| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 3045915 | 104 (1.180) | 8 (0.090) | 6/244 | NT | 7.8% | coding (449/894 nt) | pstA | phosphate ABC transporter permease |
| ? | NC_002947 | = 3045948 | 88 (1.010) | coding (482/894 nt) | pstA | phosphate ABC transporter permease | |||||
Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
CGACAGCAAACTGGCCAACGCTGCGCGCTTTGCCGCCAAGATGCTCACTGGCCTGCCATCGATCCTGGCCGGGGTGTTTGCCTACGCCTTGGTGGTGATGACCACCGGTACCTACTCGGCACCGGCAGGCGGCGTGGCGCTGGCGGTGCTGATGCTGCCGATCGTGGTGCTGACCGCCGAAGAGTCGATGAAGATGGTGCCCAAGATCATGAAGGACGCCGCCTACGGCATGGGTTGCACCCGTGCCCAGGTGATCTGGAAGATCGTCCTGCCTACCGGCCTGCCGGCCATCCTCACC > NC_002947/3045799‑3046096 | cGACAGCAAACTGGCCAACGCTGCGCGCTTTGCCGCCAAGATGCTCACTGGCCTGCCATCGATCCTGGCCGGGGTGTTTGCCTACGCCTTGGTGGTGATGACCACCGGTACCTACTCGGCACCGGCAGGCGGCGTGGCGCTGGCGGTGCt > 2:488527/1‑150 (MQ=255) gACATCAAACTGGCCAACGCTGCGCGCTTTGCCGCAAAGATGCTCACCAGTTGTTCATCGATCCTGGCCGGGGTGTTTGCCTACGCCTTGGTGGTGATGACCACCGGTACCTACTCGGCACCGGCAGGCGGCGTGGCGCTGGCGGTGCTg < 1:651562‑M2/150‑2 (MQ=255) cAGCAAACTGGCCAACGCTGCGCGCTTTGCCGCCAAGATGCTCACTGGCCTGCCATCGATCCTGGCCGGGGTGTTTGCCTACGCCTTGGTGGTGATGCGCACCGGTACCTACTCGGCATCGGCAGGCGGCGTGGCGCTGGCGGTGCTGAt < 1:1812106/150‑1 (MQ=255) cAGCAAACTGGCCAACGCTGCGCGCTTTGCCGCCAAGATGCTCACTGGCCTGCCATCGATCCTGGCCGGGGTGTTTGCCTACGCCTTGGTGGTGATGACCACCGGTACCTACTCGGCACCGGCAGGCGGCGTGGCGCTGGCGGTGCTGAt < 1:307478/150‑1 (MQ=255) cAAACTGGCCAACGCTGCGCGCTTTGCCGCCAAGATGCTCACTGGCCTGCCATCGATCCTGGCCGGGGTGTTTGCCTACGCCTTGGTGGTGATGACCACCGGTACCTACTCGGCACCGGCAGGCGGCGTGGCGCTGGCGGTGCTGAtgct > 2:757366/1‑150 (MQ=255) aaCTGGCCAACGCTGCGCGCTTTGCCGCCAAGATGCTCACTGGCCTGCCATCGATCCTGGCCGGGGTGTTTGCCTACGCCTTGGTGGTGATGACCACCGGTACCTACTCGGCACCGGCAGGCGGCGTGGCGCTGGCGGTGCTGAtgctgc < 1:419305/150‑1 (MQ=255) aaCTGGCCAACGCTGCGCGCTTTGCCGCCAAGATGCTCACTGGCCTGCCATCGATCCTGGCCGGGGTGTTTGCCTACGCCTTGGTGGTGATGACCACCGGTACCTACTCGGCACCGGCAGGCGGCGTGGCGCTGGCGGTGCTGAtgctgc < 2:464130/150‑1 (MQ=255) tGGCCAACGCTGCGCGCTTTGCCGCCAAGATGCTCACTGGCCTGCCATCGATCCTGGCCGGGGTGTTTGCCTACGCCTTGGTGGTGATGACCACCGGTACCTACTCGGCACCGGCAGGCGGCGTGGCGCTGGCGGTGCTGATGCTGCCGa < 2:1168603/150‑1 (MQ=255) tGGCCAACGCTGCGCGCTTTGCCGCCAACATGCTCACTGGCCTGCCATCGATCCTGGCCGGGGTGTTTGCCTACGCCTTGGTGGTGATGACCACCGGTACCTACTCGGCACCGGCAGGCGGCGTGGCGCTGGCGGTGCTGATGCTGCCGa > 1:1592137/1‑150 (MQ=255) aaCGCTGCGCGCTTTGCCGCCAAGATGCTCACTGGCCTGCCATCGATCCTGGCCGGGGTGTTTGCCTACGCCTTGGTGGTGATGACCACCGGTACCTACTCGGCACCGGCAGGCGGCGTGGCGCTGGCGGTGCTGATGCTGCCGATCgtg > 1:572640/1‑150 (MQ=255) cgcgcTTTGCCGCCAAGATGCTCACTGGCCTGCCATCGATCCTGGCCGGGGTGTTTGCCTACGCCTTGGTGGTGATGACCACCGGTACCTACTCGGCACCGGCAGGCGGCGTGGCGCTGGCGGTGCTGATGCTGCCGATCGTGGTGCTGa < 1:1427552/150‑1 (MQ=255) cgcgcTTTGCCGCCAAGATGCTCACTGGCCTGCCATCGATCCTGGCCGGGGTGTTTGCCTACGCCTTGGTGGTGATGACCACCGGTACCTACTCGGCACCGGCAGGCGGCGTGGCGCTGGCGGTGCTGATGCTGCCGATCGTGGTGCTGa < 2:1544922/150‑1 (MQ=255) gcgcTTTGCCGCCAAGATGCTCACTGGCCTGCCATCGATCCTGGCCGGGGTGTTTGCCTACGCCTTGGTGGTGATGACCACCGGTACCTACTCGGCACCGGCAGGAGGAGTGGCGCTGGCGGTGCTGAGGCGGCTGGTCGTGGGGCTGAc > 2:1086627/1‑150 (MQ=255) gccgccAAGATGCTCACTGGCCTGCCATCGATCCTGGCCGGGGTGTTTGCCTACGCCTTGGTGGTGATGACCACCGGTACCTACTCGGCACCGGCAGGCGGCGTGGCGCTGGCGGTGCTGATGCTGCCGATCGTGGTGCTGACCGCCGaa < 2:507094/150‑1 (MQ=255) aaGATGCTCACTGGCCTGCCATCGATCCTGGCCGGGGTGTTTGCCTACGCCTTGGTGGTGATGACCACCGGTACCTACTCGGCACCGGCAGGCGGCGTGGCGCTGGCGGTGCTGATGCTGCCGATCGTGGTGCTGACCGCCGAAGAGTCg > 1:1610124/1‑150 (MQ=255) aaGATGCTCACTGGCCTGCCACCGATCCTGGCCGGGGTGTTTGCCTACGCCTTGGTGGTGATGACCACCGGTACCTACTCGGCACCGGCAGGCGGCGTGGCGCTGGCGGTGCTGATGCTGCCGATCGTGGTGCTGACCGCCGAAGAGTCg > 2:815321/1‑150 (MQ=255) gATGCTCACTGGCCTGCCACCGATCCTGGCCGGGGTGTTTGCCTACGCCTTGGTGGTGATGACCACCGGTACCTACTCGGCACCGGCAGGCGGCGTGGCGCTGGCGGTGCTGATGCTGCCGATCGTGGTGCTGACCGCCGAAGAGTCGAt < 1:815321/150‑1 (MQ=255) aTGCTCACTGGCCTGCCATCGATCCTGGCCGGGGTGTTTGCCTACGCCTTGGTGGTGATGACCACCGGTACCTACTCGGCACCGGCAGGCGGCGTGGCGCTGGCGGTGCTGATGCTGCCGATCGTGGTGCTGACCGCCGAAGAGTCGATg > 1:301195/1‑150 (MQ=255) 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tGGCCGGGGTGTTTGCCTACGCCTTGGTGGTGATGACCACCGGTACCTACTCGGCACCGGCAGGCGGCGTGGCGCTGGCGGTGCTGAt > 2:539403/1‑88 (MQ=255) tGGCCGGGGTGTTTGCCTACGCCTTGGTGGTGATGACCACCGGTACCTACTCGGCACCGGCAGGCGGCGTGGCGCTGGCGGTGCTGATGCTGCCGCTCGTGGTGCTGACCGCCGAAGAGTCGATGAAGATGGTGCCCAAGATCATGAAgg > 2:2177107/1‑150 (MQ=255) ggCCGGGGTGTTTGCCTACGCCTTGGTGGTGATGACCACCGGTACCTACTCGGCACCGGCAGGCGGCGTGGCGCTGGCGGTGCTGATGCTGCCGATCGTGGTGCTGACCGCCGAAGAGTCGATGAAGATGGTGCCCAAGATCATGa < 2:849038/146‑1 (MQ=255) ggCCGGGGTGTTTGCCTACGCCTTGGTGGTGATGACCACCGGTACCTACTCGGCACCGGCAGGCGGCGTGGCGCTGGCGGTGCTGATGCTGCCGATCGTGGTGCTGACCGCCGAAGAGTCGATGAAGATGGTGCCCAAGATCATGa > 1:849038/1‑146 (MQ=255) ggggTGTTTGCCTACGCCTTGGTGGTGATGACCACCGGTACCTACTCGGCACCGGCAGGCGGCGTGGCGCTGGCGGTGCTGATGCTGCCGATCGTGGTGCTGACCGCCGAAGAGTCGATGAAGATGGTGCCCAAGATCATGAAGGAcgcc < 1:1615352/150‑1 (MQ=255) gggTGTTTGCCTACGCCTTGGTGGTGATGACCACCGGTACCTACTCGGCACCGGCAGGCGGCGTGGCGCTGGCGGTGCTGAtgctgc > 2:1206930/1‑87 (MQ=255) 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2:539427/1‑150 (MQ=255) gCACCGGCAGGCGGCGTGGCGCTGGCGGTGCTGATGCTGCCGATCGTGGTGCTGACCGCCGAAGAGTCGATGAAGATGGTGCCCAAGATCATGAAGGACGCCGCCTACGGCATGGGTTGCACCCGTGCCCAGGTGATCTGGAAGATCGTc < 1:1086627/150‑1 (MQ=255) cACCGGCAGGCGGCGTGGCCCTGGCGGTGCTGATGCTGCCGATCGTGGTGCTGACCGCCGAAGAGTCGATGAAGATGGTGCCCAAGATCATGAAGGACGCCGCCTACGGCATGGGTTGCACCCGTGCCCAGGTGATCTGGAAGATCGTcc < 2:1537073/150‑1 (MQ=255) aCCGGCAGGCGGCGTGGCGCTGGCGGTGCTgagtaggtaccggtggtcatcaccaccaaggcgtaggcaaacaccccggccaggatcgatgg < 2:1688019‑M2/92‑63 (MQ=255) ncgGCAGGCGGCGTGGCGCTGGCGGTGCTgagtgggtaccggtggtcatcaccaccaaggcgtaggcaaacaccccggccaggatcgatggcaggccagtgagcatcttggcggcaaagcgcgcagcgttggccagtttgctgtcggggc < 2:1740732‑M2/149‑122 (MQ=255) cGGCAGGCGGCGTGGCGCTGGCGGTGCTgagtaggtaccggtggtcatcaccaccaaggcgtaggcaaacaccccggccaggatcgatggcaggccagtgagcatcttggcggcaaagcgcgcagcgttggccagtttgctgtcggggcc < 2:377970‑M2/150‑123 (MQ=255) cGGCAGGCGGCGTGGCGCTGGCGGTGCTgagtaggtaccggtggtcatcaccaccaaggcgtaggcaaacaccccggccaggatcgatggcaggccagtgagcatcttggcggcaaagcgcgcagcgttggccagtttgctgtcggggcc < 2:200463‑M2/150‑123 (MQ=255) cGGCAGGCGGCGTGGCGCTGGCGGTGCTGATGCTGCCGCTGCTGGTGCTGACCGCCGAAGAGTCGATGAAGATGGTGCCCAAGATCATGAAGGACGCCGCCTACGGCATGGGTTGCACCCGTGCCCAGGTGATCTGGAAGATCGTCCTGc < 1:613051/150‑1 (MQ=255) cGGCAGGCGGCGTGGCGCTGGCGGTGCTGATGCTGCCGATCGTGGTGCTGACCGCCGAAGAGTCGATGAAGATGGTGCCCAAGATCATGAAGGACGCCGCCTACGGCATGGGTTGCACCCGTGCCCAGGTGATCTGGAATATCGTCCTGc < 2:1503986/150‑1 (MQ=255) ggcgTGGCGCTGGCGGTGCTGCTGCTGCCGATCGTCGTGATGCCCGCCGAAGAGTCGATGAAGATGGTGCCCAAGATCATGAAGGACGCCGCCTACGGCATGGGTTGCACCCGTGCCCAGGTGATCTGGAAGATCGTCCTGCCTACCGGc < 2:1288956/150‑1 (MQ=255) gcgTGGCGCTGGCGGTGCTGATGCTGCCGATCGTGGTGCTGACCGCCGAAGAGTCGATGAAGATGGTGCCCAAGATCATGAAGGACGCCGCCTACGGCATGGGTTGCACCCGTGCCCAGGGGTTTTGGAAGATCGTCCTGCCTACCGGcc < 1:2177107/150‑1 (MQ=255) tGGCGCTGGCGGTGCTGATGCTGCCGATCGTGGTGCTGACCGCCGAAGAGTCGATGAAGATGGTGCCCAAGATCATGAAGGACGCCGCCTACGGCATGGGTTGCATTCGTGCCCAGGTGATCTGGAAGATCGTCCTGCCTACCGGCCTGc < 1:540273/150‑1 (MQ=255) cTGGCGGTGCTgagtgggtaccggtggtcatcaccaccaaggcgtaggcaaacaccccggccaggatcgatggcaggccagtgagcatcttggcggcaaancncgcagcnttggccagtttgntgtcggggccgagttcggccagganca > 1:1740732‑M2/1‑11 (MQ=255) gCGGTGCTGATGCTGCCGATCGTGGTGCTGACCGCCGAAGAGTCGATGAAGATGGTGCCCAAGATCATGAAGGACGCCGCCTACGGCATGGGTTGCACCCGTGCCCAGGTGATCTGGAAGATCGTCCTGCCTACCGGCCTGCCGGcc < 1:1610509/147‑1 (MQ=255) gCGGTGCTGATGCTGCCGATCGTGGTGCTGACCGCCGAAGAGTCGATGAAGATGGTGCCCAAGATCATGAAGGACGCCGCCTACGGCATGGGTTGCACCCGTGCCCAGGTGATCTGGAAGATCGTCCTGCCTACCGGCCTGCCGGCCATc > 2:1515405/1‑150 (MQ=255) ggTGCTGATGCTGCCGATCGTGGTGCTGACCGCCGaa < 1:1565353/37‑1 (MQ=255) ggTGCTGATGCTGCCGATCGTGGTGCTGACCGCCGaa > 2:1565353/1‑37 (MQ=255) gCTGATGCTGCCGATCGTGGTGCTGACCGCCGAAGAGTCGATGAAGATGGTGCCCAAGATCATGAAGGACGCCGCCTACGGCATGGGTTGCACCCGTGCCCAGGTGATCTGGAAGATCGTCCt > 1:1641675/1‑123 (MQ=255) gCTGATGCTGCCGATCGTGGTGCTGACCGCCGAAGAGTCGATGAAGATGGTGCCCAAGATCATGAAGGACGCCGCCTACGGCATGGGTTGCACCCGTGCCCAGGTGATCTGGAAGATCGTCCt < 2:1641675/123‑1 (MQ=255) cTGATGCTGCCGATCGTGGTGCTGACCGCCGAAGAGTCGATGAAGATGGTGCCCAAGATCATGAAGGACGCCGCCTACGGCATGGGTTGCACCCGTGCCCAGGTGATCTGGAAGATCGTCCTGCCTACCGGCCTGCCGGCCATCCTCAcc > 2:1488223/1‑150 (MQ=255) | CGACAGCAAACTGGCCAACGCTGCGCGCTTTGCCGCCAAGATGCTCACTGGCCTGCCATCGATCCTGGCCGGGGTGTTTGCCTACGCCTTGGTGGTGATGACCACCGGTACCTACTCGGCACCGGCAGGCGGCGTGGCGCTGGCGGTGCTGATGCTGCCGATCGTGGTGCTGACCGCCGAAGAGTCGATGAAGATGGTGCCCAAGATCATGAAGGACGCCGCCTACGGCATGGGTTGCACCCGTGCCCAGGTGATCTGGAAGATCGTCCTGCCTACCGGCCTGCCGGCCATCCTCACC > NC_002947/3045799‑3046096 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |