New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 138 total aligned reads displayed.
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gCCATTCCCCTGCGCTGTTCTGGCTCACCACTACCCCGCTACGCCGAACCACGGCGACATGACCCGCCTGGCAGCCATGGTGCTGTCCGGCAAGATTCCAGCGCCCGAGGTGCTGGTCGGCGGCACGCCCTGCCAGGCCTTCAGCGTGGc < 1:1411742/150‑1 (MQ=255) ccATTCCCCTGCGCTGTTCTGGCTCACCACTACCCCGCTACGCCGAACCACGGCGACATGACCCGCCTGGCAGCCATGGTGCTGTCCGGCAAGATTCCAGCGCCCGAGGTGCTGGTCGGCGGCACGCCCTGCCAGGCCTTCAGCGTGGcc > 1:1565826/1‑150 (MQ=255) cccTGCGCTGTTCTGGCTCACCACTACCCCGCTACGCCGAACCACGGCGACATGACCCGCCTGGCAGCCATGGTGCTGTCCGGCAAGATTCCAGCGCCCGAGGTGCTGGTCGGCGGCACGCCCTGCCAGGCCTTCAGCGTGGCCGGCATg > 1:331192/1‑150 (MQ=255) ccTGCGCTGTTCTGGCTCACCACTACCCCGCTACGCCGAACCACGGCAACATGACCCGCCTGGCAGCCATGGTGCTGTCCGGCAAGATTCCAGCGCCCGAGGTGCTGGTCGGCGGCACGCCCTGCCAGGCCTTCAGCGTGGCCGGCATGc < 1:1423378/150‑1 (MQ=255) cTGCGCTGTTCTGGCTCACCACTACCCCGCTACGCCGAACCACGGCGACATGACCCGCCTGGCAGCCATGGTGCTGTCCGGCAAGATTCCAGCGCCCGAGGTGCTGGTCGGCGGCACGCCCTGCCAGGCCTTCAGCGTGGCCGGCATGCg > 1:2334208/1‑150 (MQ=255) tGCGCTGTTCTGGCTCACCACTACCCCGCTACGCCGAACCACGGCGACATGACCCGCCTGGCAGCCATGGTGCTGTCCGGCAAGATTCCAGCGCCCGAGGTGCTGGTCGGCGGCACGCCCTGCCAGGCCTTCAGCGTGGCCGGCATGCga < 1:719231/150‑1 (MQ=255) gcgcTGTTCTGGCTCACCACTACCCCGCTACGCCGAACCACGGCGACATGACCCGCCTGGCAGCCATGGTGCTGTCCGGCAAGATTCCAGCGCCCGAGGTGCTGGTCGGCGGCACGCCCTGCCAGGCCTTCAGCGTGGCCGGCATGCGAg < 1:456168‑M2/150‑2 (MQ=255) cTGTTCTGGCTCACCACTACCCCGCTACGCCGAACCACGGCGACATGACCCGCCTGGCAGCCATGGTGCTGTCCGGCAAGATTCCAGCGCCCGAGGTGCTGGTCGGCGGCACGCCCTGCCAGGCCTTCAGCGTGGCCGGCATGCGAgaag > 1:2018695‑M2/1‑146 (MQ=255) tGTTCTGGCTCACCACTACCCCGCTACGCCGAACCACGGCGACATGACCCGCCTGGCAGCCATGGTGCTGTCCGGCAAGATTCCAGCGCCCGAGGTGCTGGTCGGCGGCACGCCCTGCCAGGCCTTCAGCGTGGCCGGCATGCGAgaagg > 2:1917328‑M2/1‑145 (MQ=255) ttCTGGCTCACCACTACCCCGCTACGCCGAACCACGGCGACATGACCCGCCTGGCAGCCATGGTGCTGTCCGGCAAGATTCCAGCGCCCGAGGTGCTGGTCGGCGGCACGCCCTGCCAGGCCTTCAGCg > 2:896332/1‑129 (MQ=255) 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2:45042‑M1/150‑140 (MQ=255) gCCAGGCCTTCAGCGTGGCCGGCATGCGAGAAGGCCTGGCCGATCCCCGCGGCGCCCTCACCATCAAATACGTGGAGCTGCTCGATGCaa > 1:1745974/1‑90 (MQ=255) ccAGGCCTTCtcgcatgccggccacgctgaaggcctggcagggcgtgccgccgaccagcacctcgggcgctggaatcttgccggacagcaccatggctgccaggcgggtcatgtcgccatggttcggcgtagcggggtagtggtgagcca < 2:1436008‑M1/150‑141 (MQ=255) ccAGGCCTTCAGCGTGGCCGGCATGCGAnaaggcctggcagggcntncngccgaccagcacctcgggcgctggaatcttgccgggcagcaccatggctgccaggcgggtcatgaagctgtggttcggcgtaggggggtagtggtgagccc < 1:1181318‑M2/150‑123 (MQ=255) cAGGCCTTCtcgcatgccggccacgctgaaggcctggcagggcgtgccgccgaccagcacctcgggcgctggaatcttgccggacagcaccatggctgcc < 1:2336428‑M1/100‑92 (MQ=255) aGGCCTTCtcgcatgccggccacgctgaaggcctggcagggcgtgccgccgaccagcacctcgggcgctggaatcttgccggacagcaccatggctgccaggcgggtcatgtcgccgtggttcggcgtagcggggtagtggtgagccaga > 2:456168‑M1/1‑8 (MQ=255) aGGCCTTCAGCGTGGCCGGCATGCGAgaaggcctggcagggcgtgccgccgaccagcacctcgggcgct > 1:763293‑M2/1‑26 (MQ=255) aGGCCTTCAGCGTGGCCGGCATGCGAgaaggcctggcagggcgtgccgccgaccagcacctcgggcgct < 2:763293‑M2/69‑44 (MQ=255) aGGCCTTCAGCGTGGCCGGCATGCGAgaaggcctggaagggcgtgccgccgaccagcacctcgggcgctggaatcttgccggacagcaccatggctgccaggcgg < 1:904891‑M2/105‑80 (MQ=255) ggCCTTCtcgcatgccggccacgctgaaggcctggcagggcgtgccgccgaccagcacctcgggcgctggaatcttgccggacagcaccctggctgccaggcgggtcatgtcgccgtggttcgtcgtagcggggtagtggtgagccagaa < 2:615179‑M1/150‑144 (MQ=255) ccTTCtcgcatgccggccacgctgaaggcctggcagggcgtgccgccgaccagcacctcgggcgctggaatcttgccggacagcaccatggctgccaggcgggtcatgtcgccgtggttcggcgtagcggggtagtggtgagccagaaca > 2:1917328‑M1/1‑5 (MQ=255) ccTTCAGCGTGGCCGGCATGCGAGAAGGCCTGGCCGATCCCCGCGGCGCCCTCACCATCAAATACGTGGAGCTGCTCGATGCAATTGACCATGTTCGAACAAGGCGTGGCCAGCCCGAGGCCGCCTGCCTCTGGGAAAACGTCCCCGGCg > 2:1272339/1‑150 (MQ=255) ttCAGCGTGGCCGGCATGCGAGAAGGCCTGGCCGATCCCCGCGGCGCCCTCACCATCAAATACGTGGAGCTGCTCGATGCAATTGACCATGTTCGAACAAGGCGTGGCCAGCCCGAGGCCGCCTGCCTCTGGGAAAACGTc < 2:537484/141‑1 (MQ=255) ctcgcatgccggccacgctgaaggcctggcagggcgtgccgccgaccagcacctcgggcgctggaatcttgccggacagcaccatggctgccaggcgggtcatgtcgccgtggttcggcgtagcggggtagtggtgagccagaacagcgc < 1:456168‑M1/150‑150 (MQ=255) | GAGATCGAGCCATTCCCCTGCGCTGTTCTGGCTCACCACTACCCCGCTACGCCGAACCACGGCGACATGACCCGCCTGGCAGCCATGGTGCTGTCCGGCAAGATTCCAGCGCCCGAGGTGCTGGTCGGCGGCACGCCCTGCCAGGCCTTCAGCGTGGCCGGCATGCGAGAAGGCCTGGCCGATCCCCGCGGCGCCCTCACCATCAAATACGTGGAGCTGCTCGATGCAATTGACCATGTTCGAACAAGGCGTGGCCAGCCCGAGGCCGCCTGCCTCTGGGAAAACGTCCCCGGCGTCCT > NC_002947/4420385‑4420683 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |