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Only 100 of 129 total aligned reads displayed.
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tAGAACTCGCGCGC‑‑‑‑CTTGCTGTCGCGCTTGGCGTGGCGggcgcgcgagttctacgtgtggtcggacgacgaccagaagtacgacggcacgcgcatcatcttc < 1:770884‑M2/102‑65 (MQ=255) tAGAACTCGCGCGC‑‑‑‑CTTGCTGTCGCGCTTGGCGTGGCGggcgcgcgagttctacgtgtggtcggacgacgaccagaagtacgacggcacgcgcatcatcttc > 2:770884‑M2/1‑38 (MQ=255) gAACTCGCGCGC‑‑‑‑CTTGCTGCCGCGCTTGGCGTGGCGGGCGCGCTGGAACCACGGGTGCTGGTCGCTGGTGTGGTTGATGACCAGCTCGGTGATCACCCGCAGGCCGCGCTTGTGGGCCTCGGCGATGAAACGGCGGGCGTCGGCCAtgct < 2:420702/150‑1 (MQ=255) aaCTCGCGCGC‑‑‑‑CTTGCTGCCGCGCTTGGCGTGGCGggcgcgcgagttctacgtgtggtcggacgacgaccagaagtacgacggcacgcgcatcatcttcctcgacaccgagaagtccaactggacctgggacccggtcgccggccagtac < 1:961963‑M2/150‑116 (MQ=255) cTCGCGCGC‑‑‑‑CTTGCTGCCGCGCTTGGCGTGGCGGGCTCGCTGGAACCACGGGTGCTGGTCGCTGGTGTGGTTGATGACCAGCTCGGTGATCACCCGCAGGCCGCGCTTGTGGGCCTCGGCGATGAAACGGCGGGCGTCGGCCATGCTGcc > 1:323066/1‑150 (MQ=255) tCGCGCGC‑‑‑‑CTTGCTGCCGCGCTTGGCGTGGCGgcaaggcgcgcgagttctacgtgtggtcggacgacgaccagaagtacgacggcacgcgcatcatcttcctcgacaccgagaagtccaactg > 2:1149696‑M2/1‑32 (MQ=255) tCGCGCGC‑‑‑‑CTTGCTGCCGCGCTTGGCGTGGCGgcaaggcgcgcgagttctacgtgtggtcggacgacgaccagaagtacgacggcacgcgcatcatcttcctcgacaccgagaagtccaactg < 1:1149696‑M2/123‑92 (MQ=255) gcgcgc‑‑‑‑CTTGCTGCCGCGCTTGGCGTGGCGggcgcgcgagttctacgtgtggtcggacgacgaccagaagtacgacggcacgcgcatcatcttcctcgacaccgagaagtccaa > 1:176927‑M2/1‑30 (MQ=255) gcgcgc‑‑‑‑CTTGCTGCCGCGCTTGGCGTGGCGggcgcgcgagttctacgtgtggtcggacgacgaccagaagtacgacggcacgcgcatcatcttcctcgacaccgagaagtccaa < 2:176927‑M2/114‑85 (MQ=255) gcgcgc‑‑‑‑CTTGCTGCCGCGCTTGGCGTGGCGGGCGCGCTGGAACCACGGGTGCTGGTCGCTGGTGTGGTTGATGACCAGCTCGGTGATCACCCGCAGGCCGCGCTTGTGGGCCTCGGCGATGAAACGGCGGGCGTCGGCCATGCTGCCGTa < 1:1739448/150‑1 (MQ=255) gcgcgc‑‑‑‑CTTGCTGCCGCGCTTGGCGTGGCGGGCGCGCTGGAACCACGGGTGCTGGTCGCTGGTGTGGTTGATGACCAGCTCGGTGATCACCCGCAGGCCGCGCTTGTGGGCCTCGGCGATGAAACGGCGGGCGTCGGCCATGCTGCCGTa > 1:1514803/1‑150 (MQ=255) cgcgc‑‑‑‑CTTGCTGCCGCGCTTGGCGTGGCGGGCGCGCTGGAACCACGGGTGCTGGTCGCTGGTGTGGTTGATGACCAGCTCGGTGATCACCCGCAGGCCGCGCTTGTGGGCCTCGGCGATGAAACGGCGGGCGTCGGCCATGCTGCCGTAg > 1:445906/1‑150 (MQ=255) gcgc‑‑‑‑Ccgccacgccaagcgcggcagcaaggcgcgcgagttctacgtgtggtcggacgac < 1:392480‑M1/59‑55 (MQ=255) gcgc‑‑‑‑Ccgccacgccaagcgcggcagcaaggcgcgcgagttctacgtgtggtcggacgac > 2:392480‑M1/1‑5 (MQ=255) gc‑‑‑‑CTTGCTGCCGCGCTTGGCGTGGCGGGCGCGCTGGAACCACGGGTGCTGGTCGCTGGTGTGGTTGATGACCAGCTCGGTGATCACCCGCAGGCCGCGCTTGTGGGCCTCGGCGATGAAACGGCGGGCGTCGGCCATGCTGCCGTAg < 1:1369445/147‑1 (MQ=255) gc‑‑‑‑CTTGCTGCCGCGCTTGGCGTGGCGGGCGCGCTGGAACCACGGGTGCTGGTCGCTGGTGTGGTTGATGACCAGCTCGGTGATCACCCGCAGGCCGCGCTTGTGGGCCTCGGCGATGAAACGGCGGGCGTCGGCCATGCTGCCGTAg > 2:1369445/1‑147 (MQ=255) ccgccacgccaagcgcggcagcaaggcgcgcgagttctacgtgtggtcggacgacgaccagaagtacgacggcacgcgcatcatcttcctcgacaccgagaagtccaactggacctgggacccggtcgccggccagtacttctggcaccg > 2:1716919‑M1/1‑1 (MQ=255) ccgccacgccaagcgcggcagcaaggcgcgcgagttctacgtgtggtcggacgacgaccagaagtacgacggcacgcgcatcatcttcctcgacaccgagaagtccaactggacctgggacccggtcgccggccagtacttctggcaccg > 2:884229‑M1/1‑1 (MQ=255) cTTGCTGCCGCGCTTGGCGTGGCGGGCGCGCTGGAACCACGGGTGCTGGTCGCTGGTGTGGTTGATGACCAGCTCGGTGATCACCCGCAGGCCGCGCTTGTGGGCCTCGGCGATGAAACGGCGGGCGTCGGCCATGCTGCCGTAGTCAgg < 1:1385258/150‑1 (MQ=255) | GGTCCGGCTGGTGGGAGTAGAACCGGTGCCAGAAGTACTGGCCGGCGACCGGGTCCCAGGTCCAGTTGGACTTCTCGGTGTCGAGGAAGATGATGCGCGTGCCGTCGTACTTCTGGTCGTCGTCCGACCACACGTAGAACTCGCGCGC‑‑‑‑CTTGCTGCCGCGCTTGGCGTGGCGGGCGCGCTGGAACCACGGGTGCTGGTCGCTGGTGTGGTTGATGACCAGCTCGGTGATCACCCGCAGGCCGCGCTTGTGGGCCTCGGCGATGAAACGGCGGGCGTCGGCCATGCTGCCGTAGTCAGG > NC_002947/4582925‑4583222 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |