCAAACTGGCCAACGCTGCGCGCTTTGCCGCCAAGATGCTCACTGGCCTGCCATCGATCCTGGCCGGGGTGTTTGCCTACGCCTTGGTGGTGATGACCACCGGTACCTACTCGGCACCGGCAGGCGGCGTGGCGCTgg > 1:1830158/1‑150 (MQ=255) tCGGCCCCGACAGCAAACTGGCCAACGCTGCGCGCTTTGCCGCCAAGATGCTCACTGGCCTGCCATCGATCCTGGCCGGGGTGTTTGCCTACGCCTTGGTGGTGATGACCACCGGTACCTACTCGGCACCGGCAGGCGGCGTGGCGCTgg > 1:464130/1‑150 (MQ=255) cGGCCCCGACAGCAAACTGGCCAACGCTGCGCGCTTTGCCGCCAAGATGCTCACTGGCCTGCCATCGATCCTGGCCGGGGTGTTTGCCTACGCCTTGGTGGTGATGACCACCCGTACCTACTCGGCACCGGCAGGCGGCGTGGCGCTGGc < 1:1892226/150‑1 (MQ=255) ggCCCCGACAGCAAACTGGCCAACGCTGCGCGCTTTGCCGCCAAGATGCTCACTGGCCTGCCATCGATCCTGGCCGGGGTGTTTGCCTACGCCTTGGTGGTGATGACCACCGGTACCTACTCagcaccgccagcgccacgccgcctgccg < 2:200463‑M1/150‑29 (MQ=255) ggCCCCGACAGCAAACTGGCCAACGCTGCGCGCTTTGCCGCCAAGATGCTCACTGGCCTGCCATCGATCCTGGCCGGGGTGTTTGCCTACGCCTTGGTGGTGATGACCACCGGTACCTACTCGGCACCGGCAGGCGGCGTGGCGCTg > 2:1418282/1‑147 (MQ=255) ggCCCCGACAGCAAACTGGCCAACGCTGCGCGCTTTGCCGCCAAGATGCTCACTGGCCTGCCATCGATCCTGGCCGGGGTGTTTGCCTACGCCTTGGTGGTGATGACCACCGGTACCTACTCGGCACCGGCAGGCGGCGTGGCGCTg < 1:1418282/147‑1 (MQ=255) gCCCCGACAGCAAACTGGCCAACGCTGCGCGCTTTGCCGCCAAGATGCTCACTGGCCTGCCATCGATCCTGGCCGGGGTGTTTGCCTACGCCTTGGTGGTGATGACCACCGGTACCCACTCagcaccgccagcgccacgccgcctgccgn < 2:1740732‑M1/150‑30 (MQ=255) ccccGACAGCAAACTGGCCAACGCTGCGCGCTTTGCCGCCAAGATGCTCACTGGCCTGCCATCGATCCTGGCCGGGGTGTTTGCCTACGCCTTGGTGGTGATGACCACCGGTACCTACTCGGCACCGGCAGGCGGCGTGGCGCTGGCGGt < 2:34909/150‑1 (MQ=255) cccGACAGCAAACTGGCCAACGCTGCGCGCTTTGCCGCCAAGATGCTCACTGGCCTGCCATCGATCCTGGCCGGGGTGTTTGCCTACGCCTTGGTGGTGATGACCACCGGTACCTACTCGGCACCGGCAGGCGGCGTGGCGCTGGCGGTg > 2:1200174/1‑150 (MQ=255) 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tggtgATGACCACCGGTACCTACTCGGCACCAGCAGGCGGCGTGGCGCTGGCGGTGCTGATGCTGCCGATCGTGGTGCTGACCGCCGAAGAGTCGATGAAGATGGTGCCCAAGATCATGAAGGACGCCGCCTACGGCATTGGTTGCAccc > 2:296227/1‑150 (MQ=255) tgatgaCCACCGGTACCTACTCGGCACCGGCAGGCGGCGTGGCGCTGGCGGTGCTGATGCTGCCGATCGTGGTGCTGACCGCCGAAGAGTCGATGAAGATGGTGCCCAAGATCATGAAGGACGCCGCCTACGGCATGGGTTGCACCCGt > 1:1166747/1‑149 (MQ=255) tgatgaCCACCGGTACCTACTCGGCACCGGCAGGCGGCGTGGCGCTGGCGGTGCTGATGCTGCCGATCGTGGTGCTGACCGCCGAAGAGTCGATGAAGATGGTGCCCAAGATCATGAAGGACGCCGCCTACGGCATGGGTTGCACCCGt < 2:1166747/149‑1 (MQ=255) gatgaCCACCGGTACCTACTCGGCACCGGCAGGCGGCGTGGCGCTGGCGGTGCTGAtgctgc > 1:1106995/1‑62 (MQ=255) gatgaCCACCGGTACCTACTCGGCACCGGCAGGCGGCGTGGCGCTGGCGGTGCTGAtgctgc < 2:1106995/62‑1 (MQ=255) cccaccGGTACCTACTCGGCACCGGCAGGCGGCGTGGCGCTGGCGGTGCTGATGCTGCCGATCGTGGTGCTGACCGCCGAAGAGTCGATGAAGATGGTGCCCAAGATCATGAAGGACGCCGCCTACGGCATGGGTTGCACCCGTGCCCAg < 1:930210/149‑1 (MQ=255) accaccGGTACCTACTCGGCACCGGCAGGCGGCGTGGCGCTGGCGGTGCTGATGCTGCCGATCGTGGTGCTGACCGCCGAAGAGTCGATGAAGATGGTGCCCAAGATCATGAAGGACGCCGCCTACGGCATGGGTTGCACCCGTGCCCAg < 1:1648200/150‑1 (MQ=255) caccGGTACCTACTCGGCACCGGCAGGCGGCGTGGCGCTGGCGGTGCTGATGCTGCCGATCGTGGTGCTGACCGCCGAAGAGTCGATGAAGATGGTGCCCAAGATCATGAAGGACGCCGCCTACGGCATGGGTTGCACCCGCGCCCAGGt > 1:170146/1‑150 (MQ=255) accGGTACCTACTCGGCACCGGCAGGCGGCGTGGCGCTGGCGGTGCTGATGCTGCCGATCGTGGTGCTGACCGCCGAAGAGTCGATGAAGATGGTGCCCAAGATCATGAAGGACGCCGCCTACgg < 2:2325989/125‑1 (MQ=255) accGGTACCTACTCGGCACCGGCAGGCGGCGTGGCGCTGGCGGTGCTGATGCTGCCGATCGTGGTGCTGACCGCCGAAGAGTCGATGAAGATGGTGCCCAAGATCATGAAGGACGCCGCCTACgg > 1:2325989/1‑125 (MQ=255) accGGTACCTACTCGGCACCGGCAGGCGGCGTGGCGCTGGCGGTGCTGATGCTGCCGATCGCGGTGCTGACCGCCGAAGAGTCGATGAAGATGGTGCCCAAGATCATGAAg < 1:1055374/111‑1 (MQ=255) ccGGTACCTACTCGGCACCGGCAGGCGGCGTGGCGCTGGCGGTGCTGATGCTGCCGATCGTGGTGCTGACCGCCGAAGAGTCGATGAAGATGGTGCCCAAGATCACGAAGGACGCAGCCTAAGGCATGGGTTGCACACGTGCCCAGGTGa > 2:117796/1‑150 (MQ=255) aCCTACTCGGCACCGGCAGGCGGCGTGGCGCTGGCGGTGCTGATGCTGCCGATCGTGGTGCTGACCGCCGAAGAGTCGATGAAGATGGTGCCCAAGATCATGAAGGACGCCGCCTACGGCATGGGTTGCACCCGTGCCCAGGTGATCt > 1:2189145/1‑148 (MQ=255) aCCTACTCGGCACCGGCAGGCGGCGTGGCGCTGGCGGTGCTGATGCTGCCGATCGTGGTGCTGACCGCCGAAGAGTCGATGAAGATGGTGCCCAAGATCATGAAGGACGCCGCCTACGGCATGGGTTGCACCCGTGCCCAGGTGATCt < 2:2189145/148‑1 (MQ=255) ccTACTCGGCACCGGCAGGCGGCGTGGCGCTGGCGGTGCTGATGCTGCCGATCGTGGTGCTGACCGCCGAAGAGTCGATGAAGATGGTGCCCAAGa > 2:372625/1‑96 (MQ=255) tCagcaccgccagcgccacgccgcctgccggtgccgagtaggtaccggtggtcatcaccaccaaggcgtaggcaaacaccccggccaggatcgatggcaggccagtgagcatcttggcggcaaagcgcgcagcgttggccagtttgctgt > 2:1830158‑M1/1‑2 (MQ=255) tCagcaccgccagcgccacgccgcctgccggtgccgagtaggtaccggtggtcatcaccaccaaggcgtaggcaaacaccccggccaggatcgatggc < 2:460764‑M1/98‑97 (MQ=255) tCGGCACCGGCAGGCGGCGTGGCGCTGGCGGTGCTgagtaggtaccggtggtcatcaccaccaaggcgtaggcaaacaccc < 1:1743547‑M2/81‑47 (MQ=255) cagcaccgccagcgccacgccgcctgccggtgccgagtaggtaccggtggtcatcaccaccaaggcgtaggcaaacaccccggccaggatcgatgaacaactggtgagcatctttgcggcaaagcgcgcagcgttggccagtttgatgtc < 1:651562‑M1/150‑150 (MQ=255) | CCTGGCAGCGGTGTTCCTGGCCGAACTCGGCCCCGACAGCAAACTGGCCAACGCTGCGCGCTTTGCCGCCAAGATGCTCACTGGCCTGCCATCGATCCTGGCCGGGGTGTTTGCCTACGCCTTGGTGGTGATGACCACCGGTACCTACTCGGCACCGGCAGGCGGCGTGGCGCTGGCGGTGCTGATGCTGCCGATCGTGGTGCTGACCGCCGAAGAGTCGATGAAGATGGTGCCCAAGATCATGAAGGACGCCGCCTACGGCATGGGTTGCACCCGTGCCCAGGTGATCTGGAAGATCG > NC_002947/3045766‑3046064 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |