New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | = 4121729 | 70 (0.790) | 4 (0.050) | 4/238 | NT | 5.4% | coding (102/789 nt) | PP_3624 | hypothetical protein |
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CTCGTGACCACGGCCCGGCGTAAACCACCTCTATCTCCAGCCCCAACTGCTTGCCCAGGTATTTGAGCAGGTCGGCATTGGCACCGATCAGTCGCTGAGGGTTCAGCGGGTCGCGCCACAGGTACGGGGGGTATTCCGGGTTGCCTGTGGCGGTCAGCCGTAGGCATGCATCATCCGCTGTTGCAGCCAGGGGCAGCAGTGACAGGCACATCAGGAGCAAGACGTGGCGAAAGCAACGCTCGATCATCTACGACCCTCGGCACATGAAACACCCGGCGATCCGGCGTAGTGGCCA > NC_002947/4121584‑4121878 | cTCGTGACCACGGCCCGGCGTAAACCACCTCTATCTCCAGCCCCAACTGCTTGCCCAGGTATTTGAGCAGGTCGGCATTGGCACCGATCAGTCGCTGAGGGTTCAGCGGGTCGCGCCACAGGTACGGGGGGTATTCCGGGTTGCCTGTgg < 1:768514/150‑1 (MQ=255) tGACCACGGCCCGGCGTAAACCACCTCTATCTCCAGCCCCAACTGCTTGCCCAGGTATTTGAGCAGGTCGGCATTGGCACCGATCAGTCGCTGAGGGTTCAGCGGGTCGCGCCACAGGTACGGGGGGTATTCCGGGTTGCCTGTGGCGGt > 2:281470/1‑150 (MQ=255) cACGGCCCGGCGTAAACCACCTCTATCTCCAGCCCCAACTGCTTGCCCAGGTATTTGAGCAGGTCGGCATTGGCACCGATCAGTCGCTGAGGGTTCAGCGGGTCGCGCCACAGGTACGGGGGGTATTCCGGGTTGCCTGTGGCGGTCAGc > 1:627534/1‑150 (MQ=255) 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accaccTCTATCCCCAGCCCCAACTGCTTGCCCAGGTATTTGAGCAGGTCGGCATTGGCACCGATCAGTCGCTGAGGGTTCAGCGGGTCGCGCCACAGGTACGGGGGGTATTCCGGGTTGCCTGTGGCGGTCAGCCGTAGGCATGcatca < 1:201152/150‑1 (MQ=255) ccaccTCTATCTCCAGCCCCAACTGCTTGCCCAGGTATTTGAGCAGGTCGGCATTGGCACCGATCAGTCGCTGAGGGTTCAGCGGGTCGCGCCACAGGTACGGGGGGTATTCCGGGTTGCCTGTGGCGGTCAGCCGTAGGCATGcatcat > 2:1681646/1‑150 (MQ=255) ccaccTCTATCTCCAGCCCCAACTGCTTGCCCAGGTATTTGAGCAGGTCGGCATTGGCACCGATCAGTCGCTGAGGGTTCAGCGGGTCGCGCCACAGGTACGGGGGGTATTCCGGGTTGCCTGTGGCGGTCAGCCGTAGGCATGcatcat > 2:1680727/1‑150 (MQ=255) caccTCTATCTCCAGCCCCAACTGCTTGCCCAGGTATTTGAGCAGGTCGGCATTGGCACCGATCAGTCGCTGAGGGTTCAGCGGGTCGCGCCACAGGTACGGGGGGTATTCCGGGTTGCCTGTGGCGGTCAGCCGTAGGCATGCatcatc > 1:649571/1‑150 (MQ=255) tctcCAGCCCCAACTGCTTGCCCAGGTATTTGAGCAGGTCGGCATTGGCACCGATCAGTCGCTGAGGGTTCAGCGGGTCGCGCCACAGGTACGGGGGGTATTCCGGGTTGCCTGTGGCGGTCAGCCGTAGGCATGCATCATCCGCTGTTg > 2:1087621/1‑150 (MQ=255) 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ggTTGCCTGTGGCGGTCAGCCGTAGGCATGCATCATCCGCTGTTGCAGCCAGGGGCAGCAGTGACAGGCACATCAGGAGCAAGACGTGGCGAAAGCAACGCTCGATCATCTACGACCCTCGGCACATGAAACACCCGGCGATCCGGCGTa > 1:753273/1‑150 (MQ=255) gTTGCCTGTGGCGGTCAGCCGTaggcaacccggaataccccccgtacctgtggcgcgacccgctgaaccctcagcgactgatcggtg > 1:618675‑M2/1‑22 (MQ=255) gTTGCCTGTGGCGGTCAGCCGTaggcaacccggaataccccccgtacctgtggcgcgacccgctgaaccctcagcgactgatcggtg < 2:618675‑M2/87‑66 (MQ=255) gTTGCCTGTGGCGGTCAGCCGTAGGCATGCATCATCCGCTGtt < 2:118369/43‑1 (MQ=255) gTTGCCTGTGGCGGTCAGCCGTAGGCATGCATCATCCGCTGtt > 1:118369/1‑43 (MQ=255) tGCCTacggctgaccgccacaggcaacccggaataccccccgtacctgtggcgcgacccgctgaaccctcagcgactgatcggtgccaatgccgacctgctcaaatacctgggcaagcagttggggctggagatagaggtggtttacgcc < 2:1383892‑M1/150‑146 (MQ=255) tGCCTGTGGCGGTCAGCCGTAGGCATGCATCATCCGCTGTTGCAGCCAGGGGCAGCAGTGACAGGCACATCAGGAGCAAGACGTGGCGAAAGCAACGCTCGATCATCTACGACCCTCGGCACATGAAACACCCGGCGATCCGGCGTAGTg < 1:319713/150‑1 (MQ=255) tGCCTGTGGCGGTCAGCCGTAGGCATGCATCATCCGCTGTTGCAGCCAGGGGCAGCAGTGACAGGCACATCAGGAGCAAGACGTGGCGAAAGCAACGCTCGATCATCTACGACCCTCGGCACATGAAACACCCGGCGATCCGGCGTAGTg < 1:1517721/150‑1 (MQ=255) ccTGTGGCGGTCAGCCGTAGGCATGCATCATCCGCTGTTGCAGCCAGGGGCAGCAGTGACAGGCACATCAGGAGCAAGACGTGGCGAAAGCAACGCTCGATCATCTACGACCCTCGGCACATGAAACACCCGGCGATCCGGCGTAGTGGc > 2:1590234/1‑150 (MQ=255) cTacggctgaccgccacaggcaacccggaataccccccgtacctgtggcgcgacccgctgaaccctcagcgactgatcggtgccaatgccgacctgctcaaatacctgggcaagcagttggggctgga < 2:1861770‑M1/128‑127 (MQ=255) cTacggctgaccgccacaggcaacccggaataccccccgtacctgtggcgcgacccgctgaaccctcagcgactgatcggtgccaatgccgacctgctcaaatacctgggcaagcagttggggctgga > 1:1861770‑M1/1‑2 (MQ=255) cTacggctgaccgccacaggcaacccggaataccccccgtacctgtggcgcgacccgctgaaccctcagcgactgatcggtgccaatgccgacctgct < 1:2066185‑M1/98‑97 (MQ=255) cTacggctgaccgccacaggcaacccggaataccccccgtacctgtggcgcgacccgctgaaccctcagcgactgatcggtgccaatgccgacctgct > 2:2066185‑M1/1‑2 (MQ=255) cTGTGGCGGTAAGCCGTAGGCATGCATCATCCGCTGTTGCAGCCAGGGGCAGCAGTGACAGGCACATCAGGAGCAAGACGTGGCGAAAGCAACGCTCGATCATCTACGACACTCGGCACATGAAACACCCGGCGATCCGGCGTAGTGGcc > 2:1098224/1‑150 (MQ=255) tgtgGCGGTCAGCCGTAGGCATGCATCATCCGCTGTTGCAGCCAGGGGCAGCAGTGACAGGCACATCAGGAGCAAGACGTGGCGAAAGCAACGCTCGATCATCTACGACCCTCGGCACATGAAACACCCGGCGATCCGGCGTAGTGGCCa > 1:488591/1‑150 (MQ=255) | CTCGTGACCACGGCCCGGCGTAAACCACCTCTATCTCCAGCCCCAACTGCTTGCCCAGGTATTTGAGCAGGTCGGCATTGGCACCGATCAGTCGCTGAGGGTTCAGCGGGTCGCGCCACAGGTACGGGGGGTATTCCGGGTTGCCTGTGGCGGTCAGCCGTAGGCATGCATCATCCGCTGTTGCAGCCAGGGGCAGCAGTGACAGGCACATCAGGAGCAAGACGTGGCGAAAGCAACGCTCGATCATCTACGACCCTCGGCACATGAAACACCCGGCGATCCGGCGTAGTGGCCA > NC_002947/4121584‑4121878 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |